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大豆GmF6′H1基因的克隆及功能驗(yàn)證

2015-07-04 11:14:18魏麗娟劉林德
西北植物學(xué)報(bào) 2015年2期
關(guān)鍵詞:阿魏香豆素輔酶

王 蕾,張 娟,魏麗娟,劉林德

(1 魯東大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,山東煙臺(tái)264025;2 魯東大學(xué) 農(nóng)學(xué)院,山東煙臺(tái)264025)

香豆素是一類廣泛存在于高等植物中的次生代謝產(chǎn)物,特別是在傘形科、蕓香科、豆科、菊科、瑞香科和木犀科中含量較高[1-2]。在化學(xué)結(jié)構(gòu)上,香豆素類化合物是一種具有苯丙α-吡喃酮核的順式鄰羥基肉桂酸內(nèi)酯。最近大量的科學(xué)研究顯示,香豆素及其衍生物在農(nóng)業(yè)、工業(yè)、醫(yī)藥業(yè)發(fā)揮著重要作用[3-5]。在真菌或者微生物侵染的植物中香豆素會(huì)大量積累,這表明香豆素可能與植物抗逆的防御性反應(yīng)存在著聯(lián)系[4];許多傳統(tǒng)中草藥,如前胡、蛇床子、祖師麻、花椒、秦皮、枳實(shí)等,其活性成分就是香豆素及其衍生物[6-8],它們?cè)谙住⒖咕?、抑制血栓形成、抗凝血?jiǎng)?、抗腫瘤、抑制中樞神經(jīng)系統(tǒng)和降低血壓等方面臨床療效顯著[9-10];在工業(yè)方面,香豆素因其特殊味道被用于制造香水、香皂和調(diào)味劑[11]。

香豆素在工業(yè)、農(nóng)業(yè)和醫(yī)藥業(yè)的重要性使得越來(lái)越多的研究聚焦于香豆素的合成和提取,但由于工業(yè)合成的復(fù)雜性和高成本,香豆素在植物中的合成開(kāi)始受到人們的關(guān)注。香豆素結(jié)構(gòu)種類繁多,植物體內(nèi)許多酶參與了其合成,其生物合成途徑是植物苯丙氨酸代謝途徑的一個(gè)分支,其中阿魏酰輔酶A 6′位的羥基化至關(guān)重要。最近的研究發(fā)現(xiàn),一些細(xì)胞色素單加氧酶P450是呋喃香豆素生物合成的關(guān)鍵酶,其作用機(jī)理是催化傘形花內(nèi)酯6位或者8位異戊烯化后的羥基化[12-14]。在擬南芥香豆素生物合成途徑中,對(duì)香豆酸-3′-羥化酶催化對(duì)-香豆酰-CoA 3′位羥基化,進(jìn)而生成咖啡酰輔酶A;接著咖啡酰輔酶A 氧甲基轉(zhuǎn)移酶通過(guò)修飾3′位置上氧甲基化產(chǎn)生阿魏酰輔酶A,然后一個(gè)依賴于Fe(Ⅱ)和2-酮戊二酸的雙加氧酶催化阿魏酰輔酶A 6′位的羥基化,因此該酶被命名為F6′H;上述反應(yīng)產(chǎn)物6-羥基阿魏酰輔酶A 最終通過(guò)順式/反式異構(gòu)化和內(nèi)酯化生成香豆素[15]。

本研究從大豆中克隆了1 個(gè)擬南芥AtF6′H1基因的同源基因,通過(guò)酶學(xué)特性分析其催化活性,并分析在擬南芥Atf6′h1突變體中過(guò)量表達(dá)對(duì)植株中香豆素的含量的影響。探討不同植物中F6′H同源基因可能存在的作用或調(diào)控機(jī)制。

1 材料和方法

1.1 植物材料和生長(zhǎng)條件

大豆‘黑農(nóng)35號(hào)’種子2012年5月初播種于盆中,置于光照培養(yǎng)箱(28±1)℃,16h光照(5:00~21:00),8h 暗培養(yǎng),在結(jié)莢期分別取同一植株的根、莖、葉和莢果液氮速凍后存于-80℃待用。

擬南芥(Col 0、突變體和轉(zhuǎn)基因)種子常規(guī)表面消毒后播種于MS固體培養(yǎng)基上,4℃處理2~3d后置于光照培養(yǎng)箱培養(yǎng)[(21±1)℃,濕度為75%,光照時(shí)間同上所述]。幼苗約高為1~2cm 時(shí),在無(wú)菌條件下分別移植于終濃度為100μmol/L 2,4-D、水楊酸和激動(dòng)素的MS固體培養(yǎng)基中,然后依次在處理0h、12h、24h、48h時(shí)分別取地上部分和根部材料,液氮速凍。

1.2 方 法

1.2.1 大豆GmF6′H1基因克隆及其EST 序列分析 在大豆基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中找到一個(gè)擬南芥AtF6′H1(At3g13610)和AtF6′H2(At1g55290)[15]的同源序列,根據(jù)該序列信息,在開(kāi)放閱讀框兩端分別設(shè)計(jì)GmF6′H1正向引物GmF6′H1-F(atgtcttccactcccaccaatctc)和反向引物GmF6′H1-R(tcatatcatggcaaattcaatag)。

取大豆新鮮葉片約1g,提取總RNA。大豆總RNA 提取采用Qiagen公司的RNeasy Plant Mini Kit試劑盒(Qiagen,Cat.No.74903),具體操作步驟參照說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。cDNA 第一鏈合成采用寶生物公司PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser(寶生物,DRR047S)試劑盒并參考其使用說(shuō)明進(jìn)行操作,以合成的第一鏈cDNA 為模板,以GmF6′H1-F和GmF6′H1-R 為引物,利用普洛麥格公司的GoTaq? DNA 聚合酶(普洛麥格,M3005)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。擴(kuò)增所得PCR 產(chǎn)物與pGM-T 載體(天根公司,VT302)連接后導(dǎo)入大腸桿菌DH5α,鑒定正確后送公司測(cè)序(華大公司)。序列的比對(duì)和同源比較利用Vector NTI軟件(Invitrogen)進(jìn)行分析。

1.2.2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR 分析 分別提取液氮速凍收集的大豆各種材料總RNA,DNase I處理以消除基因組DNA 污染。第一鏈cDNA 合成見(jiàn)1.2.1。實(shí)時(shí)熒光定量PCR 分析采用天根公司SYBRGreen using RealMasterMix(SYBR Green)試劑盒(TIANGEN,China,F(xiàn)P202)。反應(yīng)條件為94℃預(yù)變性2min;94℃變性15s,58℃退火15s,68℃延伸40s;35個(gè)循環(huán)。通過(guò)比較循環(huán)閾值法進(jìn)行初始轉(zhuǎn)錄物濃度估算[16],大豆Ubiquitin基因(D28123)作為內(nèi)標(biāo)。實(shí)時(shí)熒光定量PCR 所用的引物如下:大豆Ubiquitin(D28123)利用Ubiquitin-F(tctgacaccattgacaatgtg)和 Ubiquitin-R(cttctggatgttgtagtcagc);大豆GmF6′H1利用GmF6′H1-F 和GmF6′H1-R。

1.2.3 原核表達(dá)載體的構(gòu)建和重組蛋白的誘導(dǎo)表達(dá) 利用帶有特殊限制性酶切位點(diǎn)的引物GmF6′H1-BamHⅠF(aaggatccatgtcttccactcccaccaatc)和GmF6′H1-XhoⅠR(aactcgagtcatatcatggcaaattcaatag)擴(kuò)增GmF6′H1基因編碼區(qū)。用BamHⅠ、XhoⅠ對(duì)GmF6′H1基因PCR 產(chǎn)物和表達(dá)載體pET32a分別進(jìn)行雙酶切,瓊脂糖凝膠電泳回收酶切片段。利用T4DNA 連接酶連接后轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,挑取陽(yáng)性克隆進(jìn)行菌落PCR 和酶切鑒定,鑒定正確的質(zhì)粒送華大基因公司測(cè)序,確保重組表達(dá)載體的正確性,最終獲得正確的重組表達(dá)載體pET32a-GmF6′H1。

利用CaCl2化學(xué)轉(zhuǎn)化法,將pET32a-GmF6′H1質(zhì)粒轉(zhuǎn)入大腸桿菌TransBL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞。利用菌落PCR 對(duì)陽(yáng)性克隆進(jìn)行鑒定,鑒定正確的單菌落進(jìn)一步誘導(dǎo)蛋白表達(dá)。帶有pET32a-GmF6′H1質(zhì)粒的大腸桿菌BL21單菌落接種于含有100ng/mL氨芐青霉素LB液體培養(yǎng)基中,37℃過(guò)夜培養(yǎng)。然后將過(guò)夜培養(yǎng)的菌液以1∶100的比例接種于50 mL含有100ng/mL氨芐青霉素的LB 液體培養(yǎng)基中,培養(yǎng)至OD600達(dá)0.3 左右。此時(shí)將培養(yǎng)液轉(zhuǎn)入20℃搖床中培養(yǎng)1h后加入終濃度為0.5mmol/L IPTG,繼續(xù)培養(yǎng)16h。將培養(yǎng)完成的菌液4 000g、4℃離心10min收集菌體細(xì)胞,然后用冰冷的裂解緩沖液[50mmol/L Tris-Cl,pH 8.0,0.25mmol/L NaCl,1 mmol/L DTT,1 mmol/L EDTA,0.25 mmol/L PMSF(使用前加入)]重懸,超聲波破碎后,4℃離心10 min,上清上樣于Ni-Agarose His標(biāo)簽蛋白純化試劑盒(康為世紀(jì),CW0894)層析柱,沖洗3遍后,用溶解緩沖液洗脫目標(biāo)蛋白。純化的蛋白質(zhì)的濃度利用生工生物公司的Modified Bradford Protein Assay Kit(生工生物,SK3041)試劑盒進(jìn)行測(cè)定,取少量蛋白質(zhì)用于聚丙酰胺凝膠電泳檢測(cè),純化的目的蛋白立即用于酶活性鑒定。

1.2.4 GmF6′H1的酶活性分析 GmF6′H1的酶活性分析參照Kai等[15]的文獻(xiàn)。100μL 酶反應(yīng)體系中包含1.2μg蛋白,100mmol/L Tris/HCl,pH 6.5,1.0 mg/mL BSA,0.5 mmol/L FeSO4,5 mmol/L 2-酮 戊二酸鈉,5 mmol/L 抗壞血酸鈉,1 mmol/L阿魏酰輔酶A,30℃反應(yīng)1 min。反應(yīng)完成后,加入20μL 3mol/L NaOH 放置于37℃10 min以終止反應(yīng),然后加入20μL 醋酸。反應(yīng)混合物15 000g 離心10 min,上清進(jìn)行高效液相色譜(HPLC)分析。HPLC分析的條件為C18柱,流動(dòng)相為25%(體積比)的甲醇(含有0.1%的甲酸),流速為每分鐘1.0 mL,溫度為40℃,檢測(cè)波長(zhǎng)為348 nm。酶的活性鑒定所用的試劑均購(gòu)自上海生工生物工程股份有限公司,阿魏酰輔酶A 來(lái)自于余曉丹博士的饋贈(zèng)。

1.2.5 植物轉(zhuǎn)化載體的構(gòu)建 擬南芥Atf6′h1的突變體(SALK_129938)購(gòu)置于美國(guó)Salk研究所基因組分析實(shí)驗(yàn)室(Ohio State University,Columbus,OH,USA)。依據(jù)T-DNA 插入鑒定的原理(http://signal.salk.edu/tdnaprimers.2.html),在線設(shè)計(jì)3條引物L(fēng)Bb1.3(ATTTTGCCGATTTCGGAAC)、LP(GGTCGGGATTCTAATCTCAGC)和RP(AGAAGATGGTGAGGAGGCTTC)以篩選鑒定突變體純合系。

載體p1300-35S-GmF6′H1用于在擬南芥突變體Atf6′h1中過(guò)量表達(dá)GmF6′H1。利用PCR 從已測(cè)序正確的T-GmF6′H1 擴(kuò)增GmF6′H1 編碼區(qū),擴(kuò)增引物帶有特異的限制性酶切位點(diǎn)BamHⅠ和SalⅠ,PCR 片段分別用BamHⅠ和SalⅠ雙酶切后,與經(jīng)過(guò)同樣雙酶切的質(zhì)粒pCambia1300進(jìn)行連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,陽(yáng)性克隆進(jìn)行菌落PCR 和酶切鑒定。鑒定正確的質(zhì)粒利用電轉(zhuǎn)化的方法轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌GV3101以備植物轉(zhuǎn)化侵染。

1.2.6 植物轉(zhuǎn)化 擬南芥轉(zhuǎn)化方法參照Bent[17]的方法。擬南芥Atf6′h1突變體種子4℃春化2~3d后播種于用B5 營(yíng)養(yǎng)液浸泡過(guò)的含有蛭石的種植盆,隨后于23℃培養(yǎng)。待植物開(kāi)花后,剪去其主枝頂端,促側(cè)枝發(fā)展。在剪枝后的4~6d內(nèi),進(jìn)行農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化。將植株倒置于含p1300-35S-GmF6′H1質(zhì)粒的農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化緩沖液的玻璃瓶中,維持30s,取出種植盆,在暗處保濕側(cè)放24h,然后將種植盆直立,按正常的方法培育植株至結(jié)實(shí),收獲成熟種子。

轉(zhuǎn)基因植株的純合系篩選參照文獻(xiàn)[18]進(jìn)行,轉(zhuǎn) 基因植 株DNA提取采用CTAB法[18]。PCR 鑒定時(shí)分別利用潮霉素和GmF6′H1 的特異引物檢測(cè),反應(yīng)體系為DNA 模板1μL,10×PCR 緩沖液2 μL,2.5mmol/L dNTP 0.4μL,10μmol/L 的正反向引物各1μL,rTaq1U,ddH2O 補(bǔ)齊到20μL。反應(yīng)條件為94℃預(yù)變性3min,94℃變性30s,55℃退火30s;72℃延伸1.5min;35個(gè)循環(huán)后,72℃總延伸10min。

1.2.7 香豆素的定量分析 擬南芥植株中香豆素含量的測(cè)定方法見(jiàn)文獻(xiàn)[19],植物材料液氮研磨后懸浮在冰冷的甲醇中22h,甲醇溶液中含有4-羥甲香豆素作為內(nèi)標(biāo)。提取液15 000g離心10min,上清用于HPLC分析,分析條件見(jiàn)1.2.4。

2 結(jié)果與分析

2.1 大豆GmF 6′H 1的克隆

用擬南芥AtF6′H1(At3g13610)和AtF6′H2(At1g55290)[5,15]的基因序列BLAST搜索大豆的EST 據(jù)庫(kù)(Gene Index),檢測(cè)到一個(gè)EST 片段(TC440182)與擬南芥AtF6′H1和AtF6′H2一致性高達(dá)60%,沒(méi)有發(fā)現(xiàn)其它一致性更高的EST 序列。序列分析顯示TC440182具有完整的開(kāi)放閱讀框,把該基因命名為GmF6′H1。利用該序列BLAST 搜索大豆基因組文庫(kù)(NCBI,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/),在染色體18和8上均發(fā)現(xiàn)了GmF6′H1基因片段,這表明GmF6′H1基因具有2個(gè)基因拷貝,由于大豆是四倍體的雙子葉植物,因此一個(gè)基因在基因組中很可能存在著多個(gè)拷貝。基因組序列和cDNA序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),GmF6′H1和AtF6′H1以及AtF6′H2 具有相同的內(nèi)含子結(jié)構(gòu)。氨基酸序列比對(duì)顯示(圖1),GmF6′H1和AtF6′H1以及AtF6′H2分別具有54%和53%一致性。根據(jù)得到的序列信息設(shè)計(jì)特異引物,利用RT-PCR 擴(kuò)增GmF6′H1全長(zhǎng)cDNA 序列,PCR 擴(kuò)增片段,連接pGEM-T 載體后轉(zhuǎn)化大腸桿菌,陽(yáng)性克隆鑒定正確后送公司測(cè)序。該基因序列已經(jīng)上傳NCBI(KJ463390)。多次測(cè)序結(jié)果顯示,該基因與NCBI基因組文庫(kù)中的相應(yīng)序列有一個(gè)氨基酸的差異,這有可能是基因來(lái)源的大豆品種不同造成的。

大豆GmF6′H1氨基酸序列分析顯示,該蛋白具有一個(gè)2OG-Fe(Ⅱ)氧化酶超級(jí)家族的保守區(qū)域。在其N-末端有一個(gè)非血紅素雙脫氧酶區(qū)域,該區(qū)域也是依賴于2-酮戊二酸和Fe(Ⅱ)雙氧化酶活性的蛋白保守區(qū)段。該蛋白還具有一個(gè)2OGD 超級(jí)家族保守的Fe(Ⅱ)結(jié)合區(qū)域H225-X-D227-Xn-H283,AtF6′H1也有該區(qū)域。另外,在GmF6′H1中還發(fā)現(xiàn)了一個(gè)結(jié)合C5 羧基基團(tuán)的保守區(qū)域(R293-X-S295)。利用Swiss-Model工作站,根據(jù)推斷的氨基酸序列,預(yù)測(cè)了GmF6′H1、AtF6′H1和AtF6′H2蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu),這3個(gè)蛋白具有非常相似的三級(jí)結(jié)構(gòu)[20],這也暗示了GmF6′H1可能和AtF6′H1以及AtF6′H2具有相同的酶學(xué)特性,GmF6′H1可能是大豆香豆素合成途徑中的關(guān)鍵酶。

圖1 大豆與擬南芥F6′H 氨基酸序列同源性分析Fig.1 Amino acid alignment of GmF6′H1with AtF6′H1and AtF6′H2fromArabidopsis

2.2 GmF 6′H 1的轉(zhuǎn)錄表達(dá)模式分析

以大豆Ubiquitin基因?yàn)閮?nèi)參,利用實(shí)時(shí)定量PCR 研究了GmF6′H1 在各個(gè)組織器官中的表達(dá)模式,結(jié)果(圖2)表明,GmF6′H1在大豆的根中表達(dá)量最高,這暗示著大豆根中的香豆素含量最高。對(duì)擬南芥的研究也發(fā)現(xiàn),香豆素類物質(zhì)東莨菪素及其吡喃葡萄糖苷東莨菪苷在野生型的根中含量最高,是地上部分的180倍,這間接印證了香豆素類物質(zhì)東莨菪素及其衍生物主要在植物的根系中發(fā)揮重要作用,可能與植物的抗逆反應(yīng)機(jī)制有一定的關(guān)系,相關(guān)的研究也發(fā)現(xiàn),真菌和微生物侵染的植物根系會(huì)有香豆素類物質(zhì)的大量積累[21-22]。在大豆的其它組織器官中,GmF6′H1基因的表達(dá)量也相對(duì)較高,而在擬南芥中AtF6′H1和AtF6′H2主要在根部表達(dá),在地上部分的表達(dá)量極低,幾乎檢測(cè)不到,但是2,4-D 的處理能夠誘導(dǎo)AtF6′H2 在地上部分的表達(dá)。這暗示著不同植物F6′H 的作用和調(diào)控機(jī)制存在差異,它們可能有不同的底物特異性,這需要進(jìn)一步的研究進(jìn)行印證。

同時(shí),本實(shí)驗(yàn)研究了不同處理對(duì)大豆GmF6′H1轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平的影響。分別用2,4-D、水楊酸和激動(dòng)素處理了播種10d左右的大豆幼苗,取材時(shí)間為處理0、12、24 和48h。取材時(shí)分地上部分和根部,液氮速凍。然后分別提取各部分、各時(shí)間段材料的總RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA 進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR 反應(yīng)。結(jié)果顯示,2,4-D 的處理對(duì)大豆GmF6′H1的表達(dá)影響很小。但是水楊酸和激動(dòng)素的處理均顯著提高了該基因的表達(dá)水平,然而隨著處理時(shí)間的延長(zhǎng),GmF6′H1的轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平穩(wěn)定下降,最后接近處理前的水平(圖3)。這暗示了GmF6′H1基因在大豆生物抗逆中發(fā)揮著重要的作用,同時(shí)也說(shuō)明了植物對(duì)逆境的適應(yīng)性,當(dāng)逆境脅迫達(dá)到一定時(shí)間后,植物會(huì)通過(guò)調(diào)控自身基因的表達(dá)來(lái)適應(yīng)逆境,繼續(xù)保持穩(wěn)定的生長(zhǎng)。

圖2 大豆不同器官中GmF 6′H 1PCR 分析Fig.2 Expression pattern of GmF 6′H 1in different organs of soybean revealed by real-time PCR

2.3 GmF6′H1酶活性鑒定

帶有組氨酸標(biāo)簽的GmF6′H1在大腸桿菌中表達(dá)后,利用Ni-NTA 瓊脂糖層析柱純化重組蛋白,GmF6′H1在大腸桿菌中誘導(dǎo)表達(dá)和純化的蛋白見(jiàn)圖4。然后通過(guò)測(cè)定該蛋白是否能夠催化底物的鄰位羥基化來(lái)驗(yàn)證其酶學(xué)特性。以不加蛋白的反應(yīng)混合物為陰性對(duì)照,當(dāng)以阿魏酰輔酶A 為底物時(shí),一個(gè)鄰位羥基化的產(chǎn)物通過(guò)經(jīng)反式/順式異構(gòu)化和內(nèi)酯化的自發(fā)過(guò)程生成了東莨菪素。HPLC檢測(cè)到一個(gè)產(chǎn)物的吸收峰,該吸收峰的紫外吸收光譜與東莨菪素相似(圖5)。這些結(jié)果表明,大豆GmF6′H1能夠催化阿魏酰輔酶A鄰位的羥基化,屬于依賴于Fe(Ⅱ)和2-酮戊二酸依賴的雙加氧酶。

圖3 水楊酸(A)和激動(dòng)素(B)處理后地上部和根中GmF 6′H 1表達(dá)Fig.3 Expression pattern of GmF 6′H 1under the treatments of alicylic acid(A)and kinetin(B)

圖4 GmF6′H1蛋白表達(dá)和純化的SDS-PAGE檢測(cè)Fig.4 SDS-PAGE analysis of the expression of GmF6′H1

2.4 GmF6′H1參與植物香豆素合成的功能分析

為了更好地理解GmF6′H1的功能,在擬南芥Atf6′h1突變體中過(guò)量表達(dá)了大豆的GmF6′H1,以便觀察該蛋白是否能把擬南芥的突變體恢復(fù)成野生型。在35S啟動(dòng)子下的GmF6′H1通過(guò)農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化的方法轉(zhuǎn)入擬南芥Atf6′h1突變體植株。共獲得5個(gè)獨(dú)立的RT-PCR驗(yàn)證正確的轉(zhuǎn)基因系,轉(zhuǎn)基因擬南芥與Atf6′h1突變體植株外在表型沒(méi)有觀察到明顯的差異(圖6)。依據(jù)文獻(xiàn)[19]提供的方法測(cè)定轉(zhuǎn)基因植株根系的香豆素含量,同時(shí)提取擬南芥野生型和擬南芥Atf6′h1 突變體根系香豆素作為對(duì)照。HPLC分析結(jié)果(圖7)顯示,GmF6′H1過(guò)量表達(dá)的轉(zhuǎn)基因株系根中香豆素的含量相比較擬南芥突變體本身有所提高,與野生型擬南芥中香豆素含量接近。這表明GmF6′H1與AtF6′H1有相似功能,均在香豆素生物合成的過(guò)程中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。擬南芥野生型和突變體含量比較與已發(fā)表的結(jié)論相似[15]。

圖5 大豆GmF6′H1酶活性鑒定的HPLC分析Fig.5 HPLC profiles of extracts from different reaction systems

圖6 擬南芥突變體與轉(zhuǎn)基因株系表型Fig.6 The phenotype comparison among Arabidopsis

圖7 各材料根系中香豆素的含量比較Fig.7 Coumarin content in roots from different plants

3 討 論

盡管目前很多研究顯示香豆素及其衍生物在植物對(duì)病原菌的抗逆過(guò)程中發(fā)揮著重要作用,但是其機(jī)制并不清楚,很多植物香豆素合成的關(guān)鍵酶尚未知曉,而香豆素本身的醫(yī)療作用已經(jīng)使人們?cè)絹?lái)越關(guān)注它。為了更深入地理解香豆素在植物中的作用,本研究獲得了1個(gè)大豆的香豆素合成關(guān)鍵基因GmF6′H1,并通過(guò)一系列的實(shí)驗(yàn)研究了其酶學(xué)生化特性,同時(shí)利用基因的表達(dá)模式分析和互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)探索了其在植物中的生物學(xué)功能。

在過(guò)去的幾十年里,大豆的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值越來(lái)越受到人們的關(guān)注,其次生代謝的研究已經(jīng)非常深入,然而在大豆植物化學(xué)物質(zhì)中,異黃酮是目前討論最多的“健康促進(jìn)因子”,而香豆素卻并沒(méi)有引起足夠的重視。由于香豆素在植物抗逆反應(yīng)中也發(fā)揮著一定的作用,因此探索植物香豆素合成的關(guān)鍵酶顯得至關(guān)重要。同異黃酮相似,香豆素也是一組苯酚類次生代謝物,并且其生物合成途徑也是苯丙氨酸代謝途徑的一個(gè)分支。苯丙氨酸生物合成途徑起始于L-苯丙氨酸,該氨基酸經(jīng)苯丙氨酸解氨酶、肉桂酸-4-羥化酶、4-香豆酸:輔酶A 連接酶、香豆酸-3′-羥化酶、咖啡酰輔酶A 氧甲基轉(zhuǎn)移酶被催化生成阿魏酰輔酶A。接著阿魏酰輔酶A 經(jīng)過(guò)鄰位的羥基化,以及反式/順式異構(gòu)化和內(nèi)酯化的過(guò)程,最終生成香豆素類物質(zhì)東良菪素,其中后兩步的過(guò)程是自發(fā)的,不需要酶的催化,因此鄰位羥基化是植物中香豆素合成的關(guān)鍵步驟[15]。目前僅在擬南芥中報(bào)道發(fā)現(xiàn)了一個(gè)催化鄰位羥基化的香豆素生物合成關(guān)鍵酶AtF6′H1。該酶是一個(gè)依賴于Fe(Ⅱ)和2-酮戊二酸的雙加氧酶,能夠催化阿魏酰輔酶A 的6′位羥基化生成東良菪素[15]。在大豆中,利用同源克隆的方法獲得了1個(gè)擬南芥的同源基因GmF6′H1。氨基酸序列比對(duì)的分析結(jié)果顯示,該酶與擬南芥AtF6′H1、AtF6′H2 的一致性很高。分別利用GmF6′H1、AtF6′H1和AtF6′H2氨基酸序列進(jìn)行了三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),結(jié)果表明,GmF6′H1 和擬南芥AtF6′H1、AtF6′H2 具有相似的空間結(jié)構(gòu)和作用位點(diǎn)。而且GmF6′H1的酶學(xué)特性分析也顯示,該蛋白能夠以阿魏酰輔酶A 為底物催化其6′位羥基化生成東良菪素,這表明大豆GmF6′H1也是香豆素生物合成關(guān)鍵酶。與此同時(shí),在擬南芥Atf6′h1突變體中過(guò)量表達(dá)GmF6′H1明顯提高了轉(zhuǎn)基因植株根系中的香豆素含量,與擬南芥野生型根中的香豆素含量接近,進(jìn)一步印證了大豆GmF6′H1的功能。將來(lái),利用過(guò)量表達(dá)和RNA 抑制的方法,在大豆中研究GmF6′H1的功能可能會(huì)更深入地揭示其更多的生物功能。

基因表達(dá)模式的分析結(jié)果顯示,與擬南芥AtF6′H1相比,GmF6′H1存在著獨(dú)特的轉(zhuǎn)錄表達(dá)模式。GmF6′H1 在大豆的根、莖、葉、莢果中均有表達(dá),而擬南芥AtF6′H1主要在根中表達(dá),在地上部分其表達(dá)量極低,這說(shuō)明大豆中香豆素在根和地上部分都發(fā)揮著重要作用,或者是GmF6′H1在地上部分以其他物質(zhì)為底物催化化合物生成。在根中,香豆素可能和異黃酮一樣,作為一種植物根系分泌的一種信號(hào)物質(zhì),吸引相應(yīng)的微生物與根系形成共生關(guān)系,促進(jìn)植物的營(yíng)養(yǎng)吸收,或者作為一種化學(xué)物質(zhì)抑制微生物在根系的生長(zhǎng),相關(guān)研究也發(fā)現(xiàn)香豆素類化合物不僅能夠觸殺一些農(nóng)業(yè)害蟲(chóng)[23],而且對(duì)一些植物病原真菌有顯著的抑制作用[24]。在地上部分,香豆素可能以其特殊的味道增強(qiáng)了植物的抗菌、抗蟲(chóng)性,而且有研究也發(fā)現(xiàn)香豆素能夠抵抗紫外線的照射,并且紫外線照射能夠提高香豆素的抑菌性[4]。當(dāng)用抗逆信號(hào)分子水楊酸和激動(dòng)素處理大豆的幼苗時(shí),GmF6′H1 在地上部分和根中都被強(qiáng)烈地誘導(dǎo)表達(dá),而2,4-D 對(duì)該基因的表達(dá)沒(méi)有明顯的作用,這表明GmF6′H1在大豆正常生長(zhǎng)和抗逆過(guò)程中可能都發(fā)揮著重要作用,由于大豆本身的香豆素種類就很繁雜,因此與擬南芥AtF6′H1相比,大豆GmF6′H1可能有更廣的底物范圍,也可能是不同植物中的香豆素合成酶存在不同的調(diào)控機(jī)制。由于目前報(bào)道的以輔酶A 為底物的雙加氧酶并不多見(jiàn),因此對(duì)大豆GmF6′H1的反應(yīng)機(jī)制和底物特異性進(jìn)行進(jìn)一步的深入探討將會(huì)為今后的研究提供更多的借鑒。

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