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實(shí)時(shí)熒光聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)偶聯(lián)高特異性核酸侵入反應(yīng)檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性

2015-07-30 07:16鄭夢(mèng)琳等
分析化學(xué) 2015年7期
關(guān)鍵詞:探針多態(tài)性位點(diǎn)

鄭夢(mèng)琳等

摘 要 建立了實(shí)時(shí)熒光聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)偶聯(lián)高特性核酸侵入反應(yīng)檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性(SNP)的方法。優(yōu)化了體系中flap核酸內(nèi)切酶1(FEN1酶)和野生型檢測(cè)探針等用量,確定了最佳反應(yīng)條件,即FEN1酶用量為1.5 U,野生型檢測(cè)探針用量為0.125 μmol/L,0.5 μmol/L Invader突變型檢測(cè)探針,各0.25 μmol/L通用野生型(VIC)和突變型(FAM)熒光共振轉(zhuǎn)移發(fā)卡探針,顯著降低了野生型樣本和突變型樣本背景信號(hào),避免了背景信號(hào)對(duì)檢測(cè)結(jié)果分型的干擾。采用本方法對(duì)編碼乙醛脫氫酶2(ALDH2)基因ALDH2*2位點(diǎn)21例樣本、細(xì)胞色素P450 2C19基因CYP2C19*2和CYP2C19*3位點(diǎn)各19例樣本進(jìn)行分型檢測(cè),結(jié)果表明, ALDH2*2位點(diǎn)GG純合10例,GA雜合8例,AA純合3例;CYP2C19*2位點(diǎn)GG純合9例,GA雜合8例,AA純合2例;CYP2C19*3位點(diǎn)GG純合18例,GA雜合1例。使用焦磷酸測(cè)序進(jìn)行驗(yàn)證,兩種方法檢測(cè)結(jié)果一致。本方法特異性好、操作簡(jiǎn)便、耗時(shí)短、成本低,可實(shí)現(xiàn)對(duì)SNP單管閉管無污染的分型檢測(cè)。

關(guān)鍵詞 實(shí)時(shí)熒光PCR; 核酸侵入反應(yīng); 單核苷酸多態(tài)性; 乙醛脫氫酶2基因; 細(xì)胞色素P450 2C19基因

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