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紫色葉用萵苣遺傳多樣性及親緣關(guān)系的TRAP分析

2015-09-12 06:13王亞楠韓瑩琰范雙喜卜
中國(guó)蔬菜 2015年3期
關(guān)鍵詞:葉用亞類萵苣

王亞楠 韓瑩琰 范雙喜卜 斌

(北京農(nóng)學(xué)院植物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,北京 102206)

紫色葉用萵苣遺傳多樣性及親緣關(guān)系的TRAP分析

王亞楠 韓瑩琰 范雙喜*卜 斌

(北京農(nóng)學(xué)院植物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,北京 102206)

利用TRAP標(biāo)記對(duì)47份紫色葉用萵苣種質(zhì)進(jìn)行親緣關(guān)系及遺傳多樣性分析。20對(duì)引物組合共擴(kuò)增出多態(tài)性條帶430條,多態(tài)性比率(PPB)為67.08%。47份紫色葉用萵苣材料的遺傳相似系數(shù)在0.706 3~0.982 8之間,Nei’s基因多樣性指數(shù)(He)和Shannon’s信息指數(shù)(I)分別為0.255 3和0.397 6,遺傳多樣性水平較低。聚類分析結(jié)果表明,47份紫色葉用萵苣材料分為2大類群,第Ⅱ類群又分為5個(gè)亞類,葉片形態(tài)相似的種質(zhì)基本上聚在一起,親緣關(guān)系較近。

紫色葉用萵苣;TRAP標(biāo)記;遺傳多樣性

葉用萵苣(Lactuca sativaL.)是菊科萵苣屬一年或二年生草本植物,在世界范圍內(nèi)廣泛種植(Kristkova et al.,2008),也是菊科植物基因組計(jì)劃(Compositae Genome Project,http://compgenomics.ucdavis.edu/)研究的一個(gè)重要物種(Truco et al.,2007)。葉用萵苣原產(chǎn)于地中海沿岸,5世紀(jì)傳入中國(guó),近年來(lái)大規(guī)模栽培,按葉色可分為綠色和紫色兩類,其中紫色葉用萵苣色澤艷麗,營(yíng)養(yǎng)成分含量較高,富含花青素,具有抗氧化、抗癌、抗心血管病、美容等保健功能(蔣先明,1999),受到育種者和消費(fèi)者的青睞。

對(duì)萵苣屬種質(zhì)資源遺傳多樣性的研究歐美國(guó)家報(bào)道較多,多種標(biāo)記方法都有應(yīng)用(Hill et al.,1996;Dilpreet et al.,2011)。Kesseli 等(1991)利用RFLP標(biāo)記對(duì)67份萵苣屬種質(zhì)資源進(jìn)行多樣性分析,否定了栽培萵苣起源于柳葉萵苣(L.saligna)與刺毛萵苣(L. virosa)雜交的假說(shuō)。van de Wiel等(1999)利用SSR標(biāo)記推斷出栽培萵苣與野萵苣(L.serriola)的親緣關(guān)系較近。Simko(2009)利用EST-SSR標(biāo)記成功區(qū)分了96份栽培萵苣的不同亞種,并且能區(qū)分開(kāi)綠色萵苣和紫色萵苣。Uwimana等(2012)利用SSR標(biāo)記分析了歐洲萵苣屬種質(zhì)資源的居群結(jié)構(gòu),根據(jù)雜交基因流向判斷出野萵苣在歐洲蔓延迅速的原因。

我國(guó)對(duì)葉用萵苣的研究主要集中在生理生化方面(范雙喜和伊東正,2002;聞婧 等,2011),關(guān)于葉用萵苣遺傳多樣性的研究較少,尤其是紫色葉用萵苣更加少見(jiàn)。李悅(2010)采用系統(tǒng)學(xué)和形態(tài)解剖學(xué)方法研究了中國(guó)萵苣屬及其近緣屬的親緣關(guān)系。劉麗娟(2008)利用SRAP標(biāo)記和形態(tài)標(biāo)記對(duì)50份萵苣材料進(jìn)行了遺傳多樣性分析,兩種聚類結(jié)果具有較好的相關(guān)性和符合度。

目標(biāo)區(qū)域擴(kuò)增多態(tài)性(target region amplified polymorphism,TRAP) 是 Hu和 Vick在 SRAP技術(shù)基礎(chǔ)上,利用EST序列設(shè)計(jì)定向引物,擴(kuò)增出與目標(biāo)基因序列相關(guān)的多態(tài)性片段的一項(xiàng)技術(shù),具有操作簡(jiǎn)單、重復(fù)性好、效率高等優(yōu)點(diǎn),在種質(zhì)資源鑒定評(píng)價(jià)、構(gòu)建遺傳圖譜、重要性狀基因標(biāo)記、輔助選擇育種與指紋分析等方面都有應(yīng)用(Hu & Vick,2003;杜曉華 等,2004;Hu et al., 2005)。

生產(chǎn)上紫色葉用萵苣的栽培和研究水平遠(yuǎn)落后于綠色葉用萵苣,而且品種類型和數(shù)量有限,品種更新緩慢。部分種質(zhì)缺乏系譜背景,來(lái)源不明,給育種工作帶來(lái)不便。同時(shí),各地頻繁引種導(dǎo)致品種混雜、退化現(xiàn)象嚴(yán)重。紫色葉用萵苣種質(zhì)資源創(chuàng)新和新基因發(fā)掘亟待解決。本試驗(yàn)首次對(duì)我國(guó)紫色葉用萵苣的遺傳多樣性進(jìn)行研究,利用TRAP標(biāo)記對(duì)47份紫色葉用萵苣種質(zhì)進(jìn)行親緣關(guān)系鑒定和種質(zhì)評(píng)價(jià),了解其遺傳背景,為深入挖掘利用種質(zhì)資源、指導(dǎo)親本選配、提高育種效率提供理論 參考。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)材料

供試47份紫色葉用萵苣材料由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所國(guó)家種質(zhì)資源中期庫(kù)、北京京研益農(nóng)科技發(fā)展中心、中蔬種業(yè)科技(北京)有限公司、河北青縣青豐種業(yè)有限公司提供,品種名稱及葉片形態(tài)特征見(jiàn)表1,來(lái)源地主要集中在北京和河北,有38份;其余的福建3份、山東2份、美國(guó)3份、日本1份。

1.2 試驗(yàn)方法

2012年2月25日溫室播種,3月28日定植于大棚,每個(gè)品種定植1個(gè)小區(qū),25株,株距40 cm,兩側(cè)設(shè)置保護(hù)行,各小區(qū)管理水平一致。依據(jù)萵苣種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)(李錫香和王海平,2006)觀測(cè)、記錄葉片性狀。

在幼苗長(zhǎng)至5~6片真葉時(shí)分別取嫩葉,液氮速凍后于-80 ℃冰箱保存。利用植物基因組提取試劑盒(北京鼎國(guó)生物技術(shù)有限公司生產(chǎn))提取DNA。采用1%瓊脂糖凝膠電泳及紫外分光光度計(jì)檢測(cè)DNA質(zhì)量和濃度,并稀釋至30~50 ng·μL-1,-20 ℃冰箱保存待用。

引 物 序 列 參 照 Li和 Quiros(2001)、Hu等 (2005)的方法進(jìn)行設(shè)計(jì),用葉片形態(tài)(葉形、葉面褶皺、葉尖、葉緣)差異較大的羅生1號(hào)、紅生1號(hào)、立生3號(hào)、大橡生1號(hào)4個(gè)品種進(jìn)行引物篩選,從60對(duì)引物中篩選出多態(tài)性明顯、條帶清晰、重復(fù)性好的20對(duì)引物組合,對(duì)47份紫色葉用萵苣種質(zhì)進(jìn)行遺傳分析。表2為試驗(yàn)所用引物序列,表3為TRAP分析所用引物組合。TRAPPCR 反應(yīng)體系(20 μL):DNA 模板 2 μL(60~100 ng·μL-1),10×PCR Buffer(Mg2+free)2 μL,Mg2+1.6 μL(2.0 mmol·L-1),dNTP 0.8 μL(0.2 mmol·L-1), 引 物 1.5 μL(0.75 μmol·L-1),Taq酶 0.2 μL(1.0 U),ddH2O 11.9 μL。PCR 擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性 5 min;94 ℃變性 45 s,35 ℃退火 45 s,72 ℃延伸 1 min,5 個(gè)循環(huán);94 ℃變性 45 s,51 ℃退火 45 s,72 ℃延伸 1 min,35 個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物用6.0%變性聚丙烯酰胺電泳分離,銀染顯帶。

1.3 數(shù)據(jù)處理

采用人工讀帶在膠片觀察燈上觀測(cè)結(jié)果,根據(jù)引物遷移率和擴(kuò)增條帶的有、無(wú)分別記為1和0,構(gòu)建二元矩陣。采用POPGEN Version 1.31軟件計(jì)算遺傳多態(tài)性數(shù)據(jù),包括多態(tài)性比率(PPB)、Nei’s基因多樣性指數(shù)(He)、Shannon’s信息指數(shù)(I)。 根 據(jù) Nei和 Li(1979) 的 方 法, 采 用NTSYS-pc 2.1軟件中的DICE法計(jì)算相似系數(shù);采用UPGMA法進(jìn)行聚類分析,生成聚類圖。

表1 供試種質(zhì)名稱、來(lái)源地、葉片形態(tài)特征及TRAP擴(kuò)增結(jié)果

表2 試驗(yàn)所用TRAP引物序列

表3 20對(duì)TRAP引物組合對(duì)47份紫色葉用萵苣材料的擴(kuò)增結(jié)果

2 結(jié)果與分析

2.1 TRAP-PCR擴(kuò)增結(jié)果

利用20對(duì)引物組合對(duì)47份紫色葉用萵苣材料進(jìn)行TRAP-PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增片段長(zhǎng)度200~1 000 bp;共擴(kuò)增出641條條帶,其中多態(tài)性條帶430條,平均每對(duì)引物獲得21.50條多態(tài)性條帶,多態(tài)性比率為67.08%;引物組合QGA7H07R-Sa12擴(kuò)增出的條帶數(shù)最多,達(dá)53條;引物組合GGB9J18R-Sa12擴(kuò)增條帶的多態(tài)性最高,多態(tài)性比率為97.06%(表3、圖1)。TRAP-PCR擴(kuò)增能檢測(cè)到特異擴(kuò)增位點(diǎn)的引物有7對(duì),占引物對(duì)總數(shù)的35.00%。豐富的多態(tài)性條帶及對(duì)品種間稀有遺傳變異的檢測(cè)能力表明,TRAP技術(shù)對(duì)供試紫色葉用萵苣種質(zhì)具有較高的鑒別能力,適合分析該物種的遺傳多樣性。

2.2 遺傳變異性分析

由表1可知,供試47份紫色葉用萵苣材料擴(kuò)增出的條帶數(shù)在353~453條之間,平均為421條;多態(tài)性條帶數(shù)在146~246條之間,平均為214條。引物擴(kuò)增結(jié)果表明(表3),47份紫色葉用萵苣材料的 Nei’s基因多樣性指數(shù)在 0.187 1~0.314 2 之間,平均為 0.255 3;Shannon’s信息指數(shù)在 0.305 1~ 0.476 1之間,平均為 0.397 6;遺傳相似系數(shù)在 0.706 3~0.982 8 之間,平均為 0.837 0。20 號(hào)紅皺羅沙與46號(hào)紫色油麥菜、27號(hào)紅生1號(hào)與46號(hào)紫色油麥菜間的遺傳相似系數(shù)最小,均為0.706 3;25號(hào)美國(guó)紫葉生菜與29號(hào)意大利紫葉生菜間的遺傳相似系數(shù)最大,為0.982 8。47份紫色葉用萵苣種質(zhì)的Nei’s基因多樣性指數(shù)和Shannon’s信息指數(shù)較低,品種間相似系數(shù)較高,說(shuō)明供試紫色葉用萵苣材料的多樣性水平較低,遺傳背景狹窄。

圖1 引物組合GGB9J18R-Sa12對(duì)47份紫色葉用萵苣材料的擴(kuò)增結(jié)果

從表1還可以看出,2號(hào)w32、3號(hào)P-B1、13號(hào)紅帆、14號(hào)P-S6、20號(hào)紅皺羅沙、35號(hào)橡葉生菜等6份材料檢測(cè)到特異性位點(diǎn),占總數(shù)的12.77%。這表明供試紫色葉用萵苣種質(zhì)雖然多樣性水平較低,但種質(zhì)間依然存在較高的遺傳分化。

2.3 聚類分析

根據(jù)DICE相似系數(shù),采用UPGMA法構(gòu)建聚類圖(圖2),在相似系數(shù)0.813處將供試47份紫色葉用萵苣材料劃分為2個(gè)類群。

第Ⅰ類群共6份種質(zhì),為42號(hào)、43號(hào)、44號(hào)、45號(hào)、46號(hào)、47號(hào),全部為油麥菜類型,葉形偏 長(zhǎng)、披針形或長(zhǎng)橢圓形,葉面褶皺少,邊緣為不規(guī)則鋸齒狀;其余41份種質(zhì)劃分為第Ⅱ類群,在相似系數(shù)0.828處進(jìn)一步細(xì)分為5個(gè)亞類。

第1亞類共17份種質(zhì),1號(hào)和2號(hào)為半結(jié)球皺葉類型;5號(hào)為半結(jié)球直立類型;21號(hào)、22號(hào)、23號(hào)、24號(hào)、25號(hào)、29號(hào)、30號(hào)、31號(hào)的親緣關(guān)系較近,形態(tài)上表現(xiàn)為:葉片提琴形或長(zhǎng)橢圓形,葉面皺或微皺,葉尖圓或鈍尖,葉緣為不規(guī)則鋸齒狀或鈍齒狀;33號(hào)、38號(hào)、39號(hào)、40號(hào)的親緣關(guān)系較近,形態(tài)上表現(xiàn)為:葉片深裂宛如橡葉、近圓形、葉面褶皺較少、葉尖為銳尖、葉緣重鋸齒狀,此亞類中的36號(hào)、37號(hào)也具有相似形態(tài),但是與這4份種質(zhì)的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

第2亞類共18份種質(zhì),全部為皺葉類型。9 號(hào)、10號(hào)、11號(hào)、12號(hào)、14號(hào)、16號(hào)、17號(hào)、18 號(hào)、19號(hào)、20號(hào)、26號(hào)的親緣關(guān)系較近,形態(tài)上表現(xiàn)為:葉面褶皺多、葉尖較圓、葉緣為重鋸齒狀或細(xì)鋸齒狀,此亞類中的13號(hào)、15號(hào)也具有相似形態(tài),但與這11份種質(zhì)的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),其中13號(hào)紅帆的親緣關(guān)系最遠(yuǎn),是美國(guó)引進(jìn)品種,表現(xiàn)出與國(guó)內(nèi)品種的差異;27號(hào)、28號(hào)與第1亞類中的21號(hào)、22號(hào)等種質(zhì)形態(tài)相似,32號(hào)、34號(hào)、41號(hào)與第1亞類中的33號(hào)、38號(hào)等種質(zhì)形態(tài)相似,但是這5份種質(zhì)卻歸為第2亞類,TRAP聚類結(jié)果與形態(tài)分類不完全相同可能是因?yàn)檫@幾份種質(zhì)的遺傳背景比較復(fù)雜,或者是TRAP所用引物擴(kuò)增區(qū)域的局限性造成的。

第3亞類包含3號(hào)和4號(hào)2份種質(zhì),都是半結(jié)球直立類型,亦都是由北京市農(nóng)林科學(xué)院蔬菜研究中心選育而成。

圖2 47份紫色葉用萵苣種質(zhì)TRAP聚類分析樹(shù)狀圖(UPGMA法)

第4亞類共3份種質(zhì),6號(hào)、7號(hào)是半結(jié)球直立類型,由北京市農(nóng)林科學(xué)院蔬菜研究中心育成;35號(hào)為皺葉類型,來(lái)自河北,其形態(tài)與7號(hào)相似,葉片倒卵形、葉面微皺、葉尖圓、葉緣呈不規(guī)則鋸齒狀。

第5亞類只有1份種質(zhì)8號(hào),為半結(jié)球直立 類型。

聚類結(jié)果顯示(圖2),13號(hào)、14號(hào)、22號(hào)、23號(hào)等4份國(guó)外引進(jìn)品種與國(guó)內(nèi)品種不存在明顯的遺傳差異,表明其有共同的遺傳基礎(chǔ);供試材料在地理來(lái)源聚類上混雜,沒(méi)有明顯的規(guī)律性,這與供試種質(zhì)的來(lái)源地主要集中在河北及北京地區(qū)有關(guān),也可能是頻繁引種使紫色葉用萵苣種質(zhì)間某些基因相互滲入,打破了種質(zhì)的地域限制。

3 結(jié)論與討論

本試驗(yàn)采用的20對(duì)TRAP引物組合在47份紫色葉用萵苣種質(zhì)間均能擴(kuò)增出條帶,平均每對(duì)引物擴(kuò)增出多態(tài)性條帶21.50條,多態(tài)性比率為67.08%,可見(jiàn)采用TRAP標(biāo)記檢測(cè)紫色葉用萵苣種質(zhì)能產(chǎn)生較多譜帶,多態(tài)性位點(diǎn)豐富,這與Hu等(2005)在萵苣屬種質(zhì)上的擴(kuò)增結(jié)果相似,證明TRAP標(biāo)記具有穩(wěn)定的重復(fù)性。劉麗娟(2008)采用SRAP標(biāo)記對(duì)萵苣屬植物擴(kuò)增得到的引物多態(tài)性條帶平均為25.58條,表明TRAP標(biāo)記對(duì)紫色葉用萵苣的遺傳分析與SRAP具有可比擬的擴(kuò)增效率和圖譜。

本試驗(yàn)采用TRAP標(biāo)記對(duì)47份紫色葉用萵苣材料的親緣關(guān)系進(jìn)行分類,將其劃分為2大類群,第Ⅱ類群又劃分為5個(gè)亞類。依據(jù)Lebeda等 (2007)的分類方法可以將紫色葉用萵苣分為脆葉結(jié)球萵苣、綿葉結(jié)球萵苣、直立萵苣、皺葉萵苣和拉丁萵苣。采用 EST-SSR(Simko,2009)、AFLP(Hill et al.,1996) 和 SAMPL(Witsenboer et al.,1997)等分子標(biāo)記方法對(duì)萵苣屬種質(zhì)資源進(jìn)行多樣性分析,聚類結(jié)果與Lebeda等(2007)的劃分結(jié)果一致。本試驗(yàn)也得到了相似的聚類結(jié)果:供試47份紫色葉用萵苣種質(zhì)含有直立萵苣和皺葉萵苣2個(gè)類型,TRAP聚類結(jié)果基本上將2個(gè)類型區(qū)分開(kāi)了,第1、2亞類主要為皺葉萵苣,第3、4、5亞類主要為直立萵苣。

紫色葉用萵苣的主要食用部位是葉片,葉片性狀是其重要的形態(tài)特征。其中皺葉萵苣類型葉形、葉褶皺、葉尖、葉緣等葉片表型性狀存在較大差異(陳青君 等,2011)。卜斌(2013)對(duì)皺葉萵苣23個(gè)形態(tài)指標(biāo)的調(diào)查結(jié)果表明,葉尖、葉形、葉緣、葉褶皺等4個(gè)指標(biāo)相似的品種親緣關(guān)系較近。本試驗(yàn)在分子水平上驗(yàn)證了這一結(jié)果,33份皺葉萵苣種質(zhì)中在這4個(gè)指標(biāo)上相似的種質(zhì)基本聚在一起,表明可以依據(jù)這4個(gè)葉片性狀對(duì)皺葉萵苣進(jìn)行 分類。

按照植物學(xué)分類紫色葉用萵苣可劃分為3個(gè)變種:皺葉萵苣(L. sativavar.crispaL.)、結(jié)球萵苣(L. sativavar.capitataL.)、直立萵苣(L. sativavar.romanaGars)(蔣先明,1999)。油麥菜近年來(lái)栽培較為普遍,它的植物學(xué)分類一直有爭(zhēng)議,林辰壹等(2005)通過(guò)比較油麥菜、萵苣、菊苣的形態(tài)特征和生長(zhǎng)特性認(rèn)為其是萵苣的一個(gè)變種;金波等(2002)則認(rèn)為油麥菜是菊苣的一個(gè)變種。本試驗(yàn)中,TRAP聚類結(jié)果顯示紫色油麥菜(42號(hào)、43 號(hào)、44號(hào)、45號(hào)、46號(hào)、47號(hào))被劃為第Ⅰ類群,與直立萵苣親緣關(guān)系較近,與散葉萵苣親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。由于供試材料覆蓋萵苣變種類型不全面,油麥菜及直立萵苣品種較少,不能確定油麥菜屬于萵苣的哪個(gè)變種,需要進(jìn)一步探討。

本試驗(yàn)結(jié)果表明,供試紫色葉用萵苣種質(zhì)間差異較小,遺傳基礎(chǔ)狹窄,種質(zhì)間的遺傳相似系數(shù)總體偏高,變異范圍在 0.706 3~0.982 8 之間,Nei’s基因多樣性指數(shù)平均為0.255 3,Shannon’s信息指數(shù)平均只有0.397 6。Kesseli等(1991)認(rèn)為由于多系起源及復(fù)雜的馴化過(guò)程使萵苣具有豐富的形態(tài)和較高的遺傳多樣性;董潔等(2009)的研究表明紫色散葉萵苣主要數(shù)量性狀變異范圍大,蘊(yùn)藏著很大的選擇潛力。本試驗(yàn)結(jié)果與這兩者有所不同,可能是因?yàn)楣┰囎仙~用萵苣種質(zhì)類型單一,多為散葉類型,而葉用萵苣的變異主要發(fā)生在不同類型間,同一類型種質(zhì)間親緣關(guān)系較近,遺傳多樣性低。造成這種現(xiàn)象的原因一方面是紫色葉用萵苣是自花授粉植物,長(zhǎng)期自交繁育使群體內(nèi)基因逐漸純和,遺傳變異減少;另一方面可能是優(yōu)良品種的循環(huán)利用,在商業(yè)化育種中優(yōu)良種質(zhì)資源或相關(guān)基因被反復(fù)循環(huán)利用是常見(jiàn)的,在相近的種質(zhì)基因庫(kù)范圍內(nèi)育種,導(dǎo)致遺傳多樣性的降低,反映在形態(tài)特征上為表型相近。棉花、六倍體大麥等作物由于優(yōu)良種質(zhì)的循環(huán)利用也表現(xiàn)出遺傳多樣性降低(Bowman et al.,1996;van Esbroeck et al.,1998;Mikel,2013)。

遺傳多樣性低這一結(jié)果也反映了我國(guó)紫色葉用萵苣的育種現(xiàn)狀,目前在國(guó)內(nèi)生產(chǎn)中占較大份額的是綠色結(jié)球萵苣,紫色葉用萵苣雖然逐漸受到重視,但育種基礎(chǔ)薄弱。此外,中國(guó)不是葉用萵苣的起源中心,品種多為國(guó)外引進(jìn),后來(lái)選育的品種也多為進(jìn)口品種的衍生后代,自主育成的紫色葉用萵苣品種很少。同時(shí),由于頻繁引種,紫色葉用萵苣存在同物異名或同名異物現(xiàn)象,如25號(hào)美國(guó)紫葉生菜與29號(hào)意大利紫葉生菜兩個(gè)品種來(lái)自不同的種子公司,但遺傳相似系數(shù)為0.982 8,很可能是同物異名。在今后的育種工作中應(yīng)充分挖掘、利用含有特異等位基因的品種,選擇遺傳差異大、親緣關(guān)系遠(yuǎn)的品種為雜交親本,逐漸豐富、擴(kuò)寬紫色葉用萵苣的遺傳基礎(chǔ),提高育種效率。

卜斌.2013.葉用萵苣種質(zhì)資源形態(tài)標(biāo)記聚類分析〔碩士論文〕.北京:北京農(nóng)學(xué)院.

陳青君,韓瑩琰,谷建田,范雙喜.2011.葉用萵苣種質(zhì)資源的主要農(nóng)藝性狀鑒定與耐熱性評(píng)價(jià).中國(guó)蔬菜,(20):20-27.

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Analysis of Genetic Diversity and Relationship in Purple Lettuce by TRAP Technique

WANG Ya-nan,HAN Ying-yan,F(xiàn)AN Shuang-xi*,BU Bin

(DepartmentofPlantScienceandTechnology,BeijingAgriculturalCollege,Beijing102206,China)

TRAP technique was used to analyze the genetic diversity and relationship of 47 purple lettuce(Lactuca sativaL. ) species.20 pairs of TRAP primers amplified polymorphic bands were 430,and the polymorphic rate was 67.08%.The genetic similarity coefficient was 0.706 3-0.982 8.The average Nei’s gene diversity index and Shannon’s information index were 0.255 3 and 0.397 6,respectively,indicating that the low degree of genetic diversity in purple lettuce.The cluster analysis divided these 47 species into 2 major groups,and the Ⅱ group could be devided into 5 subgroups.The species with similar leaf morphology were clustered together,they had closer genetic relationship.

Purple lettuce;TRAP marker;Genetic diversity

王亞楠,女,碩士研究生,專業(yè)方向:葉用萵苣種質(zhì)資源與分子標(biāo)記應(yīng)用,E-mail:wynxueshu369@163.com

*通訊作者(Corresponding author):范雙喜,男,教授,博士生導(dǎo)師,專業(yè)方向:蔬菜生理與分子機(jī)理,E-mail:fsx20@163.com

2014-02-25;接受日期:2014-04-21

國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31372057),現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系北京市葉類蔬菜創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)建設(shè)專項(xiàng)(blvt-02),北京市科技新星計(jì)劃項(xiàng)目(2010B020)

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