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淺談基因工程中獲取目的基因的幾種方法

2015-10-23 16:31:36于麗麗
文理導(dǎo)航 2015年30期
關(guān)鍵詞:基因克隆方法

【摘 要】依據(jù)基因工程的實(shí)際特點(diǎn),分別對(duì)獲得目的DNA的反向PCR、反轉(zhuǎn)錄PCR和錨定PCR等幾個(gè)常用的基因克隆方法進(jìn)行了對(duì)應(yīng)的介紹和分析。

【關(guān)鍵詞】反向PCR;反轉(zhuǎn)錄PCR;錨定PCR;基因克隆;方法

據(jù)實(shí)踐可知,實(shí)施基因工程的程序,首先是要取得目的DNA的片段,這是前期必要的步驟。因此,怎么去圓滿地完成這一過(guò)程,就成為了基因工程中的首要因素。單從目的DNA的提供方式而言,其只有分離天然動(dòng)植物DNA及人造DNA兩種方式。而就獲得目的基因的方法而言,其基本上有PCR、化學(xué)合成、cDNA和設(shè)置基因文庫(kù)的方式進(jìn)行優(yōu)選等幾種類型。

1.何謂基因工程的PCR

在一九八五年,美國(guó)相關(guān)公司的數(shù)名專家首先設(shè)置了快速?gòu)?fù)制增加特性DNA片段的工藝技術(shù),具體的化學(xué)名稱叫做聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),其英文縮寫(xiě)即為PCR?;蚓酆厦钙鸪跏窃谝痪盼逦迥瓯话l(fā)現(xiàn)的,而富含較高實(shí)用價(jià)值的聚合酶是在七十年代初期才被發(fā)現(xiàn)的。然而,因?yàn)榇司酆厦覆痪哂心透邷匦阅?,其在高溫的情況下就會(huì)發(fā)生較大的性能改變,所以,不適合高溫的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)?,F(xiàn)時(shí)被廣為使用的一種聚合酶,是在一九七六年取自于溫泉水里的一種細(xì)菌。它是具有相當(dāng)耐高溫性能且極為完好的一種酶。初始的PCR概念基本是指基因的修復(fù)和復(fù)制,它具有單一和短暫的性能缺陷。從一九八三年開(kāi)始,PE公司就率先應(yīng)用了新的PCR。

因?yàn)镻CR屬于一類體外快速增加指定DNA或其序列的功能系統(tǒng),所以還可以取名為DNA的體外擴(kuò)增法。在當(dāng)今PCR工藝已經(jīng)是人類獲取外部基因的一個(gè)最佳手段,只要掌握了目的DNA的核苷酸排序,人們即能夠擬定出一段引物,采取PCR工藝,在試管內(nèi)設(shè)置反應(yīng)過(guò)程,經(jīng)歷若干小時(shí)以后,即可以把相當(dāng)小量的目的DNA或指定的基因片段增加數(shù)十萬(wàn)倍。甚至達(dá)到百萬(wàn)倍。

2.PCR工藝過(guò)程機(jī)理

由于PCR工藝是一項(xiàng)體外復(fù)制特定基因片段的生物技術(shù),所以,其與基因分子的體內(nèi)復(fù)制過(guò)程有若干相似的情況,同時(shí)也存在著不少的相異地方。細(xì)胞里基因的復(fù)制過(guò)程是首先把雙鏈DNA分解螺旋變成單鏈DNA。爾后,RNA引物與單鏈DNA模板結(jié)好對(duì),在有四種核苷酸底物的前提下,基因聚合酶與RNA引物的3端依據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)的規(guī)則組合成具有互補(bǔ)性的基因鏈。經(jīng)過(guò)一個(gè)復(fù)制過(guò)程后,單個(gè)基因分子變成了雙個(gè)基因分子。PCR就是代表試管里進(jìn)行的基因復(fù)制經(jīng)歷,其余體內(nèi)基因復(fù)制模式相同,都要具備單鏈模板、引物、四種核苷酸底物、基因聚合酶,復(fù)制后達(dá)到相同的效果。其區(qū)別就是PCR所使用的引物是單鏈的基因引物,其聚合酶是屬于耐高溫性能的。在試管中所作的整個(gè)復(fù)制過(guò)程分三個(gè)過(guò)程:第一步是變性過(guò)程,其為PCR反應(yīng)的第一階段,也就是把模板基因放置在九十五攝氏度左右的高溫之中,將雙鏈基因轉(zhuǎn)變成單鏈基因;第二步即為退火過(guò)程,也就是把反應(yīng)溫度下調(diào)到五十?dāng)z氏度左右,促使一隊(duì)引物先后與變性后的兩個(gè)模板實(shí)施配對(duì);第三步為延伸過(guò)程,即把反應(yīng)溫度設(shè)置在聚合酶反應(yīng)的最佳溫度七十二攝氏度,爾后,用目的基因做模板合成新的基因鏈。因?yàn)槠渌镁酆厦傅哪透邷仄焚|(zhì),在每個(gè)復(fù)制階段完成后,無(wú)需增加任一別的反應(yīng)組分即能夠重新開(kāi)始下一階段的復(fù)制。

3.PCR方法的基因復(fù)制

采用PCR復(fù)制DNA片段系基因工程的一項(xiàng)重要手段。

3.1依托反向PCR復(fù)制目的基因片段

由基因組依托PCR復(fù)制基因片段過(guò)程的重要一環(huán)是引物的擬定,通常能夠依據(jù)業(yè)已公布的基因排列擬定引物,也可以憑借原有的相關(guān)基因序列擬定引物。若要依據(jù)cDNA排列擬定引物增加基因數(shù)目,擬定引物時(shí),必須顧及到cDNA基因沒(méi)有內(nèi)含子,而gDNA存在內(nèi)含子,擬定引物時(shí),不能夠置于外顯子的拼接點(diǎn)上。擬定引物時(shí),一般可以在引物的末端設(shè)置一個(gè)酶切位點(diǎn),從而促進(jìn)基因片段與載體的連接。

反向PCR系一類依托原有系列增加其旁側(cè)序列的模式,憑借此方法,能夠?qū)嵤┤旧w步移。其開(kāi)始的步驟,是把基因組DNA依靠限制性的內(nèi)切酶給予切割開(kāi)來(lái),莎草用的限制酶必須在原有序列中不存在切點(diǎn),而后再依托連接酶把酶切片段連接起來(lái),與此類產(chǎn)物中,其含有原來(lái)序列的環(huán)形基因會(huì)得到大幅度增加。由此獲取原來(lái)基因片段的旁側(cè)序列。

3.2 cDNA的制備及cDNA文庫(kù)的建立

cDNA的制備可以采用RT-PCR方法。亦被稱作反轉(zhuǎn)錄PCR。其屬于一類酶促進(jìn)制備方法,就是用mDNA做模板,依靠反轉(zhuǎn)錄酶的作用,用四種脫氧核甘三磷酸為反應(yīng)物成分制備DNA,再通過(guò)復(fù)制以后就可得到雙鏈的基因。

3.3錨定PCR過(guò)程及基因的復(fù)制

經(jīng)過(guò)RT-PCR過(guò)程獲取的大規(guī)模雙鏈cDNA以后,欲要精選分離出所需的特定目的基因,若不用cDNA文庫(kù)篩選時(shí),尚可運(yùn)用錨定PCR的方法將其收獲。此種措施的特點(diǎn),是憑借原已存在的一中特異性的引物來(lái)實(shí)現(xiàn),其尤其適合于擴(kuò)增那些緊掌握一段序列形態(tài)的目的基因,比如一端序列已經(jīng)知道,而另一段序列未知的基因片段,能夠依托基因末端轉(zhuǎn)移酶將cDNA第一個(gè)末端添上一端多聚dG尾巴,爾后添加一個(gè)末端屬于多聚dC的特異引物,由此決定了擴(kuò)增的特性。錨定PCR是研究遺傳學(xué)及醫(yī)學(xué)的有效方法。

小結(jié)

通過(guò)上述介紹和分析,我們基本掌握了獲取目的基因的來(lái)源和幾種相當(dāng)實(shí)用的基因克隆方法,這幾種很常用的方法,它們都有各自的特性和優(yōu)點(diǎn),我們?cè)趯?shí)際基因工程研究中,還要不斷的總結(jié)、完善并加以創(chuàng)新,促使其能夠更好地為我們?nèi)祟惖倪z傳、醫(yī)學(xué)等相關(guān)行業(yè)服務(wù)。

【參考文獻(xiàn)】

[1]趙煥英,包金風(fēng).實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)的原理及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J].中國(guó)組織化學(xué)與細(xì)胞化學(xué)雜志,2007.16(4):492-497

[2]董明,宮月華,王蘭等.DNA提取的應(yīng)用與相關(guān)技術(shù)分析[J].遺傳,2003.25(2):205-207

[3]郭燕霞,劉開(kāi)會(huì),邱寧等.6種特殊生物檢材的DNA提取[J].刑事技術(shù),2002.5:52-53

【作者簡(jiǎn)介】

于麗麗(1981.12-),籍貫:吉林省梨樹(shù)縣;單位:公主嶺實(shí)驗(yàn)中學(xué)。

(作者單位:公主嶺實(shí)驗(yàn)中學(xué))

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