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·醫(yī)學(xué)動(dòng)態(tài)·
科學(xué)家深挖表觀遺傳組鑒別出引發(fā)髓母細(xì)胞瘤的關(guān)鍵原因
近日,來自圣猶大兒童研究醫(yī)院的研究人員通過研究鑒別出了引發(fā)腦部腫瘤亞型4組髓母細(xì)胞瘤的細(xì)胞,該研究或?yàn)殚_發(fā)新型靶向療法抵御常見腦部腫瘤提供一定幫助和希望。
研究人員利用分析工具Chip-Seq,基于表觀遺傳調(diào)節(jié)子的活性鑒別并且追蹤了不同亞型髓母細(xì)胞瘤的差異性,這些表觀遺傳調(diào)節(jié)子包括一些已知的主要調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子,其可以結(jié)合名為增強(qiáng)子及超級增強(qiáng)子的DNA序列,這種主要的調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子和超級增強(qiáng)子可以聯(lián)合作用來調(diào)節(jié)關(guān)鍵基因的表達(dá),比如負(fù)責(zé)細(xì)胞身份的基因等。
研究者使用的工具對28種髓母細(xì)胞瘤腫瘤中超過3 000種超級增強(qiáng)子進(jìn)行了鑒別,同時(shí)他們還根據(jù)不同腫瘤亞型鑒別出了超級增強(qiáng)子的活性,這些超級增強(qiáng)子可以開啟一些癌癥基因,包括ALK、MYC、SMO和OTX2基因等,這些基因都和髓母細(xì)胞瘤直接相關(guān)。研究者發(fā)現(xiàn),Lmx1A或許是4型髓母細(xì)胞瘤亞型的主要轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)子,Lmx1A被認(rèn)為在小腦等結(jié)構(gòu)中扮演著重要角色,研究者表示,這項(xiàng)研究是對單一癌癥亞型進(jìn)行的大型表觀遺傳學(xué)研究,更重要的是他們首次對原始的病人腫瘤組織進(jìn)行了大型的隊(duì)列梯度研究,此前研究中因?yàn)檠芯繉ο髢H限于細(xì)胞系,所以他們僅能對腫瘤的表觀遺傳組進(jìn)行研究,而研究中對髓母細(xì)胞瘤亞型進(jìn)行單獨(dú)的研究或許為后期闡明疾病發(fā)生機(jī)制,以及開發(fā)特殊的個(gè)體化療法提供新的基礎(chǔ)和思路。