蔡俁林,周云,龔亮
(1.湖南省益陽市箴言中學(xué),湖南益陽 413058)
(2.湖南工業(yè)大學(xué)生命科學(xué)與化學(xué)學(xué)院,湖南株洲 412000)
納米火焰探針檢測腫瘤耐藥性相關(guān)mRNA
蔡俁林1,周云1,龔亮2*
(1.湖南省益陽市箴言中學(xué),湖南益陽 413058)
(2.湖南工業(yè)大學(xué)生命科學(xué)與化學(xué)學(xué)院,湖南株洲 412000)
信使RNA(mRNA)是由DNA經(jīng)由轉(zhuǎn)錄而來,帶著相應(yīng)的遺傳訊息,為下一步轉(zhuǎn)譯成蛋白質(zhì)提供所需的訊息。檢測mRNA的表達,了解其功能在腫瘤研究中具有重要意義。納米火焰探針,作為一種具有良好穩(wěn)定性和特異性的金納米粒子-DNA納米復(fù)合物,能有效對腫瘤mRNA進行檢測成像。該文構(gòu)建的納米火焰探針能很好地實現(xiàn)對耐藥性基因的檢測。
信使RNA;耐藥性基因;納米火焰探針
信使RNA(mRNA)是由DNA經(jīng)轉(zhuǎn)錄而來,與DNA序列互補的核糖核苷酸序列。細胞核的DNA將遺傳信息傳遞給mRNA,經(jīng)由mRNA傳遞到細胞質(zhì),再通過細胞質(zhì)中的各種細胞器識別mRNA中的信息,同時合成蛋白質(zhì)。
癌細胞耐藥性的產(chǎn)生是導(dǎo)致腫瘤化療失敗的重要因素之一,耐藥性基因MRP1過度表達與腫瘤細胞產(chǎn)生耐藥性密切相關(guān)。檢測MRP1 mRNA的表達量有助于臨床預(yù)測及指導(dǎo)用藥,進一步了解并探討腫瘤細胞的耐藥機制[1]。
納米火焰探針是一種金納米粒子-DNA的納米復(fù)合物,文獻報道此類探針可以有效實現(xiàn)腫瘤mRNA的檢測成像[2-3],且具有良好的特異性和穩(wěn)定性。因此,該實驗設(shè)計用納米火焰探針檢測MRP1 mRNA,為檢測耐藥性相關(guān)mRNA提供一種簡單、快速、準(zhǔn)確的方法。
1.1 膠體金溶液的合成
化學(xué)合成的金納米粒子尺寸不一,直徑從幾個納米到幾百個納米都可以合成。在典型的合成過程中,金的化合物首先被還原劑還原成金原子,并進一步聚集形成金納米粒子,同時穩(wěn)定劑會吸附或者化學(xué)結(jié)合到金納米粒子表面。由于穩(wěn)定劑通常是帶電荷的,當(dāng)修飾到納米粒子表面之后,帶電荷的納米粒子會相互排斥,從而形成穩(wěn)定的膠體。
1.2 膠體金修飾DNA
硫醇、硫醚或二硫醚衍生物中的S原子與Au表面的強烈相互作用遵循軟硬酸堿作用原理,Au-S鍵極易自發(fā)形成并釋放熱量。通過在DNA末端修飾巰基,利用Au-S鍵,可以直接將DNA組裝與金表面。
1.3 對mRNA的檢測
通過將兩條互補配對的DNA鏈組裝在金納米顆粒表面,一條為特異性識別mRNA的序列,另一條為互補的短鏈DNA并修飾熒光染料,在沒有靶分子存在時,染料的熒光可以被金納米粒子淬滅,當(dāng)遇到DNA或RNA的靶分子時,識別序列與靶分子通過競爭雜交,短鏈DNA被釋放,熒光恢復(fù)。因此可以用于檢測mRNA(圖1)。
2.1 儀器
三頸燒瓶;油浴鍋;島津UV-2450型紫外分光光度計;FluoroMax-4熒光分光光度計。
2.2 試劑
檸檬酸三鈉(>99.0%);四氯金酸(99.99%); 0.1 mol/L NaCl緩沖溶液(0.01 mol/L Tris-Acetate, pH=7.0);其中氯化鈉為分子生物級純度;所有溶液均采用三次蒸餾的去離子水配制。經(jīng)HPLC純化后的巰基修飾寡核苷酸:(DNA序列)(生工生物工程(上海)股份有限公司)
圖1 納米火焰探針檢測腫瘤耐藥性相關(guān)mRNAFig.1Schematic illustration of multidrug resistance associated mRNA detection using nano-flares
納米金標(biāo)記長鏈:5’-SH-AAAAA TGC TGT TCG TGC CCC CGC CG-FAM-3’
納米金標(biāo)記短鏈DNA:5’-GCA CGA ACA GCAT–Cy3-3’
MDR1 mRNA:5'-CGG CGG GGG CAC GAA CAG CA-3'
3.1 金納米顆粒的合成
金溶膠由HAuCl4經(jīng)檸檬酸三鈉溶液還原而成[4-5]。具體步驟如下。將合成過程中所有玻璃器皿用王水浸泡3 h,再用超純水涮洗3遍,放入70℃烘箱烘干備用。取2.2×10-2mol/L氯金酸與25 mL超純水至三頸燒瓶中100℃油浴加熱至沸騰,加入0.8 mL 2.5×10-2mol/L檸檬酸三鈉溶液,反應(yīng)30 min后自然冷卻至室溫,掃描紫外可見光譜表征后置于4℃冰箱保存。
3.2 金顆粒表面修飾DNA
將巰基修飾的環(huán)狀寡核苷酸序列用100 mmol/L TCEP活化,使DNA末端巰基形成的分子間二硫鍵切斷,然后與金納米粒進行連接反應(yīng),二者加入的量為100∶1(摩爾比)。避光反應(yīng)12 h后,將200 μL 2 mol/L NaCl分多次加入上述溶液內(nèi)進行鹽老化。最后通過13000 r/min,10 min離心作用收集沉淀,沉淀復(fù)溶后得到穩(wěn)定的DNA修飾的金納米顆粒溶液。用紫外分光光度計對其進行表征。
3.3 計算金納米顆粒表面標(biāo)記DNA的數(shù)量
因為納米金具有熒光猝滅的效果,因此可以通過熒光的變化來計算金納米顆粒表面標(biāo)記的DNA的數(shù)量。為了計算金納米顆粒上標(biāo)記DNA的數(shù)量,首先將未與金納米顆粒孵育的兩條DNA鏈根據(jù)不同的濃度進行熒光測定,繪制出標(biāo)準(zhǔn)曲線。同時,收集DNA與金納米顆粒反應(yīng)離心后的上清液,測定其熒光強度,通過計算上清液的熒光值與未與金顆粒反應(yīng)對應(yīng)DNA的熒光值之間的差值,計算出每個納米金表面修飾DNA的數(shù)量。
3.4 檢測熒光恢復(fù)測定MRP1 mRNA濃度
當(dāng)溶液中的MRP1 mRNA與納米金上標(biāo)記的長鏈雜交后,釋放出一端標(biāo)記熒光團的短鏈DNA,該游離短鏈DNA的熒光得以恢復(fù)。基于此理論基礎(chǔ),通過熒光分光光度計定量測定雜交后的熒光信號強度值。
實驗在緩沖溶液DPBS中進行。首先將標(biāo)記長鏈的納米金與標(biāo)記熒光團的短鏈DNA在75℃下雜交反應(yīng)10 min,待溫度緩慢降至室溫后,離心除去未雜交的短鏈。隨后加入不同濃度的MRP1 mRNA,室溫下反應(yīng)1 h后,測定溶液的熒光光譜。
如圖2所示,黑色的線為未標(biāo)記DNA的金納米顆粒,其在518 nm處有其紫外的特征吸收峰,并且根據(jù)吸收峰的峰值可以計算出金納米顆粒的濃度。紅色的線為標(biāo)記DNA的金納米顆粒,在522 nm處有其紫外的特征吸收峰,相對于未標(biāo)記DNA的顆粒,有4 nm左右的紅移,并且在260 nm處有個DNA的特征吸收峰,表明DNA已經(jīng)成功修飾在金納米顆粒表面。
根據(jù)測定不同濃度的DNA樣品的熒光值(圖3A),并將其濃度與熒光之間的關(guān)系進行線性擬合,得到了線性方程:y=56359+634405x(圖3B),其中x代表濃度,y為熒光強度。通過測定上清液中DNA的熒光值可以得到上清液中DNA的濃度,根據(jù)加入的DNA濃度之間的差值以及金納米顆粒的濃度,就可以計算出每個顆粒上標(biāo)記的DNA的數(shù)量。在這個實驗中,根據(jù)計算,每個金納米顆粒上標(biāo)記了約70條DNA。
圖3 (A)不同濃度的DNA以及上清液樣品的熒光值測定;(B)DNA濃度與其對應(yīng)熒光值的校正曲線Fig.3(A)Fluorescence spectra of different concentration DNA and supernatant(brown);(B)Calibration curve of fluorescence value and corresponding DNA concentration
圖2 金納米顆粒與修飾了DNA的金納米顆粒的紫外表征圖Fig.2UV absorbance spectrum of gold nanoparticle and DNA modified gold nanoparticle
在緩沖溶液中對不同濃度的MRP1 mRNA進行了測定,如圖4A為在加入不同濃度的MRP1 mRNA得到的熒光發(fā)射光譜。由圖可以看出,隨著加入的MRP1 mRNA濃度增加,熒光強度也隨之升高。圖4B為探針的校正曲線,其動力學(xué)響應(yīng)范圍為200 nmol/L~2 μmol/L,檢測下限為70 nmol/L。
該文成功將DNA修飾在金納米顆粒上,成功構(gòu)建了納米火焰探針,并且利用熒光的方法實現(xiàn)了對癌細胞內(nèi)耐藥性基因MRP1 mRMA的檢測。通過對各方面的分析,都表明在金納米顆粒表面修飾上了足夠多的DNA序列。而且修飾后的納米火焰探針能夠很好地實現(xiàn)對一定范圍內(nèi)的耐藥性基因MRP1 mRNA的線性響應(yīng)。因此該方法具有癌癥相關(guān)基因的mRNA檢測具有潛在的應(yīng)用價值。
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Nano-flares for detection of multidrug resistance associated mRNA
Cai Yu-lin1,Zhou Yun1,Gong Liang2*
(1.Yiyang Zhenyan School,Yiyang 413058,China)(2.College of Life Sciences and Chemistry,Hunan University of Technology,Zhuzhou 412000,China)
Messenger RNA(mRNA)is a large family of RNA molecules that convey genetic information from DNA to the ribosome.Detection of mRNA expression and investigation of their function have great impact on cancer research.Nano-flares,a novel gold nanoparticle-DNA complex exhibits great stability and specificity in detection and imaging cancer related mRNA.In this paper,we utilize nano-flares to detect mRNA associated with multidrug resistance.
mRNA;multidrug resistance gene;nano-flares
生化分析與生物傳感;國家自然科學(xué)基金(21325520)
*通信聯(lián)系人,E-mail:gl569940808@126.com