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管氏腫腿蜂感染W(wǎng)olbachia的分子檢測

2016-06-04 03:14黃鏡梅劉乃勇許小露李麗芳朱家穎西南林業(yè)大學林學院云南省森林災害預警與控制重點實驗室云南昆明650224
西南林業(yè)大學學報 2016年3期
關(guān)鍵詞:序列分析

黃鏡梅 劉乃勇 許小露 李麗芳 楊 斌 朱家穎(西南林業(yè)大學林學院云南省森林災害預警與控制重點實驗室,云南昆明 650224)

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管氏腫腿蜂感染W(wǎng)olbachia的分子檢測

黃鏡梅 劉乃勇 許小露 李麗芳 楊 斌 朱家穎
(西南林業(yè)大學林學院云南省森林災害預警與控制重點實驗室,云南昆明 650224)

摘要:Wolbachia是一類在節(jié)肢動物中廣泛感染的胞內(nèi)共生菌,為了解Wolbachia在管氏腫腿蜂體內(nèi)的感染情況,采用Wolbachia的通用引物、A大組特異性引物和B大組特異性引物對管氏腫腿蜂體內(nèi)Wolbachia的wsp基因進行PCR擴增及序列測定,所獲得的基因片段分別命名為wSgu、wSguA和wSguB,長度分別為620、572 bp和463 bp?;蛐蛄蟹治霰砻鱳Sgu與wSguB序列間堿基差異較大,同源性僅為60%。系統(tǒng)發(fā)育分析表明該寄生蜂感染了A大組的Wolbachia,但對于該寄生蜂是否也感染了B大組的Wolbachia尚待確定。

關(guān)鍵詞:管氏腫腿蜂;Wolbachia;wsp基因;PCR;序列分析

Wolbachia(沃爾巴克氏體)是一種廣泛存在于節(jié)肢動物中的細胞內(nèi)共生菌,屬于細菌門,變形桿菌α亞門的立克次氏體,為革蘭氏陰性細菌。據(jù)統(tǒng)計,昆蟲中Wolbachia的感染率已經(jīng)達到70%以上[1]。Wolbachia是通過母系細胞質(zhì)遺傳,在寄主中能產(chǎn)生多種生殖調(diào)控行為來保證其在寄主中穩(wěn)定遺傳[2]。目前,對生物體內(nèi)Wolbachia的檢測,主要利用其l6S rDNA、ftsZ和wsp等進行PCR擴增與序列分析[3-6]。由于Wolbachia的wsp基因相對于其他基因進化最快,且在GenBank中登錄的基因量也越來越多,因而該基因被廣泛運用于Wolbachia的感染檢測[5-6]。根據(jù)分子系統(tǒng)發(fā)生,將Wolbachia劃分為11個超群(supergroup A-K);又根據(jù)wsp基因序列,將主要感染昆蟲等的Wolbachia A大組和B大組進一步分為12個亞組[7]。

管氏腫腿蜂(Scleroderma guani)屬膜翅目腫腿蜂科(Hymenoptera:Bethylidae),分布廣泛,是許多鉆蛀性害蟲幼蟲和蛹的體外寄生蜂,被較為廣泛的應用于林間防治天牛、小蠹蟲等鉆蛀性害蟲。關(guān)于該寄生蜂的生物學特性等方面均已取得顯著的進展[8]。然而,關(guān)于管氏腫腿蜂Wolbachia的感染檢測仍未有報道。為此,本研究對管氏腫腿蜂體內(nèi)Wolbachia的wsp基因進行PCR檢測,并對其wsp基因序列進行系統(tǒng)進化分析,進而了解Wolbachia在該寄生蜂內(nèi)的感染情況,旨在為今后進一步研究Wolbachia對該寄生蜂生殖方式的影響和將管氏腫腿蜂更好地應用于鉆蛀害蟲的生物防治奠定基礎。

1 材料與方法

1.1供試昆蟲源

試驗中所用管氏腫腿蜂由黃粉甲蛹在實驗室內(nèi)進行繼代飼養(yǎng),取成蜂保存于-70℃?zhèn)溆谩?/p>

1.2基因組DNA提取

采用改良的蛋白酶K法,具體方法如下:1)取5頭用超純水洗滌過的管氏腫腿蜂放在裝有200 μL裂解液(100 mmol Tris-HC1,25 mmol EDTA,500 mmol NaCl,1%SDS,pH 8.0)的1.5 mL離心管中研磨,然后用300 μL裂解液沖洗研磨棒;2)加蛋白酶K至終濃度為100 μg/ mL,50℃水浴4 h;3)加入等體積的酚-氯仿-異戊醇(25∶24∶1),離心(14 000 r/ min,5 min),用氯仿-異戊醇(24∶1)重復抽提1次;4)轉(zhuǎn)移上清至潔凈的1.5 mL離心管中,加入1 mL預冷的無水乙醇,離心(14 000 r/ min,10 min),用75%乙醇洗滌沉淀,充分干燥后用0.5×TE溶解沉淀,4℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3Wilbachia的wsp基因片段PCR擴增

wsp基因片段的PCR擴增參照Zhou等[7]的方法,采用wsp基因的通用引物為81F/691R、A大組特異性引物為136F/691R和B大組特異性引物為81F/522R,3對引物所用擴增體系和PCR反應程序相同,PCR反應體系(50 μL)為:正向引物和反向引物各(10 μmol/ L)為1.25 μL,DNA模板為2.5 μL,10×PCR buffer為5 μL,dNTP(10 mmol/ L)為1.25 μL,Taq polymerase(Promega)為0.5 μL,MgCl2(25 μmol/ L)為3.75 μL,用ddH2O補足體積。PCR程序為:94℃預變性4 min;94℃變性1 min,48℃退火1 min,72℃延伸1 min,35個循環(huán);72℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳分析,紫外燈下檢測拍照。

1.4克隆和測序

PCR擴增反應結(jié)束后,按照Axygen凝膠回收試劑盒將PCR產(chǎn)物純化后,連接至pMD-18T載體上,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞中,涂平板后通過藍白斑篩選及菌液PCR檢測陽性重組克隆。最后菌液送至南京金斯瑞公司進行測序驗證。

1.5序列分析

用NCBI網(wǎng)站上的BLAST工具進行Wolbachia的wsp基因序列檢索和同源性比較,ClustalX1.83軟件[9]對所測得的結(jié)果以及GenBank中已登陸的其他相關(guān)物種的wsp基因序列進行比對后,用MEGA 4.0中的鄰接法(neighbor-joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,并用1 000次自導復制來評價各分支的置信度[10]。

2 結(jié)果與分析

2.1wsp基因的PCR檢測

以管氏腫腿蜂基因組DNA為模板,利用wsp基因的通用引物、A大組特異性引物和B大組特異性引物均擴增出了wsp基因的目的片段(圖1),說明其感染了Wolbachia。根據(jù)所用引物不同,將通過通用引物獲得的基因片段命名為wSgu,A和B大組特異引物獲得的基因片段分別命名為wSguA 和wSugB。

圖1 管氏腫腿蜂體內(nèi)Wilbachia的wsp基因的PCR擴增電泳圖Fig.1 Electrophorogram of PCR amplification of wsp genes of Wolbachia in Scleroderma guani

2.2wsp基因片段的序列測定及分析

含目的基因的重組質(zhì)粒經(jīng)測序驗證后發(fā)現(xiàn),當使用81F和691R通用引物時,擴增獲得的wSgu基因片段長度為620 bp;采用A大組特異性引物136F和691R擴增獲得的wSguA基因片段長度為572 bp;采用B大組特異性引物81F和522R擴增獲得的wSguB基因片段長度為463 bp。對測序獲得的序列分析結(jié)果表明,wSguA序列不正確,因而不進行后續(xù)分析,而wSgu和wSguB基因片段已經(jīng)提交GenBank(登錄號分別為KX001811和KX001812)?;蛐蛄斜葘Y(jié)果表明,wSgu與wSguB序列間堿基差異較大,同源性僅為60%(圖2)。

圖2 管氏腫腿蜂體內(nèi)Wilbachia的wsp基因序列比較Fig.2 Comparisons of wsp gene sequences of Wolbachia in Scleroderma guani

在NCBI網(wǎng)站上進行BLAST發(fā)現(xiàn)(相關(guān)序列見表1),wSgu和wSguB與A大組序列的一致性高達87%,因此采用B大組特異性引物獲得的片段并非來自B大組Wolbachia。系統(tǒng)發(fā)育分析進一步表明,wSgu和wSguB同時聚到A大組,說明該寄生蜂感染了A大組的Wolbachia(圖3)。但由于wSguA序列不對,對于該寄生蜂是否也感染了B大組的Wolbachia有待進一步研究。

表1 GenBank中其他相關(guān)物種的wsp基因序列Table 1 Wsp gene sequences of other related species in GenBank

圖3 Wilbachia的wsp基因序列NJ樹Fig.3 Neighbor-joining tree of Wolbachia based on the wsp sequences

3 結(jié)論與討論

據(jù)報道Wolbachia在許多昆蟲體內(nèi)均有感染,是節(jié)肢動物體內(nèi)最為豐富的共生微生物之一[11-12]。本試驗采用了wsp基因的通用引物、A大組特異性引物和B大組特異性引物,對管氏腫腿蜂體內(nèi)Wolbachia感染情況進行檢測,從PCR擴增結(jié)果得知,該寄生蜂已經(jīng)感染了Wolbachia。另外,雖然獲得了相應的基因片段,但是序列分析表明,wSgu 與wSguB序列間核苷酸同源性較低(60%),這很可能與在同一寄主里可能存在多種傳播機制有關(guān)[13-14],也可能是復合感染引起的[15]。系統(tǒng)發(fā)育分析進一步支持PCR檢測結(jié)果,且證實該寄生蜂感染的是A大組的Wolbachia。雖然在研究中曾多次嘗試鑒定wSguA基因,但均未能成功獲得該基因的正確序列,因此,對于該寄生蜂是否也感染了B大組的Wolbachia,仍然有待進一步研究。Wolbachia在昆蟲中感染的檢測結(jié)果與檢測時所用的引物有關(guān),并且Wolbachia在昆蟲中存在2種感染[15-16](三重感染和復合感染)以及在昆蟲體內(nèi)Wolbachia的A大組和B大組的豐富度不同[17],如果在檢測時若用通用引物就只能判斷出該昆蟲被Wolbachia的某一個大組感染。由于本研究僅采用了Wolbachia的wsp基因來檢測Wolbachia在管氏腫腿蜂中的感染情況,以及構(gòu)建了系統(tǒng)進化樹對管氏腫腿蜂所感染W(wǎng)olbachia的類型進行了分析,雖能得出一些判斷,但還需把wsp基因檢測與其他16S rDNA等相關(guān)基因檢測相結(jié)合做進一步的驗證[18-20]。研究發(fā)現(xiàn),感染了Wolbachia的昆蟲和其它節(jié)肢動物的生殖方式受Wolbachia的調(diào)控[11,21],但其調(diào)控作用因寄主種類不同而不同[22]。因此,關(guān)于Wolbachia對管氏腫腿蜂的生殖調(diào)控機制也有待進一步研究。

[參考文獻]

[1]Hilgenboecker K,Hammerstein P,Schlattmann P,et al.How many species are infected with Wolbachia?A statistical analysis of current data[J].FEMS Microbiology Letters,2008,281(2):215-220.

[2]Werren J H,Baldo L,Clark E.Wolbachia:master manipulators of invertebrate biology[J].Nature Reviews Microbiology,2008,6(10):741-751.

[3]郭曉鵬,李正西.我國煙粉虱自然種群中存在廣泛的Wolbachia感染現(xiàn)象[J].微生物學報,2008,48(1):63-67.

[4]林煌真,李正西.福建省煙粉虱自然種群Wolbachia感染特點[J].昆蟲學報,2008,51(1):14-19.

[5]宋月,王哲,劉宏岳,等.北京地區(qū)亞洲玉米螟種群中Wolbachia超感染[J].昆蟲學報,2008,51(6):665-670.

[6]江幸福,王蕾,張蕾,等.蔬菜蚜蟲感染沃爾巴克氏體(Wolbachia)的分子檢測[J].植物保護,2009,35(4):63-65.

[7]Zhou W,Rousset F,O’Neill S.Phylogeny and PCR-based classification of Wolbachia strains using wsp gene sequences[J].Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences,1998,265(1395):509-515.

[8]陳君,程惠珍.腫腿蜂的應用研究進展[J].中國生物防治,2000,16(4):166-170.

[9]Thompson J D,Gibson T J,Plewniak F,et al.The ClustalX windows interface:flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools [J].Nucleic Acids Research,1997,25(24):4876-4882.

[10]Tamura K,Dudley J,Nei M,et al.MEGA4:molecular evolutionary genetics analysis(MEGA)software version 4.0[J].Mo1ecular Biology and Evolution,2007,24 (8):1596-1599.

[11]Werren J H.Biology of Wolbachia[J].Annual Review of Entomology,1997,42(1):587-609.

[12]趙玲,朱道弘,楊筱慧,等.四種癭蜂體內(nèi)Wolbachia感染的PCR檢測及感染株系的wsp基因序列分析[J].應用昆蟲學報,2013,50(4):998-1005.

[13]Raychoudhury R,Baldo L,Oliveira D C,et al.Modes of acquisition of Wolbachia:horizontal transfer,hybrid introgression,and codivergence in the Nasonia species complex[J].Evolution,2009,63(1):165-183.

[14]劉淑平,呂仲賢,徐紅星,等.寄生蜂體內(nèi)共生菌Wolbachia研究進展[J].環(huán)境昆蟲學報,2011,3 (1):107-116.

[15]宋月,沈佐銳,王哲,等.Wolbachia在玉米螟赤眼蜂內(nèi)的三重感染[J].昆蟲學報,2009,52(4):445-452.

[16]Cook J M,Butcher R D J.The transmission and effects of Wolbachia bacteria in parasitoids[J].Researches on Population Ecology,1999,41(1):15-28.

[17]楊璞,朱家穎,陳曉鳴,等.一種新的白蠟蟲寄生蜂體內(nèi)Wolbachia的wsp基因分子檢測及序列分析[J].林業(yè)科學研究,2011,24(3):340-344.

[18]柴換娜,杜予州,吳海燕.稻縱卷葉螟感染W(wǎng)olbachia 的ftsZ基因和16S rDNA基因的序列分析[J].昆蟲學報,2011,54(4):416-424.

[19]王歡,胡萃,葉恭銀,等.兩種金小蜂體內(nèi)Wolbachia 的wsp基因分子檢測及序列分析[J].植物保護學報,2006,33(3):235-240.

[20]Paraskevopoulos C,Bordenstein S R,Wernegreen J J,et al.Towards a Wolbachia multilocus sequence typing system:discrimination of Wolbachia strains present in Drosophila species[J].Current Microbiology,2006,53(5):388-395.

[21]Stouthamer R,Breeuwer J A J,Hurst G D D.Wolbachia pipientis:microbial manipulator of arthropod reproduction[J].Annual Review of Microbiology,1999,53 (1/2):71-102.

[22]Kageyama D,Narita S,Imamura T,et al.Detection and identification of Wolbachia endosymbionts from laboratory stocks of storedproduct insect pests and their parasitoids[J].Journal of Stored Products Research,2010,46(1):13-19.

(責任編輯張坤)

第1作者:黃鏡梅(1992—),女,碩士生。研究方向:昆蟲生理生化與分子生物學。Email:1025682082@qq.com。

Molecular Detection of Wolbachia Infection in Scleroderma guani

Huang Jingmei,Liu Naiyong,Xu Xiaolu,Li Lifang,Yang Bin,Zhu Jiaying
(Key Laboratory of Forest Disaster Warning and Control of Yunnan Province,College of Forestry,Southwest Forestry University,Kunming Yunnan 650224,China)

Abstract:Wolbachia is a group of intracellular symbionts ubiquitously occurred in arthropods.To investigate the Wolbachia infection in Scleroderma guani,wsp gene of Wolbachia in S.guani were detected with universal primers and gene-specific primers of A and B supergroups.The sequences obtained were named as wSgu,wSguA and wSguB with the lenth of 620,572 bp and 463 bp,respectively.Gene sequence analysis showed that the difference of base pairs were large between wSgu and wSguB,and their nucleotide identity was only 60%.Phylogenetic analysis showed that this parasitic wasp was infected with A-Wolbachia,while whether this parasitic wasp infected with B-Wolbachia remains to be further investigated.

Key words:Scleroderma guani,Wolbachia,wsp gene,PCR,sequence analysis

通信作者:朱家穎(1984—),男,博士,教授。研究方向:昆蟲生理生化與分子生物學。Email:jyzhu001@gmail.com。

基金項目:云南省林學一級學科博士點建設項目(林學學位授權(quán)學科項目經(jīng)費)資助;國家自然科學基金項目(31260449)資助;云南省中青年學術(shù)與技術(shù)帶頭人后備人才項目(2013HB077)資助;云南省高校森林有害生物科技創(chuàng)新團隊項目資助;西南地區(qū)生物多樣性保育國家林業(yè)局重點實驗室開放基金資助。

收稿日期:2015-12-19

doi:10.11929/ j.issn.2095-1914.2016.03.029

中圖分類號:S718.7

文獻標志碼:A

文章編號:2095-1914(2016)03-0169-05

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