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玉米CMS–C型雄性不育系C543恢復(fù)基因的初定位

2016-07-28 08:21劉偉華羅紅兵邱博
關(guān)鍵詞:連鎖花粉單株

劉偉華,羅紅兵,b*,邱博

(湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) a.農(nóng)學(xué)院;b.南方糧油作物協(xié)同創(chuàng)新中心,湖南 長沙 410128)

玉米CMS–C型雄性不育系C543恢復(fù)基因的初定位

劉偉華a,羅紅兵a,b*,邱博a

(湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) a.農(nóng)學(xué)院;b.南方糧油作物協(xié)同創(chuàng)新中心,湖南 長沙 410128)

摘 要:以玉米恢復(fù)系614、B137分別與CMS-C型雄性不育系C543組配的F2代(614群體和B317群體)為試材,進(jìn)行花粉育性鑒定和遺傳分析?;ǚ塾早R檢發(fā)現(xiàn),C543花藥內(nèi)沒有花粉,屬于無花粉型雄性不育;遺傳分析表明,C543的不育性狀由1對隱性核基因控制,恢復(fù)系614和B137各有1對核恢復(fù)基因;SSR標(biāo)記連鎖分析結(jié)果將恢復(fù)基因定位在玉米8號染色體短臂上,位于標(biāo)記umc1483附近,兩者距離約16.9 cM。

關(guān) 鍵 詞:玉米;雄性不育系;質(zhì)核互作;連鎖分析;基因定位

投稿網(wǎng)址:http://xb.ijournal.cn

雄性不育是玉米雜種優(yōu)勢利用的重要途徑,尤其是細(xì)胞質(zhì)雄性不育對實現(xiàn)玉米“三系”配套雜交種的生產(chǎn)具有重要意義。根據(jù)育性恢復(fù)專效理論,玉米細(xì)胞質(zhì)雄性不育可分為C型、T型和S 型[1]。隨著分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展,對玉米細(xì)胞質(zhì)雄性不育的遺傳基礎(chǔ)和恢復(fù)基因定位進(jìn)行了大量研究。Khey-pour等[2]認(rèn)為玉米CMS-C型細(xì)胞質(zhì)雄性不育是由1對顯性恢復(fù)基因控制;陳偉程等[3]研究認(rèn)為CMS-C型細(xì)胞質(zhì)雄性不育由2對重疊基因控制,而陳紹江等[4]認(rèn)為玉米 CMS-C型細(xì)胞質(zhì)雄性不育的恢復(fù)基因由3對甚至更多的顯性互補基因控制。Wise等[5]運用RFLP分子標(biāo)記將Rf1定位在玉米3號染色體的標(biāo)記umc97與umc92之間,將Rf2定位在9號染色體的標(biāo)記umc153與sus1之間。王澤立等[6]運用分子標(biāo)記將玉米 CMS-S型恢復(fù)基因 Rf3定位在2號染色體上,與標(biāo)記RR6距離約為2.0 cM。李鵬等[7]利用BC1F1群體進(jìn)行連鎖分析,將Rf3精細(xì)定位在2號染色體長臂的標(biāo)記A81和A134之間,兩者相距Rf3分別為1.3和1.1 cM?;謴?fù)基因Rf4 和Rf5分別被定位在8號染色體的短臂上和5號染色體的長臂上,且兩者具有疊加效應(yīng)[8]。湯繼華等[9]利用不育系Cms237和恢復(fù)系A(chǔ)6l9構(gòu)建定位群體,

1 材料與方法

2013年春季,以CMS-C型雄性不育系C543為母本、自交系614為父本進(jìn)行雜交,得到F1。夏季種植F1,套袋自交得到F2(614群體)。2013年夏季種植親本C543和B137,于開花散粉期進(jìn)行雜交,得到 F1;2014年春季種植 F1,并套袋自交得到F2(B137群體)。本研究所用材料為614群體和B137群體。

1.2 方法

1.2.1 花粉育性鑒定

在玉米F2群體開花散粉期,取群體單株未開放的小穗于冰盒中,帶回實驗室。采用花粉碘染法,于顯微鏡下觀察花粉育性情況。

1.2.2 遺傳分析

在F2群體開花散粉期,對其進(jìn)行育性考察并統(tǒng)計,進(jìn)行χ2檢驗,并取B137群體的不育單株的葉片提取DNA用于連鎖分析。

1.3 葉片DNA的提取

目前中國旅游業(yè)已步入大眾旅游階段,但大眾旅游者的旅游活動仍以觀光旅游為主,休閑旅游與度假旅游尚處于快速增長之中。因而,遺產(chǎn)型旅游景區(qū)仍是旅游者出游的最佳旅游目的地。但受諸多因素影響,近年來國內(nèi)各遺產(chǎn)型旅游景區(qū)門票漲聲一片,其中依托高品質(zhì)、世界級的自然、文化遺產(chǎn)旅游地漲幅更大。如世界自然遺產(chǎn)地九寨溝的門票由最初的108元調(diào)整至如今的220元,世界文化遺產(chǎn)地布達(dá)拉宮的門票也由最初的100元調(diào)整至300元等等。全面、快速的景區(qū)門票上漲,降低了景區(qū)的社會可進(jìn)入性,致使低收入群體望景興嘆,其旅游需求難以滿足。

采用改進(jìn)的SDS法提取葉片DNA:取適當(dāng)新鮮幼嫩玉米葉片于2 mL離心管中,加液氮,迅速用電鉆磨碎,再加入750 μL Buffer A,顛倒混勻,65 ℃水浴45 min,其間輕搖幾次,取出離心管,放置幾分鐘,依次加入氯仿和異戊醇各350 μL,上下顛倒,輕搖3 min,12 000 r/min離心10 min,上清液轉(zhuǎn)入2 mL滅菌離心管中,加入等體積的異丙醇,顛倒搖勻,得DNA白色絮狀沉淀,用玻璃棒挑出DNA于1.5 mL滅菌離心管中,用70%乙醇洗3次,無水乙醇沖洗1次,于超凈工作臺上風(fēng)干,加適量TE溶解,并置于-20 ℃下保存,備用。

1.4 PCR反應(yīng)體系及程序

PCR擴增采用10 μL反應(yīng)體系,包括1 μL模板DNA,0.6 μL引物(F/R),3.4 μL Mix(內(nèi)含dNTP、Taq酶、Buffer等,北京康為世紀(jì)公司提供),5 μL ddH2O。

擴增程序為94 ℃ 預(yù)變性5 min,94 ℃ 變性30 s,60 ℃ 退火30 s,72 ℃延伸1 min,35個循環(huán);72 ℃ 延伸10 min。之后于4 ℃保存,備用。PCR擴增產(chǎn)物用 6%變性聚丙烯酰胺凝膠電泳后進(jìn)行銀染,顯影觀察統(tǒng)計并拍照。

1.5 多態(tài)性標(biāo)記的篩選

首先利用271對Indel標(biāo)記(由中國農(nóng)業(yè)大學(xué)金危危老師提供),篩選出52對在親本間具有多態(tài)性的標(biāo)記。但該類型的多態(tài)性標(biāo)記分布不均,未完全覆蓋所有染色體兩條臂,因此,利用已有的SSR標(biāo)記進(jìn)行適當(dāng)補充,共篩選出 43對在親本間具有多態(tài)性的SSR標(biāo)記。

1.6 電泳條帶統(tǒng)計與重組率計算

根據(jù)顯影觀察結(jié)果,將不育突變體基因型標(biāo)記為1,恢復(fù)系基因型標(biāo)記為2,雜合基因型標(biāo)記為3。

重組率=重組數(shù)/(個體總數(shù)×2)。將1%的重組率換算成1 cM,計算標(biāo)記與目的基因的遺傳距離。

2 結(jié)果與分析

2.1 雄性不育系C543的花粉育性鑒定結(jié)果

在F2群體開花散粉期,對C543不育株和可育株雄穗中部未開放小穗的花藥進(jìn)行碘-碘化鉀染色,鏡檢結(jié)果見圖1。從圖1可知,可育株的花粉碘染后呈現(xiàn)出藍(lán)黑色(圖1-A),且花粉粒形狀規(guī)則,這表明該類型植株的花粉育性正常,能夠正常受精結(jié)實,而不育株的花藥內(nèi)沒有觀察到花粉粒,無法進(jìn)行碘-碘化鉀染色(圖 1-B),這說明不育株的花藥在發(fā)育過程中出現(xiàn)了異常,無法形成正??捎幕ǚ哿#罱K導(dǎo)致敗育。

圖1 C543可育株和不育株的花粉碘染鏡檢結(jié)果Fig. 1 Result of I2–KI solution-stained pollen for fertile and sterile individuals

2.2 雄性不育系C543的遺傳分析

對614群體和B137群體進(jìn)行田間育性觀察和統(tǒng)計分析結(jié)果(表1)表明,2個群體中不育單株數(shù)與可育單株數(shù)的比例分別為3.489∶1和3.222∶1,經(jīng)χ2檢驗,符合3∶1的理論分離比,說明C543的不育性狀是由1對隱性核基因控制的,在恢復(fù)系中有對應(yīng)的顯性育性恢復(fù)基因。

表1 F2群體中可育株與不育株的分離比例Table 1 The segregation ratio of plants for wild type and mutant type in F2populations

2.3 雄性不育系C543育性恢復(fù)基因的連鎖分析

利用篩選出的43對SSR標(biāo)記對C543的34個不育單株進(jìn)行基因分型,發(fā)現(xiàn)8號染色體短臂上的標(biāo)記umc1483擴增產(chǎn)物條帶出現(xiàn)偏分離現(xiàn)象,且有少數(shù)交換帶型,而其他SSR多態(tài)性標(biāo)記的擴增結(jié)果也是不育帶型、可育帶型和雜合帶型隨機分離,因此,可以初步確定標(biāo)記umc1483與目的基因連鎖(圖2)。利用umc1483對B137群體中的65個不育單株進(jìn)行基因分型,經(jīng)統(tǒng)計,有 42條帶為不育親本帶型,有18條帶為雜合帶型,只有4條帶為可育親本帶型,這說明F1在形成配子時,同源染色體非姐妹染色單體片段間發(fā)生交換,且單交換多于雙交換。65個單株中得到 22株重組單株,重組率為16.9%,目的基因與umc1483的相對遺傳距離約為16.9 cM。

圖2 標(biāo)記umc1483在親本間與部分F2群體不育單株中的擴增結(jié)果Fig. 2 Result of DNA amplified by marker umc1483 between parents and some F2individuals

3 結(jié)論與討論

本研究結(jié)果表明,雄性不育系C543花藥內(nèi)無花粉存在,敗育徹底;614群體和B137群體中不育株和可育株的分離比及卡方檢驗的結(jié)果證實 C543的不育性是由1對隱性基因控制的,相應(yīng)的恢復(fù)系中有顯性恢復(fù)基因存在,使育性得以恢復(fù)。

親本間多態(tài)性標(biāo)記的多少,標(biāo)記的分布均勻度及標(biāo)記質(zhì)量的高低都會對后期的連鎖分析產(chǎn)生一定影響。本試驗利用 Indel標(biāo)記在親本間進(jìn)行多態(tài)性篩選時,一共篩選到 52對多態(tài)性標(biāo)記,但標(biāo)記分布不均勻且部分標(biāo)記多態(tài)性不好,在連鎖分析中也并未發(fā)現(xiàn)有偏分離的標(biāo)記,可能是由于標(biāo)記距離目的區(qū)域較遠(yuǎn)。利用SSR多態(tài)性標(biāo)記進(jìn)行連鎖分析時,發(fā)現(xiàn)8號染色體短臂上的標(biāo)記umc1483在群體不育株擴增時出現(xiàn)偏分離現(xiàn)象,初步判斷其與目的基因存在連鎖。湯繼華等[9]也將一個玉米C型胞質(zhì)不育的恢復(fù)基因Rf4初步定位在8號染色體的短臂上,但不知道其連鎖標(biāo)記 bnlg2307位置是否與umc1483接近,兩者是否為同一位點。而段柳靜[10]在8號染色體8.00-8.01 Bin區(qū)對恢復(fù)基因Rf4進(jìn)行定位的位置與本研究中定位的連鎖標(biāo)記 umc1483比較接近。通過對恢復(fù)基因進(jìn)行SSR標(biāo)記的定位分析,經(jīng)重組率換算可知目的基因與umc1483的遺傳距離較大,約為16.9 cM,這可能是由于群體數(shù)量少的原因造成的,也可能是由于連鎖標(biāo)記距離目的基因的實際物理距離還較遠(yuǎn)。本研究只找到與目的基因連鎖的單側(cè)標(biāo)記,且遺傳距離較大,未來的工作要加大群體數(shù)量,繼續(xù)對umc1483附近進(jìn)行標(biāo)記開發(fā)或使用新型標(biāo)記。

本試驗的分子生物學(xué)實驗部分在中國農(nóng)業(yè)大學(xué)金危危老師幫助下完成,對金危危老師的指導(dǎo)與幫助表示真心感謝!

參考文獻(xiàn):

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[3] 陳偉程,羅福和,季良越.玉米C型胞質(zhì)雄性不育的遺傳及其在生產(chǎn)上的應(yīng)用[J].作物學(xué)報,1979,5(4):21-28.

[4] 陳紹江,陳偉程.玉米C型胞質(zhì)雄性不育恢復(fù)基因的定位研究[J].河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報,1989,23(3):201-208.

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[10] 段柳靜.玉米C型胞質(zhì)雄性不育育性恢復(fù)主基因Rf4的精細(xì)定位[D].鄭州:河南農(nóng)業(yè)大學(xué),2009.

責(zé)任編輯:尹小紅

英文編輯:梁 和

中圖分類號:S513;Q78

文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

文章編號:1007-1032(2016)01-0016-04

收稿日期:2015-09-08 修回日期:2015-12-18

基金項目:“十二·五”農(nóng)村領(lǐng)域國家科技計劃項目(2011BAD35B01);湖南省科技計劃項目(2013TP4096);長沙市科技計劃項目(K1406002-61)

作者簡介:劉偉華(1990—),男,福建南平人,碩士研究生,lwillhall@163.com;*通信作者,羅紅兵,教授,主要從事玉米種質(zhì)創(chuàng)新的新技術(shù)及應(yīng)用研究,hbluo48@sohu.com將Rf4定位在8號染色體短臂上,位于標(biāo)記bnlg2307附近。利用分子標(biāo)記定位育性恢復(fù)基因,對深入研究細(xì)胞質(zhì)雄性不育的育性恢復(fù)機理具有重要意義。筆者對不育系C543的不育特征和遺傳特征進(jìn)行分析,并利用分子標(biāo)記對育性恢復(fù)基因進(jìn)行初步定位研究,以期為將來的基因克隆、功能機理研究和雄性不育的利用提供參考依據(jù)。

Primary mapping of restoring gene for CMS-C cytoplasmic male sterility line C543 in maize

Liu Weihuaa,Luo Hongbinga,b*,Qiu Boa
(a. College of Agronomy; b. Southern Regional Collaborative Innovation Center for Grain and Oil Crops in China, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China)

Abstract:Two F2generations, which from the hybridizations of C543×614 and C543×B137, were used as experiment materials to analyze the pollen fertility and inheritance. The results showed that C543 was pollen-free male sterility,which was controlled by a pair of recessive nuclear genes, and there was a restoring gene in restorer 614 and B137,respectively. With the analyzing of SSR, the restoring gene of B137 was mapped on short arm of chromosome 8 and 16.9 cM from the marker umc1483.

Keywords:maize; male sterility line; cytoplasm-nuclear interaction; linkage analysis; gene mapping

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