李 瓊* 伍 輝(重慶市渝北區(qū)人民醫(yī)院檢驗科,重慶 401120)
?
肺癌3p缺失區(qū)基因傳感器的研究
李 瓊* 伍 輝
(重慶市渝北區(qū)人民醫(yī)院檢驗科,重慶 401120)
【摘要】目的 研究3p缺失區(qū)基因傳感器,早發(fā)現(xiàn)人類個體的基因缺失,以便預(yù)測、預(yù)防肺癌的發(fā)生,即使有早期肺癌,本人積極參與治療,也是可以治愈的。方法 采用電化學(xué)中的循環(huán)伏安法與金電極的自組裝法對缺失的靶基因進(jìn)行檢測。結(jié)果 自組裝的金電極用循環(huán)伏安法可檢測出缺失的靶基因。結(jié)論 對3p多個缺失基因的檢測,可早預(yù)防、預(yù)測、治療肺癌,具有較好的臨床意義。
【關(guān)鍵詞】3p缺失區(qū);基因傳感器;肺癌;金電極;循環(huán)伏安法
醫(yī)學(xué)模式是認(rèn)識健康與疾病等醫(yī)學(xué)問題的思維方法,國家衛(wèi)生部陳竺部長反復(fù)提出與解釋的“4P”醫(yī)學(xué)模式[1]即預(yù)防性(Preventive)、預(yù)測性(Predictive)、個體化(Personalized)和參與性(participatory)更加證明了疾病的預(yù)防、預(yù)測、早診斷、早治療的重要性,同時強調(diào)干預(yù)個體生活行為以達(dá)到預(yù)防疾病、控制發(fā)展的目標(biāo)。
肺癌是世界范圍內(nèi)的主要惡性腫瘤。其發(fā)病率和病死率在許多發(fā)達(dá)國家已上升為惡性腫瘤的第一位。跟大多數(shù)腫瘤一樣,發(fā)展成肺癌需要很長時間,有的需要10年以上,而3p(人類3號染色體短臂)基因部分缺失3年以前就發(fā)生了[2-3]。如果3p缺失基因早測出,提出相應(yīng)的保健干預(yù)措施,對肺癌的早期預(yù)防、預(yù)測、診斷具有非常重要的意義,同時也是“4P”醫(yī)學(xué)模式的一個佐證。
電流型基因[4-5]傳感器即將已知序列的單鏈多核苷酸臉(ssDNA)固定在電極上(該課題是金電極),當(dāng)電極的單鏈核酸與互補靶序列雜交形成雙鏈分子時,能表現(xiàn)出一定的物理信號(電流)改變,可通過電子學(xué)等技術(shù)將信號放大而顯示。該電流型基因傳感器檢測肺癌基因缺失的方法是一種簡單的、可靠的DNA雜交基因傳感器。
該課題基于“4P”醫(yī)學(xué)模式與電流型基因傳感器的可行性,以金為基底,通過巰基與金電極形成Au-s鍵自組裝法固定基因探針,實現(xiàn)對3p缺失區(qū)的基因檢測,為肺癌的預(yù)防、預(yù)測、早診斷提供一個新的檢測方法。
1.1 儀器:電化學(xué)工作站(辰華CHI660,上海辰華儀器有限公司),金電極(直徑3 mm,天津市高仕睿聯(lián)科技有限公司),移液器,Thermo,LIBROR AEL-200電子天平(日本島津公司),BRANSON B3200S-T超聲清洗儀(上海必能信超聲公司)。
1.2 試劑:鐵氰化鉀(5 mmol/L),DNA固定與雜交緩沖液(TE Buffer組成濃度:10 mM Tris-HCl、1mM EDTA、pH=8.0),3p缺失的4個基因的探針序列見表1。
表1 DNA序列表
1.3 方法
1.3.1 金電極的活化:金電極分別用1.0 μm和0.05 μm A12O3粉在鹿皮上打磨光亮后,用蒸餾水沖洗干凈,分別在蒸餾水、無水乙醇、蒸餾水中超聲洗滌10 min;然后將金電極浸泡在piranha(30%H2O2∶98%H2SO4=1∶3v/v)中10分鐘,取出在室溫下晾干待用。然后將一支活化金電極在5 mmol/L鐵氰化鉀緩沖溶液中循環(huán)伏安(CV)法掃描,掃速為0.1 V/s,掃描電壓為0.6~-0.2 V,持續(xù)掃描直到穩(wěn)定的CV圖(圖1中的b)。
1.3.2 基因傳感器的制備:將0.5 μmol/L探針液體取5 μL滴加到活化的金電極表面,冰箱0~4 ℃中過夜,通過Au-S自組裝成膜。然后金電極在5 mmol/L鐵氰化鉀緩沖溶液中循環(huán)伏安(CV)法掃描,掃速為0.1 V/s,掃描電壓為0.6~-0.2 V,持續(xù)掃描直到穩(wěn)定的CV圖(圖1中的a)。
圖1 活化金電極與組裝金電極的CV圖(a:組裝金電極;b:活化金電極)
1.3.3 探針濃度的選擇:以系列探針濃度(以SEMA3B為例,探針濃度依次:0.1、0.5、1.0 μmol/L)液體取5 μL滴加到活化后的金電極表面,冰箱0~4 ℃中過夜,通過Au-S自組裝成膜,然后組裝金電極在5 mmol/L鐵氰化鉀緩沖溶液中循環(huán)伏安(CV)法掃描,掃速為0.1 V/s,掃描電壓為0.6~-0.2 V,持續(xù)掃描直到穩(wěn)定的CV圖(圖2),以便選擇組裝探針液濃度那個濃度最恰當(dāng)。結(jié)合其他3個基因CV掃描峰電流情況,該課題選出固定探針濃度0.5 μmol/L。
1.3.4 靶基因濃度線性范圍:滴加5 μL探針液(濃度0.5 μmol/L)在活化金電極表面,0~4 ℃過夜成膜,取出用TE緩沖液小流量沖洗自然干,滴加5 μL不同濃度的靶基因在組裝金電極膜表面,37 ℃雜交2 h,取出用TE緩沖溶液沖洗自然干,然后在5 mmol/L鐵氰化鉀緩沖溶液中循環(huán)伏安(CV)法掃描,掃速為0.1 V/s,掃描電壓為0.6~-0.2 V,持續(xù)掃描直到穩(wěn)定的CV圖,其響應(yīng)電流隨靶基因濃度的增加而不斷減?。▓D3),且對不同濃度的靶基因作線性關(guān)系圖(圖4)。靶基因濃度:0、10、30、50、70、100、120、130(0.01 pmol/L)
圖2 不同探針濃度的CV圖(a:1.0 μmol/L b:0.5 μmol/L c:0.1μmol/L)
圖3 不同靶基因濃度的CV圖 圖4 不同濃度的靶基因線性關(guān)系圖
2.1 活化金電極與探針膜的cv表征:圖1b是活化裸金電極的cv圖表征,它的氧化峰和還原峰電流峰很典型,a表示探針膜的cv圖表征,它的氧化峰和還原峰電流有所下降,這是因為單核苷酸鏈通過Au-S自組裝到到金電極上,部分阻礙了電子的傳遞。同時表示探針成功組裝到金電極上。
2.2 基因傳感器自組裝不同探針濃度的cv表征(圖2):從c到a氧化峰電流與還原峰電流均降低,是因為組裝的探針濃度從低到高,電子傳遞進(jìn)一步被阻礙,因此電流降低。同時表示組裝電極具有生物活性。
2.3 用自組裝基因傳感器分別測定靶基因濃度cv表征(圖3):氧化峰電流與還原峰電流隨著靶基因濃度升高其峰電流降低,是因為雜交作用,隨著濃度的增加,電子傳遞進(jìn)一步被阻礙,因此電流降低。同時表示組裝電極具有生物活性,能與對應(yīng)的核苷酸單鏈發(fā)生雜交反應(yīng)。圖4的靶基因線性關(guān)系圖看出,其濃度在10~100(0.01 pmol/L)成線性。圖3與圖4表示該基因傳感器可以檢測3p缺失基因。
利用自主裝Au-S固定基因探針,成功構(gòu)建了靈敏的電流型肺癌基因傳感器。與傳統(tǒng)方法相比,該方法有以下三個突出優(yōu)點:①能早期篩查出肺癌發(fā)生的可能性;②自組裝固定提高靈敏度;③在本實驗中,以ssDNA固定作為基因模型,實驗了該方法對肺癌缺失基因的檢測,同時該方法可推廣到其他基因的測定,在臨床早診斷方面有著重要的應(yīng)用,為4P醫(yī)學(xué)的預(yù)防、預(yù)測、早診斷、個體化提供理論證據(jù)。
參考文獻(xiàn)
[1] 暴樹生,師新宇.用4P醫(yī)學(xué)理念構(gòu)建和諧醫(yī)患關(guān)系的探討[J].衛(wèi)生軟科學(xué),2012,26(11):954-957.
[2] 梅新宇,孫余婕,徐美青,等.非小細(xì)胞肺癌3p染色體多區(qū)域雜合性缺失檢測的研究[J].中國肺癌雜志,2008,11(4):534-537.
[3] 翟艷輝,李瑩,胡文利,等.染色體3p21.3缺失區(qū)域11個相關(guān)基因在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)[J].中國肺癌雜志,2009,12(8):853-858.
[4] 周殿明,吳一丹,劉佩,等.電化學(xué)DNA傳感器[J].化學(xué)傳感器,2011,31(1):10-17.
[5] 譙康全,吳永強,劉新露.新型肺癌壓電DNA傳感器的研制[J]壓電與聲光,2012,34(2):249-252.
中圖分類號:R734.2
文獻(xiàn)標(biāo)識碼:B
文章編號:1671-8194(2016)16-0036-02
基金項目:重慶市醫(yī)學(xué)科研計劃項目(編號:2012-2-297)
*通訊作者