張亮,張健
· 綜述 ·
基因表達(dá)評(píng)分在非糖尿病冠心病診斷中的應(yīng)用進(jìn)展
張亮1,張健1
現(xiàn)有的冠狀動(dòng)脈粥樣硬化性心臟?。ü谛牟。┰\斷手段主要有心電圖、心臟超聲、冠狀動(dòng)脈造影、冠狀動(dòng)脈CTA及心肌灌注成像(MPI)等,其中冠狀動(dòng)脈造影是診斷冠心病的金標(biāo)準(zhǔn),臨床中在冠狀動(dòng)脈造影檢查前通常使用非侵入性檢查手段進(jìn)行危險(xiǎn)因素評(píng)估,但均存在特異性差或敏感度低等缺陷,不利于冠心病的早期診斷。
基因表達(dá)評(píng)分(GES)是基于患者年齡、性別以及通過(guò)qRT-PCR的方法定量檢測(cè)患者外周血中23個(gè)基因表達(dá)水平使用特定公式(表1)進(jìn)行計(jì)算從而得出相應(yīng)評(píng)分,其用于非糖尿病患者冠心病檢測(cè)已被多中心研究證實(shí)。
1.1 研究背景 冠心病及其并發(fā)癥,如急性心肌梗死、心力衰竭,具有極高的致死率和致殘率。在當(dāng)今心臟病學(xué)實(shí)踐中,治療指南[1]建議對(duì)于中危患者推薦無(wú)創(chuàng)性影像檢查,對(duì)于高?;颊咄扑]行冠狀動(dòng)脈造影。然而在實(shí)際臨床工作中,對(duì)于可疑胸痛患者的危險(xiǎn)分層缺少明確指征,且無(wú)創(chuàng)性影像檢查僅能篩查出不到40%的冠心病患者[2,3]。另外在女性可疑胸痛患者中,使用如心電圖、心臟超聲等無(wú)創(chuàng)性檢查并不能很好的排除非冠心病患者[4],因此一種無(wú)創(chuàng)準(zhǔn)確的冠心病早期檢測(cè)手段在冠心病診療中顯得更為迫切需要,COURAGE(Clinical Trials Utilizing Revascularization and Aggressive Drug Evaluation)研究[5]也推薦盡量使用創(chuàng)傷性較小的診斷手段來(lái)確診疾病。外周血的基因表達(dá)變化非常靈敏的反應(yīng)冠心病的發(fā)生發(fā)展?fàn)顟B(tài)[6],目前已有研究[7,8]表明,定量測(cè)定外周血中相關(guān)基因的表達(dá)量可反應(yīng)冠心病的嚴(yán)重程度,因此通過(guò)非侵入性的血液檢查,可以可靠的評(píng)估冠心病的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。
1.2 基因選擇 冠心病的主要發(fā)病因素是冠狀動(dòng)脈粥樣硬化,而動(dòng)脈粥樣硬化的發(fā)生發(fā)展與炎癥密切相關(guān)[9]。一些炎癥細(xì)胞與因子聚集在損傷的內(nèi)皮周?chē)?,促使?dòng)脈粥樣硬化的形成和易損斑塊的破裂。由于血液循環(huán),動(dòng)脈粥樣硬化的先天性免疫應(yīng)答和適應(yīng)性相關(guān)的循環(huán)血細(xì)胞包括嗜中粒細(xì)胞,NK細(xì)胞,B、T淋巴細(xì)胞特異性表達(dá)相關(guān)的基因間接的表現(xiàn)在外周血中,如CASP5[10]在脂核進(jìn)展的過(guò)程中表達(dá)水平明顯上調(diào);KLRC4[11]通過(guò)激活NK細(xì)胞進(jìn)而減少動(dòng)脈粥樣硬化過(guò)程中淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)。
DUKE大學(xué)CATHGEN實(shí)驗(yàn)室展開(kāi)一項(xiàng)研究,共納入195例患者,經(jīng)過(guò)微陣列分析篩選出2438個(gè)冠心病相關(guān)基因,進(jìn)行相關(guān)性分析后選出88個(gè)基因用于RT-PCR,分別對(duì)非糖尿病和糖尿病患者進(jìn)行冠心病相關(guān)基因表達(dá)量分析(其中非糖尿病患者124例,糖尿病患者71例),陽(yáng)性組判定標(biāo)準(zhǔn):在一個(gè)主要的器官中有一處最大狹窄≥75%,或有兩處≥50%為病例組,對(duì)照組為所有主要血管中<25%狹窄。最終在非糖尿病人群與糖尿病人群中分別確定42和12個(gè)顯著相關(guān)的基因(P<0.05)且兩者之間沒(méi)有重疊基因,所以后續(xù)臨床研究只針對(duì)非糖尿病患者。PREDICT(Personalized Risk Evaluation and Diagnosis in the Coronary Tree)研究【http://www.clinicaltrials.gov, NCT00500617】中納入198例非糖尿病冠心病患者,經(jīng)過(guò)微陣列分析篩選出5935個(gè)冠心病相關(guān)基因,通過(guò)生物相關(guān)性分析數(shù)據(jù)特異、生物相關(guān)性以及RT-PCR后基因表達(dá)水平測(cè)定共篩選出113個(gè)冠心病基因。選擇PREDICT組[12]中640例非糖尿病樣本(病例組/對(duì)照組:210/430),用RT-PCR分析這113個(gè)基因,從而進(jìn)行算法開(kāi)發(fā)。用LASSO分析基因表達(dá)的相關(guān)性,將基因進(jìn)行分類(lèi),用嶺回歸分析(Ridge Regression),基于基因表達(dá)相關(guān)聚類(lèi)和細(xì)胞類(lèi)型分析,最終確定與冠心病相關(guān)的類(lèi)群,包括性別、年齡以及6個(gè)基因組23個(gè)基因,包括20個(gè)冠心病相關(guān)基因及3個(gè)管家校準(zhǔn)基因。
1.3 基因評(píng)分系統(tǒng) 以基因表達(dá)評(píng)分系統(tǒng)為基礎(chǔ)的Corus CAD算法包含患者年齡、性別以及全血中6個(gè)基因組共23個(gè)基因,它提供一個(gè)1-40的評(píng)分,其陰性預(yù)測(cè)值達(dá)95%;評(píng)分≤15分的患者冠狀動(dòng)脈狹窄程度≤25%,且1年內(nèi)的血運(yùn)重建及不良事件的發(fā)生率極低,基因表達(dá)評(píng)分與心血管事件及血運(yùn)重建具有明顯的相關(guān)性[13]。隨著分?jǐn)?shù)增高,其冠狀動(dòng)脈狹窄程度越高,該評(píng)分可以預(yù)測(cè)冠心病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。在一項(xiàng)前瞻性實(shí)驗(yàn)中[14],使用該算法用ROC分析交叉驗(yàn)證估計(jì)AUC=0.70(95%CI:0.65~0.75),在臨床中具有較好的應(yīng)用價(jià)值。另外,基因表達(dá)評(píng)分在女性人群中的應(yīng)用表現(xiàn)尤其出色[15]。
1.4 實(shí)驗(yàn)影響因素 一項(xiàng)實(shí)驗(yàn)[16]通過(guò)全血質(zhì)控品來(lái)考察批內(nèi)變異及批間變異情況,包括人員,儀器,試劑在內(nèi)一共分析11個(gè)影響因素。批內(nèi)和批間變異性分別是0.092和0.059,總體變異性是0.11。將11個(gè)影響因素進(jìn)行回歸分析發(fā)現(xiàn),檢測(cè)板和cDNA試劑盒是主要的影響因素??傮w上看,RNA提取試劑盒,cDNA合成以及qRT-PCR貢獻(xiàn)了大部分批間變異(52.3%),其次是操作和儀器(18.9%,9.2%),其余19.6%未知。批間變異中的PCR過(guò)程在總體變異中貢獻(xiàn)最大,試劑批次是批內(nèi)變異中的主要因素。
2.1 GES優(yōu)于核素心肌灌注顯像(MPI) COMPASS(Coronary Obstruction Detection by Molecular Personalized Gene Expression)[17]研究是一項(xiàng)多中心的前瞻性試驗(yàn),共納入537例非糖尿病患者,將入選者外周血樣本用于GES檢測(cè),之后這些患者又接受了MPI檢測(cè)。對(duì)于MPI檢測(cè)異常的患者接受冠狀動(dòng)脈造影或者冠狀動(dòng)脈CTA。最終431例患者完成了GES、MPI和冠狀動(dòng)脈成像(冠狀動(dòng)脈造影或CT血管成像)?;颊咂骄挲g56±10歲(48%為女性)。預(yù)先設(shè)定終點(diǎn)是GES受試者操作特性分析確定的>50%狹窄。GES受試者工作特征曲線下面積(AUC)為0.79,靈敏度,特異性及陰性預(yù)測(cè)值分別為89%、52%和96%,對(duì)應(yīng)的閾值為<15分,患者占比46%。通過(guò)受試者操作特性以及再分類(lèi)分析GES優(yōu)于其它臨床因子,并與最大動(dòng)脈狹窄程度呈高度相關(guān)關(guān)系。對(duì)患者進(jìn)行6個(gè)月的隨訪顯示,GES>15的患者中,有97%的患者,即28名患者中有27例出現(xiàn)不良心血管事件或接受血管重建。GES在冠心病的檢測(cè)中有高靈敏度和高陰性預(yù)測(cè)值。在這項(xiàng)臨床實(shí)驗(yàn)中,GES優(yōu)于其它臨床因子和MPI。
2.2 GES與冠狀動(dòng)脈狹窄程度及斑塊負(fù)荷高度相關(guān) 為尋求確定GES與通過(guò)CT血管成像檢測(cè)得到的患者冠狀動(dòng)脈狹窄之間的相關(guān)性。在一項(xiàng)前瞻性實(shí)驗(yàn)中[18],研究者對(duì)526例非糖尿病患者分別進(jìn)行冠狀動(dòng)脈CT檢查和GES檢測(cè),結(jié)果得出基因評(píng)分與冠狀動(dòng)脈狹窄程度呈正相線性關(guān)系。另外一項(xiàng)研究[19]分析了PREDICT和COMPASS研究中來(lái)源于59個(gè)中心的610例患者(平均年齡57±11歲;50%為男性),這些患者進(jìn)行冠狀動(dòng)脈CTA得到狹窄程度以及GES評(píng)分。根據(jù)冠狀動(dòng)脈狹窄程度將冠狀動(dòng)脈CTA結(jié)果分為5級(jí),0:無(wú)狹窄,①極小狹窄,②輕微狹窄,③中等狹窄,④?chē)?yán)重狹窄,⑤堵塞。通過(guò)單因素方差(ANOVA)以及受試者工作特征曲線(ROC)進(jìn)行相關(guān)性分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)GES與CTA評(píng)分(r=0.37;P<0.001)高度相關(guān)。通過(guò)方差分析,隨著GES值升高,冠狀動(dòng)脈狹窄程度也不斷增加(P<0.001);GES與最大冠狀動(dòng)脈狹窄(r=0.41;P<0.01)及狹窄評(píng)分指數(shù)(r=0.38,P<0.01)高度相關(guān),GES低值(<15)靈敏度為0.90,GES高值(>28)特異性為0.87。GES與通過(guò)CT血管成像檢測(cè)得到的患者動(dòng)脈粥樣硬化斑塊和狹窄之間高度相關(guān)。一項(xiàng)基于ATLANTA(Assessment of Tissus characteristics,Lesion morphology and hemodynamics by Angiography with fraction flow reserve,intravascular ultrasound and virtual histology and Non-invasive computed Tomography in Atherosclerotic plaques)研究結(jié)果的臨床試驗(yàn)[20],通過(guò)使用IVUS/VH測(cè)量冠狀動(dòng)脈斑塊負(fù)荷(包括纖維組織、壞死脂核、鈣質(zhì)密度),用斯皮爾曼等級(jí)相關(guān)關(guān)系處理測(cè)量結(jié)果與基因表達(dá)評(píng)分的關(guān)系。試驗(yàn)共納入18例患者,平均年齡61.1±8.6歲,67%為男性,平均GES21.6±9.4分,經(jīng)過(guò)斯皮爾曼等級(jí)相關(guān)處理后認(rèn)為GES不僅僅與冠心病相關(guān),而且與斑塊負(fù)荷有關(guān),其鈣化程度越高、斑塊體積越大,相應(yīng)GES越高。
2.3 基因表達(dá)評(píng)分穩(wěn)定性 穩(wěn)定性是檢測(cè)分子生物診斷手段是否可靠的重要指標(biāo)。一項(xiàng)[21]研究使用受試者操作特性曲線(ROC)分析來(lái)源于PREDICT研究中樣本中基因表達(dá)評(píng)分,研究者重新檢測(cè)了保存5年的PREDICT研究中驗(yàn)證樣本隊(duì)列(n=526),基因表達(dá)評(píng)分平均值從5年前的20.3分變?yōu)?年后的19.8分(n=501),另外將173例約1年前入組的COMPASS研究患者樣本用于GES檢測(cè),基因表達(dá)評(píng)分平均值有微小的上升,從15.9分~17.3分,相對(duì)應(yīng)的冠心病風(fēng)險(xiǎn)上升2.5%,表明血液中的基因表達(dá)并不會(huì)隨時(shí)間而發(fā)生量的明顯改變,其中一些微小的變化考慮是由于心血管藥物的使用所導(dǎo)致。
3.1 使用GES診斷冠心病 IMPACT-PCP(Investigation of a Molecular Personalized Coronary Gene Expression Test on Primary Care Practice Pattern)研究[22]是一項(xiàng)評(píng)估Corus CAD評(píng)分在醫(yī)師對(duì)于首次就診的阻塞性冠心病患者中的診斷策略的影響。在4個(gè)初級(jí)護(hù)理機(jī)構(gòu)中用基因表達(dá)評(píng)分(GES)診斷穩(wěn)定的、非急性的、非糖尿病并伴有胸痛和相關(guān)癥狀的患者。所有接受GES檢測(cè)的患者,記錄他們?cè)贕ES之前和之后的診斷策略。GES是通過(guò)外周血中23個(gè)基因表達(dá)水平的計(jì)算對(duì)冠心病進(jìn)行診斷,陰性預(yù)測(cè)值為96%。結(jié)果證實(shí)在251例受試者中,140例女性(56%);平均年齡56歲(標(biāo)準(zhǔn)差13.0),平均體質(zhì)指數(shù)30 mg/kg2(標(biāo)準(zhǔn)差6.7)。平均GES為16(范圍1~38),127例患者(51%)低GES。251例中有145例患者在GES后改變了診斷方案,在對(duì)247例(98%)患者為期30 d的隨訪中,僅有1例MACE事件(低GES評(píng)分患者發(fā)生出血性卒中)報(bào)道。由此認(rèn)為將GES整合入冠心病的診斷流程中顯示出臨床實(shí)用性,可以?xún)?yōu)化患者的診斷評(píng)估。
3.2 使用GES預(yù)測(cè)MACE 臨床中已經(jīng)證實(shí)血液GES可用于冠心病的預(yù)測(cè),然而對(duì)于那些接受冠狀動(dòng)脈造影的患者,GES是否同樣能夠預(yù)測(cè)其主要心血管不良事件及血運(yùn)重建情況從而對(duì)治療進(jìn)行相關(guān)指導(dǎo)。一項(xiàng)基于PREDICT 研究結(jié)果的臨床試驗(yàn)[23],共納入1160例患者,通過(guò)隨訪造影及基因表達(dá)評(píng)分,評(píng)估其在1年內(nèi)MACE(主要心血管不良事件)和血管重建情況,研究結(jié)束時(shí)共1116例完成隨訪,其30 d不良事件率為23%,12個(gè)月不良事件率增加2.2%。GES與MACE/血管重建率相關(guān),GES大于15的患者,>30 d MACE/血管重建的風(fēng)險(xiǎn)增加,MACE總發(fā)生率為1.5%(17/1116),17例中3例GES≤15。全部低GES組(n=396),MACE/血管重建陰性預(yù)測(cè)值為90%。由此推測(cè)基因表達(dá)評(píng)分在臨床中可篩選出無(wú)阻塞性冠心病以及1年內(nèi)發(fā)生MACE可能性低的患者。
3.3 使用GES指導(dǎo)醫(yī)師避免過(guò)度檢查 IMPACT-CARD(Investigation of a Molecular Personalized Coronary Gene Expression Test on Cardiology Practice Pattern)研究[24]是一項(xiàng)前瞻性臨床試驗(yàn),為了評(píng)估GES是否影響心臟科醫(yī)師在冠心病患者臨床診斷中的決策。該項(xiàng)研究共納入83例穩(wěn)定性冠心病患者,分別由6位心臟科醫(yī)師根據(jù)臨床因素及患者癥狀作出臨床決策,包括侵入性檢查或無(wú)創(chuàng)性檢查,然后根據(jù)GES結(jié)果重新作出最終決策。結(jié)果發(fā)現(xiàn),有48例患者[58%,95%CI(46%,69%)]的診療意見(jiàn)發(fā)生變動(dòng),更多的患者接受了少量的、無(wú)創(chuàng)檢查,在這部分人群中高達(dá)91%的患者GES≤15分。而對(duì)于那些檢查項(xiàng)目增多的患者,其GES均有不同程度的升高。在這項(xiàng)研究中,結(jié)果表明在臨床實(shí)踐中可以通過(guò)基因表達(dá)評(píng)分來(lái)指導(dǎo)低?;颊弑苊饨邮苓^(guò)度的醫(yī)療檢查的方法是有效可行的。
GES可有效的評(píng)估冠心病風(fēng)險(xiǎn),可以預(yù)測(cè)冠狀動(dòng)脈狹窄程度、斑塊負(fù)荷,在冠心病的檢測(cè)中具有高靈敏度和高陰性預(yù)測(cè)值,優(yōu)于其它臨床因子和MPI。目前以GES為代表的項(xiàng)目Corus@CAD檢測(cè)已在美國(guó)50個(gè)州,印度,以色列等地獲得了檢測(cè)許可,并被美國(guó)安泰保險(xiǎn)和考文垂的健康保險(xiǎn)納入醫(yī)療保險(xiǎn)覆蓋范圍。近來(lái),國(guó)外越來(lái)越多的科研團(tuán)體展開(kāi)對(duì)GES在疾病中的應(yīng)用,美國(guó)心臟病協(xié)會(huì)亦發(fā)表臨床策略聲明[25]討論在未來(lái)臨床中基因如何在心臟疾病的診斷與治療中發(fā)揮作用,亦代表了當(dāng)今醫(yī)療的大趨勢(shì)。
GES作為一項(xiàng)新型的檢測(cè)手段,在應(yīng)用初期仍存在諸多不足,對(duì)于糖尿病人群、合并全身反應(yīng)綜合征、系統(tǒng)性感染、服用類(lèi)固醇藥物或化療藥物的人群,會(huì)干擾GES的準(zhǔn)確性。且目前國(guó)外研究所納入的人群多為白種人,對(duì)于亞洲人群,其研究結(jié)果需要進(jìn)一步驗(yàn)證。
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本文編輯:張靈
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A
1674-4055(2017)04-0510-03
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張健,E-mail:menciuszhang@sina.com
10.3969/j.issn.1674-4055.2017.04.40
中國(guó)循證心血管醫(yī)學(xué)雜志2017年4期