夏金玲 沈陽市康平縣人民醫(yī)院檢驗(yàn)科 (遼寧 沈陽 110500)
Microflex MALDI-TOF MS全自動微生物分析系統(tǒng)對腸桿菌科細(xì)菌的鑒定能力評估
夏金玲 沈陽市康平縣人民醫(yī)院檢驗(yàn)科 (遼寧 沈陽 110500)
目的:分析Microflex?MALDI-TOF MS全自動微生物分析系統(tǒng)對腸桿菌科細(xì)菌的鑒定能力。方法:選擇500株腸桿菌科質(zhì)控菌株與臨床分離菌株作為檢測標(biāo)本,分別進(jìn)行Microflex?MALDI-TOF MS與Vitek 2 Compact菌株鑒定,對兩組方案的檢測結(jié)果進(jìn)行分析統(tǒng)計(jì)。結(jié)果:Microfex?MALDI-TOF MS對細(xì)菌種、屬的鑒定率分別為97.00%(485/500)與3.00%(15/500),Vitek 2 Compact對細(xì)胞種、群、屬的鑒定率分別為83.20%(416/500)、14.20%(71/500)、2.60%(13/500),比較兩組方式的鑒定符合率差異顯著(P<0.05)。結(jié)論:對腸桿菌科細(xì)胞采取Microfex?MALDI-TOF MS鑒定方式的符合率明顯高于Vitek 2 Compact鑒定方式,具有成本低、操作簡便、快速等優(yōu)勢,建議在醫(yī)學(xué)微生物檢驗(yàn)中推廣應(yīng)用。
全自動微生物分析系統(tǒng) 微生物檢測 腸桿菌科細(xì)菌
近些年來,革蘭陰性桿菌在臨床微生物的樣本中分離率已經(jīng)超過70%[1],其中33%左右為腸桿菌科細(xì)菌[2],該類細(xì)菌與人類之間的關(guān)系密切。近些年來,隨著臨床醫(yī)學(xué)技術(shù)、免疫抑制劑等的快速發(fā)展,導(dǎo)致醫(yī)院感染事件的發(fā)生率與日俱增(腸桿菌科細(xì)胞導(dǎo)致),因此,對感染性疾病積極進(jìn)行臨床診斷與治療的意義重大。本次研究對腸桿菌科細(xì)菌采取Microfex?MALDI-TOF MS全自動微生物分析系統(tǒng)鑒定方式,可達(dá)到較為顯著的應(yīng)用效果。
1.1 一般資料
選擇500株腸桿菌科質(zhì)控菌株與臨床分離菌株作為檢測標(biāo)本,所有檢測標(biāo)本均由本地臨床檢驗(yàn)中心2015年1月~2015年12月各類樣本分離得來。
1.2 方法
選擇實(shí)驗(yàn)儀器與試劑類型包括:Vitek 2 Compact與配套的革蘭陰性桿菌鑒定卡、Microflex?MALDI-TOF MS檢測儀與α-氰基-4-羥基肉桂酸、Mastercycler EP Gradient Thermal Cycler聚合酶鏈反應(yīng)、ABI Prism 310 CeneticAnalyzer DNA測序儀、PCR擴(kuò)增試劑盒與DNA膠回收試劑盒、Test Standard(BTS)、三氟乙酸、乙醇、甲酸、沙門菌屬診斷血清等。
Vitek 2 Compact鑒定:嚴(yán)格挑選純菌落(平板上),準(zhǔn)備好菌懸液(濃度為0.5麥?zhǔn)蠁挝唬o予Vitek 2 Compact與配套的鑒定板完成操作。
MALDI-TOF MS儀的鑒定:切換為線性操作工作模式,選擇基質(zhì)抑制偏轉(zhuǎn)模式。提取脈沖離子(100ns),2000~20000為相對分子質(zhì)量。選擇待測樣本,將去離子水與乙醇加入,含量分別為300μL與μL,充分將其混勻后離心操作,之后進(jìn)行干燥沉淀處理,將1~80μL的甲酸水溶液(70%)兌入,并搖勻,之后加入等量的乙腈,并混勻,連續(xù)離心2min之后選取1μL的上清液,滴入MALDI靶板內(nèi)并晾干(室溫狀態(tài)下),將α-氰基-4-羥基肉桂酸基質(zhì)液(含量為1μL)對上述樣本點(diǎn)嚴(yán)格進(jìn)行覆蓋,并在室溫下晾干處理。之后進(jìn)行質(zhì)譜分析,將上述實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)納入數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行處理,若檢測得知評分≥1.7則說明檢測的樣本圖譜與數(shù)據(jù)庫中相匹配的圖譜高度具有一定的相似性。
血清凝集:嚴(yán)格依照《全國臨床檢驗(yàn)操作規(guī)程》(第3版)中對沙門菌血清凝集試驗(yàn)中的操作方案進(jìn)行。
測序基因:提取細(xì)菌基因組的DNA(選用水煮法),檢測模板為細(xì)菌基因組DNA,之后采取PCR擴(kuò)增處理,采取細(xì)菌16S核糖體進(jìn)行操作,嚴(yán)格依照試劑說明書上的內(nèi)容進(jìn)行PCR體系配置。將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳處理后,將DNA條帶瓊脂凝膠塊進(jìn)行割取,并采用DNA膠回收試劑盒對PCR產(chǎn)物進(jìn)行回收,之后測序DNA序列,將檢測得知的DNA序列與BLAST工具比較,由此獲取菌株類別。
1.3 評價(jià)指標(biāo)
對比兩組鑒定方法的符合率。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
采取SPSS18.0的統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件納入本文檢測所需數(shù)據(jù),計(jì)數(shù)資料采用χ2檢驗(yàn),結(jié)果用率表示,檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05,計(jì)量資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
Microflex?MALDI-TOF MS對細(xì)菌種、屬的鑒定率分別為97.00%(485/500) 與3.00%(15/500),Vitek 2 Compact對細(xì)胞種、群、屬的鑒定率分別為83.20%(416/500)、14.20%(71/500)、2.60%(13/500),比較兩組方式的鑒定符合率差異顯著(P<0.05)。
腸桿菌科細(xì)菌在臨床上稱之為一類感染病原菌[3],分布范圍十分廣泛,較為多見,可引發(fā)肺炎、傷口感染、血流感染等不良情況,受到醫(yī)學(xué)工作者的廣泛關(guān)注。以往臨床上對腸桿菌科細(xì)菌主要采取手工板條法與儀器法進(jìn)行鑒定,其中儀器法中最常見的為Vitek 2 Compact,均是依據(jù)細(xì)菌生化反應(yīng)的結(jié)果進(jìn)行判定的,存在較高的成本且檢測時(shí)間較長,Microflex?MALDI-TOF MS技術(shù)屬于一類近些年來新興的對微生物進(jìn)行檢測的方案,已經(jīng)在微生物領(lǐng)域中得到了廣泛的推廣。
本次研究對500株腸桿菌科細(xì)菌分別采取Microflex?MALDI-TOF MS與Vitek 2 Compact進(jìn)行菌株鑒定,并對于結(jié)果不符的菌株采取沙門菌血清凝集試驗(yàn)再次進(jìn)行確認(rèn),并對兩種不同的檢測方式鑒定符合率進(jìn)行比較可知,其差異具有一定的統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。其中Vitek 2 Compact數(shù)據(jù)庫中由于陰溝腸桿菌等屬于復(fù)合群,普通變形桿菌與潘氏變形桿菌屬于同一個(gè)復(fù)合群,將往往使得上述細(xì)菌鑒定程度只能到群,在數(shù)據(jù)庫等因素的影響下,容易導(dǎo)致分散的泛菌鑒定程度只能到群,分散的泛菌鑒定程度往往只能到屬。
Microflex?MALDI-TOF MS數(shù)據(jù)庫中的腸桿菌科細(xì)菌參考圖譜與Vitek 2 Compact相比,前者圖譜種類往往更多,導(dǎo)致前者對于上述細(xì)菌可鑒定至種,對沙門菌株進(jìn)行鑒定時(shí),采取前者鑒定方式對于腸炎沙門菌、豬霍亂沙門菌可鑒定至種,而后者可對傷寒沙門菌、甲型副傷寒沙門菌鑒定至種,而采取Vitek 2 Compact檢測技術(shù)對大腸埃希菌進(jìn)行鑒定可知,少量的菌屬未能夠進(jìn)行有效的鑒定,可能是由于菌落黏膜感較強(qiáng),對較為均勻的菌懸液準(zhǔn)備存在一定的難度,從而直接對鑒定結(jié)果造成一定的影響[4]。
綜上情況可知,對腸桿菌科細(xì)胞采取Microflex?MALDI-TOF MS鑒定方式的符合率明顯高于Vitek 2 Compact鑒定方式,具有成本低、操作簡便、快速等優(yōu)勢,建議在醫(yī)學(xué)微生物檢驗(yàn)中推廣應(yīng)用。
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1006-6586(2017)12-0035-02
R446.5
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2017-03-15