陳 健,孫志強(qiáng),李玉權(quán),武廣恒
(1.吉林省腫瘤醫(yī)院,吉林 長春130012;2.吉林大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,吉林 長春130021)
*通訊作者
IFN-γ基因+874位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性與宮頸癌的關(guān)系
陳 健1,孫志強(qiáng)1,李玉權(quán)1,武廣恒2*
(1.吉林省腫瘤醫(yī)院,吉林 長春130012;2.吉林大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,吉林 長春130021)
人乳頭狀瘤病毒(HPV)感染是宮頸癌發(fā)生的重要危險(xiǎn)因素[1],但僅有一定數(shù)量的HPV 感染者最終罹患宮頸癌,說明遺傳易感性在個(gè)體之間存在著差異,其作用可能在特定條件下被激發(fā),并在腫瘤發(fā)生中起到重要作用。干擾素(IFN)是一種由單核細(xì)胞和淋巴細(xì)胞產(chǎn)生的十分重要的細(xì)胞因子,具有拮抗腫瘤、廣譜抗病毒以及免疫調(diào)節(jié)等廣泛的生物活性。研究顯示[2],在IFN-γ基因中存在6個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),其中第一內(nèi)含子+874位點(diǎn)A/T單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP),可以通過改變轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)的方式進(jìn)而影響到相關(guān)基因的表達(dá)數(shù)量[3]。本實(shí)驗(yàn)中運(yùn)用單核苷酸多態(tài)性基因分型方法,比較宮頸癌病例組和對照組IFN-γ基因+874位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性基因型頻數(shù)和等位基因頻數(shù)差異,進(jìn)而探討IFN-γ基因與宮頸癌發(fā)生的相關(guān)性。
1.1 檢測對象 實(shí)驗(yàn)組:69例,漢族,其中鱗癌62例、腺癌7例,上述病例為吉林省腫瘤醫(yī)院住院病人,就診時(shí)間為2013年6月-2015年8月。經(jīng)病理切片確切診斷為宮頸癌,同時(shí)排除其他類型癌癥,年齡44.6±10.7歲;對照組:69例,漢族,為同一醫(yī)院同時(shí)期體檢正常的女性,無既往腫瘤病史,年齡45.2±9.4歲。
1.2 樣本的收集和處理 用真空采血管(5 ml,含有抗凝劑肝素鈉)收集靜脈血,采用TE飽和重蒸酚、氯仿/異戊醇混合液抽提法提取檢測對象外周血基因組DNA,-20℃保存。
1.3 引物 GenBank 檢索IFN-γ序列(NC-000012),Primer 5.0設(shè)計(jì)引物,南京金斯瑞生物科技有限公司合成。F1(上游引物):5′-cgcgcaacacaaaatcaaatca-3′,F(xiàn)2(上游引物):5′-cgcgcaacacaaaatcaaatct-3′,R(下游通用引物):5′-gctacatctgaatgacctgc-3′,PCR擴(kuò)增,片段長度527 bp。
1.4 檢測基因型 采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)方法。PCR 總的反應(yīng)體系為50 μl,PCR反應(yīng)條件:94℃ 1 min 、58℃ 50 s、72℃ 45 s,31個(gè)循環(huán),72℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物8 μl,1.0%瓊脂糖凝膠電泳電壓95V,35 min,凝膠成像系統(tǒng)分析并保存圖像。
1.5 統(tǒng)計(jì)分析 首先檢驗(yàn)基因型頻率分布是否符合Hardy-Weinberg 遺傳平衡定律的要求,基因型和等位基因頻數(shù)的分布差異采用χ2檢驗(yàn)方法,采用SPSS13.5 統(tǒng)計(jì)分析軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理及統(tǒng)計(jì)分析。用比值比(OR)和95%參數(shù)置信區(qū)間來評估相對風(fēng)險(xiǎn)程度。
2.1 Hardy-Weinberg 定律檢驗(yàn)χ2檢驗(yàn)結(jié)果表明,實(shí)驗(yàn)組、對照組基因型頻數(shù)分布均符合Hardy-Weinberg 遺傳平衡定律要求(P>0.05)。
2.2 基因型、等位基因分布狀況 IFN-γ基因通過PCR擴(kuò)增后,產(chǎn)物經(jīng)1.0%瓊脂糖凝膠電泳,根據(jù)單核苷酸多態(tài)性可分為AA、AT和TT等三種基因型,詳見表1和圖1。同一樣本用F1、R引物及F2、R兩對引物分別擴(kuò)增,如結(jié)果均出現(xiàn)527 bp長度片段,稱為AT基因型,如只有其中一對引物可以擴(kuò)增出527 bp長度片段,稱為AA或者TT基因型。經(jīng)檢驗(yàn),AA、AT和TT三種基因型實(shí)驗(yàn)組中的頻數(shù)分布與對照組比較具有顯著性差異(χ2=4.830,P=0.028);AA基因型頻數(shù)分布與對照組相比較差異具有顯著性(χ2=4.182,P=0.042);實(shí)驗(yàn)組和對照組的基因型頻數(shù)的相對危險(xiǎn)度分析后發(fā)現(xiàn),AA / TT:OR=2.02,95%CI:1.03-3.97,AA基因型患卵巢癌的風(fēng)險(xiǎn)是TT基因型的2.02倍;實(shí)驗(yàn)組和對照組中A與T兩個(gè)等位基因之間頻數(shù)分布比較具有顯著性差異(χ2=6.059,P=0.014),相對危險(xiǎn)度分析結(jié)果,A / T :OR=1.91,95%CI:1.14-3.20,A等位基因患卵巢癌的風(fēng)險(xiǎn)度是T等位基因的1.91倍。
2.3 病例組中鱗癌與腺癌之間,基因型頻數(shù)和等位基因頻數(shù)相比較,差異均無顯著性,見表2。
M:Marker(DL-2000);1-2:AA基因型;3-4:AT基因型;5-6:TT基因型;PCR 產(chǎn)物長度均為527 bp
圖1 PCR產(chǎn)物電泳后AA、AT和TT三種基因型的電泳圖譜
表1 宮頸癌病例組、正常對照組基因型頻數(shù)和等位基因頻數(shù)分布狀況
表2 宮頸癌實(shí)驗(yàn)組病理類型中基因型頻數(shù)分布狀況
目前,細(xì)胞因子與宮頸癌遺傳易感性關(guān)系的研究不斷取得進(jìn)展,研究提示[4],IL-12A rs568408 和IL-12B rs3212227 多態(tài)性可能單獨(dú)或聯(lián)合作用影響江蘇地區(qū)女性的宮頸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn);Tamandani 等[5]研究揭示,HPV18 或 HPV18 合并16型感染患者中 IL-1RA AB 基因型患宮頸鱗癌和腺癌風(fēng)險(xiǎn)降低。IFN-γ的合成量受基因調(diào)控,存在著較大的個(gè)體差異,究其原因可能是基因調(diào)節(jié)區(qū)的多態(tài)性,或者說等位基因的多態(tài)性直接控制著IFN-γ的合成[6]。IFN-γ基因+ 874位點(diǎn)存在于IFN-γ基因第一個(gè)內(nèi)含子區(qū)域,包括 AA、AT、TT 3種基因型,轉(zhuǎn)錄因子NF-kappaB的結(jié)合位點(diǎn)剛好與+ 874 位點(diǎn)處于同一位置,此位置出現(xiàn)的SNP可直接影響到與轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合能力,從而影響IFN-γ的轉(zhuǎn)錄[7]。據(jù)報(bào)道,IFN-γ基因第一內(nèi)含子+874位點(diǎn)多態(tài)性與腫瘤在內(nèi)的一些疾病具有相關(guān)性[8]。Kordi Tamandani等[9]經(jīng)過研究發(fā)現(xiàn),IFN-γ基因+874位點(diǎn)的AT和AA+AT基因型在印度北部人群中與宮頸癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)升高有關(guān),帶有等位基因A的個(gè)體產(chǎn)生IFN-γ的能力較低,提示+874位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性在決定個(gè)體HPV遺傳易感性方面可能承擔(dān)著十分重要的作用。
本文結(jié)果顯示,AA基因型、A等位基因可能是該群體宮頸癌發(fā)生的危險(xiǎn)因素。除此之外,該群體宮頸鱗癌和腺癌之間基因型頻率以及等位基因頻率相比較,均未見顯著性差異,表明本群體該位點(diǎn)SNP在宮頸癌病程中不存在組織學(xué)類型的特異性。
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1007-4287(2017)03-0498-02
2016-05-17)