張陳明,陶 勝
(安徽百友司法鑒定中心,安徽 合肥230031)
親子鑒定中STR基因座可疑多步突變2例
張陳明,陶 勝
(安徽百友司法鑒定中心,安徽 合肥230031)
法醫(yī)遺傳學;親子關(guān)系;短串聯(lián)重復序列;DNA突變分析;多步突變
兩位母親(胡某與楊某)均因為自己女兒(劉某與李某)辦理出生醫(yī)學證明所需,委托我中心進行親子關(guān)系鑒定。本中心采集四位被鑒定人指尖血備檢。用Chelex-100法提取基因組DNA,分別采用AGCU EX22、AGCU 21+1試劑盒(無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司)對常染色體上39個STR基因座進行復合擴增,并用PowerPlex?16 HS試劑盒(美國Promega公司)對常染色體上15個STR基因座進行復合擴增,對上述檢驗結(jié)果進行復核驗證。同時,采用AGCU X12試劑盒(無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司)對X染色體上12個STR基因座進行復合擴增。以上擴增均在9700型PCR儀(美國AB公司)上完成,擴增體系和擴增條件均依照試劑盒使用說明書,PCR產(chǎn)物在3130xl基因分析儀(美國Thermo Fisher Scientific公司)上進行毛細管電泳,用GeneMapper?ID v3.2軟件進行STR分型。
先用AGCU EX22試劑盒對常染色體21個STR基因座進行檢驗,發(fā)現(xiàn)兩對母女(胡某-劉某、楊某-李某)均在FGA基因座存在多步突變的可能。在第一對母女的FGA基因座,母親胡某的表型為“22”,女兒劉某的表型為“27”;在第二對母女的FGA基因座,母親楊某的表型為“21”,女兒李某的表型為“24”。采用PowerPlex?16 HS試劑盒進行復核驗證,發(fā)現(xiàn)FGA基因座的分型與上述結(jié)果一致,且這兩種STR試劑盒檢出的FGA基因座的等位基因峰(胡某女兒的“27”、楊某的“21”以及楊某女兒的“24”)在信號強度、峰高與峰面積等方面均比其他基因座的雜合子高。
采用AGCU 21+1試劑盒進一步檢測18個多態(tài)性STR基因座,第一對母女又出現(xiàn)一個STR基因座不符合遺傳規(guī)律:在D4S2408基因座,母親胡某的表型為“9”,女兒劉某的表型為“10”;在第二對母女中,母親楊某均能提供女兒李某必需的等位基因。對12個X-STR基因座進行分型檢驗,發(fā)現(xiàn)兩對母女在每個X-STR基因座均有一個相同的等位基因。按照SF/Z JD0105001—2016《親權(quán)鑒定技術(shù)規(guī)范》,在考慮第一對母女FGA和D4S2408基因座存在突變可能、第二對母女FGA基因座存在突變可能的前提下,累積親權(quán)指數(shù)分別為1.020 1×104、1.525 1×105。
在親子鑒定實踐中,STR基因座發(fā)生突變的現(xiàn)象是普遍存在的,且其發(fā)生突變的主要機制是復制滑動突變,只涉及一個基序的加或減稱為一步突變,約占STR基因座的90%,少數(shù)突變基因會涉及幾個基序,稱多步突變[1]。多步突變是通過逐步突變形成的,突變的步數(shù)越多,其發(fā)生的機會越小,最多突變步數(shù)為四步[2]。通常STR基因座核心序列重復次數(shù)越多,基因突變率越高,F(xiàn)GA基因座等位基因范圍在12.2~51.2,目前觀察到的等位基因數(shù)目多達80個,共有69種變異,在常見突變的基因座中,F(xiàn)GA基因座的突變率最高(0.29%)[3,4]。
在本文的兩個案例中,F(xiàn)GA基因座的可疑突變分別達到了五步及三步,這在日常鑒定實踐中極為罕見,甚至第一對母女還同時有另一個STR基因座(D4S2408)存在一步突變的可能。查閱文獻發(fā)現(xiàn),親子鑒定中同時存在2個及以上STR基因座突變的現(xiàn)象已有報道[5-7]。
關(guān)于親子鑒定實踐中遇到這種突變的應對策略,筆者認為,若只有1個或2個STR基因座不符合孟德爾遺傳規(guī)律,為了避免因STR基因座發(fā)生突變而錯判,應增加突變率低、穩(wěn)定性好的STR基因座進行復核驗證,以便能更有效地排除近親關(guān)系。在二聯(lián)體親子鑒定中,遇到突變時若能使雙親的另一方也參與檢驗,更有利于結(jié)果的準確判斷。有文獻[8]報道,F(xiàn)GA基因座存在等位基因丟失導致假突變現(xiàn)象,因此,若發(fā)生突變的基因座檢測為純合子,最好換用其他廠家生產(chǎn)、引物序列不同的試劑盒或重新設(shè)計引物進行驗證,以防出現(xiàn)等位基因漏檢,即雜合子擴增丟失現(xiàn)象。如出現(xiàn)類似突變,也可以考慮應用高通量二代測序儀分型檢測判斷,有條件的還可進一步增加紅細胞血型、SNP等遺傳標記系統(tǒng)、性染色體STR分型、mtDNA測序、插入缺失(InDel)位點檢驗等技術(shù),以確保鑒定意見的準確性與嚴謹性。
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DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2017.04.035
1004-5619(2017)04-0451-02
2016-04-05)
(本文編輯:李 莉)
張陳明(1985—),男,碩士研究生,助理研究員,主要從事法醫(yī)物證學鑒定;E-mail:448531970@qq.com