張延紅,高素芳,王 燕,李金田,杜 弢(甘肅中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院,蘭州 730000)
當(dāng)歸種子蛋白質(zhì)提取方法及SDS-PAGE技術(shù)體系研究Δ
張延紅*,高素芳,王 燕,李金田,杜 弢#(甘肅中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院,蘭州 730000)
目的:建立適用于當(dāng)歸種子蛋白質(zhì)提取及十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)的技術(shù)體系,為當(dāng)歸種子蛋白質(zhì)研究和品種純度檢測(cè)提供技術(shù)支撐。方法:以蛋白質(zhì)含量和電泳條帶數(shù)量等為指標(biāo),采用濃縮膠法、鹽溶蛋白法、電極緩沖液法、二巰基蘇糖醇(DTT)法、尿素法、巰基乙醇法、三羥甲基氨基甲烷(Tris)法、丙酮沉淀法等8種方法提取當(dāng)歸種子蛋白質(zhì),篩選最優(yōu)提取方法;再以最優(yōu)提取方法為基礎(chǔ),考察不同料液比、樣品稀釋倍數(shù)(上樣量)和分離膠濃度對(duì)當(dāng)歸種子蛋白質(zhì)提取及SDS-PAGE效果的影響。結(jié)果:8種提取方法中以巰基乙醇法提取蛋白質(zhì)的含量較高(29.931mg/g),且電泳條帶數(shù)目多、泳道背景清晰;當(dāng)以巰基乙醇法為最優(yōu)提取方法時(shí),料液比為1∶10、上樣量為5倍、分離膠濃度為15%條件下電泳效果最好,共得到18條條帶。結(jié)論:建立的蛋白質(zhì)提取方法和SDS-PAGE技術(shù)體系適用于當(dāng)歸種子純度的檢測(cè)。
當(dāng)歸;種子;蛋白質(zhì)提取;SDS-PAGE
蛋白質(zhì)是基因表達(dá)的產(chǎn)物,能反映生物DNA組成上的差異,幾乎所有植物種子都具有特異性種子蛋白,其電泳譜帶具有高度的穩(wěn)定性、專(zhuān)一性。蛋白質(zhì)電泳技術(shù)就是根據(jù)種子蛋白的這些特點(diǎn),利用電泳譜帶的多態(tài)性來(lái)鑒定品種的真實(shí)性和純度。此外,種子蛋白作為遺傳標(biāo)記常被用于種屬間關(guān)系、品種鑒定及植物繁育系統(tǒng)的鑒別。種子檢驗(yàn)是保證種子質(zhì)量的重要措施,采用電泳分離的蛋白圖譜檢測(cè)農(nóng)作物種子純度已有文獻(xiàn)報(bào)道[1-2]。利用種子蛋白質(zhì)電泳圖譜鑒定種子純度具有不需將種子萌發(fā)、送檢樣品可及時(shí)進(jìn)行分析、電泳后的染色步驟相對(duì)簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn)。此外,該技術(shù)還可用于測(cè)定蛋白質(zhì)分子量和蛋白質(zhì)濃度,是許多研究領(lǐng)域的重要分析技術(shù)。當(dāng)歸為傘形科多年生草本植物當(dāng)歸[Angelica sinensis(Oliv.)Diels]的干燥根[3-4],是甘肅特色藥材之一。本試驗(yàn)以當(dāng)歸種子為研究材料,對(duì)其蛋白質(zhì)的提取方法及電泳條件進(jìn)行研究,旨在建立適宜于當(dāng)歸種子蛋白質(zhì)提取和電泳的技術(shù)體系,為當(dāng)歸種子蛋白質(zhì)研究和品種純度檢測(cè)提供技術(shù)支撐。
1.1 儀器
DYY-10C型電泳儀、DYCZ-23A型垂直電泳槽(北京市六一儀器廠);BX7200HP超聲波清洗器(上海新苗醫(yī)療器械制造有限公司);TGL16M型高速冷凍離心機(jī)(湖南凱達(dá)科學(xué)儀器有限公司)。
1.2 種子與試劑
當(dāng)歸種子由甘肅省定西市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院劉效瑞老師提供,經(jīng)晉玲教授鑒定為當(dāng)歸種子;三羥甲基氨基甲烷(Tris)、丙烯酰胺、甲叉雙丙烯酰胺、尿素、二巰基蘇糖醇(DTT)、乙二胺四乙酸(EDTA)、丙酮、甘油、考馬斯亮藍(lán)、十二烷基硫酸鈉(SDS)、冰醋酸、甲醇、甘氨酸等試劑均為分析純。
2.1 蛋白質(zhì)提取
經(jīng)查閱文獻(xiàn)[5-13]及預(yù)試驗(yàn)確定選用以下蛋白質(zhì)提取方法進(jìn)行篩選比較。
2.1.1 濃縮膠法 在文獻(xiàn)[5]方法上加以改進(jìn)。稱(chēng)取當(dāng)歸種子0.2 g,加稀釋4倍的濃縮膠緩沖液(0.5mmol/L的Tris-HCl,pH 6.7)2m L冰浴研磨,超聲震蕩30m in,離心(3 500 r/m in,離心半徑5 cm,下同)30m in,取上清液,加入等體積40%的蔗糖溶液,4℃貯存?zhèn)溆谩?/p>
2.1.2 鹽溶蛋白法 稱(chēng)取當(dāng)歸種子0.2 g,加入1.5mol/L的氯化鈉溶液2m L,在冰浴條件下研磨,離心20m in,取上清液,4℃貯存?zhèn)溆肹5]。
2.1.3 電極緩沖液法 在文獻(xiàn)[6]方法上加以改進(jìn)。稱(chēng)取當(dāng)歸種子0.2 g,加入樣品提取液[40%的蔗糖10m L,電極緩沖液(3.03 g Tris,14.4 g甘氨酸,1.0 g SDS,加雙蒸水溶解定容至1 000m L,pH 8.3)2m L,加水8m L混勻]2m L在冰浴條件下研磨,離心20m in,取上清液,4℃貯存?zhèn)溆谩?/p>
2.1.4 DTT法 稱(chēng)取當(dāng)歸種子0.2 g,加入50 mmol/L Tris-HCl(含1.5%DTT和0.6mmol/L的EDTA緩沖液,pH 8.0)樣品提取液2m L(4℃預(yù)冷備用),室溫浸泡1 h,然后研磨至糊狀后4℃下離心(10 000 r/min)20min,離心2次[5],上清液即為蛋白質(zhì)提取液。
2.1.5 尿素法 取32.43 g尿素、120μL乙二醇溶于1 000 m L雙蒸水中得到提取液。稱(chēng)取冷藏30m in后的當(dāng)歸種子0.2 g,研磨后裝入離心管中,加入提取液(料液比為1∶10),室溫下提取1 h后渦旋混合約1min,再于4℃下離心(10 000 r/min)10min,取上清液備用[7]。
2.1.6 巰基乙醇法 在文獻(xiàn)[8]方法上加以改進(jìn)。稱(chēng)取當(dāng)歸種子0.2 g,加入pH 8.0的50mmol/L Tris-HCl(含1%SDS、1%巰基乙醇、40%的蔗糖溶液)提取液2 m L,置沸水中加熱3min,立即置于冰上冷卻,取上清液備用。
2.1.7 Tris法 稱(chēng)取樣品0.2 g,加入pH 8.0的0.15mol/L Tris-HCl提取液2m L,4℃浸泡6 h,離心(4 000 r/m in)15min,取上清液備用[8]。
2.1.8 丙酮沉淀法 稱(chēng)取當(dāng)歸種子0.2 g,加入樣品提取液(pH 8.0的62.5 mmol/L Tris-HCl、0.5%SDS、10%甘油、5%巰基乙醇)2m L,渦旋混合30 s,4℃放置1 h。樣品搖勻后,在4℃下離心(12 000 r/m in)20min,上清液轉(zhuǎn)移至3 m L離心管中,加入1 m L預(yù)冷丙酮,搖勻,-20℃放置1 h沉降蛋白質(zhì),4℃下離心(5 000 r/m in)10m in,棄上清液。沉淀在-20℃放置1 h,使丙酮充分揮發(fā),沉淀備用[5]。
2.2 蛋白質(zhì)含量測(cè)定與電泳
蛋白質(zhì)含量和純度是評(píng)價(jià)提取方法的重要指標(biāo),蛋白純度不同,對(duì)電泳的影響也不同。較多的雜質(zhì)將嚴(yán)重影響電泳結(jié)果。采用考馬斯亮藍(lán)法測(cè)定上述8種方法提取的蛋白質(zhì)含量[14];采用SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)技術(shù)[15],比較各方法提取的蛋白質(zhì)電泳的條帶數(shù)目和泳道干凈程度,篩選適宜的蛋白質(zhì)提取方法。本試驗(yàn)數(shù)據(jù)均采用Excel 2003作圖,SPSS 18.0軟件進(jìn)行Duncan多重比較。
2.2.1 電泳技術(shù)操作步驟 (1)電泳槽的安裝:將2塊玻璃板垂直插入玻璃槽固定好,將溶化的1.5%瓊脂趁熱注入電泳槽平板玻璃底部,以防漏液。(2)聚合:取配制好的分離膠(濃度10%)混勻后小心注入電泳槽的玻璃板間,留出約3 cm左右的空間以灌注濃縮膠[濃度3%,配制方法:蒸餾水2.7m L、30%丙烯酰胺(29.2 g)/N,N-亞甲基雙丙烯酰胺(0.8 g)0.67 m L、濃縮膠緩沖液0.5 m L、10%SDS 50μL、10%過(guò)硫酸銨50μL、四甲基乙二胺4μL;濃縮膠緩沖液是0.5 mmol/L Tris-HCl(pH=6.7)。將上述試劑混勻后,倒入玻璃板間(分離膠上方),插入梳子,室溫靜置聚合2 h左右。(3)電泳:待濃縮膠完全聚合后,取出梳子,吸去多余的水,用微量注射槍向加樣孔內(nèi)點(diǎn)樣,在電泳槽中加電極緩沖液(將3.03 g Tris、14.4 g甘氨酸、1.0 g SDS溶入900m L超純水中,然后定容至1 000m L即為電極緩沖液)適量,并在上樣緩沖液中加7~8滴溴酚藍(lán)指示劑。接上電泳儀,恒壓60 V,待藍(lán)色溴酚藍(lán)移至分離膠時(shí),轉(zhuǎn)換電壓至120V;待藍(lán)色的溴酚藍(lán)移至下端1~1.5 cm時(shí),停止電泳。(4)染色和脫色:取出膠板后放入考馬斯亮藍(lán)G-250染色液,染色1 h。然后再用蒸餾水沖洗2遍,倒入脫色液,期間多次更換至背景清晰為止,拍照。
2.2.2 分離膠配方 配方見(jiàn)表1。
表1 分離膠配方(m L)Tab 1 Solution formula of separating gel(m L)
2.2.3 蛋白質(zhì)含量測(cè)定及電泳結(jié)果 當(dāng)歸種子8種提取方法的蛋白質(zhì)含量測(cè)定結(jié)果見(jiàn)表2,電泳圖見(jiàn)圖1。
表2 不同提取方法蛋白質(zhì)含量比較Tab 2 Com parison of protein contentsby different extractionm ethods
圖1 不同提取方法蛋白質(zhì)電泳圖Fig 1 Protein electrophoretogram by different extractionm ethods
由表2及圖1可知,丙酮沉淀法提取的蛋白質(zhì)含量最高,與其余7種方法比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),但圖譜顯示該法電泳條帶較模糊;巰基乙醇法與DTT法提取的蛋白質(zhì)含量差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);鹽溶蛋白法提取出的蛋白質(zhì)含量較低,其電泳圖譜條帶較寬、條帶顏色淺淡;Tris法提取出的蛋白質(zhì)含量最低,圖譜也顯示其條帶較寬、顏色較淡。故當(dāng)歸種子不同提取方法的蛋白質(zhì)含量測(cè)定結(jié)果與蛋白質(zhì)電泳圖譜二者有一定的對(duì)應(yīng)關(guān)系。
總的來(lái)說(shuō),8種方法電泳條帶多分布于中下部,其中巰基乙醇法電泳效果最好,總條帶數(shù)10條,明帶8條、暗帶2條,泳道背景清晰。尿素法、DTT法、電極緩沖液法、鹽溶蛋白法、濃縮膠法電泳條帶的數(shù)目和亮度差異不大,均為4~5條,其中鹽溶蛋白法的條帶明顯變寬。丙酮法和Tris法電泳條帶較模糊,數(shù)目較少。因此,巰基乙醇法是當(dāng)歸種子最適宜的蛋白質(zhì)提取方法。
2.3 提取與電泳條件的優(yōu)化
在采用巰基乙醇法提取蛋白質(zhì)的基礎(chǔ)上對(duì)提取條件(料液比)及電泳條件(上樣量、分離膠濃度)進(jìn)行進(jìn)一步的優(yōu)化試驗(yàn)。
2.3.1 料液比 稱(chēng)取當(dāng)歸種子0.2 g,分別加入1、2、3、4、 5m L樣品提取液,料液比分別為1∶5、1∶10、1∶15、1∶20、1∶25。按“2.1.6”項(xiàng)下方法提取,將提取的蛋白質(zhì)樣品用上樣緩沖液(濃縮膠緩沖液1 m L、10%SDS 1.6m L、50%甘油0.8 m L、巰基乙醇0.4m L、0.05%溴酚藍(lán)0.2 m L、雙蒸水4.0m L,混合均勻)按1∶4稀釋[9],比較蛋白質(zhì)含量、電泳條帶數(shù)目和泳道干凈程度,篩選適宜的料液比,結(jié)果見(jiàn)表3、圖2A。
表3 不同料液比條件下蛋白質(zhì)含量比較Tab 3 Com parison of p rotein contents under differentmaterials-liquid ratios
圖2 不同條件下蛋白質(zhì)的電泳圖譜比較Fig 2 Com parison of protein electrophoretogram under different conditions
由表3可知,當(dāng)料液比為1∶10時(shí),提取液中的蛋白含量最高,與其余料液比比較差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),提取效果最好。由圖2A可見(jiàn),不同料液比對(duì)電泳效果的影響顯著。料液比為1∶5時(shí)泳道顏色濃重,背景不干凈,條帶不清晰、拖尾嚴(yán)重,提取液的泳道顏色最深,且條帶較寬。其原因是提取液體積太少,蛋白質(zhì)提取不充分,雜質(zhì)太多,此結(jié)果與蛋白質(zhì)含量測(cè)定結(jié)果相一致。當(dāng)料液比為1∶10和1∶15時(shí),電泳效果較好,泳道干凈,條帶清晰、數(shù)目多,泳道上方有極細(xì)的暗帶分出。當(dāng)料液比為1∶20和1∶25時(shí),泳道下部條帶顏色變淡;且料液比為1∶25時(shí),條帶變模糊,第4、5條明帶間已無(wú)暗帶。因此,料液比優(yōu)選1∶10。
2.3.2 樣品稀釋倍數(shù)(上樣量) 在“2.3.1”項(xiàng)試驗(yàn)的基礎(chǔ)上,采用巰基乙醇法提取蛋白質(zhì),以料液比為1∶10提取種子蛋白質(zhì)。取提取后的蛋白質(zhì)樣品30μL用上樣緩沖液分別稀釋3、4、5、6、7、8、9、10、11、12倍,比較電泳條帶數(shù)目和泳道干凈程度,篩選適宜的稀釋倍數(shù),結(jié)果見(jiàn)圖2B。
由圖2B可知,稀釋3倍的蛋白質(zhì)液拖尾較嚴(yán)重,可能因蛋白質(zhì)濃度太高所致。稀釋4、5、6、7倍的條帶數(shù)最多,總數(shù)11條,亮帶8條、暗帶3條,從下向上第4、5帶間可清晰看到2條暗帶。稀釋8~12倍的條帶顏色變淡變細(xì),且有些暗帶消失。因此,樣品稀釋倍數(shù)優(yōu)選5倍。
2.3.3 分離膠濃度 在“2.3.2”項(xiàng)試驗(yàn)的基礎(chǔ)上,采用巰基乙醇法提取蛋白質(zhì),按料液比為1∶10、樣品稀釋5倍上樣。配制3%的濃縮膠及10%、12%、15%的分離膠進(jìn)行蛋白質(zhì)電泳,比較電泳條帶數(shù)目和泳道干凈程度,篩選適宜的分離膠濃度,詳見(jiàn)圖2C。
由圖2C可知,15%分離膠與10%、12%分離膠電泳效果比較,前者條帶數(shù)目明顯更多,且主要是在下部分離出更多清晰的亮帶和暗帶,中上部的亮帶差異不大,但有新的暗帶出現(xiàn)。因此,15%的分離膠可使蛋白質(zhì)分離更完全,電泳得到18條帶,其中11條亮帶、7條暗帶。計(jì)算其分子量[8]介于11.88~30.18KD之間。
篩選后的當(dāng)歸種子提取方法為巰基乙醇法,料液比為1∶10,電泳上樣量為稀釋5倍,分離膠濃度為15%。
通過(guò)本次試驗(yàn)建立了適合當(dāng)歸種子蛋白質(zhì)電泳的技術(shù)體系。不同提取方法對(duì)蛋白質(zhì)含量及電泳效果的影響很大,本試驗(yàn)采用8種提取方法,其中巰基乙醇法蛋白質(zhì)提取和電泳效果均最好。其原因可能是提取液中的SDS使蛋白質(zhì)非共價(jià)鍵和二硫鍵斷裂,并中和蛋白質(zhì)表面電荷;同時(shí)加入的巰基乙醇是一種強(qiáng)還原劑,其可使被還原的二硫鍵不易再氧化,從而使很多不溶性蛋白質(zhì)溶解并與SDS定量結(jié)合[16-17]。由于SDS和巰基乙醇的雙重作用,蛋白質(zhì)完全變性和解聚,解離成亞基或單個(gè)肽鏈,因此,蛋白質(zhì)溶解性增加、提取量增加、電泳效果好。而丙酮沉淀法的提取液中也含有SDS和巰基乙醇,也取得了較好的提取效果,但丙酮沉淀法耗時(shí)長(zhǎng)、方法復(fù)雜。在本試驗(yàn)中該法圖譜顯示電泳條帶較模糊,其原因是該法提取的蛋白質(zhì)呈固體狀,故上樣時(shí)將蛋白質(zhì)沉淀用上樣緩沖液稀釋了8倍,而其余方法樣品只稀釋了5倍,故丙酮沉淀法的稀釋倍數(shù)大于其他方法。
本課題組通過(guò)黨參、大黃、紅芪、苦豆子、甘草、黃芪、板藍(lán)根和柴胡9種藥材種子蛋白質(zhì)提取及SDSPAGE研究發(fā)現(xiàn)(待發(fā)表),巰基乙醇法均有很好的提取和電泳效果,適用性很廣,而且用時(shí)短,方法簡(jiǎn)單易行,可供其他植物種子借鑒使用。
當(dāng)歸種子蛋白質(zhì)分子量較小,采用15%的分離膠較12%、10%的分離膠蛋白質(zhì)電泳圖譜分離出的條帶更多,分離效果更好。在對(duì)9種藥材的種子蛋白質(zhì)電泳時(shí)發(fā)現(xiàn),15%的分離膠可獲得更多的電泳條帶。另外,在研究過(guò)程中本課題組發(fā)現(xiàn)利用冷藏和冷凍兩種方式保存了1周的蛋白質(zhì)提取液,在電泳時(shí)冷凍法保存的蛋白質(zhì)提取液其電泳條帶分離得更清晰,且在冷凍保存1個(gè)月后仍能取得良好的電泳效果。其原因可能是溫度越低越有利于蛋白質(zhì)的保存。因此,冷凍法能夠更長(zhǎng)時(shí)間地保存蛋白質(zhì)提取液,不會(huì)導(dǎo)致蛋白變性。
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Study on the Protein Extraction M ethod in Angelicae sinensis Seed and Its SDS-PAGE Technical System
ZHANG Yanhong,GAO Sufang,WANG Yan,LIJintian,DU Tao(School of Pharmacy,Gansu University of Chinese Medicine,Lanzhou 730000,China)
OBJECTIVE:To establish the technical system that is suitable for protein extracting in Angelicae sinensis seed and sodium dodecyl sulfate-polyacrylam ide gel electrophoresis(SDS-PAGE),and provide technical support for detecting the protein quality and variety purity.METHODS:Using protein content and number of electrophoretic bands as indexes,8 methods,including voncentrated gel method,salt-soluble protein method,electrode buffer method,dimercaptosyl alcohol(DTT)method,urea method,mercaptoethanolmethod,trimethylolaminomethane(Tris)method,and acetone precipitation method,were conducted to extract the protein in A.sinensis seed and screen the optimal extraction method.Then based on optimal extraction method,effects of differentmaterials-lipid ratios,sample dilution times(sample volume)and separate gel concentration on SDS-PAGE were investigated.RESULTS:Mercaptoethanolmethod extracted the highest protein contents(29.931 mg/g),w ith many electrophoretic bands and clear background.When mercaptoethanolmethod was used as optimal extraction method,electrophoresis effects were the best in the conditions ofmaterials-lipid ratio of 1∶10,sample volume of 5 times,separate gel concentration of 15%,which obtained 18 bands totally.CONCLUSIONS:Established protein extraction method and SDS-PAGE technical system are suitable for detecting the purity of A.sinensis seed.
Angelicae sinensis;Seed;Protein extraction;SDS-PAGE
R284.2
A
1001-0408(2017)13-1751-04
2016-08-27
2016-11-08)
(編輯:劉 萍)
國(guó)家中醫(yī)藥管理局“國(guó)家基本藥物所需中藥材種子種苗繁育基地建設(shè)”基金資助項(xiàng)目(No.國(guó)中醫(yī)藥辦規(guī)財(cái)發(fā)〔2013〕41號(hào))
*副教授,博士。研究方向:藥用植物育種和組織培養(yǎng)方面的教學(xué)和研究。E-mail:zhyh456789@163.com
#通信作者:教授,碩士生導(dǎo)師。研究方向:藥用植物育種的教學(xué)和研究。E-mail:gslzdt@163.com
DOI 10.6039/j.issn.1001-0408.2017.13.07