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抗水稻細菌性條斑病芽孢桿菌菌株的選育

2017-05-30 10:48:04吳建飛張金龍田迪朱金梅張溢峰白先放
安徽農(nóng)業(yè)科學 2017年16期
關(guān)鍵詞:響應面法

吳建飛 張金龍 田迪 朱金梅 張溢峰 白先放

摘要[目的]分離篩選得到抗水稻細菌性條斑病芽孢桿菌菌株,并進行鑒定,最后優(yōu)化其產(chǎn)芽孢發(fā)酵條件。[方法]采用牛津杯法測定菌株拮抗能力,通過單因素試驗對培養(yǎng)基成分和培養(yǎng)條件進行優(yōu)化,利用Plackett-Burman試驗篩選出3個顯著影響因子,最后利用響應面法確定顯著因子的最佳組合濃度。[結(jié)果]菌株JF48對細菌性條斑病菌的抑菌圈直徑達(37±3) mm,經(jīng)鑒定為解淀粉芽孢桿菌,其最佳產(chǎn)芽孢發(fā)酵條件為玉米粉14.69 g/L,豆粕粉 9.54 g/L,CaCl2 2.00 g/L,NaCl 5.00 g/L,MgSO4 1.00 g/L,裝液量50/250 mL,轉(zhuǎn)速為 200 r/min,初始 pH 7.5,溫度 38 ℃,接種量1.0%,最高芽孢產(chǎn)量為3.6×109 cfu/mL,與優(yōu)化前相比提高了105倍。[結(jié)論]菌株JF48對細菌性條斑病具有很強抗性,響應面法有效提高了其芽孢產(chǎn)量。

關(guān)鍵詞解淀粉芽孢桿菌;細菌性條斑?。豁憫娣?/p>

中圖分類號S435.111.4+9文獻標識碼A文章編號0517-6611(2017)16-0003-06

Study on Biocontrol of Bacterial Leaf Streak with Antagonistic Bacillus

WU Jianfei, ZHANG Jinlong, TIAN Di, BAI Xianfang* et al

(College of Life Science and Technology, Guangxi University, Nanning, Guangxi 530004)

Abstract[Objective] The aim was to screen a Bacillus strain with antagonistic ability to bacterial leaf streak and identify, and optimize the fermentation condition to enhance the spore production.[Method] We used Oxford cup method to determine the antagonistic ability; 16S rDNA sequence analysis was used to identify the strain; single factor and response surface tests to optimize sporulation conditions. [Result] The JF48 strain belonged to Bacillus amyloliquefaciens, and the diameter of the inhibition zone reached (37±3)mm; the optimal spore culture conditions of Bacillus amyloliquefaciens JF48 were as followsed: corn flour 14.69 g/L, soybean meal 9.54 g/L, CaCl2 2.00 g/L, NaCl 5.00 g/L, MgSO4 1.00 g/L, liquid volume 50 mL/250 mL, rotation 200 r/min, initial pH 7.5, temperature 38 ℃, inoculation 1.0%. Under this fermentation condition, the spore production of JF48 strain reached 3.6×109 cfu/mL, which was 105 times that of optimizing before.[Conclusion] The strain JF48 has a strong antagonistic ability to bacterial leaf streak and response surface method effectively improves its spore production.

Key wordsBacillus amyloliquefaciens;Bacterial leaf streak;Response surface methodology

基金項目2017年度廣西高等教育創(chuàng)優(yōu)計劃教學相關(guān)項目——優(yōu)勢特色專業(yè)項目(優(yōu)質(zhì)本科專業(yè))。

作者簡介吳建飛(1990—),男,湖南株洲人,碩士,從事微生物學研究。*通訊作者,教授,碩士生導師,從事生物技術(shù)研究。

收稿日期2017-04-19

水稻細菌性條斑?。˙acterial Leaf Streak,BLS),簡稱細條病,是由稻黃單胞菌稻生致病變種(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola,Xooc)引起的一種水稻病害。細條病的發(fā)生具有流行性、暴發(fā)性和毀滅性等特點[1-2],已經(jīng)成為世界水稻種植區(qū)的主要病害之一,嚴重威脅到水稻的高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)[3]。目前,防治水稻細菌性條斑病的主要藥物是噻唑類殺菌劑[4]?;瘜W藥劑在防治植物病蟲害的同時也殺死了許多無害甚至有益的生物,同時也提高了植物病原菌的抗藥性,對生態(tài)環(huán)境造成了嚴重的破壞。而以發(fā)展綠色農(nóng)業(yè)為宗旨的生物防治,將會在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中發(fā)揮越來越重要的作用,甚至可能替代化學藥劑成為一個綠色安全的選擇[5]。

解淀粉芽孢桿菌物種豐富,廣泛分布在土壤和植物表面。近年隨著解淀粉芽孢桿菌具有抑制多種植物病原菌能力的發(fā)現(xiàn),成為了具有微生物農(nóng)藥發(fā)展?jié)摿Φ奈⑸锓N類。筆者篩選分離得到的解淀粉芽孢桿菌JF48對水稻細菌性條斑病菌具有明顯的抗性,提高了其芽孢產(chǎn)量,為解淀粉芽孢桿菌JF48應用于生物防治方面提供了參考。

1材料與方法

1.1材料

1.1.1供試菌株。

拮抗菌株自土壤樣品中分離純化得到;水稻細菌性條斑病菌由廣西大學生命科學與技術(shù)學院何勇強教授提供。

1.1.2培養(yǎng)基。

NA培養(yǎng)基:酵母膏5 g/L,牛肉膏1 g/L,細菌學蛋白胨5 g/L,氯化鈉5 g/L,蔗糖10 g/L,pH 7.0。

種子培養(yǎng)基:細菌學蛋白胨10 g/L,牛肉膏3 g/L,葡萄糖5 g/L,氯化鈉5 g/L,pH 7.0。

碳源基礎培養(yǎng)基:酵母粉10 g/L,氯化鈉5 g/L,pH 7.0。

氮源基礎培養(yǎng)基:最適碳源5 g/L,氯化鈉5 g/L,pH 7.0。

無機鹽基礎培養(yǎng)基:氯化鈉5 g/L,最適碳源5 g/L,最適氮源10 g/L,pH 7.0。

LB培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g/L,酵母粉5 g/L,氯化鈉10 g/L,pH 7.0。

1.2方法

1.2.1拮抗菌株的分離與純化。

稱取10 g樣品土壤加入到裝有少許玻璃珠和90 mL無菌水的250 mL錐形瓶中,在200 r/min、30 ℃條件下振蕩搖勻30 min,制成1×10-1土壤懸浮液。吸取1 mL 1×10-1懸浮液至EP管中,80 ℃水浴15 min,按梯度依次稀釋至1×10-7~1×10-2,吸取合適稀釋梯度的稀釋液1 mL于平板上均勻涂布,倒置于30 ℃培養(yǎng)箱中,24 h后進行觀察,選取形態(tài)各異的單菌落。

1.2.2拮抗菌株的篩選和抑菌能力的測定。

初篩完成后,采用抑菌圈法對初篩得到菌株進行抑菌活性測定。測定時先在培養(yǎng)皿底部鋪1層5 mL左右的水瓊脂,以保證培養(yǎng)皿底部平整,冷卻后在培養(yǎng)皿中間放置牛津杯,將完全融化的NA培養(yǎng)基冷卻至50 ℃左右,每100 mL培養(yǎng)基中加入0.2 mL指示菌液(1×109 cfu/mL),搖勻,倒入平皿中,每皿15 mL左右,冷卻后取出牛津杯,每孔加入0.1 mL待篩選菌液(1×109 cfu/mL),以加NA液體培養(yǎng)基為空白對照,每個處理3次重復,靜置30 min,于30 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng),48 h后觀察抑菌效果,測量并記錄抑菌圈直徑。

1.2.3拮抗菌株的鑒定。

提取拮抗菌株的基因組DNA,采用通用引物對16S rDNA進行擴增,純化后送至華大基因科技有限公司進行測序。將測定的序列提交到 NCBI數(shù)據(jù)庫,應用BLAST 程序與已有的基因序列進行同源性比對分析,下載同源性較高的序列,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

1.2.4芽孢檢測及芽孢轉(zhuǎn)化率檢測方法。

采用稀釋涂布法對芽孢進行計數(shù)[6],通過顯微鏡觀察、計數(shù),計算芽孢轉(zhuǎn)化率。

1.2.5拮抗菌株產(chǎn)芽孢培養(yǎng)基成分及培養(yǎng)條件優(yōu)化。

1.2.5.1單因素試驗。試驗內(nèi)容包括碳源種類(葡萄糖、蔗糖、玉米粉、可溶性淀粉、麥芽糖、糊精)及其濃度(6.00、10.00、14.00、18.00、22.00 g/L)、氮源種類(胰蛋白胨、豆粕粉、酵母粉、牛肉膏、蛋白胨)及其濃度(6.00、8.00、10.00、12.00、14.00 g/L)、無機鹽(NaCl 5.00 g/L、 CaCl2 2.00 g/L、MgSO4 1.00 g/L、MnSO4 1.00 g/L、K2HPO4 0.10 g/L、 KH2PO4 0.10 g/L)、裝液量[50/250(mL)、75/250(mL)、100/250(mL)、125/250(mL)、150/250(mL)]、轉(zhuǎn)速(140、160、180、200、220 r/min)、初始pH(6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5)、培養(yǎng)溫度(29、31、33、35、37、39 ℃)、接種量(0.5%、1.0%、2.0%、3.0%、4.0%、5.0%)。

1.2.5.2Plackett-Burman 試驗。

根據(jù)單因素試驗結(jié)果,以芽孢產(chǎn)量(cfu/mL)為響應值設計6個因子的Plackett-Burman(PB)試驗篩選顯著因子,每個因子取高(+1)、低(-1)2個水平,確定各個因子對芽孢產(chǎn)量影響的大小。試驗因素與水平見表1。

1.2.5.3最陡爬坡試驗。

根據(jù) Plackett-Burman 試驗結(jié)果篩選出3個顯著影響因子及爬坡方向,以單因素試驗結(jié)果為依據(jù)確定爬坡步長。其他因素取單因素最佳水平,通過最陡爬坡試驗逼近芽孢產(chǎn)量最大值區(qū)域。試驗設計見表2。

1.2.5.4Box-Behnken 試驗。

以最陡爬坡試驗中最優(yōu)組合為中心點,使用Design-Expert 8.0.6設計3因素3水平Box-Behnken 試驗,各因素水平設置見表3。

2結(jié)果與分析

2.1拮抗菌株的分離與篩選

從土壤中分離得到的菌株JF48對細菌性條斑病的抑制能力最強,其抑菌圈直徑達(37±3)mm(圖1)。測定JF48菌株最初在LB培養(yǎng)基中芽孢產(chǎn)量為3.4×107 cfu/mL。

2.2拮抗菌株的鑒定

拮抗菌株16S rDNA擴增片段檢測結(jié)果如圖2所示。測序結(jié)果進行BLAST分析,構(gòu)建JF48菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹如圖3所示。

測序所得序列進行同源性比較,結(jié)果表明,菌株JF48與解淀粉芽孢桿菌同源性高達99%,系統(tǒng)發(fā)育樹中菌株JF48與解淀粉芽孢桿菌處于同一分支。因此,鑒定JF48菌株為解淀粉芽孢桿菌Bacillus amyloliquefaciens。

2.3單因素試驗結(jié)果

2.3.1碳源種類及濃度的優(yōu)化。

由圖4可知,碳源種類對菌株JF48芽孢產(chǎn)量的影響非常顯著,當以玉米粉為碳源時芽孢產(chǎn)量達0.95×108 cfu/mL,其芽孢轉(zhuǎn)化率也最高。

由圖5可知,玉米粉濃度為1.4%時芽孢數(shù)量和轉(zhuǎn)化率達到最大,芽孢產(chǎn)量達1.88×108 cfu/mL。此后,隨著玉米粉濃度的繼續(xù)增加,營養(yǎng)物質(zhì)過剩,不利于芽孢的形成,芽孢產(chǎn)量減少。

2.3.2氮源種類及濃度的優(yōu)化。

由圖6可知,不同氮源對菌體總量及芽孢轉(zhuǎn)化率的影響有較大差異,以豆粕粉為氮源時芽孢量達5.87×108 cfu/mL,芽孢轉(zhuǎn)化率達80%。

由圖7可知,氮源濃度對菌體總量影響較大。在豆粕粉濃度為1.0%時芽孢產(chǎn)量達到最大值。

2.3.3無機鹽種類的優(yōu)化。

由圖8可知,與對照組相比CaCl2、MgSO4能有效提高JF48菌株的芽孢產(chǎn)量和轉(zhuǎn)化率。故選擇向JF48培養(yǎng)基中加入CaCl2、MgSO4。

2.3.4裝液量對芽孢產(chǎn)量和轉(zhuǎn)化率的影響。

由圖9可知,裝液量對芽孢產(chǎn)量和芽孢轉(zhuǎn)化率都有較大影響。裝液量在50 mL時芽孢產(chǎn)量和芽孢轉(zhuǎn)化率均最高,芽孢產(chǎn)量為1.46×109 cfu/mL。

2.3.5搖床轉(zhuǎn)速對芽孢產(chǎn)量和轉(zhuǎn)化率的影響。

由圖10可知,隨著轉(zhuǎn)速的增加,芽孢轉(zhuǎn)化率一直在提高,然而芽孢總數(shù)卻先增后減,并在200 r/min時達到最大值。

2.3.6初始pH對芽孢產(chǎn)量和轉(zhuǎn)化率的影響。

由圖11可知,芽孢產(chǎn)量和轉(zhuǎn)化率都在初始pH 7.5時達到最大值,芽孢量達1.48×109 cfu/mL。

2.3.7溫度對芽孢產(chǎn)量和轉(zhuǎn)化率的影響。

由圖12可知,隨著溫度的升高,芽孢轉(zhuǎn)化率變化不大,芽孢產(chǎn)量先增后減,并在37 ℃時達到最大值(3.03×109 cfu/mL)。

2.3.8接種量對芽孢產(chǎn)量和轉(zhuǎn)化率的影響。

由圖13可知,接種量在0.5%~2.0%時對芽孢產(chǎn)量影響很小,并在1.0%時達到最大值(3.06×109 cfu/mL)。

2.4Plackett-Burman 試驗結(jié)果

試驗設計及結(jié)果見表 4。方差分析表明,模型P=0.003 5,模型顯著。A(玉米粉)、B(豆粕粉)、F(溫度)3個因素影響顯著。由P值可知,因素影響重要性大小為F(溫度)>B(豆粕粉)>A(玉米粉),選取這3個顯著影響因素進一步試驗。

2.5最陡爬坡試驗結(jié)果

根據(jù) Plackett-Burman 試驗結(jié)果可以得出,A(玉米粉)、B(豆粕粉)、F(溫度)3個因素都為正效應,以芽孢產(chǎn)量的梯度方向作為爬坡方向,設計最陡爬坡試驗,結(jié)果見表5。

2.6響應面試驗結(jié)果由最陡爬坡試驗可知,在第3組試驗芽孢產(chǎn)量達到最大值,此時因素水平設置為A(玉米粉)15 g/L、B(豆粕粉)10 g/L、F(溫度)38 ℃。以該試驗組合為試驗中心點進行響應面 Box-Benhnken 設計與分析(表6)。將試驗結(jié)果輸入設計表格,運行Design-Expert 8.0.6,對響應值進行多元回歸擬合及方差分析。

試驗所得模型回歸擬合度P<0.000 1,說明該模型回歸顯著性好,芽孢產(chǎn)量與試驗因素之間存在顯著的回歸關(guān)系。失擬值P(0.368)>0.05,模型的失擬項不顯著,說明試驗誤差小。該模型的決定系數(shù)R2=0.991 9,校正決定系數(shù)R2=0.981 4,表明該回歸方程求得的芽孢產(chǎn)量預測值的可信度為98.14%。

運用 Design-Expert 8.0.6得到3個顯著影響因子兩兩相互作用的響應面三維圖及等高線圖。響應面曲線圖凸起,則表明有與最大響應值相對應的最適變量組合。等高線的形狀則可以形象地反映出因素間交互作用的強弱。如果等高線為橢圓形,表明2個因素的交互作用顯著;若等高線近似圓形,則說明2個因素的交互作用不顯著。

由圖14可知,當溫度一定時,隨著玉米粉和豆粕粉濃度的增加,芽孢產(chǎn)量呈現(xiàn)明顯先增加后減少的趨勢,后期由于碳氮比例過高,碳源過剩反而不利于芽孢的形成;等高線圖呈橢圓形,說明玉米粉和豆粕粉交互作用明顯。

由圖15可知,當豆粕粉濃度一定時,隨著玉米粉、豆粕粉的增加,芽孢產(chǎn)量先增后減,后期碳源過剩會降低芽孢轉(zhuǎn)

化率,溫度過高會抑制菌體生長;等高線圖呈圓形,說明玉米粉和溫度交互作用不顯著。

由圖16可知,當玉米粉濃度一定時,芽孢產(chǎn)量受溫度變化影響較大,受豆粕粉濃度影響較??;芽孢產(chǎn)量隨著兩者的增加呈現(xiàn)先增后減的趨勢;等高線圖呈橢圓形,說明豆粕粉和溫度兩者交互作用明顯。

通過對響應面回歸方程的求導,可以得出該模型的最大值。當A=14.69(g/L)、B=9.54(g/L)、C=38.26 ℃時,預測芽孢產(chǎn)量可達3.687 4×109 cfu/mL。

為了驗證該模型的可行性,采用最佳培養(yǎng)條件進行驗證。3次驗證試驗平均芽孢產(chǎn)量為3.6×109 cfu/mL,與模型預測值(3.687 4×109 cfu/mL)接近,說明該模型可以用來預測實際發(fā)酵情況。

3結(jié)論

從土壤中篩選得到的抗細菌性條斑病芽孢桿菌菌株JF48抑菌圈直徑達(37±3)mm,表明其對細條病菌有很強的抗性,經(jīng)16S rDNA鑒定為解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens);通過單因素和響應面試驗得到其最佳產(chǎn)芽孢發(fā)酵條件:玉米粉14.69 g/L,豆粕粉 9.54 g/L,CaCl2 2.00 g/L,NaCl 5.00 g/L,MgSO4 1.00 g/L,裝液量50 mL/250 mL,轉(zhuǎn)速為 200 r/min,初始 pH 7.5,溫度 38 ℃,接種量1.0%。最終芽孢產(chǎn)量達3.6×109 cfu/mL,與優(yōu)化前的3.4×107 cfu/mL相比提高了105倍,與預測值(3.687 4×109 cfu/mL)接近,說明該模型可以用來預測實際發(fā)酵情況。

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