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廣西扶綏縣肝癌高危人群HBV S區(qū)基因突變與原發(fā)性肝癌的相關(guān)性研究

2017-07-18 12:03:55甘膺元鄧偉黃天壬吳杭航黃月瑩張玉麗
中國(guó)癌癥防治雜志 2017年3期
關(guān)鍵詞:基因突變測(cè)序肝癌

甘膺元鄧偉黃天壬吳杭航黃月瑩張玉麗

作者單位:530021南寧1廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院實(shí)驗(yàn)研究部;2廣西醫(yī)科大學(xué)研究生院

廣西扶綏縣肝癌高危人群HBV S區(qū)基因突變與原發(fā)性肝癌的相關(guān)性研究

甘膺元1,2鄧偉1黃天壬2吳杭航1,2黃月瑩1,2張玉麗1,2

作者單位:530021南寧1廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院實(shí)驗(yàn)研究部;2廣西醫(yī)科大學(xué)研究生院

目的探討廣西扶綏縣肝癌高危人群乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)S區(qū)基因突變及其與原發(fā)性肝癌(primary liver cancer,PLC)的關(guān)系。方法收集來(lái)自扶綏縣肝癌高危人群隊(duì)列30例原發(fā)性肝癌患者為病例組,同時(shí)在隊(duì)列中按條件收集30例未發(fā)生肝癌的持續(xù)HBsAg陽(yáng)性者為對(duì)照組,兩組1∶1匹配,收集血清標(biāo)本。采用巢式PCR方法擴(kuò)增出HBV S區(qū)基因片段,對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序分析。結(jié)果病例組和對(duì)照組突變率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的突變點(diǎn)為T(mén)140A、T140C、T300C、G620A(P<0.05);條件logistic回歸分析顯示,T140C突變可能降低原發(fā)性肝癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.484,95%CI:0.239~0.994),T300C突變可能增加原發(fā)性肝癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=2.911,95%CI:1.110~7.629)。結(jié)論與原發(fā)性肝癌發(fā)生相關(guān)的HBVS區(qū)基因突變位點(diǎn)有T140A、T140C、T300C和G620A,其中T140C、T300C與原發(fā)性肝癌發(fā)生有獨(dú)立相關(guān)性。

肝腫瘤;乙型肝炎病毒;S基因;基因突變;病例對(duì)照研究

原發(fā)性肝癌(primary liver cancer,PLC)是常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,廣西是我國(guó)肝癌高發(fā)地區(qū),據(jù)統(tǒng)計(jì),2013年廣西肝癌發(fā)病率高達(dá)41.66/10萬(wàn),死亡率達(dá)34.66/10萬(wàn)[1]。扶綏縣是廣西肝癌發(fā)病率和死亡率較高的地區(qū)之一,而HBV感染是該地區(qū)肝癌高發(fā)的重要因素。HBV屬嗜肝DNA病毒科病毒,其DNA由負(fù)鏈和正鏈組成,負(fù)鏈含4個(gè)開(kāi)放讀碼框架,分別為前S/S基因區(qū)、前C/C基因區(qū)、P基因區(qū)和X基因區(qū),其中HBV S區(qū)基因序列包括第155~833位核苷酸,編碼226個(gè)氨基酸。其中親水區(qū)(majorhydrophilic region,MHR)位于nt.100~169,為S區(qū)基因常出現(xiàn)突變的片段。研究發(fā)現(xiàn)該片段發(fā)生突變易造成免疫逃逸,導(dǎo)致病情加重、預(yù)后不良,而在MHR外的sW172突變者較未突變者肝癌發(fā)生率顯著增高[2]。但目前對(duì)廣西扶綏縣肝癌發(fā)生與S區(qū)基因突變的相關(guān)性研究較少,本研究探討HBV S區(qū)基因突變與PLC相關(guān)性,現(xiàn)報(bào)道如下。

1 材料與方法

1.1 研究對(duì)象

所有研究對(duì)象均來(lái)自廣西扶綏縣肝癌高發(fā)區(qū)肝癌高危人群隨訪隊(duì)列,該隊(duì)列由早期全人群篩查后檢測(cè)為HBsAg陽(yáng)性但未發(fā)生肝癌者組成,其中病例組為隊(duì)列中連續(xù)5年(2011~2015年)隨訪檢測(cè)結(jié)果HBsAg均陽(yáng)性的(半年檢測(cè)1次)PLC新發(fā)病例30例,年齡30~65歲,診斷符合中國(guó)抗癌協(xié)會(huì)肝癌專(zhuān)業(yè)委員會(huì)2015年修訂的《原發(fā)性肝癌規(guī)范化病理診斷指南》;對(duì)照組選擇標(biāo)準(zhǔn)為該隊(duì)列中與病例組同村、同性別、年齡相差2歲以?xún)?nèi)但未發(fā)生癌變的持續(xù)5年檢測(cè)為HBsAg陽(yáng)性者,與病例組進(jìn)行1∶1匹配。病例組和對(duì)照組的HBV基因型均要求為C型,基因型根據(jù)S區(qū)核苷酸序列測(cè)序結(jié)果,采用NCBI在線病毒基因分型工具確定[3]。收集病例組和對(duì)照組血清標(biāo)本,置-80℃冰箱備用。

1.2 HBV DNA的提取

血清HBV DNA提取試劑盒購(gòu)于上海天根生化科技公司,提取過(guò)程嚴(yán)格按照試劑盒說(shuō)明書(shū)操作。

1.3 HBV S區(qū)基因的PCR擴(kuò)增

引物合成和Taq酶購(gòu)自寶生物工程有限公司。HBV DNA基因擴(kuò)增采用巢式PCR方法,第一輪反應(yīng)引物序列:上游引物為5′-GGGTCACCATATTCTTGGG-3′,下游引物為5′-GACCCACAATTCTTTGACAT-3′;第二輪反應(yīng)引物序列:上游引物為5′-GCGGGGTTTTTCTTGTTGA-3′,下游引物為5′-GGGACTCAAGATGTTGTACAG-3′。PCR反應(yīng)體系總體積為50μL,含DNA模板3μL,上下游引物各1μL,Premix Taq 25μL,加入ddH2O補(bǔ)足至50μL。PCR反應(yīng)條件:第一輪:95℃預(yù)變性3 min;94℃變性15 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 min,共30個(gè)循環(huán);72℃終末循環(huán)10 min;第二輪反應(yīng)退火溫度為58℃,其他反應(yīng)條件同第一輪PCR反應(yīng)條件。取產(chǎn)物7μL進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,產(chǎn)物目的基因長(zhǎng)度為586 bp。

1.4 HBV S區(qū)基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序及結(jié)果分析

PCR擴(kuò)增產(chǎn)物由北京六合華大基因科技股份有限公司廣州分公司測(cè)序,返回的結(jié)果采用Mutation Surveyor V4.0.5軟件與GenBank上的NC_003977.2進(jìn)行比對(duì)分析。

1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

采用SPSS 23.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。兩組研究對(duì)象配對(duì)采用單因素配對(duì)χ2檢驗(yàn)或確切概率法,單因素分析結(jié)果有意義的突變點(diǎn)進(jìn)行多因素條件logistic回歸分析。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 一般資料比較

病例組和對(duì)照組的性別、年齡、ALT、DNA拷貝數(shù)等一般資料比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見(jiàn)表1。

表1 兩組一般資料比較[n(%)]

2.2 HBV S區(qū)基因的PCR擴(kuò)增及測(cè)序結(jié)果

擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠電泳結(jié)果顯示,7份樣本PCR產(chǎn)物中,6份通過(guò)凝膠電泳在586 bp處出現(xiàn)亮條帶,與目的片段長(zhǎng)度相符,3號(hào)樣本因產(chǎn)物濃度過(guò)低未見(jiàn)相應(yīng)電泳條帶,見(jiàn)圖1。將S區(qū)擴(kuò)增產(chǎn)物與GenBank上的NC_003977.2進(jìn)行比對(duì),結(jié)果顯示突變率較高的位點(diǎn)有33個(gè),部分結(jié)果如圖2所示,該圖為對(duì)照組編號(hào)24的標(biāo)準(zhǔn)序列300號(hào)堿基T突變?yōu)镃,相鄰位點(diǎn)未出現(xiàn)突變。

2.3 HBV S區(qū)基因突變點(diǎn)

測(cè)序結(jié)果顯示,HBV S區(qū)共有33個(gè)堿基位點(diǎn)發(fā)生突變,其中病例組和對(duì)照組突變頻率均較高(≥50%)的有A133G、T135A、A136C、T146C、C203T、A328C、T337A、C339A、C364A、G365A、T374C、A378C、A401C、C408T、C420A、C444T、C465T、G476C、A479G、C503T,兩組均較低(<50%)的有T213C、C246A、A345T、C348A、C377T、A390C、T530C,兩組突變率相差較大(相差>30%)的有G139A、T140A、T140C、C158T、T300C、G620A。

圖1 HBV S區(qū)基因擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖

圖2 對(duì)照組編號(hào)24部分測(cè)序結(jié)果分析圖

2.4 HBV S區(qū)基因突變的單因素分析

在33個(gè)發(fā)生突變的基因位點(diǎn)中,病例組和對(duì)照組T140C、T140A、T300C、G620A突變點(diǎn)的突變率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),其中病例組T140A、T300C突變點(diǎn)的突變率高于對(duì)照組,T140C、G620A突變率低于對(duì)照組。見(jiàn)表2。

2.5 多因素條件logistic回歸分析結(jié)果

logistic回歸分析結(jié)果顯示,T140C突變可能降低PLC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.484,95%CI:0.239~0.994);T300C突變可能增加PLC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=2.911,95%CI:1.110~7.629)。見(jiàn)表3。

表2 HBV S區(qū)基因突變單因素分析

表3 HBV S區(qū)基因突變多因素條件logistic回歸分析

3 討論

肝癌的發(fā)生是一個(gè)多因素、多基因參與和調(diào)控的復(fù)雜過(guò)程,HBV慢性持續(xù)感染是PLC發(fā)生的重要因素。HBV是高度變異的DNA病毒,基因突變發(fā)生較頻繁,研究發(fā)現(xiàn)75.9%的HBV再活化患者中攜帶超過(guò)1種HBsAg突變體[4],分析優(yōu)勢(shì)基因型中毒株的基因突變可能有助于尋找PLC發(fā)生的病因。國(guó)內(nèi)外研究中,與HBV S區(qū)相關(guān)的基因突變所引起的氨基酸改變主要發(fā)生于“a”抗原決定簇內(nèi)(第124~147AA寡片段)[5],該區(qū)段內(nèi)突變可能改變膜蛋白構(gòu)象,影響抗原性而不能形成誘導(dǎo)性抗體,從而引起免疫逃避[6-7],發(fā)生隱匿型HBV感染(occult hepatitis B virus infection,OBI)[8],其中較常見(jiàn)的突變有126、145位氨基酸突變[9-11]。亦有研究指出G145R單一突變引起免疫逃避的風(fēng)險(xiǎn)不高,需其他氨基酸(如T116N、P120S/E、Q129H等)發(fā)生突變產(chǎn)生協(xié)同作用,才能增加風(fēng)險(xiǎn)[12]。此外,堿基突變可使終止密碼子提前出現(xiàn)和HBV S區(qū)部分片段缺失,影響HBsAg表達(dá)、合成和分泌,從而影響OBI發(fā)展[13-16]。

本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)病例組和對(duì)照組中126位蘇氨酸的核苷酸位點(diǎn)C377T突變率相同,說(shuō)明扶綏縣肝癌高危人群中HBV 126位蘇氨酸突變與PLC的發(fā)生無(wú)相關(guān)性,這和其他地區(qū)的研究結(jié)果不一致。錢(qián)福初等[17]研究發(fā)現(xiàn)HBV S區(qū)基因突變尤其是MHR出現(xiàn)突變,可能增加嚴(yán)重肝臟疾病的發(fā)生率,其中與126位氨基酸突變的相關(guān)性最強(qiáng)。地區(qū)優(yōu)勢(shì)基因差異可能是造成與本研究結(jié)果不同的原因。

本研究結(jié)果還顯示,T140A、T140C、T300C和G620A突變與扶綏縣肝癌高危人群發(fā)病有相關(guān)性,其中T300C突變?cè)贛HR內(nèi),該突變?cè)讵?dú)立風(fēng)險(xiǎn)分析中顯示與PLC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)呈正相關(guān)(OR=2.911),提示其可能增加HBsAg持續(xù)陽(yáng)性者發(fā)生PLC的風(fēng)險(xiǎn),但該位點(diǎn)突變的發(fā)生在國(guó)內(nèi)尚未有報(bào)道,或許能為研究扶綏縣免疫逃避等因素對(duì)PLC發(fā)生發(fā)展的影響提供新的思路。另外,T140C突變導(dǎo)致47位纈氨酸突變?yōu)楸彼幔讵?dú)立風(fēng)險(xiǎn)分析中提示該突變可能降低扶綏縣肝癌高危人群的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),但該位點(diǎn)突變的出現(xiàn)是否與隊(duì)列人群的藥物干預(yù)、臨床治療相關(guān),尚需進(jìn)一步調(diào)查研究。

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[2017-02-21收稿][2017-03-25修回][編輯羅惠予]

A case-control study of association between hepatitis B virus S genemutation and primary liver cancer

Gan Yingyuan1,2,Deng Wei1,Huang Tianren2,Wu Hanghang1,2,Huang Yueying1,2,Zhang Yuli1,2(1Department of Research,Affiliated Tumor Hospital of GuangxiMedical University,2Graduate School of GuangxiMedical University,Nanning 530021,P.R.China)

Huang Tianren.E-mail:tianrenhuang@sina.com

Liver neoplasm;Hepatitis B virus;Sgene;Genemutation;Case-control study

R735.7

A

1674-5671(2017)03-05

10.3969/j.issn.1674-5671.2017.03.04

國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81260319);廣西高??茖W(xué)技術(shù)研究資助項(xiàng)目(KY2015ZD025,ZD2014039,2013ZD016)

黃天壬。E-mail:tianrenhuang@sina.com

【Abstract】Objective To study potential associations between mutations in hepatitis B virus(HBV)S gene and risk of primary liver cancer(PLC)in FuSui county of the Guangxi Zhuang Autonomous Region.M ethods A total of 30 new cases of PLC from individuals at high PLC risk in FuSui(based on HBsAg positivity lasting from 2011 to 2015)werematched with 30 controlswithout cancer.The S genewas amplified from DNA in serum by nested PCR and sequenced directly.Results were analyzed by chi-squared test,F(xiàn)isher's exact test and conditional logistic regression.Results Frequencies of themutations T140A,T140C,T300C and G620A differed significantly between cases and controls(P<0.05).Logistic regression linked T140C to significantly lower risk of PLC(OR 0.484,95%CI:0.239-0.994)and T300Cwith significantly higher risk of PLC(OR 2.911,95%CI:1.110-7.629).Conclusion T140C and T300C are independent predictors of PLC,with T140C an apparent protective factor and T300C an apparent risk factor.

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