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不同刪失比例下AFT模型與Cox模型表現(xiàn)比較的模擬研究*

2017-09-03 10:00:10昆明醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)系650500肖媛媛何利平許傳志
中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì) 2017年4期
關(guān)鍵詞:估計(jì)值參數(shù)估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)差

昆明醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)系(650500) 肖媛媛 陳 瑩 何利平 喻 箴 許傳志

不同刪失比例下AFT模型與Cox模型表現(xiàn)比較的模擬研究*

昆明醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)系(650500) 肖媛媛 陳 瑩 何利平 喻 箴 許傳志△

目的 評(píng)價(jià)當(dāng)生存數(shù)據(jù)出現(xiàn)不同刪失比例的條件下,AFT模型和Cox模型的表現(xiàn)優(yōu)劣。方法 采用自編SAS宏程序模擬不同參數(shù)設(shè)置、不同比例均勻刪失的Weibull分布,分別采用AFT模型和Cox模型對(duì)模擬產(chǎn)生的數(shù)據(jù)進(jìn)行擬合,并從偏倚、準(zhǔn)確性和覆蓋程度三個(gè)指標(biāo)對(duì)兩個(gè)模型的表現(xiàn)進(jìn)行評(píng)價(jià)。結(jié)果 在分布參數(shù)和自變量效應(yīng)值固定的情況下,AFT模型在參數(shù)估計(jì)偏倚和準(zhǔn)確性兩方面的表現(xiàn)卻始終優(yōu)于Cox模型。刪失比例越大,AFT模型的表現(xiàn)相對(duì)而言越優(yōu)異。而在覆蓋程度方面,對(duì)于相同參數(shù)設(shè)置及刪失比例的模擬數(shù)據(jù),兩個(gè)模型的表現(xiàn)相似。結(jié)論 AFT模型的總體表現(xiàn)優(yōu)于Cox模型,當(dāng)刪失生存數(shù)據(jù)同時(shí)滿足兩類模型的應(yīng)用條件時(shí),應(yīng)該優(yōu)先選擇偏倚更小、準(zhǔn)確性更高的AFT模型進(jìn)行分析。

AFT模型 Cox模型 刪失比例 表現(xiàn) 模擬研究

作為最為常見的兩類生存分析模型,Cox模型與AFT模型在不同條件下的表現(xiàn)比較是一個(gè)引人關(guān)注的問題,也有部分學(xué)者曾經(jīng)探討過,但大都集中在參數(shù)估計(jì)的準(zhǔn)確度及數(shù)據(jù)擬合優(yōu)度的比較方面。如Orbe等采用隨機(jī)數(shù)據(jù)模擬的方法比較了一類半?yún)?shù)AFT模型和Cox模型的擬合優(yōu)度,發(fā)現(xiàn)半?yún)?shù)AFT模型得到的結(jié)果更為準(zhǔn)確[1];Qi在運(yùn)用AFT模型和Cox模型擬合同一真實(shí)數(shù)據(jù)后發(fā)現(xiàn)AFT模型的擬合優(yōu)度要高于Cox模型[2];Sayehmir等[3],Ponnuraja等[4],Nawumbeni等[5]將AFT模型和Cox模型同時(shí)運(yùn)用于真實(shí)數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)AFT模型的預(yù)測(cè)表現(xiàn)明顯優(yōu)于Cox模型等。但目前尚無研究討論在應(yīng)用條件同時(shí)滿足時(shí),不同刪失數(shù)據(jù)比例下AFT模型和Cox模型的表現(xiàn)比較。本研究擬采用隨機(jī)數(shù)據(jù)模擬的方法對(duì)這一問題進(jìn)行初步探討。

對(duì)象與方法

1.選擇模擬分布

要對(duì)AFT模型和Cox模型的表現(xiàn)進(jìn)行對(duì)比,就必須采用同一模擬數(shù)據(jù)集。因此,模擬的數(shù)據(jù)集必須同時(shí)滿足AFT模型和Cox模型的應(yīng)用條件,即比例風(fēng)險(xiǎn)和恒定加速失效因子。常見的生存分布類型中,只有兩種分布同時(shí)滿足上述兩個(gè)應(yīng)用條件,指數(shù)分布(exponential distribution)和Weibull分布(Weibull distribution)??紤]到指數(shù)分布是Weibull分布的特例,為不失一般性,本研究選擇Weibull分布為模擬分布。

2.模擬設(shè)計(jì)

(1)模擬條件設(shè)定

為了集中討論不同參數(shù)條件下刪失比例對(duì)兩類模型表現(xiàn)的影響,在數(shù)據(jù)模擬前,我們對(duì)模擬數(shù)據(jù)的其他特征簡化設(shè)定如下:只研究單一自變量,且為了兼顧統(tǒng)計(jì)效能,該自變量取值定義為滿足參數(shù)為B(1,0.5)的二項(xiàng)分布;所有模擬組別均為大樣本(N=1000),不考慮樣本含量對(duì)結(jié)果的影響;只考慮隨機(jī)刪失,且刪失分布定義為均勻分布;考慮到Weibull分布中尺度參數(shù)λ的作用僅為拉伸或壓縮原始分布,并不改變其形狀,因此總可以用固定系數(shù)將其還原為原始分布,故模擬研究中不再考慮它的變化對(duì)結(jié)果的影響,所有模擬組均設(shè)置為1。

(2)產(chǎn)生生存時(shí)間

目前在隨機(jī)模擬產(chǎn)生滿足比例風(fēng)險(xiǎn)假定的生存時(shí)間分布,即指數(shù)分布、Weibull分布和Gompertz分布時(shí),經(jīng)常采用的是Bender等于2005年提出的模擬方法[6]。本次研究也采用上述方法隨機(jī)產(chǎn)生生存數(shù)據(jù),具體步驟為:①采用SAS統(tǒng)計(jì)分析軟件產(chǎn)成[0,1]上均勻分布的隨機(jī)變量U,樣本含量為N;②根據(jù)預(yù)先設(shè)定的分布參數(shù)λ、γ以及協(xié)變量的回歸系數(shù)向量β,結(jié)合生成的隨機(jī)變量U的取值,利用公式1轉(zhuǎn)換得到生存時(shí)間T,樣本含量同樣為N。

(3)生成含特定比例刪失的生存數(shù)據(jù)

在進(jìn)行生存數(shù)據(jù)的隨機(jī)模擬研究時(shí),刪失數(shù)據(jù)的生成遠(yuǎn)比完整數(shù)據(jù)復(fù)雜得多,尤其是含特定比例刪失的數(shù)據(jù)。除非特別說明,本文所指代的刪失均為隨機(jī)刪失。在前期對(duì)相關(guān)領(lǐng)域文獻(xiàn)進(jìn)行細(xì)致檢索和梳理后,我們發(fā)現(xiàn):雖然有學(xué)者已經(jīng)提出了一些含特定比例刪失生存數(shù)據(jù)的模擬方法,但這些方法或是在邏輯架構(gòu)上就存在欠妥之處,或是經(jīng)實(shí)際驗(yàn)證無法得到設(shè)定刪失比例的生存數(shù)據(jù)。正是由于現(xiàn)有研究存在上述不足,在當(dāng)前研究中,我們采用自行編制的SAS宏程序隨機(jī)模擬產(chǎn)生含特定比例刪失的生存數(shù)據(jù)。該宏程序的編制思路、步驟及具體的程序步驟我們已在前期發(fā)表的一項(xiàng)研究中進(jìn)行過詳細(xì)描述[7]。

(4)模擬策略

前面已經(jīng)述及,根據(jù)研究目的,模擬所需的部分非重點(diǎn)關(guān)注參數(shù)和特征已經(jīng)設(shè)置為恒定。在設(shè)置模擬策略時(shí),只重點(diǎn)關(guān)注Weibull分布形狀參數(shù)γ,比例風(fēng)險(xiǎn)效應(yīng)系數(shù)β和刪失比例設(shè)定值P的變化對(duì)兩類生存分析模型表現(xiàn)的影響。因此,最終確定執(zhí)行如下4組模擬,其中,每組模擬均執(zhí)行刪失比例分別為10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%的9小組模擬(表1)。

在進(jìn)行模擬研究時(shí),依據(jù)所要達(dá)到的估計(jì)值準(zhǔn)確度的大小,可以采用公式(2)計(jì)算單次模擬的模擬次數(shù)[8]:

上式中,σ是所估計(jì)參數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)差,δ是預(yù)先設(shè)定的參數(shù)估計(jì)精度,可用標(biāo)準(zhǔn)差的百分位數(shù)表示,Z1-(a/2)是標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)分布下第1-(a/2)百分位數(shù)的取值,1-θ為檢驗(yàn)效能。

本次研究中,δ取σ的15%,檢驗(yàn)效能定為90%,由此計(jì)算得到的模擬次數(shù)為467次。為方便起見,每小組模擬重復(fù)次數(shù)統(tǒng)一取500次。

3.模型表現(xiàn)評(píng)價(jià)指標(biāo)

隨機(jī)數(shù)據(jù)模擬研究在評(píng)價(jià)特定模型擬合變現(xiàn)時(shí),通常采用如下三個(gè)方面的指標(biāo):偏倚(bias)、準(zhǔn)確性(accuracy)和覆蓋程度(coverage)[8]。本次研究中將每次通過完整數(shù)據(jù)得到的參數(shù)估計(jì)值作為金標(biāo)準(zhǔn),也從上述三個(gè)方面出發(fā)設(shè)定如下評(píng)價(jià)指標(biāo):

(1)偏倚:評(píng)價(jià)指標(biāo)為采用刪失數(shù)據(jù)得到的模型參數(shù)估計(jì)值^β與使用完整數(shù)據(jù)擬合模型得到的參數(shù)估計(jì)值^β0相比的相對(duì)絕對(duì)偏差,其計(jì)算公式參見公式(3):

(2)準(zhǔn)確性:評(píng)價(jià)指標(biāo)為采用刪失數(shù)據(jù)得到的模型參數(shù)估計(jì)值^β的標(biāo)準(zhǔn)差^S與使用完整數(shù)據(jù)擬合模型得到的參數(shù)估計(jì)值^β0的標(biāo)準(zhǔn)差^S0的比值,其計(jì)算公式參見公式(4):

(3)覆蓋程度:覆蓋程度是指用模擬數(shù)據(jù)得到的效應(yīng)估計(jì)值多大程度覆蓋了真實(shí)效應(yīng)值。本次模擬研究采用顯著性一致率來評(píng)價(jià)覆蓋程度,定義為使用完整數(shù)據(jù)得到的參數(shù)估計(jì)值^β0顯著(P<0.05)的模擬次數(shù)(N)中,采用刪失數(shù)據(jù)得到的參數(shù)估計(jì)值^β也同樣顯著的次數(shù)(Nacco)所占的百分比。其計(jì)算公式參見公式(5):

結(jié) 果

1.偏倚

(1)兩模型總體比較

從圖1可以看出,在四組模擬策略下,不論生存分布的形狀參數(shù)γ及自變量X的效應(yīng)系數(shù)β如何設(shè)置,隨著刪失比例的增加,Cox模型和AFT模型的偏倚都逐漸加大,但在任何刪失比例下,AFT模型的偏倚均小于Cox模型的偏倚。

在四組模擬策略下,隨著刪失比例的增加,AFT模型和Cox模型的偏倚之差逐漸增大。刪失比例在70%以下時(shí),兩模型偏倚之差增速較緩;當(dāng)刪失比例超過70%時(shí),偏倚之差陡增。此外,在刪失比例小于70%時(shí),模擬數(shù)據(jù)參數(shù)設(shè)置對(duì)兩類模型偏倚之差的影響不大,而當(dāng)刪失比例大于70%時(shí),隨著形狀參數(shù)γ的增大,或效應(yīng)系數(shù)β的減小,AFT模型和Cox模型的偏倚之差迅速增大(圖2)。

(2)不同形狀參數(shù)下兩類模型的偏倚變化

從圖3可以看出:對(duì)兩類模型而言,當(dāng)刪失數(shù)據(jù)比例小于60%時(shí),形狀參數(shù)γ的變化對(duì)偏倚的影響不大;而當(dāng)刪失比例大于60%時(shí),隨著刪失比例的增加,γ對(duì)偏倚的影響逐漸增大。尤其是Cox模型,大約在缺失比例50%時(shí),γ對(duì)偏倚的影響開始顯現(xiàn),到缺失比例90%時(shí),γ=2時(shí)的偏倚比γ=0.5時(shí)的偏倚大約9%(35.2%和26.2%)。對(duì)AFT模型而言,偏倚的增幅不明顯,同樣在缺失比例90%時(shí),γ=0.5和γ=2的偏倚差距僅為不到2%(13.0%和11.2%)。

(3)自變量不同效應(yīng)參數(shù)下兩類模型的偏倚變化

從圖4可以看出:在任一刪失比例下,當(dāng)研究因素X的效應(yīng)逐漸減弱時(shí),Cox模型和AFT模型的偏倚均逐漸增大。偏倚的增加速度也隨刪失比例的增大而增大,尤其當(dāng)刪失比例大于70%時(shí),效應(yīng)參數(shù)越小的組別偏倚的增大越快。如刪失比例從70%上升至90%、γ=2、β=0.2時(shí),Cox模型偏倚的增加達(dá)到了1.1倍(43.3%到91.9%),雖然AFT模型在偏倚絕對(duì)值方面的表現(xiàn)明顯優(yōu)于Cox模型,但其偏倚增速卻與Cox模型接近,為0.9倍(34.2%到65.7%)。

圖1 不同參數(shù)及刪失比例下Cox模型和AFT模型偏倚

圖2 不同參數(shù)及刪失比例下Cox模型和AFT模型偏倚之差

2.準(zhǔn)確性

對(duì)于Cox模型和AFT模型,隨著刪失比例的增加,其參數(shù)估計(jì)的標(biāo)準(zhǔn)差與通過完整數(shù)據(jù)得到的標(biāo)準(zhǔn)差之間的比值逐漸增大,意即其參數(shù)估計(jì)的準(zhǔn)確性逐漸降低。尤其是在刪失比例大于70%后,準(zhǔn)確性加速降低。生存時(shí)間形狀參數(shù)γ和自變量X效應(yīng)系數(shù)β的變化對(duì)兩類模型參數(shù)估計(jì)的準(zhǔn)確性無明顯影響:以四組模擬中刪失比例30%為例,Cox模型得到的準(zhǔn)確性估計(jì)值皆為1.2,AFT模型得到的準(zhǔn)確性估計(jì)值皆為1.14;再如刪失比例70%時(shí),Cox模型得到的準(zhǔn)確性估計(jì)值依次為1.85、1.84、1.83、1.83,AFT得到的準(zhǔn)確性估計(jì)值依次為1.63、1.56、1.57、1.56。

在四組模擬數(shù)據(jù)中,在任一刪失比例下,AFT模型參數(shù)估計(jì)的準(zhǔn)確性表現(xiàn)始終優(yōu)于Cox模型,且差距隨刪失比例的增大而增大。當(dāng)四組模擬數(shù)據(jù)刪失比例達(dá)到90%時(shí),采用Cox模型計(jì)算得到的參數(shù)標(biāo)準(zhǔn)差是完整數(shù)據(jù)參數(shù)標(biāo)準(zhǔn)差的約3.2倍,而AFT模型介于2.4~2.7倍(圖5)。

3.覆蓋程度

不同刪失比例下Cox模型和AFT模型得到的顯著性一致率如表2所示。不難看出,在自變量X的效應(yīng)較強(qiáng)時(shí)(β=1),刪失比例的變化對(duì)兩種模型的顯著性一致率無影響,均為100%。而當(dāng)自變量的效應(yīng)逐漸減弱時(shí),隨著刪失比例的增加,兩種模型在顯著性一致率方面的表現(xiàn)逐漸下滑,且下滑速度相當(dāng)。如當(dāng)β=0.2,γ=2時(shí)(組號(hào)=4),對(duì)應(yīng)Cox模型中X所導(dǎo)致的風(fēng)險(xiǎn)比為1.2,AFT模型中X加速失效因子為0.9,刪失數(shù)據(jù)比例為50%及以下時(shí),兩種模型的顯著性一致率均大致高于80%。當(dāng)刪失比例高于50%時(shí),顯著性一致率加速下滑,特別當(dāng)刪失比例達(dá)到90%時(shí),兩種模型的顯著性一致率均僅為30%左右。

圖3 形狀參數(shù)γ不同時(shí)Cox模型和AFT模型偏倚隨刪失比例變化趨勢(shì)

圖4 自變量X效應(yīng)系數(shù)β不同時(shí)Cox模型和AFT模型偏倚隨刪失比例變化趨勢(shì)

圖5 不同參數(shù)及刪失比例下Cox模型和AFT模型準(zhǔn)確性

表2 不同參數(shù)及刪失比例下Cox模型和AFT模型顯著性一致率(%)

討 論

本研究以Weibull分布為模擬分布,討論了在分布參數(shù)和自變量效應(yīng)值取值不同的情況下,生存時(shí)間刪失比例對(duì)Cox模型和AFT模型表現(xiàn)的影響。研究發(fā)現(xiàn):在分布參數(shù)和自變量效應(yīng)值固定的情況下,隨著生存時(shí)間刪失比例的增加,Cox模型和AFT模型在參數(shù)估計(jì)方面的偏倚均增大,準(zhǔn)確性均降低,尤其是在刪失比例大于70%時(shí),兩類模型在偏倚和準(zhǔn)確性方面的表現(xiàn)更是加速下滑。其中,刪失比例對(duì)Cox模型表現(xiàn)的影響與前文提到的一項(xiàng)研究結(jié)果一致[8],而生存數(shù)據(jù)刪失比例對(duì)AFT模型表現(xiàn)的影響則尚未查見既往文獻(xiàn)報(bào)道。

盡管隨著刪失比例的增加,兩類模型在偏倚和準(zhǔn)確性方面的變化趨勢(shì)一致。但對(duì)于特定刪失比例的生存數(shù)據(jù),在分布參數(shù)和自變量效應(yīng)值固定的情況下,AFT模型在參數(shù)估計(jì)偏倚和準(zhǔn)確性兩方面的表現(xiàn)卻始終優(yōu)于Cox模型。刪失比例越大,AFT模型的表現(xiàn)相對(duì)而言越優(yōu)異。以偏倚方面的表現(xiàn)為例,當(dāng)生存分布的形狀參數(shù)γ=2,自變量X的效應(yīng)參數(shù)β=1時(shí),刪失比例為40%時(shí),Cox模型的偏倚約為AFT模型的2倍,而當(dāng)刪失比例增加至90%時(shí),Cox模型的偏倚約為AFT模型的3倍。再從準(zhǔn)確性方面來看,同樣的形狀參數(shù)和自變量效應(yīng)參數(shù)情況下,刪失比例為40%時(shí),Cox模型的參數(shù)標(biāo)準(zhǔn)差為金標(biāo)準(zhǔn)的1.3倍,AFT模型的參數(shù)標(biāo)準(zhǔn)差為金標(biāo)準(zhǔn)的1.2倍,當(dāng)刪失比例增加至90%時(shí),Cox模型的參數(shù)標(biāo)準(zhǔn)差增至金標(biāo)準(zhǔn)的3.2倍,而AFT模型的參數(shù)標(biāo)準(zhǔn)差卻只增至金標(biāo)準(zhǔn)的2.5倍。

在醫(yī)學(xué)研究中,生存分析一般都運(yùn)用于縱向研究所獲取的數(shù)據(jù)。受限于研究的成本投入及倫理學(xué)標(biāo)準(zhǔn),縱向研究的時(shí)間往往比較有限。正是因?yàn)槿绱?,醫(yī)學(xué)領(lǐng)域所涉及的生存分析一般會(huì)包含較大比例的刪失數(shù)據(jù)。在Web of Science中隨機(jī)搜尋新近發(fā)表的腫瘤生存分析文獻(xiàn)就不難發(fā)現(xiàn)這一現(xiàn)象。如Heemskerk-Gerritsen等發(fā)表的一項(xiàng)關(guān)于乳腺癌的生存分析研究有88%的刪失[9],再如Cardwell等發(fā)表的另一項(xiàng)關(guān)于乳腺癌生存分析的研究中,刪失數(shù)據(jù)占92%[10]。考慮到醫(yī)學(xué)研究中生存數(shù)據(jù)的特點(diǎn)和本次模擬研究所得到的結(jié)果,當(dāng)生存數(shù)據(jù)同時(shí)滿足Cox模型和AFT模型的應(yīng)用條件時(shí),應(yīng)該優(yōu)先選擇偏倚更小、準(zhǔn)確性更高的AFT模型進(jìn)行參數(shù)估計(jì)。

當(dāng)研究因素真實(shí)效應(yīng)較弱時(shí),如果生存時(shí)間刪失比例同時(shí)過高,則不論AFT模型還是Cox模型,其正確判斷真實(shí)效應(yīng)顯著性的能力均受到較大影響。本次模擬中,研究因素HR=1.2,即加速失效因子=0.9時(shí),若刪失比例為80%以上,則正確判斷的比例低于50%。因此在運(yùn)用AFT模型或Cox模型進(jìn)行生存分析時(shí),一旦預(yù)判某一研究因素的真實(shí)效應(yīng)較弱,同時(shí)生存時(shí)間刪失比例較大時(shí),對(duì)分析結(jié)果的解讀需謹(jǐn)慎。

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(責(zé)任編輯:鄧 妍)

國家自然科學(xué)基金(81460519);云南省自然科學(xué)基金(2013FZ064)

△通信作者:許傳志,E-mail:xuchzhi@qq.com

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2018年4月世界粗鋼產(chǎn)量表(續(xù))萬噸
Logistic回歸模型的幾乎無偏兩參數(shù)估計(jì)
基于向前方程的平穩(wěn)分布參數(shù)估計(jì)
基于競(jìng)爭失效數(shù)據(jù)的Lindley分布參數(shù)估計(jì)
對(duì)于平均差與標(biāo)準(zhǔn)差的數(shù)學(xué)關(guān)系和應(yīng)用價(jià)值比較研究
2014年5月世界粗鋼產(chǎn)量表萬噸
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