劉紅麗,劉 瑩,郭紅燕
1.361000 福建省廈門市婦幼保健院 林巧稚婦兒醫(yī)院婦科 2.100191 北京市,北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部病理教研室 3.100191 北京市,北京大學(xué)第三醫(yī)院婦科
·論著·
*通信作者:郭紅燕,主任醫(yī)師;E-mail:bysyghy@163.com
核因子kappa B1和RelA基因多態(tài)性與漢族女性卵巢上皮性癌的關(guān)系研究
劉紅麗1,劉 瑩2,郭紅燕3*
1.361000 福建省廈門市婦幼保健院 林巧稚婦兒醫(yī)院婦科 2.100191 北京市,北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部病理教研室 3.100191 北京市,北京大學(xué)第三醫(yī)院婦科
背景炎癥與腫瘤關(guān)系密切,核因子kappa B(NF-κB)信號通路是重要的炎癥通路之一,單核苷酸多態(tài)性(SNPs)與疾病易感性亦存在重要關(guān)聯(lián),p50/p65復(fù)合體是NF-κB信號通路中調(diào)節(jié)靶基因轉(zhuǎn)錄的重要分子。目的探討NF-κB1、RelA基因多態(tài)性與漢族女性卵巢上皮性癌的關(guān)系,以期從分子水平為卵巢上皮性癌的預(yù)防和診治提供依據(jù)。方法2014年2月—2015年2月選取1999—2010年于北京大學(xué)第三醫(yī)院、北京腫瘤醫(yī)院、北京醫(yī)院婦科進(jìn)行手術(shù)治療的漢族卵巢上皮性癌患者286例為病例組。同期選取與病例組年齡匹配的在上述醫(yī)院體檢健康的漢族女性302例為對照組。提取研究對象DNA,利用HapMap數(shù)據(jù)庫中中國北京漢族人群(CHB)NF-κB1、RelA基因包含兩端2 kb鄰近區(qū)域的全部SNPs位點的基因分型數(shù)據(jù),選擇SNPs位點,NF-κB1基因共確定了4個SNPs位點,分別是rs3774934(A/G)、rs3774938(A/G)、rs230510(A/T)、rs909332(A/T);RelA基因共確定了3個SNPs位點,分別是rs10896027(C/G)、rs7119750(C/T)、rs11820062(C/T)。采用TaqMan探針法對SNPs位點進(jìn)行基因分型,根據(jù)基因分型數(shù)據(jù),構(gòu)建單倍域圖,推斷每例研究對象的單體型、雙體型情況。結(jié)果對照組rs3774934、rs3774938、rs230510、rs909332、rs10896027、rs7119750、rs11820062均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。兩組NF-κB1基因rs3774934、rs3774938、rs230510位點基因型和等位基因頻率比較,差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05);兩組NF-κB1基因rs909332位點基因型比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05);兩組NF-κB1基因rs909332位點等位基因頻率比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。多因素Logistic回歸分析結(jié)果顯示,NF-κB1基因rs3774934、rs3774938、rs230510、rs909332位點基因型均不是卵巢上皮性癌的影響因素(P>0.05);NF-κB1基因單體型均不是卵巢上皮性癌的影響因素(P>0.05);NF-κB1基因雙體型GA-GA是卵巢上皮性癌的影響因素(P<0.05)。兩組RelA基因rs10896027、rs7119750、rs11820062位點基因型和等位基因頻率比較,差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。多因素Logistic回歸分析結(jié)果顯示,RelA基因rs10896027、rs7119750、rs11820062位點基因型均不是卵巢上皮性癌的影響因素(P>0.05);RelA基因單體型不是卵巢上皮性癌的影響因素(P>0.05);RelA基因雙體型CC-CC是卵巢上皮性癌的影響因素(P<0.05)。結(jié)論NF-κB、RelA基因多態(tài)性與漢族女性卵巢上皮性癌易感性具有一定關(guān)系,NF-κB1基因雙體型——rs3774934(G>A)和rs3774938(A>G)的GA-GA、RelA基因雙體型——rs7119750(C>T)和rs11820062(C>T)的CC-CC與卵巢上皮性癌的易感性有關(guān)。
卵巢腫瘤;多態(tài)性,單核苷酸;漢族;NF-κB;RelA
根據(jù)國家癌癥中心2015年公布的統(tǒng)計數(shù)據(jù),卵巢癌的病死率為22.5%,仍高居我國婦科生殖道惡性腫瘤的首位[1]。越來越多的研究證實了炎癥在腫瘤惡性進(jìn)展中的介導(dǎo)和推進(jìn)作用,核因子kappa B(NF-κB)信號通路是重要的炎癥通路之一;NF-κB是Rel蛋白家族〔包括c-Rel、p50/p105(NF-κB1)、p52/p100(NF-κB2)、p65(RelA)及RelB 5個成員〕的成員[2]。通常所說的NF-κB指的是p50/p65復(fù)合體,大多數(shù)p50/p65復(fù)合體以異二聚體形式存在,其分別由NF-κB1、RelA基因編碼。p50/p65復(fù)合體從抑制性分子中釋放,進(jìn)入細(xì)胞核,調(diào)節(jié)靶基因的轉(zhuǎn)錄,廣泛參與調(diào)控免疫應(yīng)答、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞生長等多個基因的表達(dá)。有研究表明,NF-κB信號通路參與了卵巢上皮性癌的發(fā)生和發(fā)展[3-5],而且不同程度地影響腫瘤細(xì)胞對化療的敏感性及患者的預(yù)后[6-7]。單核苷酸多態(tài)性(SNPs)是指人類基因組核苷酸序列中單個堿基的序列存在差異,并在人群中的分布頻率>1%,被認(rèn)為是與疾病易感性和藥物反應(yīng)有關(guān)的重要因素,其與卵巢癌的發(fā)生、發(fā)展、化療耐藥、預(yù)后評估方面的相關(guān)性研究也是目前國際上婦科腫瘤基因組學(xué)研究的重點[8-10]。本研究旨在探討NF-κB1、RelA基因多態(tài)性與漢族女性卵巢上皮性癌的關(guān)系,以期從分子水平為卵巢上皮性癌的預(yù)防和診治提供實驗依據(jù)。
1.1 研究對象 2014年2月—2015年2月選取1999—2010年于北京大學(xué)第三醫(yī)院、北京腫瘤醫(yī)院、北京醫(yī)院婦科進(jìn)行手術(shù)治療的卵巢上皮性癌患者286例為病例組。年齡25~82歲,平均年齡(54.6±11.8)歲;雌激素受體(ER)狀態(tài):陽性63例,陰性59例,缺失164例;孕激素受體(PR)狀態(tài):陽性49例,陰性70例,缺失167例;CA125情況:正常(≤35 U/L)23例,升高216例,缺失47例;腫瘤最大直徑:≤5 cm 131例,>5 cm 136例,缺失19例;臨床分期:Ⅰ期43例,Ⅱ~Ⅳ期213例,缺失30例;淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況:有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移113例,無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移158例,缺失15例;遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移情況:有遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移96例,無遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移177例,缺失13例。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)漢族;(2)術(shù)后經(jīng)病理學(xué)檢查證實為卵巢上皮性癌。同期選取與病例組年齡匹配的在上述醫(yī)院體檢健康的女性302例為對照組。年齡27~79歲,平均年齡(53.0±12.0)歲。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)漢族;(2)無現(xiàn)患腫瘤或惡性腫瘤病史。研究對象均簽署知情同意書,本研究獲得北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部倫理委員會的批準(zhǔn)。
1.2 研究方法
1.2.1 一般資料收集 收集研究對象一般資料,包括年齡、BMI、初潮年齡、絕經(jīng)年齡、初產(chǎn)年齡、絕經(jīng)狀態(tài)、生育史、一級親屬腫瘤家族史、吸煙史等。其中連續(xù)或累積吸煙6個月或以上者為有吸煙史。
1.2.2 提取DNA 病例組DNA提取自甲醛溶液固定、石蠟包埋切片的非腫瘤組織,對照組DNA提取自外周血白細(xì)胞,使用酚-氯仿-異戊醇抽提液進(jìn)行提取。
1.2.3 選擇SNPs位點 將HapMap數(shù)據(jù)庫中中國北京漢族人群(CHB)NF-κB1、RelA基因包含兩端2 kb鄰近區(qū)域的全部SNPs位點的基因分型數(shù)據(jù)(NF-κB1:Chr4,103、639、518-103、759、506;RelA:Chr11,65、176、393-65、188、951)上傳至Haploview軟件中。在“Minimum minor allele freq.”錄入框中輸入0.05,選擇最小等位基因(MAF)>5%的SNPs進(jìn)行連鎖不平衡(LD)分析。采用Confidence intervals方法劃定兩個基因相關(guān)范圍內(nèi)的blocks,選取1%為單體型頻率下限,確定SNPs位點。NF-κB1基因共確定了4個SNPs位點,分別是rs3774934(A/G)、rs3774938(A/G)、rs230510(A/T)、rs909332(A/T);RelA基因共確定了3個SNPs位點,分別是rs10896027(C/G)、rs7119750(C/T)、rs11820062(C/T)。
1.2.4 基因分型及質(zhì)量控制 采用TaqMan探針法對SNPs位點進(jìn)行基因分型,其中TaqMan探針和引物由Applied Biosystems公司合成并授權(quán)使用,HT7900實時熒光定量PCR儀購自美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司。
每次基因分型實驗,384孔板中均設(shè)置有陰性對照和陽性對照,若≥15%的樣本分型失敗則整板分型結(jié)果棄用。多個SNPs位點分型均失敗的DNA樣本棄用。選取3%樣本進(jìn)行重復(fù)檢測,由2名研究員在不知道分組的情況下分別進(jìn)行結(jié)果判讀,兩次結(jié)果的吻合率在99%以上。
1.2.5 單倍域圖及單體型的構(gòu)建 根據(jù)基因分型數(shù)據(jù),采用Haploview軟件分別推算病例組和對照組NF-κB1、RelA基因單個SNPs位點的D′和r2,然后構(gòu)建單倍域圖。采用SAS 9.1 PROC HAPLOTYPE程序,根據(jù)最大似然算法(EM算法)推斷每例研究對象的單體型、雙體型情況。記錄研究對象NF-κB1、RelA基因單個SNPs位點、單體型、雙體型情況。其中NF-κB1基因的單體型分別為:rs3774934(G>A)和rs3774938(A>G)的GG、GA,rs230510(A>T)和rs3774938(A>G)的AA,其他;雙體型分別為:rs3774934(G>A)和rs3774938(A>G)的GA-GG、GG-GG、GA-GA,rs3774934(G>A)和rs909332(A>T)的AA-GG,rs230510(A>T)和rs3774938(A>G)的AA-GA,rs909332(A>T)和rs230510(A>T)的AA-AA,其他。RelA基因單體型分別為:rs7119750(C>T)和rs11820062(C>T)的CC、TT、TC,rs7119750(C>T)和rs10896027(C>G)的CT;雙體型分別為:rs7119750(C>T)和rs11820062(C>T)的CC-TT、CC-CC、TT-TT、CT-TT、CT-CT及rs10896027(C>G)和rs11820062(C>T)的CC-CT,其他。
2.1 一般資料比較 兩組年齡分布、絕經(jīng)年齡、初產(chǎn)年齡、一級親屬腫瘤家族史發(fā)生率比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05);病例組BMI、初潮年齡、絕經(jīng)前期所占比例、有生育史率小于對照組,吸煙率大于對照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,見表1)。
2.2 對照組SNPs位點的Hardy-Weinberg平衡檢驗 對照組rs3774934、rs3774938、rs230510、rs909332、rs10896027、rs7119750、rs11820062均符合Hardy-Weinberg平衡(χ2=2.591、2.205、1.315、1.462、2.127、1.368、1.387,P=0.143、0.146、0.982、0.809、0.584、0.916、0.825)。
2.3 NF-κB1基因單個SNPs位點、單體型、雙體型與卵巢上皮性癌的關(guān)聯(lián)分析
表1 兩組一般資料比較
注:a為χ2值;b表示對照組、病例組分別有41、26例未絕經(jīng);c表示對照組、病例組分別有9、39例沒有生育史,其初產(chǎn)年齡記為12.0歲
2.3.1 NF-κB1基因單個SNPs位點與卵巢上皮性癌的關(guān)聯(lián)分析 兩組NF-κB1基因rs3774934、rs3774938、rs230510位點基因型和等位基因頻率比較,差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05);兩組NF-κB1基因rs909332位點基因型比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05);兩組NF-κB1基因rs909332位點等位基因頻率比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05,見表2~5)。
以組別為因變量(賦值:對照組=0,病例組=1),NF-κB1基因rs3774934(賦值:GG=0,AG=1,AA=2)、rs3774938(賦值:AA=0,AG=1,GG=2)、rs230510(賦值:AA=0,AT=1,TT=2)、rs909332(賦值:AA=0,AT=1,TT=2)位點基因型為自變量,年齡(賦值:≤55歲=0,>55歲=1)、BMI(賦值:≤23.0 kg/m2=0,>23.0 kg/m2=1)、絕經(jīng)狀態(tài)(絕經(jīng)前期=0,絕經(jīng)后期=1)、生育史(賦值:有生育史=0,無生育史=1)、一級親屬腫瘤家族史(賦值:無=0,有=1)、吸煙史(賦值:無=0,有=1)為混雜因素,進(jìn)行多因素Logistic回歸分析,結(jié)果顯示,NF-κB1基因rs3774934、rs3774938、rs230510、rs909332位點基因型均不是卵巢上皮性癌的影響因素(P>0.05,見表6)。
2.3.2 NF-κB1基因單體型與卵巢上皮性癌的關(guān)聯(lián)分析 以組別為因變量(賦值:對照組=0,病例組=1),NF-κB1基因單體型(賦值:GG=0,AA=1,GA=2,其他=3)為自變量,年齡(賦值:≤55歲=0,>55歲=1)、BMI(賦值:≤23.0 kg/m2=0,>23.0 kg/m2=1)、絕經(jīng)狀態(tài)(絕經(jīng)前期=0,絕經(jīng)后期=1)、生育史(賦值:有生育史=0,無生育史=1)、一級親屬腫瘤家族史(賦值:無=0,有=1)、吸煙史(賦值:無=0,有=1)為混雜因素,進(jìn)行多因素Logistic回歸分析,結(jié)果顯示,NF-κB1基因單體型均不是卵巢上皮性癌的影響因素(P>0.05,見表7)。
2.3.3 NF-κB1基因雙體型與卵巢上皮性癌的關(guān)聯(lián)分析 以組別為因變量(賦值:對照組=0,病例組=1),NF-κB1基因雙體型(賦值:AA-GG=0,GA-GG=1,GG-GG=2,AA-GA=2,AA-AA=3,GA-GA=4,其他=5)為自變量,年齡(賦值:≤55歲=0,>55歲=1)、BMI(賦值:≤23.0 kg/m2=0,>23.0 kg/m2=1)、絕經(jīng)狀態(tài)(絕經(jīng)前期=0,絕經(jīng)后期=1)、生育史(賦值:有生育史=0,無生育史=1)、一級親屬腫瘤家族史(賦值:無=0,有=1)、吸煙史(賦值:無=0,有=1)為混雜因素,進(jìn)行多因素Logistic回歸分析,結(jié)果顯示,NF-κB1基因雙體型GA-GA是卵巢上皮性癌的影響因素(P<0.05,見表8)。
2.4 RelA基因單個SNPs位點、單體型、雙體型與卵巢上皮性癌的關(guān)聯(lián)分析
2.4.1 RelA基因單個SNPs位點與卵巢上皮性癌的關(guān)聯(lián)分析 兩組RelA基因rs10896027、rs7119750、rs11820062位點基因型和等位基因頻率比較,差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05,見表9~11)。
表2 兩組NF-κB1基因rs3774934位點基因型和等位基因頻率比較〔n(%)〕
表3 兩組NF-κB1基因rs3774938位點基因型和等位基因頻率比較〔n(%)〕
表4 兩組NF-κB1基因rs230510位點基因型和等位基因頻率比較〔n(%)〕
表5 兩組NF-κB1基因rs909332位點基因型和等位基因頻率比較〔n(%)〕
注:-為采用Fisher′s確切概率法
表6 NF-κB1基因單個SNPs位點對卵巢上皮性癌影響的多因素Logistic回歸分析結(jié)果
表7 NF-κB1基因單體型對卵巢上皮性癌影響的多因素Logistic回歸分析結(jié)果
注:以GG為對照
表8 NF-κB1基因雙體型對卵巢上皮性癌影響的多因素Logistic回歸分析結(jié)果
注:以AA-GG為對照
以組別為因變量(賦值:對照組=0,病例組=1),RelA基因rs10896027(賦值:CC=0,GG=1,CG=2)、rs7119750(賦值:CC=0,CT=1,TT=2)、rs11820062(賦值:CC=0,CT=1,TT=2)位點基因型為自變量,年齡(賦值:≤55歲=0,>55歲=1)、BMI(賦值:≤23.0 kg/m2=0,>23.0 kg/m2=1)、絕經(jīng)狀態(tài)(絕經(jīng)前期=0,絕經(jīng)后期=1)、生育史(賦值:有生育史=0,無生育史=1)、一級親屬腫瘤家族史(賦值:無=0,有=1)、吸煙史(賦值:無=0,有=1)為混雜因素,進(jìn)行多因素Logistic回歸分析,結(jié)果顯示,RelA基因rs10896027、rs7119750、rs11820062位點基因型均不是卵巢上皮性癌的影響因素(P>0.05,見表12)。
表9 RelA基因rs10896027位點基因型和等位基因頻率比較〔n(%)〕
表10 RelA基因rs7119750位點基因型和等位基因頻率比較〔n(%)〕
表11 RelA基因rs11820062位點基因型和等位基因頻率比較〔n(%)〕
表12 RelA基因單個SNPs位點對卵巢上皮性癌影響的多因素Logistic回歸分析結(jié)果
2.4.2 RelA基因單體型與卵巢上皮性癌易感性的關(guān)聯(lián)分析 以組別為因變量(賦值:對照組=0,病例組=1),RelA基因單體型為自變量(賦值:CC=0,CT=1,TT=2,TC=3),年齡(賦值:≤55歲=0,>55歲=1)、BMI(賦值:≤23.0 kg/m2=0,>23.0 kg/m2=1)、絕經(jīng)狀態(tài)(絕經(jīng)前期=0,絕經(jīng)后期=1)、生育史(賦值:有生育史=0,無生育史=1)、一級親屬腫瘤家族史(賦值:無=0,有=1)、吸煙史(賦值:無=0,有=1)為混雜因素,進(jìn)行多因素Logistic回歸分析,結(jié)果顯示,RelA基因單體型不是卵巢上皮性癌的影響因素(P>0.05,見表13)。
2.4.3 RelA基因雙體型與卵巢上皮性癌易感性的關(guān)聯(lián)分析 以組別為因變量(賦值:對照組=0,病例組=1),RelA基因雙體型為自變量(賦值:CC-TT=0,CC-CT=1,CC-CC=2,TT-TT=3,CT-TT=4,CT-CT=5,其他=6),年齡(賦值:≤55歲=0,>55歲=1)、BMI(賦值:≤23.0 kg/m2=0,>23.0kg/m2=1)、絕經(jīng)狀態(tài)(絕經(jīng)前期=0,絕經(jīng)后期=1)、生育史(賦值:有生育史=0,無生育史=1)、一級親屬腫瘤家族史(賦值:無=0,有=1)、吸煙史(賦值:無=0,有=1)為混雜因素,進(jìn)行多因素Logistic回歸分析,結(jié)果顯示,RelA基因雙體型CC-CC是卵巢上皮性癌的影響因素(P<0.05,見表14)。
表13 RelA基因單體型對卵巢上皮性癌影響的多因素Logistic回歸分析結(jié)果
注:以CC為對照
表14 RelA基因雙體型對卵巢上皮性癌影響的多因素Logistic回歸分析結(jié)果
注:以CC-TT為對照
炎癥是生物抵抗外界病原體侵入的重要防御機(jī)制,越來越多的研究證實炎癥在腫瘤惡性進(jìn)展中的介導(dǎo)和推進(jìn)作用[11-13]。腫瘤炎性微環(huán)境是近年來腫瘤領(lǐng)域的研究熱點,而NF-κB信號通路是重要的炎癥通路之一,在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中起重要作用。SNPs在基因組中存在廣泛變異,可用作遺傳學(xué)上的分子標(biāo)志物,亦可闡明疾病和基因的關(guān)系,探索疾病相關(guān)基因。卵巢癌是一種嚴(yán)重危害婦女健康、生命的惡性腫瘤,已有多項研究證實,在卵巢癌組織中NF-κB相關(guān)蛋白高表達(dá)[14]。本研究通過病例對照研究設(shè)計,以NF-κB1、RelA基因為候選基因,利用HapMap CHB的SNP分型數(shù)據(jù)作為SNPs位點的選點依據(jù),共選出NF-κB1基因的4個SNPs位點和RelA基因的3個SNPs位點,在包含286例卵巢上皮性癌患者和302例正常對照的漢族人群,用TaqMan Realtime-PCR方法進(jìn)行基因分型,對照組進(jìn)行SNPs位點的Hardy-Weinberg平衡檢驗使其符合代表性和隨機(jī)性,利用分型數(shù)據(jù)和Haploview軟件在病例組和對照組分別進(jìn)行單倍域的構(gòu)建,對漢族女性遺傳多態(tài)性與卵巢上皮性癌易感性及其進(jìn)展相關(guān)性進(jìn)行研究,目前在國內(nèi)國際尚未見類似報道。
3.1 NF-κB1基因SNPs位點與卵巢上皮性癌的關(guān)系 近些年來國際上也有關(guān)于NF-κB1基因多態(tài)性與各種腫瘤的相關(guān)性研究,其中啟動子區(qū)-94位插入/缺失多態(tài)性比較常見,僅在中國漢族人群中就發(fā)現(xiàn)與鼻咽癌、前列腺癌、膀胱癌等多種惡性腫瘤的發(fā)生存在相關(guān)性[15-17],并且在卵巢癌中也證實這種相關(guān)性[8]。但DUAN等[9]對該多態(tài)性進(jìn)行meta分析提示,-94位插入/缺失多態(tài)性僅與口腔癌、卵巢癌有顯著關(guān)聯(lián),而與直腸癌、膀胱癌及腎細(xì)胞癌無顯著關(guān)聯(lián)。NF-κB1基因其他位點多態(tài)性與腫瘤的關(guān)系也有報道,如有報道rs4648127位點多態(tài)性與肺癌易感性有顯著關(guān)聯(lián)[18],rs4648068位點多態(tài)性與胃癌有顯著相關(guān)性[19]。上述研究只是針對NF-κB1單個位點的多態(tài)性與腫瘤關(guān)系的研究。CHANG等[20]選取歐洲及高加索血統(tǒng)的NF-κB1基因6個代表性位點進(jìn)行與霍奇金淋巴瘤易感性的研究發(fā)現(xiàn),rs1585215多態(tài)性與之顯著相關(guān)〔AG vs.AA:OR=2.1,95%CI(1.5,2.9);GG vs.AA:OR=3.5,95%CI(2.2,5.7),P=1.7×10-8〕。而美國另一項研究證實rs4648022的多態(tài)性與非霍奇金淋巴瘤存在顯著關(guān)系[21]。2014年美國卵巢癌協(xié)會的一項多中心研究,選取有關(guān)NF-κB通路的220個基因的2 282個tagSNP位點,在15 604例患者和23 235例對照中研究其與卵巢癌易感性的關(guān)系,其中NF-κB1基因選取8個多態(tài)性位點進(jìn)行分析,僅rs1609993與卵巢癌整體風(fēng)險相關(guān),但經(jīng)多因素回歸分析后無統(tǒng)計學(xué)意義,最后僅發(fā)現(xiàn)白介素(IL-1)基因的rs17561與卵巢透明細(xì)胞癌易感性有顯著意義[10]。
本研究結(jié)果顯示,NF-κB1基因雙體型GA-GA是卵巢上皮性癌的影響因素,目前尚未發(fā)現(xiàn)與之相同雙體型與惡性腫瘤關(guān)系的相關(guān)報道,有報道rs3774934多態(tài)性與非霍奇金淋巴瘤不存在顯著關(guān)系[21],另有報道rs3774938多態(tài)性與霍奇金淋巴瘤不存在顯著關(guān)系[22]。至于位點的多態(tài)性是通過何種途徑影響癌癥的發(fā)生,針對某一位點多態(tài)性與表型的關(guān)系研究較少,有研究提示rs3774934位點多態(tài)性與CD44表型相關(guān)[23],而CD44是一種細(xì)胞表面跨膜糖蛋白分子,與許多惡性腫瘤的侵襲和轉(zhuǎn)移密切相關(guān)[24-25]。
3.2 RelA基因SNPs位點與卵巢上皮性癌的關(guān)系 關(guān)于RelA基因遺傳多態(tài)性的研究相對少見。有學(xué)者研究RelA基因遺傳多態(tài)性與肺結(jié)核的關(guān)系,選取5個SNPs位點,其單個SNPs位點、單體型均未發(fā)現(xiàn)顯著關(guān)聯(lián)[26]。另一項日本關(guān)于RelA基因遺傳多態(tài)性與精神分裂癥關(guān)系研究,選取4個SNPs位點rs7119750(SNP1)、rs11568300(SNP2)、rs2306365(SNP3)和rs11820062(SNP4),其中SNP1、SNP3和SNP4與精神分裂癥存在顯著關(guān)系,在引入混雜因素進(jìn)行多因素回歸分析后發(fā)現(xiàn)SNP3和SNP4與精神分裂癥的這種顯著關(guān)系仍存在[27]。本研究結(jié)果顯示,兩組RelA基因rs10896027、rs7119750、rs11820062位點基因型和等位基因頻率無差異;多因素Logistic回歸分析結(jié)果顯示,RelA基因rs10896027、rs7119750、rs11820062位點基因型均不是卵巢上皮性癌的影響因素,RelA基因單體型不是卵巢上皮性癌的影響因素,RelA基因雙體型CC-CC是卵巢上皮性癌的影響因素;提示同一個SNPs位點在不同疾病發(fā)病中的作用不同,即使在同一種腫瘤中,由于人群不同,其作用也可能不同。由于不同人群間基因組的LD圖不同,無法進(jìn)行單體型和雙體型結(jié)果的比較。
理論上說,多位點單體型所包含信息量大于單位點等位基因,而多位點雙體型所包含信息量大于單位點基因型。雙體型可定義為來自兩個參與染色體的單體型所有可能組合的特定變異,等于所有位點上的所有基因型的分層分析和所有單體型的分層分析。因此,有研究認(rèn)為,當(dāng)樣本量足夠大時,單體型和雙體型分析應(yīng)比等位基因和基因型分析更有效[28]。YANG等[29]發(fā)現(xiàn),白介素4中-590C>T和內(nèi)含子3 VNTR中,單個位點多態(tài)性與口咽癌均無顯著關(guān)聯(lián),但T、RP1/T、RP1雙體型增加其發(fā)病風(fēng)險,有顯著關(guān)聯(lián)。再有,LEE等[30]發(fā)現(xiàn),CAPN10基因111單體型與多囊卵巢綜合征(PCOS)風(fēng)險增加有關(guān),121單體型與PCOS無關(guān)聯(lián),而111/121雙體型與PCOS易感性增加的關(guān)聯(lián)性比任何單體型均高〔OR=3.4,95%CI(2.2,5.2)〕。
3.3 本研究不足 本課題采取候選基因的研究方法和SNPs的選點策略,對NF-κB1、RelA基因的SNPs位點、單體型、雙體型與卵巢上皮性癌的易感性分別進(jìn)行了全面的關(guān)聯(lián)分析。但尚有不足之處:(1)樣本量相對較少,需要繼續(xù)擴(kuò)大樣本量進(jìn)行分析。(2)僅考慮NF-κB1、RelA基因的遺傳多態(tài)性,且選取單體型標(biāo)簽SNPs,其很可能僅作為1個標(biāo)簽而存在,而真正發(fā)揮作用的是與之連鎖的其他SNPs或該炎癥通路其他相關(guān)基因上的多態(tài)性位點上的基因-基因交互作用,應(yīng)進(jìn)一步擴(kuò)大基因分析種類和SNPs分型數(shù)量。(3)僅選取北京部分漢族人群進(jìn)行研究,如果資源和條件允許的話,還需要在另一個大的人群中進(jìn)行重復(fù)研究。(4)未進(jìn)行術(shù)后無進(jìn)展生存期的關(guān)聯(lián)研究,仍需進(jìn)一步完善隨訪資料。
綜上所述,NF-κB、RelA基因多態(tài)性與漢族女性卵巢上皮性癌易感性具有一定關(guān)系,NF-κB1基因雙體型——rs3774934(G>A)和rs3774938(A>G)的GA-GA、RelA基因雙體型——rs7119750(C>T)和rs11820062(C>T)的CC-CC與卵巢上皮性癌的易感性有關(guān)。本研究結(jié)果對于卵巢上皮性癌的風(fēng)險預(yù)測、防治和治療提供一條新的線索和路徑,但尚需進(jìn)行大樣本、多地域、多民族廣泛深入的協(xié)同研究進(jìn)一步驗證。
志謝:感謝北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部病理教研室田新霞教授、北京腫瘤醫(yī)院及北京醫(yī)院病理科對本實驗提供樣本支持,感謝本實驗中涉及的500多名正常對照女性和卵巢上皮性癌患者,其對醫(yī)學(xué)研究的支持是該試驗順利進(jìn)行的保障。
作者貢獻(xiàn):劉紅麗進(jìn)行文章的構(gòu)思與設(shè)計,研究的實施與可行性分析;劉瑩進(jìn)行數(shù)據(jù)收集、整理,統(tǒng)計學(xué)處理;劉紅麗進(jìn)行結(jié)果的分析與解釋,撰寫論文,進(jìn)行論文、英文的修訂,負(fù)責(zé)文章的質(zhì)量控制及審校;郭紅燕對文章整體負(fù)責(zé),監(jiān)督管理。
本文無利益沖突。
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AssociationofGeneticPolymorphismsinNF-κB1andRelAwithEpithelialOvarianCancerSusceptibilityamongChineseHanWomen
LIUHong-li1,LIUYing2,GUOHong-yan3*
1.DepartmentofGynecology,XiamenMaternalandChildHealthCareHospital,LinqiaozhiWomenandChildren′sHospital,Xiamen361000,China2.DepartmentofPathology,PekingUniversityHealthScienceCenter,Beijing100191,China3.DepartmentofGynecology,PekingUniversityThirdHospital,Beijing100191,China
*Correspondingauthor:GUOHong-yan,Chiefphysician;E-mail:bysyghy@163.com
BackgroundNuclear factor kappa B (NF-κB) signaling pathway is one of the important inflammatory pathways that is closely related to tumor,and single nucleotide polymorphism (SNPs) are also associated with disease susceptibility.P50/p65 complex is an important molecule in NF-κB signaling pathway of regulating transcription of target genes.ObjectiveTo investigate the association of genetic polymorphisms in NF-κB1 and RelA with epithelial ovarian cancer susceptibility among Chinese Han women,so as to provide an experimental basis for the prevention,diagnosis and treatment of epithelial ovarian cancer at molecular level.MethodsFrom February 2014 to February 2015,we selected 286 Chinese Han women with epithelial ovarian cancer who
surgical treatment in Department of Gynaecology of Peking University Third Hospital,Beijing Cancer Hospital,Beijing Hospital from 1999 to 2010 as the case group,and recruited 302 age-matched healthy Chinese Han women underwent physical examination during the same period in the above hospitals as the control group.DNA of the subjects was extracted,SNPs were selected from genotyping data of NF-κB1 and RelA genes of the Chinese Han population in Beijing (CHB) containing all SNPs at the 2 kb neighborhood in the HapMap database.The identified four SNPs in NF-κB1 gene were rs3774934 (A/G),rs3774938 (A/G),rs230510 (A/T),rs909332 (A/T) respectively,and the identified three SNPs in RelA gene were rs10896027 (C/G),rs7119750 (C/T),rs11820062 (C/T) respectively.The SNPs were genotyped by TaqMan probes.Based on the genotyping data,the haplotype block map was constructed.And the haplotype and diplotype of each subject were deduced.ResultsThe rs3774934,rs3774938,rs230510,rs909332,rs10896027,rs7119750 and rs11820062 in the control group met the Hardy-Weinberg equilibrium (P>0.05).The genotypes and allele frequencies of rs3774934,rs3774938,and rs230510 in NF-κB1 gene did not differ significantly between the two groups (P>0.05).There was significant difference in genotype of rs909332 in NF-κB1 gene between the two groups (P<0.05).There was no significant difference in allele frequencies of rs909332 in NF-κB1 gene between the two groups (P>0.05).Multivariate Logistic regression analysis showed that the genotypes of rs3774934,rs3774938,rs230510 and rs909332 in NF-κB1 gene were not the influencing factors of epithelial ovarian cancer (P>0.05);haplotypes of NF-κB1 gene were not the influencing factors of epithelial ovarian cancer (P>0.05);GA-GA diplotype of NF-κB1 gene was an influencing factor of epithelial ovarian cancer (P<0.05).There were no significant differences in genotypes and allele frequencies of rs10896027,rs7119750 and rs11820062 in RelA gene between the two groups (P>0.05).Multivariate Logistic regression analysis showed that genotypes of rs10896027,rs7119750 and rs11820062 in RelA gene were not the influencing factors of epithelial ovarian cancer (P>0.05);haplotypes of RelA gene were not the influencing factors of epithelial ovarian cancer (P>0.05);CC-CC diplotype of RelA gene was an influencing factor of epithelial ovarian cancer (P<0.05).ConclusionGenetic polymorphisms of NF-κB1 and RelA are associated with the susceptibility to epithelial ovarian cancer in Chinese Han women.GA-GA diplotype of rs3774934 (G>A) and rs3774938 (A>G) of NF-κB1 gene and CC-CC diplotype of rs7119750 (C>T) and rs11820062 (C>T) of RelA gene are associated with susceptibility to epithelial ovarian cancer.
Ovarian neoplasms;Polymorphism,single nucleotide;Han nationality;NF-kappa B;RelA
R 737.31
A
10.3969/j.issn.1007-9572.2017.00.062
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2017-01-18;
2017-06-30)
(本文編輯:崔麗紅)