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山西首次完成苦蕎全基因組測序

2017-12-29 00:00:00
科學(xué)導(dǎo)報(bào) 2017年66期

科學(xué)導(dǎo)報(bào)訊 記者郭峰峰 通訊員程春生 9月20日,記者從山西省農(nóng)科院獲悉,農(nóng)科院農(nóng)作物品種資源研究所張麗君博士等人,通過基因組測序,揭示了苦蕎的天然產(chǎn)物蘆丁的生物合成及耐逆機(jī)制,為苦蕎優(yōu)良品種的定向選育奠定了分子基礎(chǔ),對指導(dǎo)苦蕎的種植與深加工產(chǎn)業(yè)的發(fā)展具有重要的意義,同時(shí)標(biāo)志著我國在苦蕎基因組研究領(lǐng)域已取得國際領(lǐng)先地位。相關(guān)成果日前發(fā)表于《分子植物》雜志。

苦蕎也叫苦蕎麥,是蓼科蕎麥屬作物。苦蕎性喜陰濕冷涼,并具有很高的抗逆性,多種植于海拔1200~3500米的高山地域??嗍w也是少有的藥食同源植物之一,其主要藥用成分為蘆丁。

研究人員通過4ZcV0ny21bFdA3NrJ9ArrQ==結(jié)合二代、三代、Bionano、Hi-C測序數(shù)據(jù)組裝,首次獲得了苦蕎489.3Mb高質(zhì)量染色體水平的參考基因組序列,注釋了33366個蛋白編碼基因,并鑒定了蘆丁代謝途徑上編碼各類酶的基因以及調(diào)控這些基因表達(dá)的MYB類轉(zhuǎn)錄因子。該研究還發(fā)現(xiàn),苦蕎中存在大量可能與植物耐鋁、抗旱和耐寒相關(guān)的新基因。

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