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貴州紫心甘薯種質(zhì)資源ISSR遺傳多樣性分析

2018-01-17 10:55宋吉軒鄧仁菊
種子 2017年12期
關(guān)鍵詞:親緣甘薯種質(zhì)

宋吉軒, 李 云, 李 標(biāo), 鄧仁菊, 李 麗

(貴州省生物技術(shù)研究所, 貴陽550006)

甘薯屬旋花科甘薯屬一年生作物,由于塊根產(chǎn)量高、適應(yīng)性廣,是重要的糧食、飼料、工業(yè)原料及生物能源作物之一。而紫心甘薯薯肉一般為紫色或深紫色,除含有普通甘薯各種營養(yǎng)成分外,還富含有豐富的花青素,由于花青素具有特殊的功能,從而表現(xiàn)出一些特有的生理活性和功能[1]。有研究表明,紫心甘薯具有抗氧化、保肝和改善視力等功能,同時還能降低血清中的相關(guān)酶,對高血壓等心血管病有較好的預(yù)防功能[1-2]。

ISSR分子標(biāo)記在作物種質(zhì)資源鑒定、分類及親緣關(guān)系分析等中有重要的應(yīng)用,對研究材料的背景要求不嚴(yán),且具有引物設(shè)計簡單、多態(tài)性高、重復(fù)性好和結(jié)果可靠等優(yōu)點(diǎn)[3],在一些作物種質(zhì)資源鑒定和親緣關(guān)系研究中進(jìn)行了相應(yīng)的應(yīng)用[4-5]。同時,ISSR分子標(biāo)記在甘薯遺傳多樣性等方面獲得了肯定,并有較高的分辨力[6]。目前利用ISSR分子標(biāo)記分析貴州紫心甘薯種質(zhì)資源的遺傳多樣性還未見報道。本研究利用ISSR分子標(biāo)記對23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源的親緣關(guān)系進(jìn)行分析,初步了解紫心甘薯材料間的親緣關(guān)系,為貴州省選育紫心甘薯新品種,提高育種效率提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材 料

實(shí)驗(yàn)材料為引進(jìn)和新選育的貴州紫心甘薯種質(zhì)資源,一共23份(見表1)。

表1 23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源

1.2 方 法

1.2.1 紫心甘薯基因組DNA的提取

紫心甘薯種質(zhì)資源基因組DNA的提?。?],獲得的基因組DNA溶液的質(zhì)量可達(dá)到ISSR分子標(biāo)記要求。

1.2.2 ISSR-PCR反應(yīng)與電泳檢測

ISSR-PCR的反應(yīng)體系、擴(kuò)增參數(shù)和電泳檢測[8]。反應(yīng)體系:采用20μL體系,Taq 酶(1U/L)0.2μL,10×buffer 2μL,甲 酰 胺 (1%)1μL,dNTP(0.3mmol/L):0.6μL,引 物(1U)2μL,DNA模板(45ng/μL):2μL,加水補(bǔ)至20μL;擴(kuò)增參數(shù):94℃充分變性5min,然后40個循環(huán):94℃變性90s,50~60℃退火45s,72℃延伸7min,最后72℃延伸8min,4℃終止反應(yīng);電泳檢測:取PCR擴(kuò)增產(chǎn)物5μL在1.5%瓊脂糖凝膠上進(jìn)行,需45min左右,以DL 2 000作為標(biāo)記,電泳完后進(jìn)行照像保存,方便下一步讀取條帶。

1.2.3 數(shù)據(jù)分析

以瓊脂糖電泳的每條DNA帶為1個單位,有帶的賦值為1,無帶的賦值為0,應(yīng)用Excel進(jìn)行數(shù)據(jù)輸入,統(tǒng)計結(jié)果為0~1型的數(shù)據(jù),然后利用DPS統(tǒng)計軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理并聚類分析。

2 結(jié)果與分析

2.1 紫心甘薯種質(zhì)資源的ISSR結(jié)果

通過從15個ISSR引物中最終篩選出7個多態(tài)性好且條帶清晰的ISSR引物[9]。利用篩選出的7個引物一共擴(kuò)增出45個條帶,每個引物平均擴(kuò)增出6.5個條帶,其多態(tài)性帶為41個,多態(tài)性百分?jǐn)?shù)達(dá)到91.1%。其中,引物825、835和引物841對23份貴州紫心甘薯種質(zhì)的ISSR-PCR擴(kuò)增結(jié)果見圖1~圖3。

2.2 ISSR聚類分析

通過DPS統(tǒng)計軟件對23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源進(jìn)行了聚類分析,所獲得的聚類圖結(jié)果見圖4。

23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源的遺傳相似系數(shù)范圍為0.07~0.62,平均值為0.32,表明23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源的親緣關(guān)系比較接近,黔紫薯1號和13-4-1的最大,為0.62;13-32-36和13-27-5的最小,為0.07。

由圖4可知,ISSR分子標(biāo)記產(chǎn)生的聚類圖將23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源分為5大類群,第1類為13-4-1、13-24-2、13-26-3、13-27-6、13-27-1、13-4-2、13-19-3、13-24-2、13-27-5、13-32-36、13-34-15、13-34-22、徐紫1號和徐紫糯共15份;第2類為13-24-1、13-27-2、濟(jì) 薯 18 和 13-32-38 等 共 4 份;第 3 類 為13-35-16和寧紫薯1號共2份;13-32-35和黔紫薯1號分別為第4類和第5類,都只有1份。

圖1 23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源的擴(kuò)增結(jié)果(引物:825)

圖2 23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源的擴(kuò)增結(jié)果(引物:835)

圖3 23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源的擴(kuò)增結(jié)果(引物:841)

其 中 13-4-1 與 13-24-1、13-32-35、13-35-16、福薯9號和黔紫薯1號的歐式距離達(dá)0.4以上,最高達(dá)0.62。在今后貴州省紫心甘薯新品種選育工作中,應(yīng)引進(jìn)一些遺傳相似系數(shù)較大即親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的紫心甘薯種質(zhì)資源進(jìn)行親本組配,可選育出性狀優(yōu)異的雜交后代。

3 討 論

ISSR分子標(biāo)記具有不受取材、時間及人為限制等優(yōu)點(diǎn),這是傳統(tǒng)的形態(tài)標(biāo)記無法相比的。李強(qiáng)等研究表明,利用ISSR分子標(biāo)記采用17個引物分析62份甘薯親本材料的遺傳多樣性,一共檢測出490條多態(tài)性的條帶,表明ISSR分子標(biāo)記是甘薯遺傳多樣性分析的可行有效的手段[10]。賀學(xué)勤等研究表明,RAPD、ISSR和AFLP這3種分子標(biāo)記都可明晰甘薯品種間的親緣關(guān)系,但I(xiàn)SSR分子標(biāo)記的聚類分析圖與系譜圖最相近,所以ISSR分子標(biāo)記更合適用于甘薯品種親緣關(guān)系的分析[11]。本研究結(jié)果與前人的基本一致,說明ISSR分子標(biāo)記的穩(wěn)定性較好,多態(tài)性高,達(dá)到91.1%,最后通過瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果表明,出現(xiàn)的條帶也是較豐富的。

國內(nèi)紫心甘薯種質(zhì)資源數(shù)量有限,本實(shí)驗(yàn)僅對23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源進(jìn)行ISSR分析。結(jié)果表明,15個ISSR引物中最終篩選出7個多態(tài)性好且條帶清晰的ISSR引物,這些篩選出的引物最終共擴(kuò)增出45個條帶,每個引物平均擴(kuò)增出6.5個條帶,其多態(tài)性帶為41個,多態(tài)性百分?jǐn)?shù)達(dá)到91.1%。ISSR分子標(biāo)記產(chǎn)生的聚類圖將23份紫心甘薯品種分為5大類群,遺傳相似系數(shù)范圍為0.07~0.62,均值為0.32,表明23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源的親緣關(guān)系比較接近,黔紫薯1號和13-4-1的最大,為0.62;13-32-36和13-27-5的最小,為0.07。 第 1 類 為 13-4-1、13-24-2、13-26-3、13-27-6、13-27-1、13-4-2、13-19-3、13-24-2、13-27-5、13-32-36、13-34-15、13-34-22、徐紫1號和徐紫糯共計15份;第2類為13-24-1、13-27-2、濟(jì)薯18和13-32-38等4份;第3類為13-35-16和寧紫薯1號等2份;13-32-35和黔紫薯1號分別為第4類和第5類,都只有1份。

ISSR分子標(biāo)記聚類分析把23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源分為不同的群別,較好地明晰了23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源的親緣關(guān)系,在今后貴州省紫心甘薯新品種選育工作中,應(yīng)引進(jìn)一些遺傳相似系數(shù)較大即親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的紫心甘薯種質(zhì)資源進(jìn)行親本組配,可選育出性狀優(yōu)異的雜交后代。

圖4 23份貴州紫心甘薯種質(zhì)資源的ISSR聚類分析

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