張麗琴,管海寧,肖作淼,劉聰,肖九長(zhǎng)
陰溝腸桿菌是一種常見(jiàn)的條件致病菌,可導(dǎo)致傷口、呼吸道、泌尿道的嚴(yán)重感染,且多為醫(yī)院內(nèi)感染[1]。由于臨床廣泛地使用廣譜抗菌藥物治療陰溝腸桿菌引起的感染,導(dǎo)致陰溝腸桿菌檢出及對(duì)常用抗菌藥物的耐藥性逐年上升,造成耐藥問(wèn)題日益嚴(yán)重[2]。陰溝腸桿菌的耐藥機(jī)制多而復(fù)雜,關(guān)于主動(dòng)外排系統(tǒng)的研究較少,為了解AcrABTolC外排系統(tǒng)在贛南地區(qū)臨床分離陰溝腸桿菌中的攜帶情況及介導(dǎo)耐藥性形成中的作用,我們對(duì)AcrAB-TolC外排系統(tǒng)的 acrA,acrB,acrR和 tolC四種基因進(jìn)行了檢測(cè),并對(duì)其與陰溝腸桿菌耐藥性的關(guān)系進(jìn)行了研究,現(xiàn)報(bào)告如下。
1.1 菌株來(lái)源 收集贛南地區(qū)三所三甲綜合醫(yī)院2015年1月至2015年6月從呼吸道、泌尿道、傷口等臨床標(biāo)本中分離的陰溝腸桿菌共136株,剔除同一患者相同部位分離的重復(fù)菌株,所有菌株經(jīng)Vitek 2 compact全自動(dòng)微生物鑒定藥敏分析系統(tǒng)進(jìn)行鑒定和藥敏。質(zhì)控菌株:大腸埃希菌ATCC 25922、銅綠假單胞菌ATCC 27853。
1.2 主要儀器及試劑 法國(guó)梅里埃公司生產(chǎn)的Vitek 2 compact全自動(dòng)微生物鑒定藥敏分析系統(tǒng)及配套的GN、AST-GN16卡;PCR擴(kuò)增儀為德國(guó)艾本德公司產(chǎn)品;瓊脂糖凝膠電泳儀為美國(guó)博樂(lè)公司產(chǎn)品;凝膠成像系統(tǒng)為法國(guó)VILBER公司產(chǎn)品。細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒購(gòu)自北京索萊寶科技有限公司;Taq DNA Polymerase cat.No.:B500010(內(nèi)含:10×buffer、Mg2+、Taq DNA Polymerase) 和 dNTP購(gòu)自上海生工生物工程有限公司。
1.3 方法
1.3.1 目的基因的PCR檢測(cè) 細(xì)菌DNA的提取嚴(yán)格按照試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。將已提取的陰溝腸桿菌DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增。所用引物由上海生工合成,詳見(jiàn)表1。PCR反應(yīng)體系均為20μl:10×buffer 2.0μl,Mg2+(25mM)1.2μl,dNTP(2.5mM)1.6μl,Taq DNA Polymerase (5U/μl)0.5μl, 上 、 下 游 引 物(10μM) 各 1.0μl,DNA 模板 2.0μl,ddH2O 10.7μl。反 應(yīng) 條 件 :acrA 基 因 :95℃ ,5min→(95℃ ,30s+60℃,30s+72℃,30s)×30 循 環(huán)→72℃,10min;acrB基因:95℃,5min→(95℃,30s+60℃,30s+72℃,30s)×30 循 環(huán)→72℃,10min;acrR 基 因 :94℃,4min→(95℃,30s+48℃,30s+72℃,1min)×30 循環(huán)→72℃,10min;tolC 基 因 :95℃ ,5min→(95℃ ,30s+60℃ ,30s+72℃,30s)×30 循環(huán)→72℃,10min。 反應(yīng)結(jié)束后取5μl PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)含Goldview I型核酸染色劑的2%瓊脂糖凝膠電泳40min,使用凝膠成像系統(tǒng)觀察拍照。將PCR陽(yáng)性產(chǎn)物送上海生工測(cè)序,在基因庫(kù)中比對(duì)分析。
1.3.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 使用WHONET 5.6和SPSS 15.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,耐藥率的組間比較采用u檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
表1 目的基因的引物序列和產(chǎn)物長(zhǎng)度
2.1 陰溝腸桿菌的藥敏結(jié)果 136株陰溝腸桿菌對(duì)頭孢曲松的耐藥率高達(dá)52.2%,氨曲南、復(fù)方新諾明、環(huán)丙沙星、慶大霉素等抗菌藥物的耐藥率均在30%以上,亞胺培南的耐藥率已高達(dá)15.4%,未出現(xiàn)替加環(huán)素耐藥株。
2.2 目的基因的檢測(cè)結(jié)果 136株陰溝腸桿菌中,tolC、acrR、acrA及 acrB基因的檢出率分別為95.6%、80.9%、70.6%和61.7%,其中tolC基因檢出率顯著高于其它三種基因。同時(shí)攜帶四種基因的菌株最多,占36.8%(50/136)。部分菌株四種基因PCR產(chǎn)物電泳圖見(jiàn)圖1?;驕y(cè)序結(jié)果在NCBI基因庫(kù)中比對(duì)分析顯示,acrA基因序列與登錄號(hào)AM287286陰溝腸桿菌的同源性為98%;acrB基因序列與登錄號(hào)AM287287陰溝腸桿菌的同源性為99%;tolC基因序列與登錄號(hào)AM287288陰溝腸桿菌的同源性為98%;acrR基因序列與登錄號(hào)EF627524陰溝腸桿菌的同源性為99%。
圖1 部分陰溝腸桿菌四種基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果電泳圖
2.3 外排系統(tǒng)基因與常用抗菌藥物耐藥之間的關(guān)系 根據(jù)外排系統(tǒng)基因的攜帶進(jìn)行分組比較136株陰溝腸桿菌對(duì)四類常用抗菌藥物的耐藥率。分組情況為:四種基因全(+)組與 acrA(+)acrB(-)tolC(+)acrR(+)組、acrA(+)與 acrA(-)組、acrB(+)與 acrB(-)組、tolC(+)與 tolC(-)組、acrR(+)與acrR(-)組。 統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示:4(+)組和 3(+)組比較 P=0.771>0.05,無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;各外排系統(tǒng)基因陽(yáng)性組的耐藥率均高于相應(yīng)外排系統(tǒng)基因陰性組 (P<0.01),有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,見(jiàn)表2。
2014年和2015年全國(guó)細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè)報(bào)告陰溝腸桿菌在革蘭陰性菌分離中排第五位,是醫(yī)院感染的重要病原菌。本實(shí)驗(yàn)136株陰溝腸桿菌藥敏結(jié)果顯示,臨床使用最廣泛的三代頭孢菌素的耐藥率高達(dá)50%以上,特別是作為治療腸桿菌科細(xì)菌最佳藥物的碳青霉烯耐藥率已高達(dá)15.4%,提示多重耐藥甚至泛耐藥的陰溝腸桿菌在贛南地區(qū)的檢出不在少數(shù),且耐藥問(wèn)題不容樂(lè)觀。
陰溝腸桿菌耐藥機(jī)制復(fù)雜,產(chǎn)β-內(nèi)酰胺酶是其主要耐藥機(jī)制,但在細(xì)菌多重耐藥性產(chǎn)生過(guò)程中主動(dòng)外排系統(tǒng)也發(fā)揮了重要作用[3-5]。AcrAB-TolC外排系統(tǒng)隸屬于主動(dòng)外排系統(tǒng)的耐藥結(jié)節(jié)分化超家族。該系統(tǒng)廣泛存在于大腸埃希菌、肺炎克雷伯菌、陰溝腸桿菌等腸桿菌科細(xì)菌中,它可主動(dòng)將進(jìn)入菌體內(nèi)的抗生素泵出,使藥物濃度下降難以發(fā)揮抗菌作用而出現(xiàn)耐藥[6,7]。 acrA,acrB,tolC 和acrR四種基因存在于染色體上,可編碼AcrABTolC外排系統(tǒng)[8]。
表2 根據(jù)基因攜帶分組比較四類常用抗菌藥物的耐藥率(%)
本研究顯示,acrA,acrB,tolC和acrR四種基因的攜帶率均在60%以上,其中tolC基因的檢出率最高,acrB基因的檢出率最低,說(shuō)明AcrAB-TolC外排系統(tǒng)基因在陰溝腸桿菌中普遍且差異性的存在;另外,此次分離的陰溝腸桿菌不但在藥敏結(jié)果上與別的地區(qū)之間有所差異,而且基因攜帶方面tolC基因的檢出最為顯著,也異于其它文獻(xiàn)報(bào)道[9]。一方面可能與地域差別有關(guān),另一方面可能與各地區(qū)各醫(yī)院之間臨床抗菌藥物的使用習(xí)慣有關(guān)。胡小行等報(bào)道[10]外排系統(tǒng)在陰溝腸桿菌敏感株和耐藥株中均存在,但對(duì)耐藥株的影響大于敏感株。文中通過(guò)分組比較耐藥率的結(jié)果顯示各外排系統(tǒng)基因陽(yáng)性組的耐藥率均高于相應(yīng)外排系統(tǒng)基因陰性組 (P<0.01),說(shuō)明AcrAB-TolC外排系統(tǒng)在陰溝腸桿菌的耐藥形成中發(fā)揮了重要的作用;4(+)組和3(+)組比較無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義反映AcrAB-TolC外排系統(tǒng)的各種基因可能存在聯(lián)合作用。文獻(xiàn)報(bào)道AcrAB-TolC外排系統(tǒng)基因高表達(dá)表現(xiàn)出對(duì)多種常用抗菌藥物包括β內(nèi)酰胺類、甲氧芐啶、喹諾酮等耐藥[11-13]。盡管此次未在基因表達(dá)上進(jìn)行更深入研究,但對(duì)AcrAB-TolC外排系統(tǒng)基因分布及耐藥相關(guān)性問(wèn)題有了深刻的認(rèn)識(shí)。另外,在碳青霉烯類耐藥的多重耐藥陰溝腸桿菌中,也可能存在其它耐藥機(jī)制(高產(chǎn)AmpC酶、ESBLs、碳青霉烯酶等)的協(xié)同作用[14,15],造成了陰溝腸桿菌高水平的耐藥現(xiàn)象,其具體的基因型仍需進(jìn)一步有針對(duì)性地研究。綜上所述,AcrAB-TolC外排系統(tǒng)在陰溝腸桿菌耐藥形成中具有不可忽視的作用,加強(qiáng)陰溝腸桿菌耐藥機(jī)制的基礎(chǔ)研究,可為尋求防治陰溝腸桿菌耐藥途徑提供依據(jù)。