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美國(guó)《Emerging Infectious Diseases》2018年第3期有關(guān)人獸共患病論文摘譯

2018-01-22 08:23潘蘊(yùn)蛟,林麗
關(guān)鍵詞:莢膜血清型流感

P443 使用基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜法對(duì)流感嗜血桿菌進(jìn)行莢膜分型//Viktor M?nsson, Janet R. Gilsdorf, Gunnar Kahlmeter,等

莢模型流感嗜血桿菌具有型特異性。采用PCR方法對(duì)菌株進(jìn)行莢膜分型是可靠的,但一種更加有效的方法或許更有用。本研究對(duì)使用基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜法(MALDI-TOF)對(duì)菌株莢膜分型進(jìn)行評(píng)估。本調(diào)查涵蓋所有莢膜型分離株(a-f 型和無(wú)法分型;n=258)和同基因莢膜轉(zhuǎn)化株(a-d 型)。質(zhì)譜的主成分分析與生物標(biāo)志物分析結(jié)果顯示呈聚集性,且峰值與莢膜型特異性基因譜系一一對(duì)應(yīng)。我們使用31株選擇株建立了一個(gè)莢膜分型數(shù)據(jù)模型,用余下的227株分離株對(duì)該模型進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果顯示該模型對(duì)61株a-f型菌株的分型的靈敏度為100%,特異度為92.2%。為進(jìn)一步提高特異度,我們建立了包含50株菌株的擴(kuò)大數(shù)據(jù)模型,使用126株臨床分離株對(duì)擴(kuò)大模型進(jìn)行盲法驗(yàn)證,結(jié)果顯示擴(kuò)大模型對(duì)28株b、e、f型莢膜菌株分型的靈敏度為100%,特異度為100%。可見(jiàn),使用MALDI-TOF質(zhì)譜法對(duì)流感嗜血桿菌進(jìn)行莢膜分型是十分精確的。

P453 以色列在引入7價(jià)和13價(jià)肺炎疫苗后出現(xiàn)肺炎鏈球菌12F血清型//Assaf Rokney, Shalom Ben-Shimol, Zinaida Korenman,等

以色列分別于2009年和2010年開(kāi)始實(shí)施7價(jià)和13價(jià)肺炎疫苗的接種工作。在疫苗引進(jìn)后的七年來(lái),我們對(duì)由肺炎鏈球菌12F血清型(Sp12F)引起的侵襲性肺炎(IPD)進(jìn)行了前瞻性、人群為基礎(chǔ)的、全國(guó)性的動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)。結(jié)果顯示,2009年7月至2016年6月期間共發(fā)生侵襲性肺炎 4 573次,其中434次(9.5%)由12F血清型引起。小于5歲年齡組由12F血清型引起的侵襲性肺炎發(fā)病率上升最顯著,2009至2010年為1.44/10萬(wàn),而2011至2012年高于3.9/10萬(wàn);其它年齡組也均有不同程度的上升。在2011至2016年期間,12F血清型為引發(fā)侵襲性肺炎的主要血清型,多對(duì)青霉素不敏感(MIC>0.06 μg/mL;MIC50=0.12),且主要為序列型3774,該型僅在以色列發(fā)現(xiàn)(在2000年至2009年間占90%)。實(shí)施疫苗接種以來(lái),12F血清型作為優(yōu)勢(shì)株所引發(fā)的侵襲性肺炎持續(xù)、急劇上升,該單一血清型的擴(kuò)張可能不僅僅是一個(gè)短暫的暴發(fā)。

P471 風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估工具在流感大流行前準(zhǔn)備工作中的應(yīng)用// Stephen A. Burke, Susan C. Trock

2010年,美國(guó)疾病預(yù)防控制中心開(kāi)發(fā)了一種流感風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估工具(IRAT),用于系統(tǒng)地捕獲和評(píng)估當(dāng)前未在人類中流行的甲型流感病毒相關(guān)信息。流感風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估工具使用一個(gè)多屬性相加模型生成每種病毒的總風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分。雖然流感風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估工具不是用來(lái)預(yù)測(cè)下一次甲流大流行,但它能為大流行前準(zhǔn)備工作提供決策。

P478 印度應(yīng)用死因推斷量表來(lái)確定耐多藥肺結(jié)核患者治療期間死亡的根本原因//Poonam Ramesh Naik, Patrick K. Moonan, Abhay Subhashrao Nirgude,等

在耐多藥肺結(jié)核患者(MDR TB)中,僅不足50%的患者完成治療療程,大多數(shù)耐多藥肺結(jié)核患者因治療過(guò)程中死亡而未完成治療。為明確肺結(jié)核本身造成耐多藥肺結(jié)核患者死亡的比例,在2016年1-12月,我們使用結(jié)構(gòu)化的死因推斷工具對(duì)死者家屬進(jìn)行調(diào)查。成立的委員會(huì)對(duì)死因推斷、死亡證明以及可以從家庭成員獲取的其它醫(yī)學(xué)記錄進(jìn)行綜合分析,以探明患者的根本死因。結(jié)果發(fā)現(xiàn),肺結(jié)核是66%(47/71)死亡患者的根本死因。此外,經(jīng)過(guò)綜合分析,我們認(rèn)為6名因自殺、2名因肺栓塞而死亡的患者的根本死因也是肺結(jié)核。治療過(guò)程中死亡意味著治療程序的失敗,制定適當(dāng)、及時(shí)的干預(yù)措施的首要環(huán)節(jié)是對(duì)死亡原因進(jìn)行準(zhǔn)確了解。

P492 2014-2015年加拿大安大略省多倫多市應(yīng)用基因組測(cè)序方法定義機(jī)構(gòu)暴發(fā)流感的研究// Derek R. MacFadden, Allison McGeer, Taryn Athey,等

目前對(duì)機(jī)構(gòu)暴發(fā)流感的臨床定義是否適合尚不清楚。我們對(duì)加拿大多倫多2014-2015年流感季節(jié)期間發(fā)生的機(jī)構(gòu)暴發(fā)流感進(jìn)行了回顧性的基因組測(cè)序和流行病學(xué)分析。通過(guò)對(duì)38個(gè)報(bào)告暴發(fā)流感的長(zhǎng)期護(hù)理機(jī)構(gòu)進(jìn)行調(diào)查,我們對(duì)每個(gè)機(jī)構(gòu)最早提交的2份A型(H3N2)流感陽(yáng)性樣本進(jìn)行測(cè)序。基因組測(cè)序結(jié)果顯示,同一暴發(fā)流感機(jī)構(gòu)提交的病例樣本在基因序列上大多高度相關(guān)。而包括監(jiān)測(cè)樣本在內(nèi)的所有樣本的檢測(cè)結(jié)果表明,流感暴發(fā)的傳染源很可能來(lái)自廣泛傳播的病毒譜系。通過(guò)多數(shù)基因組和血凝素特異性基因的兩兩距離分析能識(shí)別流感暴發(fā)時(shí)同一機(jī)構(gòu)的樣本和不同機(jī)構(gòu)的樣本之間的差別閾值;曲線下面積是0.93~0.95。在識(shí)別長(zhǎng)期護(hù)理機(jī)構(gòu)暴發(fā)流感時(shí),常規(guī)基因組測(cè)序不太可能在目前臨床定義的基礎(chǔ)上提供額外的幫助;但在傳染源調(diào)查中測(cè)序可能起到重要作用。

P506 2012-2015年南非肺炎支原體的流行病學(xué)和分子學(xué)鑒定及特征// Maimuna Carrim, Nicole Wolter, Alvaro J. Benitez,等

2012-2015年期間,我們用PCR方法對(duì)南非患有嚴(yán)重呼吸系統(tǒng)疾病(SRI)、流感樣疾病患者(ILI)以及對(duì)照組的呼吸道樣本進(jìn)行肺炎支原體檢測(cè),隨后對(duì)陽(yáng)性樣本進(jìn)行培養(yǎng)和分子鑒定。嚴(yán)重呼吸系統(tǒng)疾病患者的肺炎支原體感染率為1.6%,流感樣疾病患者為0.7%,對(duì)照組為0.2%(P<0.001)。肺炎支原體陽(yáng)性者中年齡小于5歲(校正OR=7.1;95%CI=1.7~28.7)和艾滋病病毒感染(校正OR=23.8;95%CI=4.1~138.2)與疾病的嚴(yán)重性有關(guān)。嚴(yán)重呼吸系統(tǒng)疾病患者中肺炎支原體的歸因危險(xiǎn)度為93.9%(95%CI=74.4%~98.5%),流感樣疾病患者中為80.7%(95%CI=16.7%~95.6%)。支原體肺炎患者年平均住院率為28 /10萬(wàn)。我們觀察到的所有樣本均對(duì)大環(huán)內(nèi)酯類藥物敏感,基因型為P1-Ⅰ型、P1-Ⅱ型和一種具有多位點(diǎn)可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列3/6/6/2,3/5/6/2和4/5/7/2的Ⅱ型變異株。

P558 2014-2015年法屬波利尼西亞的登革熱和基孔肯雅熱病毒抗體的血清陽(yáng)性率調(diào)查// Maite Aubry, Anita Teissier, Michael Huart,等

2014-2015年期間,我們調(diào)查研究了法屬波利尼西亞的登革熱和基孔肯雅熱病毒抗體血清陽(yáng)性率。學(xué)齡兒童登革熱病毒抗體陽(yáng)性率約為60%,一般人群的陽(yáng)性率大于83%;2013年寨卡疫情發(fā)生之前,基孔肯雅熱病毒抗體陽(yáng)性率小于3%,而寨卡疫情發(fā)生后為76%。登革熱病毒群體免疫可能影響寨卡病毒感染和發(fā)病機(jī)制。

P562 2011-2015年意大利再現(xiàn)腸道血清型那波利沙門氏菌的分子流行病學(xué)分析//Michela Sabbatucci, Anna Maria Dionisi, Patrizio Pezzotti等

在歐洲,人群感染腸道血清型那波利沙門氏菌(Salmonella enterica serovar Napoli)是罕見(jiàn)的。然而,2014-2015年,在意大利沙門氏菌病例中此類感染卻占了5.9%,但其感染源尚屬未知。我們通過(guò)分析監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)以及比較菌株的遺傳相似性,發(fā)現(xiàn)受污染的蔬菜和地表水可能是人群的感染源。

P579 俄羅斯結(jié)核性脊椎炎患者結(jié)核分枝桿菌的全基因組分析//Ekaterina Chernyaeva, Mikhail Rotkevich, Ksenia Krasheninnikova等

在俄羅斯,通過(guò)對(duì)71例結(jié)核性脊椎炎患者體內(nèi)的結(jié)核分枝桿菌進(jìn)行全基因組分析,詳細(xì)描述了病原菌株的分布和耐藥表型,并發(fā)現(xiàn)其與已知耐藥突變顯著關(guān)聯(lián)。除了已知的基因因素,我們還發(fā)現(xiàn)了新的遺傳因素也與細(xì)菌毒性、致病性和耐藥性相關(guān)。

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