白玲榮,楊佐青,陶金忠
(寧夏大學(xué)農(nóng)學(xué)院,銀川 750021)
灘羊是我國(guó)唯一生產(chǎn)名貴二毛裘皮的特有綿羊品種,以生產(chǎn)美觀、輕便、保暖、耐用的裘皮而著稱。因其特殊的地理生態(tài)環(huán)境的長(zhǎng)期自然選擇和人工選育,造就了寧夏灘羊集產(chǎn)肉、產(chǎn)毛、產(chǎn)皮為一體的名貴羊種,寧夏(鹽池)是我國(guó)灘羊的主產(chǎn)區(qū),有“中國(guó)灘羊之鄉(xiāng)”的稱謂。在灘羊二毛期時(shí)(1月齡),其裘皮的特性更為突出,此時(shí)毛股長(zhǎng)而彎曲,毛穗自然下垂;毛纖維細(xì)長(zhǎng)均勻,光澤悅目,花案清晰,為寧夏五寶之一的“白寶”[1-2]。灘羊羊毛按其毛股花穗型的不同,將其分為不同的類型,其中最理想的為串字花、小串字花和軟大花等[3-6]。這些類型的羊毛在其花形結(jié)構(gòu)和毛型比例上都存在較大的差異,并且這些表型差異隨著二毛期灘羊日齡的增加逐漸減弱甚至消失[7]。因此,對(duì)于羊毛表型差異及其變化過程中差異蛋白研究具有非常重要的意義[8]。查閱國(guó)內(nèi)外相關(guān)資料,對(duì)于羊毛差異蛋白研究的文獻(xiàn)相對(duì)較少,主要集中于對(duì)羊毛“發(fā)源地”——皮膚的研究。松杰等[9]建立了內(nèi)蒙古絨山羊皮膚蛋白質(zhì)雙向電泳圖譜條件;楊潔等[10]對(duì)細(xì)毛羊皮膚組織中毛囊蛋白質(zhì)雙向電泳圖譜條件進(jìn)行了摸索;付雪峰等[11]利用雙向電泳及質(zhì)譜檢測(cè)技術(shù)對(duì)不同羊毛纖維直徑細(xì)毛羊皮膚組織差異表達(dá)蛋白質(zhì)進(jìn)行了研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)94個(gè)差異表達(dá)蛋白;楊劍波等[12]成功地構(gòu)建了中國(guó)美利奴羊超細(xì)型和哈薩克羊皮膚組織間抑制性消減cDNA文庫,初步篩選出一批可能影響羊毛性狀的差異表達(dá)ESTs;高麗霞等[13]利用雙向電泳技術(shù)對(duì)內(nèi)蒙古絨山羊全年12個(gè)月的皮膚毛囊蛋白質(zhì)進(jìn)行了研究,建立了毛囊發(fā)育周期蛋白質(zhì)圖譜,對(duì)圖譜進(jìn)行了差異蛋白比對(duì),并對(duì)差異蛋白進(jìn)行了質(zhì)譜檢測(cè),發(fā)現(xiàn)12種差異角蛋白;Flanagan等[14]用蛋白質(zhì)雙向電泳圖譜技術(shù)對(duì)羊毛差異表達(dá)蛋白進(jìn)行了分析研究;Plowman等[15]應(yīng)用凝膠和非凝膠技術(shù)對(duì)羊毛蛋白質(zhì)組學(xué)進(jìn)行了探討,并對(duì)美利奴羊、洛姆尼羊和考利代羊的羊毛蛋白進(jìn)行了研究。本實(shí)驗(yàn)旨在建立灘羊羊毛蛋白質(zhì)組的雙向電泳圖譜體系,為灘羊二毛彎曲的形成機(jī)理奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 樣品采集 灘羊羊毛樣品采自于寧夏鹽池灘羊選育場(chǎng),剪取灘羊體側(cè)肩胛骨后緣處完整羊毛樣品[16]。
1.1.2 試劑 固相膠條、IPG buffer和礦物油購(gòu)自GE公司;碘乙酰胺(IAA)、二硫蘇糖醇(DTT)、硫脲、尿素、CHAPS、Tirs-HCl、30%聚丙烯酰胺、過硫酸銨、TEMED和甘油均購(gòu)自索萊寶公司。
1.1.3 儀器 等電聚焦儀,多通道垂直電泳,惠普透射掃描儀,低溫離心機(jī),NW10UVE超純水系統(tǒng)。
1.2.1 羊毛洗滌 將采集的羊毛先用Teric GN9于60℃洗滌2 min,再于40℃洗滌2 min,然后用40℃去離子水洗滌2 min,最后用60℃去離子水洗滌2 min,放置室溫過夜干燥。將干燥的羊毛用二氯甲烷洗滌2次,每次用時(shí)5 min;再用乙醇洗滌2次,每次用時(shí)5 min;最后用超純水洗滌 2 次,每次用時(shí) 5 min,室溫干燥[17-19]。
1.2.2 樣品制備
1.2.2.1 尿素裂解法 將洗滌完畢的羊毛置于研缽中,加入液氮充分反復(fù)研磨至粉末狀。稱取10 mg羊毛樣品粉末溶于1 mL裂解液(7 mol/L尿素、2 mol/L硫脲、4%CHAPS、65 mmol/L DTT、0.5%IPG buffer、1 mmol/L EDTA、40 mmol/L Tris)中,震蕩溶解 2 min,分裝并根據(jù) Bradford法[20-21]定量上樣,其余放置于-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2.2 TCA/丙酮沉淀法 將洗滌完畢的羊毛置于研缽中,加入液氮反復(fù)研磨成粉狀。稱取10 mg樣品粉末加入1mLTCA丙酮溶液中,放置4℃冰箱過夜。將樣品置于4℃低溫離心機(jī)中12 000×g離心30 min,棄上清,加入100%丙酮(β-巰基乙醇)震蕩洗滌5 min,于低溫離心機(jī)12 000×g離心20 min。再重復(fù)一遍上述的洗滌過程;然后用90%丙酮(β-巰基乙醇)再次震蕩洗滌5 min,于低溫離心機(jī)12 000×g離心20 min,棄上清,再次重復(fù)一遍90%的丙酮洗滌過程。最后棄上清并抽真空晾干。加入1 mL裂解液(7 mol/L尿素、2 mol/L硫脲、4%的CHAPS、65 mmol/L 的 DTT、0.5%IPG buffer、1 mmol/L 的 EDTA、40 mmol/L Tris),充分裂解后,根據(jù)Bradford法定量的結(jié)果分裝,其余放置于-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 被動(dòng)上樣 將GE預(yù)制的18 cm膠條(pH值為4~7,pH 值為 3~10)在室溫下平衡 15 min,進(jìn)行蛋白質(zhì)上樣(上樣量分別為 200 μg,400 μg,600 μg,800 μg),根據(jù)蛋白上樣體積加入一定量的水化液(8 M尿素,2%CHAPS,1%DTT,0.5%IPG buffer),使混勻上樣總體積為400 μL進(jìn)行水化上樣。將混勻的蛋白樣品加入到IPG-box水化盤中,膠面向下輕輕覆蓋混合液,避免氣泡的產(chǎn)生,蓋緊IPG-box,放置15℃下被動(dòng)水化18 h。
1.2.4 第一向等電聚焦 將水化完成的膠條放入等電聚焦儀中,然后將濾紙片放置在電極和膠條間,放置電極并加入適量礦物油防止溶液的揮發(fā)。設(shè)置等電聚焦程序:300 v 30 min線性,500 v 1 h快速,8 000 v 3 h線性,8 000 v 80 000 Vhr快速,500 v 12 h快速至結(jié)束;300 v 30 min線性,500 v 1 h快速,8 000 v 3 h線性,9 000 v 90 000 Vhr快速,500 v 12 h快速至結(jié)束。
1.2.5 第二向SDS-PAGE垂直電泳 將聚焦完成后的IPG膠條用5 mL的平衡液Ⅰ(6 M尿素、2%SDS、1.5 M pH值8.8 Tris-HCl、20%甘油和1%DTT),至于搖床平衡15 min,平衡后使用電泳緩沖液潤(rùn)洗,再將膠條置于干凈水化盤,再加入平衡緩沖液Ⅱ(6 M尿素、2%SDS、1.5 M pH值8.8 Tris-HCl、20%甘油和4%IAA),放置于搖床平衡15 min。配制12%和10%的丙烯酰胺凝膠液并將其注入玻璃板夾層中,頂端留有1 cm左右的空間,用乙醇封面,以保持膠面平整。聚合時(shí)間1 h,待凝膠與上方液體分層時(shí),表明凝膠已基本聚合。倒去SDS-PAGE凝膠頂端的乙醇,用超重水沖洗膠面。將平衡好的膠條與聚丙烯酰胺凝膠膠面完全接觸,加入低熔點(diǎn)瓊脂糖封膠液室溫放置5 min,待徹底凝固后將其轉(zhuǎn)移至垂直電泳槽內(nèi)。向電泳槽中加入1×電泳緩沖液進(jìn)行第二向電泳,待溴酚藍(lán)指示劑達(dá)到底部邊緣時(shí)停止電泳。取出凝膠,切角做記號(hào)。
1.2.6 凝膠染色及圖像分析 每次凝膠用新配的考馬斯亮藍(lán)染色12 h后,用去離子水脫色48 h至背景干凈,然后再用Images-Scanner掃描儀掃描,再用PD Quest 8.0軟件分析雙向電泳圖譜的蛋白點(diǎn)數(shù)。
羊毛蛋白質(zhì)制備作為其雙向電泳圖譜建立的關(guān)鍵步驟,直接影響后續(xù)條件的建立。本次實(shí)驗(yàn)以TCA/丙酮沉淀法和尿素裂解法兩種方法進(jìn)行蛋白提取。從TCA/丙酮沉淀法(圖1A)雙向電泳圖譜中可以得到相比較于尿素裂解法(圖1B)較多的蛋白點(diǎn),在高豐度蛋白區(qū)可以較為明顯地看出,尿素裂解法溶解羊毛蛋白不夠充分,由于羊毛蛋白質(zhì)主要是由角蛋白等結(jié)構(gòu)蛋白組成,TCA/丙酮沉淀法較好地溶解了部分疏水性蛋白,提高了蛋白豐度和蛋白種類。選擇TCA/丙酮沉淀法作為灘羊羊毛蛋白質(zhì)的提取方法比較好。
圖1 不同蛋白提取方法灘羊羊毛雙向電泳圖譜
雙向電泳的蛋白上樣量對(duì)雙向電泳圖譜蛋白點(diǎn)的檢測(cè)是十分關(guān)鍵的,為了研究適合于灘羊羊毛蛋白質(zhì)雙向電泳的上樣量,本實(shí)驗(yàn)選擇了200、400、600和800 μg四種蛋白上樣量。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)上樣量為200 μg(圖2C)時(shí),只能得到高豐度蛋白,幾乎看不到低豐度蛋白;當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)上樣量為400 μg(圖2D)時(shí),得到十分模糊的低豐度蛋白,不利于后期蛋白分析;當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)上樣量為600 μg(圖2E)時(shí),高低豐度蛋白都有較清楚的分辨率;當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)上樣量為800 μg(圖2F)時(shí),高豐度蛋白由于蛋白濃度過高,影響蛋白質(zhì)的聚焦。所以相比較其他上樣量,選擇以600 μg作為灘羊羊毛雙向電泳圖譜的最適上樣量。
本實(shí)驗(yàn)選擇同為18 cm pH值范圍為3~10和4~7的2種IPG膠條作為灘羊羊毛蛋白質(zhì)雙向電泳圖譜條件的研究,從電泳圖譜中可清楚地看到,不同pH值范圍的IPG膠條對(duì)羊毛蛋白點(diǎn)的分布有較為明顯的影響,在pH值為4~7(圖3H)的圖譜中高豐度蛋白與低豐度蛋白都有較為清楚的分布;而pH值為3~10(圖3G)的圖譜中可直觀地看到其高豐度蛋白點(diǎn)出現(xiàn)堆積現(xiàn)象。因此,選擇pH值4~7作為灘羊羊毛雙向電泳的IPG膠條。
圖2 不同上樣量灘羊羊毛雙向電泳圖譜
圖3 不同pH值范圍的IPG膠條灘羊羊毛雙向電泳圖譜
蛋白質(zhì)雙向電泳技術(shù)是研究蛋白質(zhì)組學(xué)的經(jīng)典方法,對(duì)蛋白質(zhì)分離可達(dá)到理想效果,在各組織蛋白組分離和差異蛋白研究方面起重要的技術(shù)支撐[22]。在進(jìn)行蛋白質(zhì)雙向電泳過程中涉及到許多步驟和因素,都對(duì)蛋白質(zhì)雙向電泳圖譜結(jié)果有較大的影響,樣品的蛋白質(zhì)提取是進(jìn)行雙向電泳的關(guān)鍵步驟,蛋白提取方法的選擇是否合適,直接影響雙向電泳圖譜的分辨率和重復(fù)性及其后續(xù)差異蛋白點(diǎn)的鑒定。由于羊毛組織蛋白主要以角蛋白和羊毛結(jié)構(gòu)蛋白組成其特殊性,本實(shí)驗(yàn)對(duì)TCA/丙酮沉淀法[23-25]和尿素裂解法提取灘羊羊毛蛋白質(zhì)的效果進(jìn)行了研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn),TCA/丙酮沉淀法檢出的蛋白點(diǎn)數(shù)相比尿素裂解法有所增加,高豐度蛋白區(qū)蛋白點(diǎn)較為清晰,其原因可能是TCA/丙酮沉淀法反復(fù)沉淀洗滌羊毛蛋白,能較好地溶解某些疏水性蛋白,提高了蛋白豐度和蛋白種類,配合裂解液中高濃度的尿素和硫脲以及還原劑DTT、去污劑CHAPS等成分可增強(qiáng)羊毛蛋白的溶解,獲得較為理想的凝膠結(jié)果圖譜,得到清晰的蛋白點(diǎn)[26-27]。因此,選擇TCA/丙酮沉淀法作為灘羊羊毛蛋白質(zhì)的提取方法較為合適。
蛋白質(zhì)上樣量直接影響蛋白雙向電泳圖譜上蛋白點(diǎn)的分離效果,上樣量過低則導(dǎo)致低豐度蛋白不能被分離出來,上樣量過高則導(dǎo)致高豐度蛋白掩蓋部分分子量和等電點(diǎn)相近的低豐度蛋白,同時(shí)還會(huì)導(dǎo)致橫向拖帶[28]。本實(shí)驗(yàn)選擇 200、400、600、800 μg 四種不同上樣量進(jìn)行了灘羊羊毛蛋白圖譜上樣量的研究。當(dāng)上樣量為200 μg和400 μg時(shí),只能得到模糊高低豐度蛋白,很明顯不能滿足蛋白上樣量的要求,不利于后期蛋白分析;當(dāng)上樣量為800 μg時(shí),高豐度蛋白由于蛋白濃度過高,電泳圖譜蛋白出現(xiàn)聚焦現(xiàn)象,蛋白沒有得到有效的分析。相比較其他上樣量,600 μg時(shí)高低豐度蛋白都有較清楚的分辨率,羊毛蛋白得到較為理想的分離效果。因此,選擇以600 μg作為灘羊羊毛雙向電泳圖譜的最適上樣量。
雙向電泳IPG膠條的選擇主要根據(jù)羊毛蛋白的組成情況,查閱相關(guān)文獻(xiàn),選擇18 cm的pH值為4~7和pH值為3~10的2種膠條。寬pH值范圍的膠條用來分析總蛋白,窄pH值范圍的膠條可以大大提高分辨率和靈敏度,用于分析特定的蛋白[29]。從得到的蛋白圖譜可以明顯地看出,pH值為4~7的蛋白點(diǎn)得到了有效的分離。鑒于后期對(duì)灘羊羊毛差異蛋白點(diǎn)的研究需要,所以選擇pH值相對(duì)較窄的、具有很好分辨率的pH值為4~7作為灘羊羊毛雙向電泳的膠條。
對(duì)灘羊羊毛進(jìn)行洗滌,液氮研磨處理,利用TCA/丙酮沉淀法提取蛋白,選擇18 cm的pH值為4~7的IPG膠條,上樣量600 μg,聚焦時(shí)間90 000 Vhr或更高,12%SDS-PAGE凝膠,建立灘羊羊毛雙向電泳圖譜體系,為灘羊不同時(shí)期羊毛和同一時(shí)期不同花穗型羊毛,以及灘羊羊毛與其他品種羊毛之間的差異蛋白質(zhì)組學(xué)研究奠定了基礎(chǔ)。
[1]呂亞軍,王永軍,陳艷瑞,等.3~30日齡灘羊羔羊能量需要量研究[J].西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版),2009,37(4):72-73.
[2]崔明巧.鹽池灘羊品種資源的保護(hù)與發(fā)展探討[J].黑龍江畜牧獸醫(yī),2012(22):24-26.
[3]譚光兆,辛綱,郭祥濤.影響灘羊羔羊品質(zhì)一些因素的分析[J].毛皮動(dòng)物飼養(yǎng),1985(2):39-41.
[4]Ma G W,Chu Y K,Zhang W J,et al.Polymorphisms ofFSTgene and their association with wool quality traits in Chinese Merino sheep[J].PLoS One,2017,12(4):e0174868.
[5]崔重九,許百善,王天新,等.灘羊裘皮花穗的遺傳[J].寧夏農(nóng)林科技,1983(4):31-34.
[6]張幼麟,崔重九.灘羊花穗的分類方法[J].寧夏農(nóng)林科技,1965(12):33-34.
[7]Jacobs J R,Sommers K N,Zajac A M,et al.Early IL-4 gene expression in abomasum is associated with resistance toHaemonchus contortusin hair and wool sheep breeds[J].Parasite Immunol,2016,38(6):333-339.
[8]Li S,Zhou H,Gong H,et al.Identification of the ovine keratinassociated protein 22-1(KAP22-1)gene and its effect on wool traits[J].Genes(Basel),2017,8(1):122-126.
[9]松杰,董揚(yáng),李金泉,等.內(nèi)蒙古絨山羊皮膚蛋白質(zhì)雙向電泳條件優(yōu)化及圖譜建立[J].中國(guó)畜牧獸醫(yī),2012,39(7):11-14.
[10]楊潔,付雪峰,黃錫霞,等.細(xì)毛羊皮膚組織中毛囊蛋白質(zhì)2-DE圖譜的建立與初步分析[J].中國(guó)畜牧獸醫(yī),2015,42(1):124-130.
[11]付雪峰,楊涵羽璐,石剛,等.不同羊毛纖維直徑細(xì)毛羊皮膚組織差異表達(dá)蛋白質(zhì)研究[J].中國(guó)畜牧獸醫(yī),2016,43(4):879-883.
[12]楊劍波,甘尚權(quán),李晶,等.中國(guó)美利奴超細(xì)型與哈薩克羊毛囊興盛期皮膚組織消減cDNA文庫的構(gòu)建[J].中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),2012,45(15):3154-3164.
[13]高麗霞,張燕軍,張文廣,等.內(nèi)蒙古白絨山羊毛囊發(fā)育周期蛋白質(zhì)表達(dá)譜分析[J].農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào),2014,22(6):727-735.
[14]Flanagan L M,Plowman J E,Bryson W G,et al.The high sulphur proteins of wool:Towords an understanding of sheep breed diversity[J].Proteomics,2002,2:1240-1246.
[15]J E Plowman,S Deb-Choudhury,S Clerens,et al.Unravelling the proteome of wool:Towards markers of wool quality traits[J].Proteomics,2012,75(14):4315-4322.
[16]Zhang H,Zhang S,Zhao H,et al.Ovine hair follicle stem cells derived fromsingle vibrissae reconstitute haired skin[J].Int J Mol Sci,2015,16(8):17779-17797.
[17]Patrucco A,Cristofaro F,Simionati M,et al.Wool fibril sponges with perspective biomedical applications[J].Mater Sci Eng C Mater Biol Appl,2016,61(1):42-50.
[18]Zhao J,Liu N,Liu K,et al.Identification of genes and proteins associated with anagen wool growth [J].Anim Genet,2017,48(1):67-79.
[19]Gong H,Zhou H T,F(xiàn)orrest R H J,et al.Wool keratin-associated protein genes in sheep-a review[J].Genes(Basel),2016,7(6):24.
[20]Zhao Z,Liu G,Li X,et al.Characterization of the promoter regions of two sheep keratin-associated protein genes for hair cortexspecific expression[J].PLoS One,2016,11(4):e0153936.
[21]Almeida A M,Plowman J E,Harland D P,et al.Influence of feed restriction on the wool proteome:A combined iTRAQ and fiber structural study[J].Proteomics,2014,103(3):170-173.
[22]Debchoudhury S,Plowman J E,Harland D P.Isolation and analysis of keratins and keratin-associated proteins from hair and wool[J].Methods Enzymol,2015,568:279-301.
[23]甘淋,李娟,何濤,等.幾種蛋白質(zhì)含量測(cè)定方法的比較研究[J].瀘州醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào),2004,27(6):500-502.
[24]Gorg A,Postel W,Gunther S.The current state of two-dimensional electrophoresis with immobilized pH gradients[J].Electrophoresis,2002,21(6):1037-1053.
[25]Flengsrud R,Kobro G.A method for two-dimensional electrophoresis of proteins from green plant tissues [J].Analytical Biochemistry,1989,177(1):33-36.
[26]朱金勇.鎘鹽誘導(dǎo)的牙鲆腦、鰓、肝差異蛋白質(zhì)組研究[D].廈門:廈門大學(xué),2005.
[27]謝玲,應(yīng)萬濤,張開泰,等.雙向電泳和肽質(zhì)量指紋譜技術(shù)鑒定支氣管上皮細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化相關(guān)蛋白ANX1-human[J].中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào),2000(16):569-573.
[28]黃愉淋,黃德倫,官俊良,等.水牛卵泡液差異蛋白質(zhì)雙向電泳方法的建立及質(zhì)譜分析[J].畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào),2013,44(8):1244-1247.
[29]詹萍萍,王春琳,宋微微,等.曼氏無針烏賊墨囊蛋白質(zhì)提取及雙向電泳條件優(yōu)化[J].寧波大學(xué)學(xué)報(bào),2013,26(4):1-6.