国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

原發(fā)性膽汁性膽管炎相關(guān)易感基因的研究進(jìn)展

2018-02-12 11:09王姿璇潘愛萍趙克開江軍
關(guān)鍵詞:易感性多態(tài)性基因組

王姿璇,潘愛萍,趙克開,江軍

原發(fā)性膽汁性膽管炎(PBC)既往稱為原發(fā)性膽汁性肝硬化,是一種慢性進(jìn)行性肝內(nèi)膽汁淤積性疾病,典型病理表現(xiàn)為肝內(nèi)中小膽管進(jìn)行性破壞,伴門管區(qū)淋巴細(xì)胞浸潤和肝纖維化,疾病進(jìn)展最終可導(dǎo)致肝硬化和肝功能衰竭[1]。PBC的病因尚不明確,但被認(rèn)為與自身免疫有關(guān),約90%以上PBC患者的抗線粒體抗體(AMA)呈陽性。越來越多的研究證實(shí),PBC的發(fā)病機(jī)制涉及遺傳、環(huán)境及免疫等因素,其中遺傳易感性在PBC的發(fā)病中更是起到了至關(guān)重要的作用。本文就 PBC相關(guān)易感基因的研究進(jìn)展作一綜述。

1 遺傳因素在PBC發(fā)病中的作用

1.1 種族因素與PBC的發(fā)病 PBC的發(fā)病存在顯著的地域性,不同地區(qū)、不同人群的發(fā)病率存在明顯的差異。有資料顯示,北美高加索人群與歐洲人群發(fā)病率較高:發(fā)病率從0.33/10萬/年上升至5.8/10萬/年,流行率從1.91/10萬升至40.2/10萬;而亞洲人群發(fā)病率較低[2]。由此可見,人口因素特別是種族基因的差異起到了一定的作用。

1.2 家族因素與PBC的發(fā)病 PBC的發(fā)病具有顯著的家族傾向性。英國的Jones等[3]的研究顯示6.4%的PBC患者有家族史,第一代家庭成員發(fā)病率為1.4%~6.4%,是普通人的100倍。Kim等[4]通過調(diào)查研究美國PBC患者家族史發(fā)現(xiàn),有54%的患者親屬患病,一級親屬和后代的發(fā)病率分別為0.72%和1.2%。PBC患者的一級親屬的AMA陽性率明顯高于其他對照組[5]。對于同卵雙胞胎的研究顯示,同卵雙胞胎PBC發(fā)病率的一致性高達(dá)63%(5/8),異卵雙胞胎則為0(0/8)[6]。

1.3 性別因素與PBC的發(fā)病 類似于其他自身免疫性疾病,PBC患者多為女性,女性發(fā)病率是男性的10倍[7];這提示性染色體上的相關(guān)基因有可能在 PBC的發(fā)病機(jī)制中起到重要作用。

2 PBC相關(guān)易感基因的主要篩選方法

2.1 單核苷酸多態(tài)性(SNP) SNP是指人類基因組中高頻率出現(xiàn)的單個堿基對的變異所引起的DNA序列多態(tài)性,一些SNPs與復(fù)雜的遺傳性狀相關(guān)。關(guān)聯(lián)研究可以確定SNP是否與PBC相關(guān)。迄今為止,在過去的20年中,已經(jīng)使用候選基因方法鑒定了許多 PBC相關(guān)的重要易感性SNP,諸如細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞抗原4基因(CTLA4)、腫瘤壞死因子(TNF-)、細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路和轉(zhuǎn)錄因子4基因(STAT4)、蛋白酪氨酸磷酸酶非受體型基因22(PTPN22)、維生素D受體基因(VDR)、C型凝集素家族16成員A基因(Clec16A)、細(xì)胞因子信號抑制物基因1(SOCS1)及轉(zhuǎn)錄因子Spi-B基因(SPIB)[8]。

2.2 全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)GWAS是一種對人類全基因組范圍內(nèi)序列變異及SNP分析的方法,其最顯著的特點(diǎn)之一是能夠在整個人類基因組范圍內(nèi)中識別并篩選出與疾病相關(guān)遺傳基因[9]。在GWAS之前,已有許多研究探索一些自身免疫性疾病相關(guān)基因與PBC的關(guān)聯(lián),但由于統(tǒng)計(jì)能力以及研究方法的限制,研究結(jié)果的可重復(fù)性較低,并且基因的覆蓋面較窄,通常只有單一的SNP。僅有一小部分人類白細(xì)胞抗原(HLA)以及細(xì)胞毒性 T細(xì)胞抗原(CTLA-4)基因被證明在研究中具有較高的重復(fù)性,且只有HLA在不同種族、不同隊(duì)列研究中被始終證實(shí)與 PBC相關(guān)[10]。自首個關(guān)于PBC的全基因關(guān)聯(lián)研究發(fā)表以來,已有廣泛的GWAS研究與PBC相關(guān)的遺傳位點(diǎn)。目前,已有7個GWAS在對北美、歐洲、日本以及中國人群的進(jìn)行PBC相關(guān)基因的研究,大量的疾病相關(guān)基因及SNPs被發(fā)現(xiàn)[6]。

3 PBC相關(guān)易感基因

3.1 HLA易感基因 HLA基因復(fù)合體位于人類第六號染色體6p21,包含了人類基因組中最具多態(tài)性的基因。2006年,Donaldson等[11]在英國及意大利人群中發(fā)現(xiàn),HLA-DRB1*0801是共同的風(fēng)險(xiǎn)基因,而HLA-DRB1*13是共同的保護(hù)基因,DRB1*11僅在意大利人群中發(fā)現(xiàn)。2009 年,Hirschfield等[12]通過GWAS研究表明在北美的高加索人群中HLADQB1易感性最強(qiáng),此外DQB1、DRB1、DRA、DDB1這些基因也被證實(shí)與PBC相關(guān)[12]。已有大量研究表明,HLA-DRB1與PBC易感性關(guān)聯(lián)最強(qiáng)[13]。而與PBC高度相關(guān)的 DRB1*08等位基因在撒丁人群中出現(xiàn)的頻率較低,DRB1*0301-DQB1*0201單體型的高發(fā)病率則是其特有的遺傳學(xué)特征[14]。在亞洲地區(qū),Zhao等[15]研究中國人群發(fā)現(xiàn) DRB1*0803-DQB1*0601與 PBC 高度相關(guān),DRB1*0701-DQB1*0202也有關(guān)聯(lián),而DRB1*1202-DQB1*0301相對于對照組明顯降低。近來,日本一項(xiàng)大規(guī)模的研究在日本人群中鑒定了 HLA-DR-DQ區(qū)域中PBC的4個主要風(fēng)險(xiǎn)/保護(hù)因子DRB1*08:03、DQB1*06:04、 DQB1*03:01 和DQB1*04:01[16]。其中 DRB1*08:03 是日本人群中最強(qiáng)的風(fēng)險(xiǎn)基因,而DQB1*06:04保護(hù)性最強(qiáng)。

3.2 非HLA易感基因

3.2.1 白介素12(IL-12)與STAT4 歐洲的 3個 GWAS研究顯示 IL-12A,IL12RB2以及STAT4在非HLA基因位點(diǎn)中與 PBC的發(fā)病具有最強(qiáng)的關(guān)聯(lián)性[12,17],這些研究表明了PBC發(fā)病機(jī)制與參與 CD4+T細(xì)胞活化的基因變異有關(guān),尤其是促進(jìn)Th1T細(xì)胞極化的IL-12-JAK-STAT4信號通路[1]。IL-12是由IL-12A、IL-12B基因編碼的p35和p40兩個亞基組成的異二聚體分子[1],其受體由IL12RB1與IL12RB2兩個基因編碼而成[1]。2009年,北美GWAS報(bào)道了高加索人群中與PBC相關(guān)聯(lián)的非HLA風(fēng)險(xiǎn)位點(diǎn)IL-12A(rs6441286與rs574808)和 IL12RB2(rs3790567)[12],這是首次關(guān)于非HLA的PBC風(fēng)險(xiǎn)位點(diǎn)的發(fā)現(xiàn),關(guān)聯(lián)性僅次于 HLA。隨后意大利人群的GWAS研究中證實(shí)了 IL-12A和IL12RB2與PBC相關(guān)[18]。此外,IL-12信號通路上的其他基因位點(diǎn)如 STAT4以及IL-12的亞基p35也陸續(xù)被GWAS證實(shí)與PBC相關(guān)[17,19]。2015年我國首個大規(guī)模漢族PBC人群研究未發(fā)現(xiàn)IL-12A與疾病的關(guān)聯(lián),而IL12RB2、STAT4則與PBC相關(guān)[20]。上述研究結(jié)果表明,在亞洲人群中IL-12A和IL12RB2基因位點(diǎn)與PBC易感性關(guān)聯(lián)性不強(qiáng),它們是歐洲人群的重要易感位點(diǎn)。

3.2.2 細(xì)胞毒性T細(xì)胞抗原4(CTLA4)

CTLA4是主要的抑制T細(xì)胞活化的通路。CTLA 4主要表達(dá)于活化的調(diào)節(jié)性T細(xì)胞,通過與CD28競爭性結(jié)合表達(dá)于抗原提呈細(xì)胞(APC)表面的CD86/CD80來抑制細(xì)胞免疫[21]。早期的兩個Meta分析認(rèn)CTLA4+49 G>A多態(tài)性與PBC相關(guān)[22-23],Huang等[22]通過Meta分析研究發(fā)現(xiàn)CTLA4+49 G>A多態(tài)性可能是亞洲PBC人群的風(fēng)險(xiǎn)因素。美國的隊(duì)列研究發(fā)現(xiàn),相比AMA陰性患者,CTLA4 rs231775 G/G基因型和rs231725 A/A基因型在 AMA陽性的PBC患者中有較高的頻率[21,24]。日本的研究證實(shí)CTLA4 rs231775、rs3087243和rs231725與PBC易感性高度相關(guān),而rs231725與疾病的晚期進(jìn)展階段高度相關(guān)。CTLA4的單體型1(rs231775 G、rs231777 C、rs3087243 G、rs231725A、GCGA)不僅是PBC易感性的風(fēng)險(xiǎn)因素,更是疾病進(jìn)展的保護(hù)因素,而CTLA-4單倍型2(ACAG)分別是PBC易感性的保護(hù)因素以及進(jìn)展性的風(fēng)險(xiǎn)因素[21]。此外,CTLA4 rs231777和單體型 3(ATGG)與gp120抗體顯著相關(guān)[21]。

3.2.3 腫瘤壞死因子(TNF) 近年來,研究者通過GWAS發(fā)現(xiàn)了TNF-信號通路中的幾個基因座與疾病的易感性相關(guān),然而不同地區(qū)、不同種族的PBC易感基因以及SNP位點(diǎn)不同。例如,Dong等[20]在中國漢族人群中發(fā)現(xiàn)與日本PBC人群相同的 TNFSF15位點(diǎn) SNP(rs4979462),卻未發(fā)現(xiàn)與歐洲PBC人群相關(guān)聯(lián)。相反,與歐洲PBC人群相關(guān)聯(lián)的TNFRSF1A 位點(diǎn)(rs1800693)未在日本和中國人群中發(fā)現(xiàn)[19]。

3.2.4 維生素D受體(VDR) VDR基因編碼屬于核激素受體超家族的蛋白質(zhì),并且在維生素D應(yīng)答基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控中起作用。PBC患者的VDR基因多態(tài)性主要存在于 BsmI(rs1544410)、ApaI(rs7975232)和 TaqI(rs731236)三個位點(diǎn)[25]。在匈牙利人群中發(fā)現(xiàn) BsmI(rs1544410)與PBC的易感性相關(guān)[26],然而BsmI(rs1544410)在德國PBC人群中被認(rèn)為是保護(hù)基因[27]。中國人群中發(fā)現(xiàn)TaqI(rs731236)多態(tài)性與PBC疾病風(fēng)險(xiǎn)顯著關(guān)聯(lián),ApaI(rs7975232)或 BsmI(rs1544410)與PBC發(fā)病無關(guān)[28]。Fang等[25]研究發(fā)現(xiàn)ApaI多態(tài)性在總體分析和亞洲亞組中觀察到顯著的相關(guān)性,TaqI在高加索人群中有關(guān)聯(lián)而未發(fā)現(xiàn)與亞洲人群相關(guān),但未檢測到BsmI多態(tài)性與各個種族的 PBC人群有關(guān)聯(lián)。可能是基于小樣本或不同種族人群的遺傳易感性不同,這些研究的結(jié)論并不相同,環(huán)境因素以及其他風(fēng)險(xiǎn)基因之間的相互作用也可能會對結(jié)果產(chǎn)生一定影響。

4 問題與展望

自首個GWAS以來,已有大量研究從全基因組層面證實(shí)了數(shù)千個與 PBC相關(guān)的基因位點(diǎn)以及風(fēng)險(xiǎn)基因所在的通路。盡管這些研究已經(jīng)揭露了各種疾病關(guān)聯(lián)位點(diǎn),但不能完全解釋PBC的病因。PBC是涉及多種基因變異的復(fù)雜性疾病,目前發(fā)現(xiàn)的基因位點(diǎn)只是一小部分,還有大量未知基因以及通路需要進(jìn)一步研究。此外,PBC的發(fā)病機(jī)制中,遺傳因素只是一方面,環(huán)境因素包括抽煙、一些化學(xué)物質(zhì)以及感染等可能也參與了PBC的發(fā)病。隨著對 PBC遺傳易感性研究的深入,結(jié)合其他病因機(jī)制,針對不同種族的人群,風(fēng)險(xiǎn)基因位點(diǎn)的靶向治療可以成為PBC的有效治療途徑。

猜你喜歡
易感性多態(tài)性基因組
單核苷酸多態(tài)性與中醫(yī)證候相關(guān)性研究進(jìn)展
牛參考基因組中發(fā)現(xiàn)被忽視基因
NRG1-ErbB4基因多態(tài)性與局灶性癲癇易感性的關(guān)系
CLOCK基因rs4580704多態(tài)性位點(diǎn)與2型糖尿病和睡眠質(zhì)量的相關(guān)性
科學(xué)家找到母愛改變基因組的證據(jù)
血清HBV前基因組RNA的研究進(jìn)展
紫花白及基因組DNA提取方法的比較
CD14啟動子-260C/T基因多態(tài)性與胃癌易感性的Meta分析
α1抗胰蛋白酶基因多態(tài)性與肺癌易感性的研究
蒙古斑在維吾爾族新生兒中分布的多態(tài)性
安溪县| 潞西市| 温州市| 芦溪县| 佛教| 北海市| 武强县| 罗定市| 乐亭县| 合肥市| 汉源县| 疏附县| 丰宁| 金华市| 大石桥市| 濮阳县| 清远市| 大英县| 丰原市| 青铜峡市| 囊谦县| 浙江省| 朔州市| 邯郸县| 从江县| 墨脱县| 潢川县| 墨江| 陆河县| 乌苏市| 阜南县| 雷波县| 阳泉市| 象山县| 宜城市| 雅江县| 罗城| 古浪县| 临夏市| 四会市| 库伦旗|