楊 鍇 劉曉婷 閆有圣
1.北京大學(xué)國際醫(yī)院(102206);2.解放軍總醫(yī)院 3.國家衛(wèi)生健康委科學(xué)技術(shù)研究所
我國每年新增出生缺陷數(shù)約90萬例[1],其中大部分由遺傳因素導(dǎo)致,而單基因遺傳病是遺傳性出生缺陷的重要組成部分。單基因遺傳病中,“攜帶者”是對隱性遺傳方式而言,不表現(xiàn)與之相應(yīng)的疾病,但會將其傳遞給后代,使其后代有較大的患病幾率[2]。了解適齡夫妻是否為攜帶者狀態(tài),可為他們生育選擇提供幫助。目前,致病基因明確的單基因病有5000多種,其中有1000多種屬于隱性遺傳方式[3]。單基因病攜帶者篩查有幾十年的發(fā)展歷史,傳統(tǒng)的模式是基于種族、地域等因素對某些特定病種和突變進行篩查,或針對某一特定病種推廣人群普篩,并依此為陽性攜帶者提供遺傳咨詢和生育指導(dǎo)。近年來,擴展性攜帶者篩查(ECS)在歐美國家出現(xiàn),它不針對特定地域和人群,能一次性篩查幾十、幾百乃至上千種單基因病,有取代傳統(tǒng)篩查模式的趨勢[4]。然而,這種篩查方式目前還處于發(fā)展階段,面臨著諸多挑戰(zhàn)。本文將對ECS的演化歷程、發(fā)展現(xiàn)狀、面臨的問題以及未來展望進行綜述。
早期的單基因病攜帶者篩查,主要針對特定種族和地域的人群進行。例如,德裔猶太人高發(fā)的隱性遺傳病篩查[5],地中海沿岸、東南亞等地的血紅蛋白病篩查[6];或者是僅就個別或幾種疾病開展人群普篩,如囊性纖維化(CF)和脊肌萎縮癥(SMA)等[7]。隨著人類基因組計劃的完成,致病基因明確的單基因病數(shù)持續(xù)增加。同時,基因測序技術(shù)發(fā)展迅速,基因包、外顯子測序等檢測產(chǎn)品的通量更高,成本不斷下降。此外,千人基因組計劃的數(shù)據(jù)表明,普通人群中每人都可能攜帶2~5種遺傳疾病的致病突變[8]。這些理論和實踐基礎(chǔ)使得增加遺傳病篩查的病種成為一個趨勢。2010年,最早的ECS項目出現(xiàn)[9-10],其理念是在孕前或早孕期全面了解夫妻的遺傳背景,以評估其后代罹患多種遺傳疾病的風(fēng)險,從而為選擇最適宜的生育選項提供可靠證據(jù)[11]。經(jīng)過幾年發(fā)展,ECS在歐美國家得到廣泛的推廣(表1),目前美國每年有超過20萬名受檢者選擇這項檢測[14]。然而,ECS還有很多問題需要加以解決和規(guī)范化。
表1 有代表性的ECS研究數(shù)據(jù)匯總
AR為常染色體隱性遺傳;XR為X連鎖隱性遺傳
多年來,我國的遺傳病攜帶者篩查僅針對某一特定病種(類),如遺傳性耳聾[15]、SMA[16]、地中海貧血[6]等,并無權(quán)威的指南和共識對篩查的執(zhí)行加以規(guī)范和指導(dǎo)。近幾年,國內(nèi)多家第三方檢測機構(gòu)推出了ECS產(chǎn)品,但尚未獲得國家食品藥品監(jiān)督管理局(CFDA)的資質(zhì)授權(quán);并且各產(chǎn)品的設(shè)計策略、具體內(nèi)容、臨床服務(wù)水平差異較大;各檢測方也尚未積累可靠的大樣本數(shù)據(jù)作為改進參考。
2013年,美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)協(xié)會(ACMG)首先針對ECS提出了其基因包所納入的致病基因和突變應(yīng)當(dāng)滿足的5條標(biāo)準(zhǔn),并對產(chǎn)品說明、知情同意、相關(guān)咨詢的問題做出建議[17]。2015年,美國五家行業(yè)協(xié)會發(fā)表聯(lián)合聲明[18],就典型的ECS范例、開展相關(guān)事宜、知情同意、檢測后咨詢、其基因包應(yīng)滿足的條件、結(jié)果解讀、ECS研究方向等方面做出了詳盡的闡述。2016年,歐洲人類遺傳學(xué)會也發(fā)表政策性文章[19],指出現(xiàn)有的ECS尚缺乏足夠的真實性指標(biāo),還可能面臨諸多倫理學(xué)、社會學(xué)方面的問題;同時針對篩查時間、生育選擇、信息和支持、知情同意、質(zhì)量控制、科普等具體方面提出建議。2017年,美國婦產(chǎn)科協(xié)會(ACOG)發(fā)表2篇協(xié)會意見[20-21],對CF、SMA、血紅蛋白病、脆性X綜合征等幾種常見的遺傳疾病建議進行廣泛篩查,并做出詳細說明;同時也針對ECS的panel設(shè)計、相關(guān)咨詢等問題提出建議,并闡明其目前僅為一種選項不能全面代替?zhèn)鹘y(tǒng)篩查。我國的專業(yè)協(xié)會尚未就遺傳病攜帶者篩查出臺相關(guān)指南和共識,但相關(guān)專家也在持續(xù)關(guān)注該項目的發(fā)展。近期有文獻闡述了在我國推行ECS需要遵循的基本規(guī)則以及需要克服的困難,并指出我們需要有適合國情的ECS產(chǎn)品和推廣模式[22]。
目前,并沒有哪個協(xié)會限定了ECS所包含的具體病種,但對于疾病應(yīng)滿足的屬性已經(jīng)形成初步共識:①早發(fā)性的表型嚴重的疾?。虎谌巳簲y帶率較高(ACOG推薦大于1/100,但這一觀點也存在一定爭議,因為基因包中很多疾病屬于罕見病);③癥狀描述很明確;④ 高外顯率,等[17-21]。然而實際落實中,一方面各檢測機構(gòu)對于這些屬性的理解不盡相同,另一方面各機構(gòu)實際的產(chǎn)品設(shè)計與之也并不完全相符,體現(xiàn)了很強的主觀性。Chokoshvili等[11]選取了16個ECS產(chǎn)品進行多方位比較,發(fā)現(xiàn):①這些基因包所涵蓋的病種數(shù)相差很大;②僅有3種疾病被這些基因包共同納入,而各檢測方對其報告解讀的策略也存在差異;③有不少基因包納入了遲發(fā)性疾病、低外顯率疾病、表型差異大的疾病以及表型中等或較輕的疾病。相應(yīng)的,看似相似的兩個基因包,也存在著對各個疾病具體所報告突變位點不盡相同的問題。Beauchamp等[22]報道的基因包設(shè)計方法以大樣本數(shù)據(jù)作為基礎(chǔ),研究設(shè)計嚴謹,值得效仿。從我國國情出發(fā),最好由相關(guān)協(xié)會和專家經(jīng)過嚴謹?shù)拇髽颖緮?shù)據(jù)積累、調(diào)研和討論,擬定通用型的ECS病種基本框架,以在一定的時間內(nèi)供各檢測方設(shè)計作為參考。
同時進行上百種疾病的篩查,對于方法的選擇和設(shè)計是一個挑戰(zhàn)。有些疾病的突變分布于整個基因序列,有些則有著熱點突變;有些疾病的突變以點突變?yōu)橹?,有些卻以小片段缺失為主。無論使用何種方法,都需要明確該方法對其涵蓋疾病的檢出率、靈敏度和特異度,從而可以計算出進行篩查后患該疾病的殘余風(fēng)險[residual risk=患病率×(1-檢出率)],以滿足咨詢的需求[23]。理想的篩查方法應(yīng)當(dāng)具備經(jīng)濟、靈敏度高、高通量等特點。
目前,基于二代測序技術(shù)( NGS)的目標(biāo)序列捕獲分析是ECS產(chǎn)品中主要的方法[10,24],但也有少數(shù)機構(gòu)使用微陣列芯片(array-based)的方法;還有的機構(gòu)在捕獲測序的基礎(chǔ)上進行數(shù)據(jù)分析的優(yōu)化,或使用real-time PCR或mlPA的方法加以補充,從而覆蓋更多類型的突變。這些方案各有其優(yōu)勢和局限。
孕前是公認進行ECS篩查較理想的時間點[18-20,25]。因為,在孕前進行篩查,對確定為陽性的受試者可提供的生育選項最為靈活,做準(zhǔn)備的時間也更充裕[25]。此外,本著有利不傷害原則,攜帶者篩查不宜在孕期開展,檢測本身未必有獲益,但一定會給孕婦帶來傷害?,F(xiàn)階段,孕前ECS篩查的可行性較差,因為除非有過不良孕產(chǎn)史者或接觸過一定的遺傳病知識,普通人群對于遺傳病篩查的接受程度并不高。早孕期ECS篩查對于醫(yī)療機構(gòu)而言后續(xù)的遺傳咨詢和產(chǎn)前診斷要求較高,壓力較大。此外,是先篩查夫妻中的一方還是兩人同時進行篩查,這個選項也面臨著時效性、衛(wèi)生經(jīng)濟學(xué)等諸多因素的爭論[26],并沒有孰優(yōu)孰劣的共識??偟膩碚f,對于篩查的時間和策略,需要醫(yī)療機構(gòu)通過綜合考量各方面因素后得出最適宜的方案。
對受試者進行ECS檢測前的遺傳知識教育,以及檢測后詳盡的遺傳咨詢極為重要。研究顯示,遺傳學(xué)知識的充分程度和受試者的焦慮心理呈負相關(guān)[27],所以要讓受試者充分了解檢測項目的內(nèi)容、獲益和風(fēng)險、優(yōu)勢與局限等。對檢測機構(gòu)而言,客觀充分的告知,不僅是義務(wù)和責(zé)任,也能最大程度的規(guī)避風(fēng)險。ACMG在指南中指出,檢測后的咨詢至少應(yīng)當(dāng)包括:對于檢出突變的解釋,相關(guān)疾病的詳情,受試者及其親屬的患病風(fēng)險,可能需要的生育選擇[17]。
在我國,當(dāng)前遺傳咨詢的發(fā)展還難以滿足臨床的廣泛需求,經(jīng)過系統(tǒng)培訓(xùn)的、有足夠經(jīng)驗的遺傳咨詢師很少。另外,雖然我國是世界人口第一大國,但針對華人人群的開放性基因組數(shù)據(jù)庫卻寥寥無幾,而基于現(xiàn)有公共數(shù)據(jù)庫設(shè)計的ECS產(chǎn)品可能無法有效篩檢華人群體的高發(fā)突變[24]。在致病變異數(shù)據(jù)庫缺乏情況下,檢出率和參與風(fēng)險未必能很好評估,少數(shù)的嵌合體情形也需在篩查工作中注意。有共識提出,應(yīng)做好婦女婚檢與孕前優(yōu)生遺傳知識的科普教育,以及不斷積累基礎(chǔ)研究成果,降低篩查產(chǎn)品的成本,從而逐步開展ECS工作[22]。
在不同文化和政策背景下,對于陽性受試者(指夫妻雙方同為相同常染色體隱性致病基因攜帶者)的管理措施也有不同。醫(yī)療機構(gòu)所提供的建議應(yīng)遵循不傷害原則和自主選擇原則[17]。多數(shù)情況下陽性夫妻可選擇的生育選項有:①針對該疾病的產(chǎn)前診斷;②植入前遺傳學(xué)診斷(PGD)等。對于第一種選擇,基于ECS結(jié)果實施無先證者的產(chǎn)前診斷本身就是對傳統(tǒng)理念的一個挑戰(zhàn),可能引起行業(yè)的爭議。對于第二種選擇,目前我國已有基于ECS加PGD的成功案例[28],但這種方案受限于醫(yī)療機構(gòu)的水平,很難廣泛推廣。此外,有文獻指出也可采用第三方捐贈配子的方法,并需對捐贈者同樣進行篩查[18],此方法在我國尚存在政策法規(guī)的缺失和倫理學(xué)爭議。另外,醫(yī)療機構(gòu)應(yīng)當(dāng)設(shè)立備案,酌情考慮是否需要引入對陽性受試者的心理評估和心理疏導(dǎo)。
在實施ECS及其后續(xù)的產(chǎn)前診斷等處理過程中,可能會有一些意外發(fā)現(xiàn),例如:發(fā)現(xiàn)胎兒有新發(fā)突變;發(fā)現(xiàn)胎兒在該致病基因有臨床意義未明的變異;發(fā)現(xiàn)丈夫并非是胎兒的生物學(xué)父親,等等。這些問題不僅是技術(shù)性問題,也是倫理學(xué)問題,要求提供ECS的醫(yī)療機構(gòu)要有切實可行的預(yù)案。
ECS與“消費級基因檢測”有明確的不同,不可混淆,因為后者并非醫(yī)事服務(wù)行為,無醫(yī)療機構(gòu)和醫(yī)療人員的參與。另外,應(yīng)當(dāng)促進與ECS相關(guān)的法律、保險配套盡快制定,滿足其發(fā)展需求。
目前,單病種和小型panel(以種族或地域為基礎(chǔ))的篩查仍在遺傳病攜帶者篩查中占據(jù)較大比重。而經(jīng)過近十年的發(fā)展,ECS已經(jīng)不存在太大的技術(shù)性難題。隨著其檢測時間和經(jīng)濟成本的進一步降低,以及社會認知水平的提高,ECS會在很大程度上取代上述這類篩查。在我國,第三方檢測技術(shù)與歐美差距不大,但國內(nèi)相應(yīng)的基礎(chǔ)性研究工作、遺傳咨詢水平、生殖服務(wù)水平以及民眾的認知水平卻相對落后,阻礙了ECS的推廣。只有做好生殖健康領(lǐng)域多專業(yè)的全面建設(shè)和科普工作,才能更好地利用這一項目為廣大民眾服務(wù)。
單基因遺傳病大多數(shù)是罕見病,但我國的人口基數(shù)大,“任何的罕見病在中國都不罕見”。為進一步服務(wù)“健康中國”的發(fā)展戰(zhàn)略,降低出生缺陷率,應(yīng)當(dāng)進一步積累致病基因和突變的研究基礎(chǔ),提升遺傳咨詢專業(yè)水平,從而研發(fā)、推廣符合本國國情的ECS項目。