陳俞 范宇琴
[摘要]目的分析耳聾高危人群檢測(cè)中耳聾基因芯片的臨床應(yīng)用價(jià)值。方法方便選擇該院2015年8月-2016年12月接收的耳聾患者120例,均應(yīng)用耳聾基因芯片實(shí)施突變檢測(cè),觀察檢測(cè)結(jié)果。結(jié)果120例患者中,63例檢出基因突變,檢出率39.1%;63例檢出基因突變患者中,重度耳聾38例,極重度耳聾25例;57例未檢出基因突變患者中,重度耳聾50例,極重度耳聾7例。結(jié)論耳聾高危人群檢測(cè)中,耳聾基因芯片的應(yīng)用可提升檢出率,降低耳聾發(fā)生率。
[關(guān)鍵詞]耳聾基因芯片;耳聾高危人群;檢測(cè);臨床意義
[中圖分類(lèi)號(hào)]R764 [文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼]A [文章編號(hào)]1674-0742(2017)10(a)-0055-03
耳聾在臨床中比較常見(jiàn),發(fā)病后不僅交流受到影響,而且生活質(zhì)量會(huì)嚴(yán)重降低。在耳聾患者中,0.1%~0.3%為新生兒。從致病原因看,由遺傳因素導(dǎo)致的耳聾患者占據(jù)總數(shù)的50%以上。因耳聾存在高度的基因及位點(diǎn)遺傳異質(zhì)性,且相關(guān)于多個(gè)基因的突變,因而如采取傳統(tǒng)檢測(cè)4方法,僅能將同一基因同一位點(diǎn)檢測(cè)出來(lái),達(dá)不到篩查診斷要求。研究指出,耳聾高危人群檢測(cè)中,耳聾基因芯片技術(shù)具有較高的應(yīng)用價(jià)值,可與篩查診斷要求相符合。因此,該院以2015年8月-2016年12月接收的漢族耳聾患者120例為研究對(duì)象,探討耳聾基因芯片的應(yīng)用價(jià)值,現(xiàn)報(bào)道如下。
1資料與方法
1.1一般資料
方便選擇新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院接收的漢族耳聾患者120例,男68例,女52例;年齡3個(gè)月~59歲,平均(32.7±6.4)歲。納入標(biāo)準(zhǔn):均符合耳聾診斷標(biāo)準(zhǔn),患者及(或)家屬均對(duì)該研究知情,且自愿參與研究。
1.2方法
研究人員調(diào)查記錄患者發(fā)病年齡、家族史、疾病史等;所有患者均接受耳聾基因芯片(北京博奧生物有限公司)檢測(cè),檢測(cè)步驟如下。
1.2.1標(biāo)本采集與處理于患者肘靜脈處采集血液標(biāo)本5mL,置入采血管(EDTANa2抗凝)中,全血基因組DNA提取時(shí),利用全血核酸提取試劑盒(天根生化公司),完成后在20℃冰箱中保存。
1.2.2PCR反應(yīng)引物共8組,針對(duì)8個(gè)突變位點(diǎn)[GJB2基因(突變位點(diǎn):35delG、176dell6/235delc、299-300de1AT),SLC26A4基因(突變位點(diǎn):2168A>G、IVS7-2A>G),線粒體12rRNA基因(突變位點(diǎn):1494C>T、1555A>G)],將其分為兩個(gè)反應(yīng)體系,分別標(biāo)記為A、B,實(shí)施多重PCR,A、B反應(yīng)體系各20μL,將100~200ng/μL濃度的待測(cè)全血基因組DNA加入其中,擴(kuò)增引物混合物12.5μL,擴(kuò)增試劑混合物4.5μL。PCR反應(yīng)時(shí),程序如下:37℃下,反應(yīng)10min;溫度提高至95℃,反應(yīng)15min;溫度再提高至96℃,進(jìn)行1min預(yù)變性;之后溫度降低至94℃,反應(yīng)30s;繼續(xù)降低至55℃,反應(yīng)30s;提高到72℃,反應(yīng)45s,循環(huán)共進(jìn)行32個(gè);降低至70℃,反應(yīng)45s,最終降低至60℃,反應(yīng)10min。反應(yīng)期間,溫度由94℃降低至55℃時(shí),降低速度控制在0.4℃/s,而由55℃提高至70℃時(shí),提升速度控制在0.2℃/s。
1.2.3雜交 95℃條件下,于金屬浴中放置PCR產(chǎn)物,給予10min變性,完成后,迅速向冰水中放置PCR產(chǎn)物,冰浴3min。從A、B反應(yīng)體系管中將相同標(biāo)本取出,量均為25μL,向試管(內(nèi)置雜交緩沖液10μL)中混入,混合均勻會(huì),于芯片微陣列區(qū)域中加入,用蓋玻片封閉雜交盒后,在預(yù)熱雜交箱(50℃)中放置,進(jìn)行1h保溫。
1.2.4洗片 完成雜交后,取出芯片,在洗滌液I(42℃)中放置,之后通過(guò)搖床,進(jìn)行2min洗滌,隨后取出,并于洗滌液Ⅱ(42℃)中快速放人,再經(jīng)搖床給予2min洗滌。結(jié)束后,在玻片架上放置芯片,利用離心機(jī)甩干液體,離心速度1200r/min,時(shí)間2min。
1.2.5芯片掃描 芯片掃描利用掃描儀進(jìn)行,掃描儀采用晶芯LuxScanTM 10K/B微陣列芯片.激光掃描強(qiáng)度設(shè)置為90,激光波長(zhǎng)選擇532nm。
1.3觀察指標(biāo)
觀察所有患者檢測(cè)結(jié)果,同位點(diǎn)中,探針W信號(hào)表現(xiàn)為陽(yáng)性時(shí),位點(diǎn)屬于野生型;探針M信號(hào)表現(xiàn)為陽(yáng)性時(shí),位點(diǎn)屬于純合突變型;探針W信號(hào)與探針M信號(hào)均表現(xiàn)為陽(yáng)性時(shí),位點(diǎn)屬于雜合突變型。
2結(jié)果
120名患者中,63例檢出基因突變,檢出率39.1%,其中,48例GJB2基因突變攜帶者,15例SLC26A4基因突變攜帶者。48例GJB2基因突變攜帶者中,235delc純合突變28例,235delC雜合突變16例,235delC/299-300delAT復(fù)合突變4例;15例SLC26A4基因突變攜帶者中,IVS7-2A>G純合突變8例,IVS7-2A>G雜合突變7例。28例235delC純合突變患者中,23例患者父母均抽血檢測(cè),3例患者僅有母親抽血檢測(cè),2例患者父母均未抽血檢測(cè),結(jié)果顯示:23例患者父母中,均為235delC雜合突變;3例患者母親均為235delc雜合突變。16例235delC雜合突變患者中,10例患者父母中,一方為235delC雜合突變,另一方為野生型;3例患者父母中,一方為235delC雜合突變,一方為235delC純合突變;3例患者母親檢測(cè)顯示為235delC雜合突變,父親未接受檢測(cè)。4例235delC/299-300delAT復(fù)合突變患者中,父母均接受檢測(cè),結(jié)果顯示,235delC雜合突變出現(xiàn)在父親,299-300delAT雜合突變出現(xiàn)在母親。8例IVS7-2A>G純合突變患者中,均為親屬關(guān)系,父母檢測(cè)結(jié)果顯示,均攜帶IVS7-2A>G雜合突變。7例IVS7-2A>G雜合突變患者中,父母檢測(cè)結(jié)果顯示,一方攜帶IVS7-2A>G雜合突變,一方表現(xiàn)為野生型。聽(tīng)力檢測(cè)結(jié)果顯示:63例檢出基因突變患者中,重度耳聾38例,極重度耳聾25例;57例未檢出基因突變患者中,重度耳聾50例,極重度耳聾7例。
3討論
耳聾是一種最常見(jiàn)的疾病,依據(jù)具體的表型特點(diǎn),耳聾可分為兩種,一種為綜合征性耳聾(SHL),另一種為非綜合征性耳聾(NSHL);根據(jù)遺傳方式,耳聾可分為五種,分別為常染色體顯性遺傳(AD)耳聾、常染色體隱性遺傳(AR)耳聾、X連鎖遺傳耳聾、Y連鎖遺傳耳聾、線粒體遺傳耳聾,其中最為多見(jiàn)的即為AR耳聾。隨著不斷的實(shí)施與完成人類(lèi)基因組計(jì)劃,耳聾遺傳學(xué)研究取得的進(jìn)步是非常大的,可定位克隆多數(shù)的耳聾相關(guān)基因,由此也稱(chēng)產(chǎn)生耳聾基因診斷。
對(duì)于遺傳性耳聾,患者種族不同時(shí),會(huì)具有不同的致病基因,即使基因相同,突變位點(diǎn)也存在差異,甚至同一種族中,致病基因或同一基因突變位點(diǎn)也存在地區(qū)差異,種族特異性非常強(qiáng)。在我國(guó),占據(jù)五項(xiàng)殘疾首位的即為聽(tīng)力語(yǔ)言殘疾。據(jù)耳聾病分子流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果,耳聾患者中,GJB2基因突變攜帶者約占據(jù)38%,SLC26A4基因突變攜帶者約占據(jù)14.5%,線粒體DNAA1555G突變攜帶者約占據(jù)3.8%,線粒體DNA C1494T突變攜帶者約占據(jù)0.6%E3J。該研究中,GJB2基因突變攜帶者占總患者40.0%、SLC26A4基因突變攜帶者占總患者12.5%,與上述調(diào)查結(jié)果基本一致。由上述調(diào)查結(jié)果可知,我國(guó)耳聾患者常見(jiàn)的致病基因?yàn)镚JB2、SLC26A4及線粒體,前兩個(gè)基因?qū)儆贏R,第3個(gè)基因?qū)儆谀赶颠z傳。此外,SLC26A4基因突變也為耳聾患者中比較常見(jiàn)的突變情況,應(yīng)用耳聾基因芯片后,同樣可以一次性檢出。該研究中選取的161例耳聾患者中,利用耳聾基因芯片檢測(cè)中基因突變攜帶者63例,其中48例為GJB2基因突變攜帶者,15例為SLC26A4基因突變攜帶者,與流行學(xué)調(diào)查將結(jié)果存在一定的差異,考慮與樣本量數(shù)量少、地區(qū)不同等因素相關(guān),還需要做出進(jìn)一步的深入研究。
我國(guó)每年約有400萬(wàn)人的藥物敏感性突變攜帶者,35萬(wàn)人左右的藥物性耳聾患者,線粒體DAN 12Sr-RNA為與其對(duì)應(yīng)的基因,可母系遺傳,即攜帶者如為母音,懷孕后生育的子女會(huì)耳聾,而父親攜帶時(shí),則生育的子女不會(huì)耳聾。GJB2基因?qū)儆贏R,先天性重度以上感音神經(jīng)性耳聾為相關(guān)癥狀,患者同胞中,發(fā)病25%,通常隔代遺傳,可發(fā)生于男性,也可發(fā)生于女性,治療時(shí)采用人工耳蝸具有較好的效果。聾啞人因具有特殊的自身情況,配偶為正常人的幾率比較小,再加上聾啞人與聾啞人之間使用相同的語(yǔ)言溝通,存在基本相同的文化背景,因此婚配形式多為“聾一聾”方式,此種方式會(huì)極大的增加擁有相同基因突變位點(diǎn)的可能,從而提高后代耳聾的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)。因此,對(duì)于先天或后天耳聾患者,或新生兒未通過(guò)聽(tīng)力篩查,或家屬攜帶耳聾基因時(shí),均屬于高危人群,耳聾基因芯片檢查應(yīng)盡早的開(kāi)展,并根據(jù)檢測(cè)結(jié)果給予適當(dāng)?shù)母深A(yù),促進(jìn)致殘率的降低,提高患者的生活質(zhì)量,并提升我國(guó)的人口素質(zhì)水平。
綜上所述,耳聾高危患者篩查與診斷中,耳聾基因芯片檢測(cè)具有十分重要的應(yīng)用價(jià)值,能夠更為準(zhǔn)確、快速的檢測(cè)出患者的基因突變情況,假陽(yáng)性率低,且操作簡(jiǎn)單,適合推廣于臨床當(dāng)中,降低耳聾發(fā)生率,尤其適合產(chǎn)前診斷中,減少新生兒耳聾的發(fā)生,提高人口出生素質(zhì)。
(收稿日期:2017-07-04)