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湖南長(zhǎng)沙漢族人群25個(gè)Y-STR基因座的遺傳多態(tài)性

2018-03-30 02:43:39李曉明張金國黃篤厚
法醫(yī)學(xué)雜志 2018年1期
關(guān)鍵詞:基因座漢族等位基因

趙 霖,李曉明,付 永,張金國,邵 俊,李 花,黃篤厚

(長(zhǎng)沙市公安局物證鑒定所 公安部重點(diǎn)DNA檢驗(yàn)鑒定實(shí)驗(yàn)室,湖南 長(zhǎng)沙 410002)

STR檢驗(yàn)已經(jīng)成為法醫(yī)DNA鑒定的常規(guī)手段。我國已經(jīng)建成世界上最大的可疑犯罪人群常染色體STR數(shù)據(jù)庫,庫容量約4300萬[1]。然而,由于我國城鎮(zhèn)化和交通建設(shè)快速發(fā)展帶動(dòng)人口流動(dòng)頻繁,導(dǎo)致跨省市、跨區(qū)域犯罪率大幅提高,實(shí)際犯罪偵查破案中經(jīng)常不能直接比中犯罪嫌疑人。近年來,Y染色體STR數(shù)據(jù)庫發(fā)展迅速,且為案件偵破提供了較大的幫助。湖南省長(zhǎng)沙市近年來也啟動(dòng)了Y-STR數(shù)據(jù)庫的建設(shè)。本研究通過對(duì)五代居住在長(zhǎng)沙本地的漢族男性無關(guān)個(gè)體25個(gè)Y-STR基因座的遺傳多態(tài)性進(jìn)行調(diào)查,為相關(guān)鑒定和Y-STR數(shù)據(jù)庫建設(shè)提供客觀的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

1 材料與方法

1.1 樣本

口腔唾液提取卡249份,均來自知情同意的五代居住在長(zhǎng)沙本地的漢族男性無關(guān)個(gè)體,由寧鄉(xiāng)縣公安局采集提供。

1.2 提取及擴(kuò)增

利用Goldeneye?DNA身份鑒定系統(tǒng)26Y試劑盒[基點(diǎn)認(rèn)知技術(shù)(北京)有限公司]直接打唾液卡1.5mm,使用9700型PCR儀(美國AB公司)擴(kuò)增DNA,采用10μL擴(kuò)增體系,PCR熱循環(huán)參數(shù)采用試劑盒推薦方法,擴(kuò)增產(chǎn)物在3500xL基因分析儀上進(jìn)行檢測(cè),用GeneMapper?ID-X軟件進(jìn)行基因分型。

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

用直接計(jì)數(shù)法整理各基因座的等位基因頻率、單倍型頻率、基因多樣性(gene diversity,GD)、單倍型多樣性(haplotype diversity,HD)及單體型辨別能力(discriminative capacity,DC)。 GD、HD、DC 值的計(jì)算公式[2]:

其中Pi為各等位基因頻率或單倍型頻率;

其中Ndiff為單倍型種類數(shù)目,N為單倍型數(shù)。

2 結(jié)果與討論

249名長(zhǎng)沙漢族男性無關(guān)個(gè)體25個(gè)Y-STR基因座的等位基因頻率及GD值見表1~2,其中DYS449、DYS385為多拷貝基因座,GD值最低為0.416 2(DYS391),最高為 0.9558(DYS385a/b)。25 個(gè) Y-STR基因座中共檢出247種單倍型,其中245種僅單個(gè)個(gè)體具有,2種單倍型檢出了2次。HD為0.9998,DC為0.9920。

表1 長(zhǎng)沙漢族男性群體25個(gè)Y-STR基因座的等位基因頻率分布 (n=249)

表1(續(xù))

表2 25個(gè)Y-STR基因座在長(zhǎng)沙漢族男性群體中的GD值 (n=249)

25個(gè) Y-STR基因座中,除 DYS391、DYS388、DYS437、DYS438基因座外,其余GD值都大于0.5,占84%,GD值大于0.6的達(dá)到76%,說明選用試劑盒包含的25個(gè)Y-STR基因座在長(zhǎng)沙漢族男性個(gè)體人群中具有較好的多態(tài)性與識(shí)別能力[3],能滿足父系遺傳鑒定的要求,也能夠滿足該地區(qū)Y-STR家系數(shù)據(jù)庫建設(shè)的要求。

[1]劉爍,葉健.2016法醫(yī)遺傳學(xué)進(jìn)展[M].北京:中國人民公安大學(xué)出版社,2016:6.

[2]COBLE M D,HILL C R,BUTLER J M.Haplotype data for 23 Y-chromosome markers in four U.S.population groups[J].Forensic Sci Int Genet,2013,7(3):e66-e68.

[3]孫凱臻,彭珊,劉超,等.廣東漢族群體24個(gè)Y-STR基因座的多態(tài)性及突變率[J].中國法醫(yī)學(xué)雜志,2014,29(6):514-518.

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