P1958不發(fā)酵山梨醇的產(chǎn)志賀毒素大腸埃希菌的進(jìn)化//Kyle Schutz, Lauren A. Cowley, Sharif Shaaban,等

2014年7月在英格蘭暴發(fā)了一起由產(chǎn)志賀毒素大腸埃希菌(以下簡(jiǎn)稱STEC)引起的疫情，31人患病，其中13人(42%)患了溶血性尿毒綜合征。研究人員對(duì)病菌進(jìn)行分離和測(cè)序，并把測(cè)序的結(jié)果與已知的大腸埃希菌O55:H7以及O157:H7的結(jié)果進(jìn)行了比較。根據(jù)STEC O55:H7暴發(fā)菌株的主要基因組進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析，表明其進(jìn)化史的最簡(jiǎn)約模式為，能發(fā)酵山梨醇的致病性祖代O55:H7菌株，被編碼志賀毒素2a(stx2a)的噬菌體溶原化，引起srlA基因無義突變而失去發(fā)酵山梨醇的能力。STEC O157:H7和STEC O55:H7平行而聚斂的進(jìn)化史可能表明了二者進(jìn)化過程中存在共同的驅(qū)動(dòng)因素。作為有臨床意義的病原菌，STEC O157:H7的出現(xiàn)與獲得編碼stx2a噬菌體有關(guān)，因此帶有stx2a基因的STEC O55:H7的出現(xiàn)，是公共健康領(lǐng)域當(dāng)前所關(guān)注的一個(gè)問題(圖1)。

BLAST環(huán)形圖像生成器(BRIG)繪制的環(huán)狀圖。采用BLAST+(21)程序，比較了STEC O55：H7 122262的前噬菌體和同源的STEC O157：H7 Sakai前噬菌體。STEC O55：H7 122262 染色體被設(shè)置為參比基因組，122262前噬菌體(P1-P15)組成第一環(huán)。同源的STEC O157：H7 Sakai噬菌體(Sp2，Sp3，Sp6，Sp8和Sp14)在通過BLAST分析識(shí)別后，根據(jù)在表2中的已知位置添加到圖像中。推測(cè)的前噬菌體序列數(shù)據(jù)是從PHAge搜集工具(22)中檢索得到，并繪制進(jìn)BRIG圖中。

P1966發(fā)生多次重配的病毒是2016年荷蘭甲型H5N8高致病性禽流感流行的原因//Nancy Beerens, Rene Heutink, Saskia A. Bergervoet,等

2016年，在荷蘭暴發(fā)了由高致病性甲型H5N8禽流感病毒引起的禽間疫情，導(dǎo)致了大量野鳥死亡，部分商業(yè)養(yǎng)殖場(chǎng)和鳥類飼養(yǎng)基地也受到了波及。為了了解野鳥和家禽所攜帶的病毒之間的關(guān)系，研究人員對(duì)提取到的病毒進(jìn)行全基因組測(cè)序。系統(tǒng)進(jìn)化分析的結(jié)果表明，該型病毒與2016年5月在俄羅斯發(fā)現(xiàn)的clade2.3.4.4分支的H5亞型病毒有關(guān)，但又包含了新型PB2和NP基因片段，以及2種不同的PA片段的變異。分子時(shí)鐘分析表明，基因重配最可能發(fā)生在俄羅斯或蒙古的野鳥體內(nèi)。此外，荷蘭野鳥中還發(fā)現(xiàn)2株遺傳背景不同的H5N5重配病毒。此項(xiàng)研究為clade 2.3.4.4的H5亞型病毒的快速和持續(xù)重配提供了依據(jù)，并可能導(dǎo)致致病性、傳染性、傳播能力和人獸共患能力等病毒特征的快速變化(圖2)。

圖2中介鄰接網(wǎng)絡(luò)圖顯示2016年在荷蘭商業(yè)家禽養(yǎng)殖場(chǎng)(紅點(diǎn))分離得到的高致病性甲型H5N8禽流感病毒與最相似的野鳥病毒(藍(lán)點(diǎn))之間的遺傳關(guān)系。預(yù)測(cè)的中值向量用黃色表示。圖中線的長(zhǎng)度表示遺傳距離，數(shù)字表明了核苷酸變化數(shù)目。這里分析了編號(hào)1-10的野鳥病毒分離株。(見在線技術(shù)附件1表2，地址：https://wwwnc.cdc.gov/EID/article/23/12/17-1062-Techapp1.xlsx)GISAID EpiFlu數(shù)據(jù)庫(kù)(地址：https://www.gisaid.org)登錄號(hào)見在線技術(shù)附件1表1中。EW，歐亞赤頸鴨；Go，灰鵝；Ma，綠頭鴨；TD，鳳頭鴨

P1974一種新鑒定的正粘病毒——韋爾弗利特灣病毒對(duì)歐絨鴨雛的實(shí)驗(yàn)感染//Valerie Shearn-Bochsler, Hon Sang Ip, Anne Ballmann,等

韋爾弗利特灣病毒(以下簡(jiǎn)稱WFBV)是一種Quaranjavirus屬的新型正粘病毒。2006年在韋爾弗利特灣(地處美國(guó)馬薩諸塞州巴恩斯特布爾郡)的一次歐絨鴨集體死亡事件中，首次從鴨子尸體上分離得到該病毒，并且在后來該地區(qū)反復(fù)多次發(fā)生的歐絨鴨死亡事件中分離得到。在歐絨鴨的尸體中，美國(guó)的研究人員發(fā)現(xiàn)鴨子的肝臟、胰臟、脾臟和腸道都有壞死的現(xiàn)象。因此他們對(duì)6周齡的健康歐絨鴨進(jìn)行WFBV病毒的接種，以期重現(xiàn)疾病發(fā)生的自然過程。大約25%的受接種幼鴨產(chǎn)生了疾病的臨床癥狀，并需要被執(zhí)行安樂死；在試驗(yàn)中，另外有18.75%的幼鴨患病，體重下降。對(duì)照組的幼鴨未被病毒感染，不發(fā)生臨床癥狀。實(shí)驗(yàn)組中出現(xiàn)臨床癥狀的幼鴨與那些自然感染并死亡的幼鴨出現(xiàn)一致的病理?yè)p害。研究表明，從37.5%受感染的鴨子身上分離得到WFBV病毒，存活至接種后5日的幼鴨產(chǎn)生了針對(duì)WFBV的血清抗體滴度(圖3)。

圖3對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組實(shí)驗(yàn)感染韋爾弗利特灣病毒的歐絨鴨)淋巴器官的組織病理學(xué)和免疫組織化學(xué)法(IHC)法檢查(接種2天后)。A圖一只對(duì)照組小鴨的胸腺皮質(zhì)組織的蘇木精和伊紅(H&E)染色；B圖，一只實(shí)驗(yàn)組鴨子的胸腺組織H&E染色，箭頭處顯示淋巴細(xì)胞出現(xiàn)多病灶性急性凋亡；C圖，一只實(shí)驗(yàn)組鴨子的胸腺組織的IHC染色，顯示胸腺細(xì)胞上對(duì)WFBV病毒的陽(yáng)性免疫標(biāo)記；D圖，一只對(duì)照組鴨子法氏囊的H&E染色；E圖，一只實(shí)驗(yàn)組鴨子法氏囊的H&E染色，顯示淋巴細(xì)胞有顯著的彌散性消耗；F圖，一只實(shí)驗(yàn)組鴨子法氏囊的IHC法染色，顯示其對(duì)WFBV病毒呈陰性免疫標(biāo)記；G圖，一只對(duì)照組鴨子的脾臟組織的H&E染色；H圖，一只實(shí)驗(yàn)組鴨子脾臟組織的H&E染色，箭頭處顯示為多病灶合并急性壞死；I圖，脾臟組織IHC染色，放大200倍，顯示其對(duì)WFBV病毒有陽(yáng)性免疫標(biāo)記。在圖A,B和C中，比例尺為50μm，在圖D,E,F,G和H中，比例尺為100μm。

P1999匈牙利神經(jīng)侵襲性星狀病毒暴發(fā)導(dǎo)致仔豬腦脊髓炎、虛弱和癱瘓//ákos Boros, Mihály Albert, Péter Pankovics,等

近2年來在匈牙利一座規(guī)模大、產(chǎn)量高的養(yǎng)豬場(chǎng)里，新生豬幼崽(25-35日齡)中流行一種神經(jīng)系統(tǒng)疾病臨床表現(xiàn)為后半身麻痹、高死亡率，尸檢發(fā)現(xiàn)存在腦脊髓炎和神經(jīng)系壞死。從該養(yǎng)豬場(chǎng)6份豬腦和脊髓標(biāo)本，通過RT-PCR和原位雜交法，鑒定出了豬星狀病毒3型。通過定量RT-PCR法在標(biāo)本組織測(cè)試中發(fā)現(xiàn)，腦干和脊髓中病毒載量最高。從另外2個(gè)地理位置相距遙遠(yuǎn)的養(yǎng)豬場(chǎng)中留存的動(dòng)物腦和脊髓標(biāo)本中，也發(fā)現(xiàn)了類似的豬星狀病毒3型。病毒RNA主要集中在神經(jīng)細(xì)胞特別是腦干、小腦(浦肯野細(xì)胞)、頸部脊髓的神經(jīng)細(xì)胞中。星狀病毒基本上無法在糞便中被檢測(cè)到，但出現(xiàn)在呼吸道的樣本中，這表明星狀病毒存在通過呼吸道感染的可能，因此星狀病毒可導(dǎo)致常見的造成神經(jīng)系統(tǒng)障礙的傳染病(圖4)。

圖4

匈牙利某農(nóng)場(chǎng)2頭有病癥新斷奶豬崽的中樞神經(jīng)系統(tǒng)組織的病理學(xué)檢查結(jié)果。頸髓(A-E)、小腦(F-J)和腦皮層(M)的病理切片是來自于指征病例動(dòng)物(GD-1)，腦干(K)的病理切片來自于另外一只處于I期發(fā)病的動(dòng)物(GD-11)。圖(A,D,F,I,L)用蘇木精和伊紅染色。腦灰質(zhì)(圖A,D)和分子層(圖F,I,L和M)多病灶出現(xiàn)膠質(zhì)細(xì)胞增生(黑色箭頭)。神經(jīng)元變性和壞死明顯，表現(xiàn)為嗜酸性粒細(xì)胞增多、角變性、神經(jīng)元結(jié)構(gòu)缺失和出現(xiàn)空泡(圖A, D中雙箭頭)。一些浦肯野細(xì)胞神經(jīng)元由于輕度空泡化而出現(xiàn)細(xì)微的角變(圖I中雙箭頭)。原位雜交法檢測(cè)神經(jīng)侵襲性豬星狀病毒。豬星狀病毒雜交探針局限于神經(jīng)元(圖B,E,K的白色箭頭)，或者浦肯野細(xì)胞神經(jīng)元(圖G,J黑色雙箭頭)并延伸到穿過分子層的樹突(圖G,J黑色箭頭)。膠質(zhì)增生細(xì)胞(圖L、M中黑色箭頭)也出現(xiàn)豬侵襲性星狀病毒3型的雜交探針。圖C、H為對(duì)照探針在連續(xù)切片上，沒有雜交信號(hào)。原位雜交中，(圖A-C,F-H)的比例尺為500μm，圖(D,E,I-M)為50 μm。

(福建省疾病預(yù)防控制中心何梓凱、林丹 譯陳愛平 校)