浙江中醫(yī)藥大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院中醫(yī)臨床基礎(chǔ)研究所 杭州 310053
“上火”是中醫(yī)學(xué)上特有的病名,屬于“火熱證”范疇。調(diào)查顯示在中國(guó)91%的成年人有過(guò)“上火”經(jīng)歷[1]?!吧匣稹卑Y狀表現(xiàn)形式多樣,包括口腔潰瘍、牙齦紅腫、唇周面部皰疹、雙目紅赤、口干眼干、尿赤、便秘等?,F(xiàn)代醫(yī)學(xué)把“上火”視為“亞健康”狀態(tài)和代償范圍內(nèi)的急性應(yīng)激反應(yīng),是免疫功能下降時(shí)出現(xiàn)的炎癥和局部感染[2]?,F(xiàn)代醫(yī)學(xué)對(duì)“上火”相關(guān)病證的研究發(fā)現(xiàn),其發(fā)病多與環(huán)境、飲食、情志、遺傳、免疫、微生物等因素相關(guān)[3]。
情志刺激、過(guò)食辛辣燥熱、勞累過(guò)度和微生物感染等因素可引起體內(nèi)微環(huán)境變化,導(dǎo)致黏膜上皮組織的糖酵解功能活躍,從而導(dǎo)致能量代謝紊亂,進(jìn)一步引起黏膜損傷,使黏膜免疫系統(tǒng)中Th17/Treg細(xì)胞比例上調(diào),分泌型免疫球蛋白A(immunoglobulin A,I-gA)分泌減少,局部黏膜免疫力下降,易繼發(fā)感染,進(jìn)而加重黏膜損傷[4]。因此,“上火”人群中普遍存在著體內(nèi)能量代謝的紊亂及黏膜免疫的異常。
近年來(lái),研究證實(shí)腸道微生物在機(jī)體能量代謝和黏膜免疫方面發(fā)揮重要作用[5-6]。腸道微生物通過(guò)多條途徑參與機(jī)體的能量代謝,包括對(duì)不能被人體細(xì)胞消化的膳食纖維進(jìn)行酵解、對(duì)肽類或蛋白質(zhì)進(jìn)行無(wú)氧酵解、膽汁酸的生物轉(zhuǎn)化和草酸鹽復(fù)合物的降解等[7]。另外,腸道菌群可通過(guò)在腸道中定植,構(gòu)建腸道免疫屏障;腸道細(xì)菌在死亡或增殖時(shí),不斷向外界釋放脂多糖、肽聚糖或磷脂壁酸等刺激物,這些物質(zhì)進(jìn)入血液,從而引起全身黏膜免疫反應(yīng)[6]。綜上所述,腸道菌群可通過(guò)影響能量代謝和黏膜免疫,參與“上火”的發(fā)生。
為明確“上火”人群的腸道菌群結(jié)構(gòu)特征,本研究采用Illumina MiSeq測(cè)序技術(shù)檢測(cè)“上火”人群和健康人群的腸道菌群結(jié)構(gòu),進(jìn)一步了解“上火”相關(guān)的腸道菌群種類的變化。
1.1 樣本來(lái)源 樣本采集時(shí)間為2016年8月至2017年5月,采集對(duì)象為浙江中醫(yī)藥大學(xué)全日制各專業(yè)在讀本科生。所有研究對(duì)象均自愿加入“上火”項(xiàng)目研究,均符合相應(yīng)的中醫(yī)診斷標(biāo)準(zhǔn)、“上火”人群和健康人群的納入標(biāo)準(zhǔn)及排除標(biāo)準(zhǔn)。
1.2 診斷標(biāo)準(zhǔn)、納入標(biāo)準(zhǔn)和排除標(biāo)準(zhǔn)
1.2.1“上火”人群診斷標(biāo)準(zhǔn) 采用專家咨詢法,確定“上火”的診斷標(biāo)準(zhǔn):1個(gè)主癥(頭面部癥狀)或2個(gè)次癥(至少1個(gè)為頭面部癥狀)。主癥:牙齦腫痛、咽喉腫痛、口臭、口腔潰瘍、鼻瘡癤、熱瘡(顏面部皰疹)、口苦和目赤干澀。次癥:口角糜爛、目眵增多、口渴、舌痛、痤瘡、鼻腔干燥、齒衄、鼻衄、聲音嘶啞、頭痛、大便干結(jié)、小便黃、心煩、五心煩熱、多食易饑、痔瘡發(fā)作、潮熱和失眠。
1.2.2 健康人群入選標(biāo)準(zhǔn) 正常對(duì)照組為健康的大學(xué)生,近半年內(nèi)無(wú)“上火”病史(根據(jù)前文提到的“上火”診斷標(biāo)準(zhǔn)),無(wú)心腦血管病史及其他重大內(nèi)科疾病史,無(wú)結(jié)核、傷寒或肝炎等傳染病史;三大常規(guī)、肝腎功能、胸片、B超、心電圖等指標(biāo)無(wú)明顯異常;體格檢查無(wú)明顯異常;近1個(gè)月內(nèi)無(wú)腹瀉或胃腸病史,無(wú)用藥及服用微生態(tài)制劑史;無(wú)吸煙、飲酒等不良嗜好;舌質(zhì)淡紅,苔薄白,脈象正常。
1.2.3 納入標(biāo)準(zhǔn) (1)符合“上火”的診斷標(biāo)準(zhǔn);(2)符合上述標(biāo)準(zhǔn)的健康體檢者;(3)年齡18~35歲;(4)自愿參加本實(shí)驗(yàn)并簽署臨床研究知情同意書。
1.2.4 排除標(biāo)準(zhǔn) (1)由于抗生素、激素等藥物的使用引起“上火”表現(xiàn)者;(2)有重大內(nèi)科疾病、消化道疾病者或精神疾病不能配合者;(3)妊娠或哺乳期婦女;(4)存在研究者認(rèn)為不適合納入的其他情況。
1.3 樣本采集 樣本采集前,采用調(diào)查問(wèn)卷形式詳細(xì)記錄受試者的年齡、性別、身高、體質(zhì)量、飲食習(xí)慣及飲食結(jié)構(gòu)等特征,記錄中醫(yī)證候。糞便樣本采集前,先排凈小便,防止尿液污染糞便。用無(wú)菌一次性采樣杯采集新鮮糞便樣本后置于冰盒內(nèi),迅速將糞便運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行按20mg/管分裝,隨即置于-80℃冰箱中保存。
1.4 標(biāo)本收集及檢測(cè)
1.4.1 糞便DNA提取、擴(kuò)增和測(cè)序 采用糞便DNA提取試劑盒QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit(德國(guó)Qiagen公司產(chǎn)品,批號(hào):51304)抽提糞便DNA。檢查DNA濃度,并用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。合格后,采用16S rRNA基因的V3-V4區(qū)引物對(duì)基因組進(jìn)行擴(kuò)增。擴(kuò)增引物上下游分別是上游5’-X-ACTCCTACGGGAGGCAGCA-3’ 和 下 游 5’-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3’,引物由Invitrogen公司合成,“X”為區(qū)別不同樣本的8個(gè)隨機(jī)組合的核苷酸堿基片段(barcode)。PCR擴(kuò)增前,模板濃度統(tǒng)一稀釋到 20ng·μL-1。擴(kuò)增體系如下:5×反應(yīng)緩沖液 5μL、5×GC 緩沖液 5μL、100mmol·L-1dNTP 5μL、10μmol·L-1上游引物 1μL、10μmol·L-1下游引物 1μL、DNA 模板2μL、ddH2O 6μL。反應(yīng)總體系共 25μL。反應(yīng)條件:初始變性 98℃ 2min,變性 98℃ 15s,退火 55℃ 30s,延伸72℃ 30s,共25個(gè)循環(huán)。72℃延伸5min,10℃保存。
PCR擴(kuò)增產(chǎn)物質(zhì)檢合格后,進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建,采用Illumina MiSeq測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行250bp×2雙末端測(cè)序;下機(jī)進(jìn)行測(cè)序原始數(shù)據(jù)整理、過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估;序列進(jìn)行質(zhì)控過(guò)濾后,接下來(lái)進(jìn)行操作分類單元(operational taxonomic units,OTUs)列表生成及注釋。
1.4.2 數(shù)據(jù)整理、過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估 測(cè)序完成后,對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,步驟如下:(1)采用滑動(dòng)窗口法對(duì)雙端的FASTQ序列進(jìn)行質(zhì)量過(guò)濾,截掉質(zhì)量低的數(shù)據(jù);(2)利用FLASH軟件(v1.2.7)對(duì)通過(guò)質(zhì)量初篩的雙端序列根據(jù)重疊堿基進(jìn)行配對(duì)連接,并根據(jù)barcode序列將序列拆分,各自回歸到對(duì)應(yīng)樣品;(3)運(yùn)用QIIME軟件(v1.8.0)識(shí)別疑問(wèn)序列,保留長(zhǎng)度>150bp和不存在模糊堿基N的序列,并調(diào)用USEARCH(v5.2.236)檢查并剔除嵌合體序列,從而獲得最后用于分析的序列。
1.4.3 多樣性和群落結(jié)構(gòu)分析 調(diào)用QIIME軟件中的UCLUST程序,對(duì)獲得的序列按97%的序列相似度進(jìn)行歸并和OTU劃分,根據(jù)OTU在每個(gè)樣本中所包含的序列數(shù),構(gòu)建OTU在各樣本中豐度的矩陣文件。采用QIIME軟件對(duì)樣品序列進(jìn)行Alpha多樣性分析,包括ACE指數(shù)和Chao1指數(shù),并采用SPSS 16.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行兩類人群間單因素方差分析。選擇OTUs中的一條代表序列(默認(rèn)豐度最高),采用Ribosomal數(shù) 據(jù) 庫(kù) (Ribosomaldatabase project,RDP)進(jìn)行OTU分類地位鑒定。使用R軟件,根據(jù)OTU豐度矩陣和樣本分組數(shù)據(jù)構(gòu)建PCoA分析,評(píng)估微生物群落的整體差異;根據(jù)OTU豐度矩陣表,使用在線分析軟件LEfSe(http://huttenhower.sph.harvard.edu/galaxy)分析健康人群與“上火”人群間差異的腸道菌群種類,線性判別分析(linear discriminant analysis,LDA)得分大于 2,且 Kruskall-Wallis檢驗(yàn)值小于0.05即為差異顯著。
2.1 受試者臨床樣本信息統(tǒng)計(jì)分析 根據(jù)上述診斷、納入及排除標(biāo)準(zhǔn),共納入35例“上火”人群,男女比例為0.84:1,平均年齡為24.4歲,平均體重指數(shù)(body mass index,BMI)為 23.2kg/m2。為匹配“上火”人群的樣本信息,同時(shí)收集了健康人群35例,男女比例為0.67:1,平均年齡為23.7歲,平均BMI為22.3kg/m2。見(jiàn)表1。兩組基本信息采用方差分析比較,結(jié)果顯示組間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
表1 臨床研究人群基本信息Tab.1 Basic information of clinical study population
2.2 兩組受試者Alpha多樣性指數(shù)比較分析 本研究采用Chao1和ACE兩種Alpha多樣性指數(shù)反映健康人群和“上火”人群的腸道菌群多樣性?!吧匣稹比巳旱哪c道微生物多樣性平均指數(shù)均低于健康人群,但兩組之間無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05)。一般來(lái)說(shuō),Alpha多樣性指數(shù)值越高,表明群落的多樣性越高。因此,“上火”可能會(huì)導(dǎo)致腸道菌群多樣性略微降低。見(jiàn)圖1。
圖1 健康人群與“上火”人群的Alpha多樣性指數(shù)比較Fig.1 Comparison of Alpha indices between healthy and“Shanghuo”individuals
2.3 兩組受試者Beta多樣性比較分析 健康人群和“上火”人群的腸道菌群差異可以通過(guò)PCoA分析進(jìn)行歸類,PC1和PC2分別為12.94%和6.26%。兩種人群在PCoA圖上均能各自聚類,但有部分重疊,說(shuō)明兩類人群的腸道菌群Beta多樣性具有差異。見(jiàn)圖2。
2.4 健康人群與“上火”人群的差異腸道菌群分析圖3展示了健康人群和“上火”人群之間的差異腸道菌群發(fā)育樹圖,由LEfSe在線分析程序獲得,其中顯著差異的logarithmic LDA score設(shè)為3。綠色節(jié)點(diǎn)代表健康人群高于“上火”人群的腸道菌群種類,紅色節(jié)點(diǎn)代表“上火”人群顯著高于健康人群的腸道菌群種類。
圖2 基于OTU豐度矩陣表的PCoA判別分析Fig.2 PCoA analysis based on OTU abundance of gut microbiome individuals.
圖3 健康人群與“上火”人群間差異腸道菌群的LEfSe分析Fig.3 LEfSe analysis reveals the significantly different gut microbiota between healthy and“Shanghuo”individuals
在微生物門水平上,健康人群與“上火”人群間顯著差異的種類包括6個(gè),分別是放線菌門(Actinobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、變形菌門(Proteobacteria)、螺旋體門(Spirochaetes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)和迷蹤菌門(Elusimicrobia),前三個(gè)門在“上火”人群腸道內(nèi)含量顯著上調(diào),后三個(gè)門在“上火”人群腸道內(nèi)含量顯著下調(diào)。
在微生物屬水平上,LEfSe共鑒定出13個(gè)屬在兩種人群中存在顯著差異。在放線菌門(Firmicutes)中,包括8個(gè)顯著差異屬,分別是厭氧管狀菌屬A(Naerofustis)、布勞特菌屬(Blautia)、棲糞桿菌屬(Faecalibacterium)、顫螺菌屬(Oscillospira)、瘤胃球菌屬(Ruminococcus)、厭氧弧菌屬(Anaerovibrio)、考拉桿菌屬(Phascolarctobacterium) 和糞芽孢菌屬(Coprobacillus),它們均在“上火”人群中顯著上調(diào)。變形菌門(Proteobacteria)包括2個(gè)在“上火”人群腸道內(nèi)顯著上調(diào)的屬,分別是固氮螺菌屬(Azospirillum)和叢毛單胞菌屬(Comamonas)。除了在“上火”人群中上調(diào)的微生物屬,還包括“上火”人群中下調(diào)的微生物屬,分別是擬桿菌門(Bacteroidetes)中的B擬桿菌屬(Acteroides)和普氏菌屬(Prevotella),及螺旋體門(Spirochaetes)中的密螺旋體屬(Treponema)。在放線菌門(Actinobacteria)和迷蹤菌門(Elusimicrobia)中未發(fā)現(xiàn)顯著差異的屬。
中醫(yī)認(rèn)為“上火”者體內(nèi)會(huì)出現(xiàn)陰陽(yáng)失衡、火熱旺盛,導(dǎo)致能量代謝紊亂及黏膜免疫失調(diào)。腸道微生物可參與機(jī)體能量的產(chǎn)生、轉(zhuǎn)化、儲(chǔ)存和利用,并通過(guò)改變組織對(duì)能量的利用方式和AMP依賴的蛋白激酶(adenosine 5’monophosphate activated protein kinase,AMPK)磷酸化等途徑來(lái)影響機(jī)體的能量代謝[8];同時(shí),腸道菌群可調(diào)控免疫效應(yīng)因子,如sIgA的產(chǎn)生,以及模式識(shí)別受體如Toll樣受體(toll-like receptor,TLR)等的活化,從而影響機(jī)體的腸道黏膜免疫[9]。因此,本研究結(jié)果揭示的“上火”人群腸道微生物的變化,有助于解析“上火”能量代謝物紊亂和黏膜免疫失調(diào)的現(xiàn)象。
在腸道微生物中,厚壁菌門(Firmicutes)與擬桿菌門(Bacteroidetes)是兩個(gè)占主要地位的門,兩者比例在90%以上[6]。厚壁菌門(Firmicutes)與擬桿菌門(Bacteroidetes)比例的上調(diào)指示了肥胖患者腸道內(nèi)的慢性炎癥發(fā)生[10]。在“上火”人群腸道內(nèi),厚壁菌門/擬桿菌門的比例也出現(xiàn)明顯上調(diào),這說(shuō)明“上火”人群的腸道內(nèi)可能存在炎癥。除此之外,食用肉類增加或食用纖維素下降可上調(diào)厚壁菌門/擬桿菌門的比例[11],上述飲食習(xí)慣也是“上火”的主要誘因。
在微生物屬水平上,某些變化的腸道微生物屬與“上火”相關(guān)的能量代謝紊亂相關(guān)。顫螺菌屬(Oscillospira)能幫助宿主細(xì)胞降解糖類物質(zhì),從而提供能量[12];瘤胃球菌屬(Ruminococcus)通過(guò)產(chǎn)生短鏈脂肪酸類物質(zhì)為宿主細(xì)胞提供能量[13];考拉桿菌屬(Phascolarctobacterium)在腸道內(nèi)可通過(guò)降解琥珀酸鹽為宿主提供能量[14]。因此,這些與宿主能量代謝相關(guān)的菌屬在“上火”人群中上調(diào),可能是引起能量代謝紊亂的因素之一。另外,某些變化的腸道微生物屬也與“上火”相關(guān)的免疫失調(diào)相關(guān):瘤胃球菌屬(Ruminococcus)豐度上調(diào),可導(dǎo)致腸道黏膜層降解,腸道屏障不穩(wěn)定和輕度黏膜免疫失調(diào)[15];普氏菌屬(Prevotella)通過(guò)活化TLR2,調(diào)控Th17細(xì)胞相關(guān)的免疫因子,從而引起黏膜免疫失調(diào)[16];棲糞桿菌屬(Faecalibacterium)可通過(guò)調(diào)控核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)途徑,抑制炎癥反應(yīng),幫助宿主機(jī)體抵抗炎癥[17]。
綜上所述,本研究結(jié)果證實(shí)“上火”發(fā)生與腸道菌群改變相關(guān),變化的腸道菌群在一定程度上能反映“上火”導(dǎo)致的能量代謝紊亂和黏膜免疫失衡。