胡波 魏后軍 范志宇
摘要:為獲得可溶性表達(dá)的兔NF-κB p50蛋白,本研究對(duì)兔p50基因進(jìn)行大腸桿菌密碼子優(yōu)化及合成,并連接于原核表達(dá)載體pGEX-4T-1中,轉(zhuǎn)化大腸桿菌Origami B(DE3)菌株,經(jīng)異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)誘導(dǎo)表達(dá),獲得GST-p50融合蛋白。聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)結(jié)果顯示,GST-p50蛋白主要以可溶形式高效表達(dá)。經(jīng)谷胱甘肽S轉(zhuǎn)移酶(GST)磁珠純化及蛋白免疫印跡(western blot)鑒定,所表達(dá)的GST-p50蛋白具有良好的反應(yīng)原性。研究結(jié)果為進(jìn)一步開展兔NF-κB互作蛋白及信號(hào)通路的研究奠定了基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞:NF-κB;p50蛋白;原核表達(dá);鑒定;兔
中圖分類號(hào): S858.291 ?文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A ?文章編號(hào):1002-1302(2019)22-0223-03
NF-κB家族是細(xì)胞中一類重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,包含RelA(p65)、RelB、C-Rel、NF-κB1(p50)和NF-κB2(p52)5個(gè)成員。該蛋白家族成員以同源或異源二聚體形式存在,包括p50同源二聚體、p65同源二聚體和p50/p65異源二聚體等,其中p50/p65異源二聚體是NF-κB最廣泛的形式[1]。NF-κB在免疫應(yīng)答、炎癥反應(yīng)、細(xì)胞增殖和凋亡中均發(fā)揮重要的調(diào)控作用[2-4],對(duì)其的研究一直是信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和免疫學(xué)研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)。
p50蛋白含有大小為24 ku的NF-κB同源結(jié)構(gòu)域Rel homology domain(RHD),具有DNA結(jié)合、二聚化及核轉(zhuǎn)位等功能,在NF-κB介導(dǎo)的調(diào)控作用中發(fā)揮重要作用[5]。研究發(fā)現(xiàn),p50同源二聚體對(duì)機(jī)體的炎癥反應(yīng)有抑制作用,且HDAC1與p50的相互作用能抑制炎癥相關(guān)基因的表達(dá)[6]。此外,p50在腎細(xì)胞癌及膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中也發(fā)揮重要的調(diào)控作用,p50的缺失可降低腫瘤生長(zhǎng)并延長(zhǎng)生存期[7-9]。
兔作為一種重要的試驗(yàn)動(dòng)物,其NF-κB分子及其調(diào)控機(jī)制的研究尚未展開,在各種病理狀態(tài)下其NF-κB通路的激活/抑制及其關(guān)鍵分子的作用研究均缺乏相應(yīng)的基礎(chǔ)和手段。本研究通過表達(dá)NF-κB p50亞基,以期為研究兔NF-κB通路調(diào)控機(jī)制及在相關(guān)疾病中的作用奠定基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 質(zhì)粒和菌株
序列優(yōu)化的NF-κB p50基因由南京金斯瑞生物科技有限公司合成并連接于pGEX-4T-1載體;E.coli Origami B(DE3)感受態(tài)細(xì)胞購自上海唯地生物技術(shù)有限公司。
1.2 主要試劑和工具酶
Blue Plus Ⅱ Protein Marker(蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn),北京全式金生物技術(shù)有限公司);SDS-PAGE凝膠快速配制試劑盒(上海碧云天生物技術(shù)有限公司);兔抗人NF-κB p50蛋白多克隆抗體(南京善本生物科技有限公司);酶標(biāo)山羊抗兔IgG(HRP-IgG)購自北京鼎國(guó)昌盛生物技術(shù)有限公司;GST磁珠購自南京金斯瑞生物科技有限公司;氯化鈉、磷酸氫二鈉、氯化鉀等試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
1.3 兔NF-κB p50蛋白的序列分析
以DNAStar軟件對(duì)p50蛋白序列進(jìn)行氨基酸比對(duì)及功能區(qū)分析,并采用Disulfind在線工具(http://disulfind.dsi.unifi.it/)進(jìn)行二硫鍵預(yù)測(cè)及分析。
1.4 重組表達(dá)載體pGEX-4T-1-p50的獲得
采用OptimumGeneTM軟件對(duì)兔p50基因序列(GenBank No.XM017347386)進(jìn)行大腸桿菌密碼子優(yōu)化,優(yōu)化序列經(jīng)合成后連接至pGEX-4T-1載體中,獲得重組表達(dá)載體 pGEX-4T-1-p50。
1.5 GST-p50融合蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)
將重組質(zhì)粒pGEX-4T-1-p50轉(zhuǎn)化大腸桿菌Origami B(DE3)菌株,挑取單菌落接種到含氨芐青霉素(100 μg/mL)、卡那霉素(50 μg/mL)和四環(huán)素(20 μg/mL)的LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃培養(yǎng)過夜,按1 ∶ 100體積比將培養(yǎng)物接種于含以上3種抗生素的新鮮LB液體培養(yǎng)基中,振蕩培養(yǎng)至D600 nm值為0.6時(shí),加入終濃度為0.5 mmol/L的異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG),16 ℃誘導(dǎo)表達(dá)過夜,12 000 r/min 離心收集菌體,磷酸鹽緩沖液(PBS)重懸后冰浴超聲破碎,分別收集上清和沉淀,進(jìn)行12% SDS-PAGE電泳分析。
1.6 GST-p50蛋白的純化及蛋白免疫印跡(western blot)鑒定
按“1.5”節(jié)的方法大量誘導(dǎo)表達(dá)GST-p50蛋白,經(jīng)超聲破碎后,12 000 r/min離心收集上清液,采用GST磁珠純化目的蛋白,具體操作按GST磁珠說明書進(jìn)行。將純化后的GST-p50蛋白進(jìn)行SDS-PAGE,采用半干轉(zhuǎn)印法將蛋白轉(zhuǎn)移至聚偏二氟乙烯(PVDF)膜,以針對(duì)p50的多克隆抗體(1 ∶ 1 000 稀釋)為一抗,HRP標(biāo)記的羊抗兔IgG(1 ∶ 5 000稀釋)為二抗進(jìn)行反應(yīng),ECL(增強(qiáng)化學(xué)發(fā)光法)顯色觀察結(jié)果。
2 結(jié)果與分析
2.1 兔p50序列分析
以DNAStar軟件對(duì)p50序列進(jìn)行分析,結(jié)果表明,兔p50基因全長(zhǎng)1 299 bp,編碼432個(gè)氨基酸。參照已報(bào)道的人p50蛋白NTD、DD、Linker和Flexible region等區(qū)域劃分,通過氨基酸序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)兔p50蛋白同樣存在相同的功能區(qū)(圖1)。對(duì)兔p50基因編碼蛋白的進(jìn)一步分析顯示,兔p50蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量為47 404.83,等電點(diǎn)(pI)為7.46,序列中共含有7個(gè)半胱氨酸(Cys)。通過Disulfind在線工具進(jìn)行二硫鍵預(yù)測(cè),結(jié)果表明,p50蛋白單體共可形成3對(duì)二硫鍵,分別位于NTD區(qū)和Linker區(qū)(表1)。
2.3 GST-p50蛋白的表達(dá)及純化
將重組質(zhì)粒pGEX-4T-1-p50轉(zhuǎn)化E.coli Origami B(DE3)菌株,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá),超聲破碎后,上清和沉淀的SDS-PAGE電泳結(jié)果顯示,在約76 ku處有1條明顯的蛋白條帶,與預(yù)期大小一致(圖2),表明重組GST-p50蛋白主要以可溶形式表達(dá)。經(jīng)Image J軟件分析,上清中GST-p50蛋白量是包涵體的3.07倍(圖3)。
2.4 GST-p50蛋白的純化及鑒定
采用GST磁珠對(duì)表達(dá)上清中GST-p50蛋白進(jìn)行純化,SDS-PAGE電泳表明,獲得了純化的GST-p50蛋白,Western Blot鑒定結(jié)果顯示,所表達(dá)純化的融合蛋白能被p50抗體特異性識(shí)別(圖4),表明p50蛋白表達(dá)正確。
3 討論
獲得大量純化的蛋白質(zhì)是蛋白質(zhì)理化性質(zhì)和功能研究的基礎(chǔ),迄今大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)由于其遺傳背景清楚、表達(dá)高效、經(jīng)濟(jì)方便等特點(diǎn)仍然是最常用的蛋白質(zhì)表達(dá)系統(tǒng)。大腸桿菌表達(dá)外源蛋白可分為胞外分泌、周質(zhì)表達(dá)和胞質(zhì)表達(dá)3種形式。胞質(zhì)表達(dá)方式的蛋白質(zhì)表達(dá)量最高,但易形成無活性的包涵體,須經(jīng)過復(fù)雜的變性復(fù)性過程才能得到有活性的目的蛋白[10],因此提高蛋白的可溶性表達(dá)是原核表達(dá)中須要重點(diǎn)考慮的因素之一。
已有研究表明,人源和豬源NF-κB p50蛋白質(zhì)在大腸桿菌中均以包涵體形式表達(dá),須進(jìn)行變性、復(fù)性、純化等一系列處理才能用于后續(xù)研究[1,11],且蛋白復(fù)性的效率并不高。目前普遍認(rèn)為包涵體的形成是因?yàn)槎蜴I錯(cuò)配導(dǎo)致錯(cuò)誤折疊的結(jié)果,且優(yōu)化密碼子、降低表達(dá)溫度、分子伴侶、融合表達(dá)可溶性多肽等方法是提高蛋白質(zhì)可溶性表達(dá)的主要策略[12-15]。因此本研究中,首先對(duì)p50蛋白質(zhì)序列及二硫鍵形成進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)p50序列含有7個(gè)半胱氨酸,其中6個(gè)可形成3對(duì)二硫鍵,分別位于NTD和Linker區(qū)域。這些二硫鍵在表達(dá)過程中能否正確折疊和配對(duì)可能對(duì)所表達(dá)的p50蛋白質(zhì)的可溶性及活性十分關(guān)鍵。因此本研究選擇了可高效促進(jìn)蛋白二硫鍵正確折疊的Origami B(DE3)大腸桿菌作為表達(dá)宿主菌。此外,優(yōu)化p50基因序列密碼子、采用GST融合表達(dá)載體及16 ℃低溫誘導(dǎo)等方法,成功表達(dá)了p50蛋白質(zhì)。經(jīng)分析,其可溶性蛋白表達(dá)量是包涵體的3倍以上,實(shí)現(xiàn)了p50蛋白質(zhì)的高效可溶表達(dá),為后續(xù)p50相互作用蛋白質(zhì)及NF-κB信號(hào)通路的研究奠定了基礎(chǔ)。
參考文獻(xiàn):
[1]王瀟娣,朱 玲,蔡雨函,等. 豬NF-κB p65/p50亞基的原核表達(dá)及其對(duì)豬繁殖與呼吸綜合征病毒增殖的影響[J]. 病毒學(xué)報(bào),2013,29(6):621-631.
[2]Qin Z H,Tao L Y,Chen X. Dual roles of NF-κB in cell survival and implications of NF-κB inhibitors in neuroprotective therapy[J]. Acta Pharmacologica Sinica,2007,28(12):1859-1872.
[3]Hayden M S,Ghosh S. Shared principles in NF-κB signaling[J]. Cell,2008,132(3):344-362.
[4]Chen J E,Chen Z J. Regulation of NF-κB by ubiquitination[J]. Current Opinion in Immunology,2013,25(1):4-12.
[5]Kumar M,Dadhwal P,Atreya H S,et al. Backbone resonance assignments of the dimeric domain of the p50 NF-κB subunit[J]. Biomolecular NMR Assignments,2019(8):1-3.
[6]Cartwright T N,Worrell J C,Marchetti L,et al. HDAC1 interacts with the p50 NF-κB subunit via its nuclear localization sequence to constrain inflammatory gene expression[J]. Biochimica et Biophysica Acta(Gene Regulatory Mechanisms),2018,1861(10):962-970.
[7]de Souza Braga M,Da Silva Paiva K B,F(xiàn)oguer K,et al. Involvement of the NF-кB/p50/Bcl-3 complex in response to antiangiogenic therapy in a mouse model of metastatic renal cell carcinoma[J]. Biomedicine & Pharmacotherapy,2014,68(7):873-879.
[8]Theresa B,Allison M,Sarah H B,et al. Deletion of NF-κB p50 alters murine glioblastoma tumor-associated macrophage polarization,reduces tumor growth and prolongs survival[J]. Journal for Immunotherapy of Cancer,2015,3(2):395.
[9]Barberi T,Martin A,Suresh R,et al. Absence of host NF-κB p50 induces murine glioblastoma tumor regression,increases survival,and decreases T-cell induction of tumor-associated macrophage M2 polarization[J]. Cancer Immunology,Immunotherapy,2018,67(10):1491-1503.
[10]劉 爽,胡寶成. 原核系統(tǒng)可溶性表達(dá)策略[J]. 生物技術(shù)通訊,2005,16(2):172-175.
[11]李生茂,梁華平,徐 祥,等. GST Pull-down實(shí)驗(yàn)鑒定NF-κB相互作用多肽[J]. 免疫學(xué)雜志,2006,22(1):94-97.
[12]韓 平,蓋園明,朱蓓薇,等. hTNFR1在大腸桿菌中可溶性表達(dá)及純化[J]. 生物技術(shù)進(jìn)展,2018,8(3):246-253.
[13]郭玉堃,郭婉瑩,明勝利,等. O型口蹄疫病毒衣殼蛋白在大腸桿菌中的可溶性表達(dá)、純化及電鏡檢測(cè)[J]. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào),2018,38(7):1265-1271.
[14]孫 杰,秦飛燕,朱言柱,等. 犬Ⅰ型腺病毒結(jié)構(gòu)蛋白Knob的可溶性表達(dá)及免疫原性研究[J]. 黑龍江畜牧獸醫(yī),2019(15):10-14.
[15]劉盼嬈,周雪晨,朱雪蛟,等. 豬圓環(huán)病毒2型Cap蛋白在大腸桿菌中的可溶性表達(dá)及在小鼠體內(nèi)免疫特性研究[J]. 中國(guó)生物工程雜志,2016,36(4):50-56.