吳 桐
(浙江外國語學(xué)院科學(xué)技術(shù)學(xué)院,浙江 杭州 310023)
在細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)、細(xì)胞遷移、基因表達(dá)等多項(xiàng)生理活動(dòng)中,都會(huì)發(fā)生蛋白質(zhì)相互作用。所以在生命科學(xué)研究中,需要對(duì)蛋白質(zhì)相互作用進(jìn)行深入研究。但從實(shí)踐情況來看,采用傳統(tǒng)核磁共振、熒光檢測(cè)等技術(shù)進(jìn)行蛋白質(zhì)相互作用觀察,容易遭遇蛋白質(zhì)標(biāo)記問題,需要借助鑭系金屬探針特性加強(qiáng)蛋白質(zhì)標(biāo)記,從而得到科學(xué)的研究結(jié)果。
作為稀土元素,鑭系金屬中的釓元素帶有顯著的順磁特性,鋱?jiān)貏t具有較好發(fā)光特性。釓離子擁有半充滿f軌道和各向同性g張量,自旋量子數(shù)較大,同時(shí)擁有較長(zhǎng)弛豫時(shí)間[1]。利用順磁探針提供的未配對(duì)電子與核間相互作用,可以加快弛豫速率,同時(shí)不會(huì)引起交叉相干弛豫,能夠提供簡(jiǎn)單的數(shù)據(jù)分析過程。借助溶液核磁共振技術(shù),能夠使釓的順磁弛豫得到增強(qiáng),從而對(duì)蛋白質(zhì)復(fù)合體進(jìn)行標(biāo)記。在核磁共振實(shí)驗(yàn)中,順磁弛豫增強(qiáng)的大小與電子和核間距離成正比關(guān)系,電子擁有較大磁矩,能夠?qū)崿F(xiàn)長(zhǎng)距離監(jiān)測(cè),因此能夠用于研究蛋白質(zhì)相互作用。鋱的發(fā)射譜在可見光區(qū)域內(nèi),熒光壽命達(dá)毫秒級(jí)。采用熒光波譜學(xué)技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)時(shí)間延遲檢測(cè),將納秒量級(jí)背景熒光去除,從而使鋱成為發(fā)光探針對(duì)蛋白質(zhì)特異性進(jìn)行標(biāo)記,使熒光技術(shù)在蛋白質(zhì)特異性檢測(cè)上的不足得到彌補(bǔ)[2]。針對(duì)分子量較大的蛋白質(zhì),采用核磁共振等技術(shù)難以實(shí)現(xiàn)結(jié)構(gòu)解析。利用鋱?zhí)结樳M(jìn)行蛋白質(zhì)標(biāo)記,能夠?qū)Φ鞍踪|(zhì)結(jié)構(gòu)、裝配和動(dòng)態(tài)變化進(jìn)行分析,因此可以實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)相互作用的研究。
(1)利用釓探針研究蛋白質(zhì)相互作用。在對(duì)蛋白質(zhì)相互作用展開研究時(shí),利用釓探針順磁特性,通過增強(qiáng)順磁弛豫能夠提供距離信息約束,實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)系綜優(yōu)化精修,對(duì)生物大分子復(fù)合體瞬時(shí)構(gòu)象進(jìn)行觀測(cè),確定蛋白質(zhì)間發(fā)生的相互作用。采用該方法,能夠獲得較之電子質(zhì)子更短的基態(tài)結(jié)構(gòu),得到低分布頻率構(gòu)象,因此能夠?qū)Φ鞍踪|(zhì)相互作用進(jìn)行動(dòng)態(tài)研究。在研究大腸桿菌磷酸轉(zhuǎn)移系統(tǒng)時(shí),細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)需要通過蛋白質(zhì)磷酸化作用實(shí)現(xiàn)。但是從生物信息學(xué)角度來看,在數(shù)以萬計(jì)蛋白質(zhì)間,僅幾千個(gè)蛋白質(zhì)復(fù)合體能夠獲得原子水平分辨率結(jié)構(gòu)信息,其中能夠?qū)崿F(xiàn)信號(hào)傳導(dǎo)的則更少。針對(duì)蛋白質(zhì)復(fù)合體擁有較高分辨率結(jié)構(gòu)信息的特征,需要采用釓探針實(shí)現(xiàn)核磁共振實(shí)驗(yàn)中順磁弛豫增強(qiáng),對(duì)弱相互作用遭遇的蛋白質(zhì)復(fù)合體進(jìn)行檢測(cè),從而得到相應(yīng)結(jié)構(gòu)信息。
實(shí)驗(yàn)需要以大腸桿菌基因?yàn)槟0鎸?shí)現(xiàn)定點(diǎn)突變,利用非同位素進(jìn)行蛋白表達(dá)純化,然后實(shí)現(xiàn)核磁共振滴定。在整個(gè)過程中,酶I(EI)C末端結(jié)構(gòu)域內(nèi),需要對(duì)磷酸烯醇式丙酮酸的水解作用進(jìn)行催化,促使其N端結(jié)構(gòu)域(EIN)實(shí)現(xiàn)自動(dòng)磷酸化,將基團(tuán)傳遞至組氨酸磷酸運(yùn)載蛋白,最終傳遞至酶IIA(EIIA)。研究EI與EIIA間發(fā)生的相互作用,可以進(jìn)行二者間核磁共振滴定實(shí)驗(yàn),利用釓探針在EIIA突變體和D144C突變體中進(jìn)行釓離子的引入。通過研究發(fā)現(xiàn),EI和EIIA間平衡解離常數(shù)約13mM,說明二者之間存在較弱相互作用,能夠證明EI和EIIA間并非直接相互作用。通過對(duì)磷酸化酶促反應(yīng)進(jìn)行測(cè)定可以發(fā)現(xiàn),EIIA能夠被EI直接磷酸化,缺失突變體的酶則會(huì)對(duì)這一過程進(jìn)行抑制,因此可以說明Hpr酶未參與到磷酸化過程中。在實(shí)驗(yàn)期間,能夠檢測(cè)發(fā)現(xiàn)EI-EIIA復(fù)合體的存在,但是存在時(shí)間和比例均較少。由此可見在蛋白質(zhì)間發(fā)生極弱相互作用時(shí)會(huì)對(duì)復(fù)合體進(jìn)行遭遇,但在各種因素調(diào)節(jié)下能夠達(dá)到結(jié)合與解離間的平衡,保證細(xì)胞信號(hào)順利傳播。
(2)利用鋱?zhí)结樠芯康鞍踪|(zhì)相互作用。實(shí)際上,細(xì)胞中各種生理活動(dòng)需要利用不同信號(hào)通路實(shí)現(xiàn),各通路之間會(huì)發(fā)生交叉對(duì)話。蛋白質(zhì)作為細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點(diǎn),需要通過相互作用實(shí)現(xiàn)信號(hào)傳遞。采用熒光技術(shù),可以利用熒光分子間能量轉(zhuǎn)移現(xiàn)象進(jìn)行蛋白質(zhì)相互作用研究,即根據(jù)熒光分子發(fā)射光譜和受體間光譜重疊情況確定距離約束信息,對(duì)蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)學(xué)信息進(jìn)行獲取。但是由于生物樣本自發(fā)熒光,采用有機(jī)小分子探針對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行標(biāo)記會(huì)出現(xiàn)非特異性問題。采用鋱?zhí)结?,可以通過電子自旋禁阻軌道躍遷發(fā)光,只有較小的發(fā)光系數(shù),能夠利用有機(jī)生色基團(tuán)進(jìn)行能量轉(zhuǎn)移,在紫外激發(fā)下發(fā)出綠光,從而通過扣除納秒級(jí)熒光壽命實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)特異性檢測(cè)。在活細(xì)胞中,利用有色氨酸的結(jié)合標(biāo)簽,能夠使鋱離子與目的蛋白質(zhì)融合。標(biāo)簽中的天冬氨酸等可以與鋱離子構(gòu)成穩(wěn)定配位化學(xué)鍵,實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的特異性標(biāo)記。
在研究半胱氨酰白三烯受體CysLTR時(shí),可以在基因中不同位點(diǎn)進(jìn)行結(jié)合標(biāo)簽突變質(zhì)粒的插入,利用數(shù)據(jù)庫對(duì)氨基酸序列展開分析。由于其是細(xì)胞膜外N末端進(jìn)行的多次跨膜蛋白,通過插入結(jié)合標(biāo)簽,能夠使N末端和膜外loop環(huán)對(duì)鋱離子進(jìn)行結(jié)合,實(shí)現(xiàn)受體標(biāo)記。利用標(biāo)記的hCysLTR對(duì)轉(zhuǎn)染細(xì)胞進(jìn)行刺激,可以借助標(biāo)記物中激動(dòng)劑白三烯D4實(shí)現(xiàn),然后對(duì)細(xì)胞內(nèi)鈣增高情況進(jìn)行測(cè)定。從研究結(jié)果來看,利用含結(jié)合標(biāo)簽的質(zhì)粒進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染后,相較于野生型受體,得到的受體不會(huì)出現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)鈣增高的情況。在結(jié)合標(biāo)簽與hCysLTR之間進(jìn)行甘氨酸的插入,能夠?qū)崿F(xiàn)柔性鏈接。從細(xì)胞內(nèi)鈣的檢測(cè)結(jié)果來看,依然無反應(yīng),可知增加柔性鏈接長(zhǎng)度無法產(chǎn)生刺激作用。由于鋱的激發(fā)波段為紫外,不利于生物樣本觀察,因此可以引入喹諾酮,采用更長(zhǎng)波長(zhǎng)實(shí)現(xiàn)激發(fā)。
采用光學(xué)顯微鏡成像法進(jìn)行觀測(cè),可以發(fā)現(xiàn)鋱離子對(duì)細(xì)胞形態(tài)和活性不會(huì)產(chǎn)生顯著影響。利用多光子顯微鏡進(jìn)行鋱標(biāo)記的蛋白觀察,可以發(fā)現(xiàn)標(biāo)記的蛋白質(zhì)和未標(biāo)記的蛋白質(zhì)都發(fā)出了微弱熒光,與細(xì)胞自發(fā)背景熒光被激發(fā)有關(guān)。對(duì)微妙延遲檢測(cè)時(shí)間進(jìn)行設(shè)置可以發(fā)現(xiàn),未插入結(jié)合標(biāo)簽的蛋白質(zhì)熒光完全消失,但是利用鋱標(biāo)記特異性蛋白質(zhì)依然發(fā)光。由此可見,在膜外loop區(qū)蛋白質(zhì)標(biāo)記檢測(cè)方面,可以采用鋱?zhí)结槍?duì)蛋白質(zhì)相互作用進(jìn)行研究。采用該方法,利用多功能酶標(biāo)儀進(jìn)行細(xì)胞觀察,可以發(fā)現(xiàn)鋱離子對(duì)蛋白質(zhì)做出的特異性標(biāo)記。
通過研究可以發(fā)現(xiàn),在蛋白質(zhì)相互作用研究領(lǐng)域,采用傳統(tǒng)的熒光檢測(cè)技術(shù)和核磁共振技術(shù)容易遭遇蛋白質(zhì)標(biāo)記問題。而對(duì)鑭系金屬探針進(jìn)行運(yùn)用,能夠借助釓探針順磁特性和鋱?zhí)结槹l(fā)光特性實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)特異性標(biāo)記,為研究蛋白質(zhì)相互作用提供支持。因此在實(shí)踐工作中,還應(yīng)加強(qiáng)鑭系金屬探針特性分析,以便實(shí)現(xiàn)探針合理利用,滿足蛋白質(zhì)相互作用研究需求。