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抑癌基因甲基化與胃癌關(guān)系研究進展*

2019-02-12 07:37:04米志寬趙菊梅
陜西醫(yī)學(xué)雜志 2019年5期
關(guān)鍵詞:微衛(wèi)星癌基因細胞系

米志寬,趙菊梅

延安大學(xué)醫(yī)學(xué)院(延安 716000)

腫瘤表遺傳學(xué)是腫瘤學(xué)研究發(fā)展迅速的領(lǐng)域之一,隨著表遺傳學(xué)的發(fā)展,人們普遍認為腫瘤是遺傳學(xué)和表遺傳學(xué)共同作用的結(jié)果。胃癌表遺傳學(xué)主要包括DNA甲基化、組蛋白修飾和染色質(zhì)重塑幾個方面,其中抑癌基因的甲基化是非常重要的一個方面[1-2]。抑癌基因DNA的甲基化導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄水平的腫瘤抑制基因沉默,這在胃癌的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)移中都占據(jù)著十分重要的位置[3],本文對幾種抑癌基因甲基化與胃癌的關(guān)系做一綜述。

1CDH1基因和CDH4基因甲基化CDH1(Cadherin-1)在人類是編碼鈣粘素1(亦稱鈣粘蛋白1)的一種基因,是一種抑癌基因。鈣粘素/蛋白是依賴于鈣離子而介導(dǎo)細胞間黏連的一種跨膜蛋白,屬糖蛋白。鈣粘素/蛋白1亦稱上皮細胞鈣粘素/蛋白(Epithelial cadherin, E-Cadherin),是鈣粘素/蛋白超家族中最重要的一個成員,其功能缺失使腫瘤細胞易于發(fā)生轉(zhuǎn)移[4]。CDH1在所有類型的胃癌和轉(zhuǎn)移的胃癌中都可能發(fā)生高甲基化,在彌漫型胃癌中其高甲基化頻率比腸型胃癌高。對53例原發(fā)性胃癌中CDH1啟動子的甲基化情況檢測發(fā)現(xiàn),CDH1甲基化頻率為51%。研究發(fā)現(xiàn),早期胃癌的甲基化率為60%,彌漫型胃癌的甲基化率(83%)明顯高于其他組織類型的胃癌(34%)。另有報道,CDH1甲基化在早期胃癌中即有發(fā)生,CDH1甲基化高的胃癌中鈣粘素1表達降低。對60例原發(fā)早期胃癌研究顯示,CDH1甲基化率為45%,CDH1甲基化導(dǎo)致的鈣粘素1表達降低與腫瘤的淋巴轉(zhuǎn)移相關(guān);因此,CDH1甲基化是胃癌進展中的一個早期事件,鈣粘素1表達降低與胃癌的進展和轉(zhuǎn)移相關(guān)[5-6]。CDH4(Cadherin-4)是Cadherin基因超家族的另一個成員,所編碼的鈣粘素/蛋白4也是一種依賴于鈣離子而介導(dǎo)細胞間黏連的糖蛋白。CDH4基因內(nèi)含子的CpG島在95%的胃癌中發(fā)生甲基化;胃癌患者的外周血可中也可檢測到這種甲基化,因此,CDH4基因內(nèi)含子CpG島甲基化可作為胃癌診斷的一種標志物[7]。

2CDKN2A基因甲基化CDKN2A(Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A)基因是1994年美國冷泉港實驗室Kamb等發(fā)現(xiàn)的一種抑癌基因,其產(chǎn)物細胞周期蛋白依賴性激酶抑制劑2A又稱為多腫瘤抑制基因1(Multiple tumor suppressor 1)和p16蛋白,CDKN2A基因直接參與細胞周期的調(diào)控,負性調(diào)節(jié)細胞增殖及分裂。CDKN2A基因的失活能導(dǎo)致細胞惡性增殖或加速癌細胞細胞周期的進展[8]。有報道稱,在9個胃癌細胞系中有2個發(fā)生CDKN2A基因甲基化而不表達CDKN2A mRNA,用去甲基化試劑處理細胞后,因甲基化被沉默的基因重新表達;胃癌細胞系中CDKN2A基因啟動子甲基化是胃癌細胞中CDKN2A基因失活的主要機制。CDKN2A基因在慢性胃炎中沒有甲基化,在腸化生、胃腺瘤和胃癌標本中的甲基化率分別為2.1%、11.5%和42.2%,提示CDKN2A基因高甲基化可能在胃癌癌前病變的發(fā)展過程中起著作用。大鼠胃癌模型的研究發(fā)現(xiàn),CDKN2A基因的甲基化出現(xiàn)于胃癌早期;在正常胃黏膜上皮、慢性萎縮性胃炎、異型增生、胃腺瘤和胃癌中期,CDKN2A基因甲基化的頻率分別為2.7%、16.7%、37.5%、67.4%、和82.5%;變性高效液相色譜分析檢測顯示,胃癌的I、II、III、IV期,CDKN2A基因甲基化頻率分別為27.3%、37.5%、和58.8%;可以看出,CDKN2A基因甲基化的頻率隨著胃癌的發(fā)展過程而逐漸升高[9]。有作者認為,CDKN2A基因的異常甲基化可以用于預(yù)測異型增生的惡性轉(zhuǎn)化潛能,有利于胃癌的早期發(fā)現(xiàn)[10]。

3hMLH1基因甲基化hMLH1(human Mut L homolog 1)是人類與大腸桿菌Mut L同源的一種堿基錯配修復(fù)基因。堿基錯配修復(fù)對DNA復(fù)制的保真性是必需的,其功能缺陷使細胞容易發(fā)生基因突變和癌變;hMLH1基因的缺陷可引起微衛(wèi)星不穩(wěn)定(Microsatellite instability),微衛(wèi)星不穩(wěn)定是DNA錯配修復(fù)功能缺陷的一個標志[11]。7個大規(guī)模的檢測顯示,有16%~50%的胃癌變現(xiàn)為高度微衛(wèi)星不穩(wěn)定,表示有DNA錯配修復(fù)缺陷,高度微衛(wèi)星不穩(wěn)定的胃癌具有轉(zhuǎn)移頻率低、對治療反應(yīng)好、預(yù)后較好等臨床特征。研究發(fā)現(xiàn),HMLH1甲基化與高度微衛(wèi)星不穩(wěn)定之間存在顯著相關(guān)性,63%~100%的高度微衛(wèi)星不穩(wěn)定的胃癌發(fā)生HMLH1啟動子的高甲基化,而在微衛(wèi)星穩(wěn)定的胃癌中,HMLH1啟動子高甲基化頻率為0~39%。慢性胃炎沒有HMLH1的甲基化,腸化生、胃腺瘤和胃癌標本中HMLH1甲基化的頻率分別為6.3%、9.8%和20.3%;可以看出,隨著胃黏膜病變的發(fā)展演變,HMLH1甲基化頻率逐漸升高[11-12]。

4MGMT基因甲基化0-6-甲基鳥嘌呤DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(0-6-methylguanine-DNA methyltransferase, MGMT)基因是重要的DNA修飾基因。MGMT是保持細胞基因組DNA穩(wěn)定性非常重要的一種酶,其表達缺陷可增加細胞癌變的機會。MGMT基因啟動子CpG島的甲基化可導(dǎo)致MGMT基因表達缺陷并可能引起細胞癌變[4]。對26例胃癌組織和8個胃癌細胞系的研究發(fā)現(xiàn),MGMT表達降低的胃癌組織和胃癌細胞系中存在有MGMT基因啟動子DNA的甲基化,而MGMT表達正常的胃癌組織和細胞系未發(fā)現(xiàn)MGMT基因啟動子的甲基化。5-氮雜-2’-脫氧胞苷(5-aza-2'-deoxycytidine)是2’-脫氧胞苷的類似物,為一種去甲基化試劑,能通過抑制DNA甲基轉(zhuǎn)移酶而降低DNA的甲基化。存在有MGMT基因甲基化的細胞系經(jīng)過5-氮雜-2’-脫氧胞苷的處理,MGMT基因的表達恢復(fù),說明胃癌細胞中DNA甲基化是使MGMT基因表達降低的原因。研究亦發(fā)現(xiàn),MGMT基因在胃癌發(fā)生發(fā)展的不同階段都有一定程度的甲基化,MGMT基因的甲基化與胃癌進展和預(yù)后不良相關(guān)[13-14]。

5RASSF1基因甲基化RASSF1基因是人類編碼RASSF1蛋白(Ras association domain-containing protein 1)的基因。RASSF1蛋白RAS蛋白的作用類似,其表達的缺失或改變與多種腫瘤的發(fā)生相關(guān);所以,RASSF1基因?qū)僖职┗?。RASSF1啟動子CpG島的高甲基化可導(dǎo)致RASSF1基因的失活。由于剪接方式的不同,RASSF1基因有三種產(chǎn)物:RASSF1A、RASSF1B和RASSF1C[15]。檢測了150例胃癌標本和15個胃癌細胞系RASSF1A、RASSF1B和RASSF1C的表達情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn),RASSF1A表達缺失占60%、RASSF1B表達缺失占30%,而所有細胞系中均有RASSF1C的表達;不表達RASSF1A的細胞系都有該基因啟動子區(qū)高甲基化現(xiàn)象,在不表達RASSF1A的胃癌標本中,95%的有RASSF1A啟動子甲基化;失活的RASSF1A基因經(jīng)5-氮雜-2’-脫氧胞苷處理恢復(fù)甲基化后能重新活化[16]。對290份胃黏膜標本(急性胃炎、慢性胃炎、腸上皮化生、胃腺瘤和胃癌)中RASSF1A基因DNA甲基化情況的檢測發(fā)現(xiàn),胃癌中RASSF1A的甲基化率為7.5%,而在其他病變組織(急慢性胃炎、腸上皮化生和胃腺瘤)中未發(fā)現(xiàn)甲基化。由于RASSF1A的甲基化只在胃癌有而在胃的其他病變中沒有,這可以作為為胃癌輔助診斷和治療的一個靶點[17-18]。

6RUNX3基因甲基化RUNX3(Runt-related transcription factor 3)是含有runt域轉(zhuǎn)錄因子家族的一個成員。RUNX3基因也屬于腫瘤抑制基因,癌細胞中RUNX3基因往往缺失或者在轉(zhuǎn)錄水平沉默,RUNX3基因敲除的小鼠易于發(fā)生細胞增生,RUNX3基因表達的異常也與胃癌的發(fā)生和進展相關(guān)[19]。研究發(fā)現(xiàn),胃癌中RUNX3基因啟動子高甲基化是其失活的主要原因。在RUNX3基因不表達的3個胃癌細胞系中,RUNX3啟動子區(qū)的CpG島完全甲基化,而在表達RUNX3基因的細胞系中卻沒有發(fā)現(xiàn)甲基化;RUNX3基因不表達的胃癌組織標本中,RUNX3啟動子區(qū)的CpG島亦被甲基化;應(yīng)用DNA甲基化抑制劑5-氮雜-2’-脫氧胞苷可使胃癌細胞系中已經(jīng)沉默的RUNX3基因恢復(fù)表達活性;以上結(jié)果說明,RUNX3基因啟動子的甲基化是導(dǎo)致RUNX3基因沉默的原因。另有研究報道,胃癌原發(fā)灶中RUNX3啟動子區(qū)有甲基化的占75%,胃癌腹膜轉(zhuǎn)移灶中RUNX3啟動子100%地有甲基化,在良性疾病的腹腔沖洗物中未檢測到RUNX3啟動子甲基化(同時可檢測到RUNX3表達)。研究亦發(fā)現(xiàn),在99例慢性胃炎、32例腸上皮化生、77例胃腺瘤和75例胃癌組織標本中,RUNX3基因甲基化的頻率分別為8%、28%、27%和64%,可見RUNX3基因甲基化的頻率在胃癌組織中明顯高于癌前病變[20-21]。

7TFF1基因甲基化TFF1(Trefoil factor 1)基因在人類是編碼TFF1因子的基因。TFF家族所有因子的一個共同特征是都含有至少一個拷貝的Trefoil模體,他們在胃腸道粘膜穩(wěn)定分泌,功能尚不完全明了,但有保護粘膜上皮的功能。TFF1基因表達于胃粘膜,其在腫瘤細胞的表達受到重視。在胃癌中,TFF1因子的表達往往因DNA甲基化而缺失,所以TFF1基因被當做是胃癌細胞的腫瘤抑制基因[22]。研究發(fā)現(xiàn),在腸化生和分化良好的胃癌組織中可檢測到TFF1基因啟動子的高甲基化,該區(qū)有甲基化的胃癌不表達TFF1因子,說明TFF1基因啟動子的甲基化可能與胃癌的發(fā)生相關(guān)。Feng等的研究發(fā)現(xiàn),與匹配的非癌組織相比,TFF1基因在胃腫瘤組織中的表達為沉默或降低,在胃癌細胞中呈弱表達;TFF1基因在胃腫瘤組織和胃癌細胞中的低表達或沉默與其啟動子區(qū)CpG島高甲基化相關(guān),在呈弱表達;胃癌細胞中TFF1基因的表達可被去甲基化試劑恢復(fù)[23]。Tanaka等研究了182例胃癌患者TFF1的表達情況及其與患者的預(yù)后情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn),TFF1的低表達與腫瘤的浸潤情況、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況及患者的生存情況相關(guān),故作者認為,TFF1的表達情況可作為判斷胃癌患者預(yù)后的一個實用指標[24]。

除了上述幾種基因外,亦有報道稱CAC-NA2D3、CHFR、DCC、FGFR2、NMDAR2B、p14、p15、PTEN、RARβ、SFRP2、SLC5A8和TIMP-3等基因啟動子的甲基化與胃癌的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。對胃癌多個基因或位點的甲基化的研究發(fā)現(xiàn),胃癌的發(fā)生發(fā)展往往是多個基因甲基化積累的結(jié)果[25-26]。此外,DNA低甲基化亦可導(dǎo)致基因激活,近年來已經(jīng)引起了重視[27]。

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