林慧嫻 鄭磊
1南方醫(yī)科大學(xué)檢驗(yàn)與生物技術(shù)學(xué)院(廣州510000);2南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院檢驗(yàn)科(廣州510000)
近年來興起的液體活檢技術(shù)克服了傳統(tǒng)組織活檢的侵入性、取樣困難以及難以監(jiān)測等局限性,使腫瘤的實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)監(jiān)測成為可能。液體活檢技術(shù)主要針對循環(huán)腫瘤核酸(circulating tumor DNA,ctDNA)、細(xì)胞外囊泡(extracellular vesicles,EVs)及循環(huán)腫瘤細(xì)胞(circulating tumor cells,CTCs)等標(biāo)志物的檢測分析,具有非侵入性、重復(fù)性強(qiáng)等優(yōu)勢,在腫瘤早期診斷、治療決策、療效評(píng)估和耐藥監(jiān)測中具有巨大的發(fā)展?jié)摿εc臨床應(yīng)用前景。此外,液體活檢還可反映腫瘤的基因譜,對腫瘤診治的精準(zhǔn)化進(jìn)程具有推進(jìn)性意義,因此本文將對上述液體活檢的三大檢測標(biāo)志物的生物學(xué)特性、主要檢測方法以及臨床應(yīng)用進(jìn)行簡要綜述,為證明其臨床有效性和實(shí)用性提供思路,對指導(dǎo)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)研究和液體活檢的臨床實(shí)踐有重要意義。
腫瘤患者外周血游離DNA(cell free DNA,cfDNA)濃度比健康人群高10~100 倍,其中ctDNA 可來源于凋亡或者壞死的腫瘤細(xì)胞、CTCs和外泌體。ctDNA 長度約為150~200 bp,其存在形式包括單鏈DNA、雙鏈DNA 及DNA-蛋白復(fù)合體,半衰期為15 min~2 h。雖然ctDNA 僅占全部cfDNA的0.01%~1%,但ctDNA的遺傳信息和腫瘤組織有良好一致性,可以動(dòng)態(tài)反映腫瘤基因譜特征。
ctDNA的檢測包括濃度變化和結(jié)構(gòu)改變兩個(gè)方面。因ctDNA 占cfDNA 總量的比例較低,且ctDNA 與體細(xì)胞凋亡釋放的核酸相比可能僅有一個(gè)或數(shù)個(gè)堿基的微小差別,故對其檢測技術(shù)靈敏度要求極高。以選擇性擴(kuò)增為核心的技術(shù)包括熒光定量PCR、液滴式數(shù)字PCR[1]、cold-PCR[2]、ARMS-PCR[3]、高分辨溶解曲線分析技術(shù)[4]等,這類方法靈敏度較高,但易發(fā)生偏向性擴(kuò)增,且只可檢測已知突變。以測序技術(shù)為核心的Sanger 測序(一代)、增強(qiáng)化TAM-測序[5]和CAPP-測序[6](二代)、納米孔單分子測序[7](三代)等方法具有高通量和高效率的優(yōu)點(diǎn),但成本相對較高。此外,PCR-流式聯(lián)合技術(shù)[8]、新興的微球依賴性懸浮點(diǎn)陣法[9]等在提高檢測準(zhǔn)確性和降低成本方面都有一定的提升。其中微球依賴性懸浮點(diǎn)陣法基于液相芯片技術(shù),靈敏度提高至可檢測低至2 μL的樣本。
EVs 是細(xì)胞在生理或病理狀態(tài)下旁分泌的一種膜性囊泡,包括凋亡小體(>1000 nm)、微囊泡(100~1000 nm)和外泌體(30~100 nm)。EVs 存在于淋巴液、血液、唾液、尿液、腦脊液等體液中,半衰期較ctDNA 與CTCs 長。EVs可將其攜帶的脂質(zhì)、蛋白質(zhì)、核酸、細(xì)胞因子等物質(zhì)運(yùn)輸至特定部位,在細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、增殖與分化、炎癥反應(yīng)、腫瘤轉(zhuǎn)移與耐藥等方面,發(fā)揮重要的作用。
EVs的檢測主要包括分離鑒定與內(nèi)容物分析。分離技術(shù)包括差速離心法、密度梯度離心法、尺寸排阻法、微流控法和磁珠分選法等。離心法的優(yōu)點(diǎn)是對EVs的活性損傷較小,但所需樣本量較大且分離純度較差。尺寸排阻法和微流控技術(shù)的分離效率較高,但也存在特異性不足的問題。免疫磁珠分選法具有較好的特異性,但抗原表位的激活可能不利于后續(xù)的功能分析。EVs的鑒定包括以電子顯微鏡法、納米顆粒跟蹤法、動(dòng)態(tài)光散射法為主的物理學(xué)鑒定和以蛋白印記法、酶聯(lián)免疫法為主的免疫學(xué)鑒定。物理學(xué)方法通過形態(tài)和粒徑特征對EVs 進(jìn)行表征,免疫學(xué)方法則通過檢測特異的表面蛋白標(biāo)志物對EVs 進(jìn)行鑒定和亞群分析。EVs 內(nèi)容物包括蛋白質(zhì)、核酸、脂質(zhì)和代謝物,其分析技術(shù)主要有質(zhì)譜法、流式細(xì)胞法、液滴式數(shù)字PCR法[10]、核磁共振法、表面等離子共振法[11]等。此外,近年來發(fā)展迅速的生物傳感和電化學(xué)傳感技術(shù),如電化學(xué)“三明治”免疫夾心法[12]、將磁選與電化學(xué)檢測相結(jié)合的手持式iMEX 分析裝置[13]以及基于金屬納米顆粒直接電氧化法的多通道金芯片[14]等,均可應(yīng)用于EVs 檢測分析領(lǐng)域。其中多通道金芯片利用特異性適配體修飾不同的金屬納米顆粒,特異性捕獲表達(dá)多種標(biāo)志物的目的外泌體與微囊泡。適配體、納米材料以及電化學(xué)傳感器的聯(lián)合運(yùn)用大大提高了該技術(shù)的靈敏度以及檢測效率。
CTCs 是自發(fā)或者因診療操作而脫離腫瘤原發(fā)灶或轉(zhuǎn)移灶進(jìn)入外周血的腫瘤細(xì)胞,半衰期為1~2.4 h。絕大多數(shù)CTCs 在短期內(nèi)被免疫系統(tǒng)殺滅,極少數(shù)CTCs 可通過誘導(dǎo)血小板聚集成“物理屏障”逃避免疫殺傷,同時(shí)激活血小板釋放血管內(nèi)皮生長因子、TGF-β[15]等調(diào)節(jié)因子,進(jìn)而增強(qiáng)其遷移侵襲力并促進(jìn)新血管形成[16]。雖然CTCs 數(shù)量稀少(1~10個(gè)CTC/mL),但與腫瘤轉(zhuǎn)移和復(fù)發(fā)密切相關(guān),是腫瘤預(yù)后和監(jiān)測的潛在標(biāo)志物。
CTCs 檢測包括分離富集和鑒定分析兩個(gè)方面。CTCs分離富集技術(shù)包括以過濾法、密度梯度離心法、微流控法為代表的物理學(xué)方法和以CellSearch 法[17]、Anda Test 法[18]、MagSweeper 法[19]為代表的免疫分選方法。物理方法主要依賴細(xì)胞大小、密度、電泳特征的差異,具有靈敏性高、漏檢率低的優(yōu)點(diǎn),但是分離純度較低,且可能漏檢體積較小的CTCs。免疫方法具有較好的分離純度和特異性,但是受到表面標(biāo)志物表達(dá)異質(zhì)性的影響,可能導(dǎo)致某些CTCs亞群的漏檢。CTC-iChip[20]技術(shù)將兩種原理有機(jī)結(jié)合,先根據(jù)細(xì)胞大小進(jìn)行分離,然后利用特異性抗體(CKs 或CD45)進(jìn)行二次富集,提高了檢測的捕獲率與準(zhǔn)確性。此外,納米材料和適配體體系[21]、聲學(xué)原理[22]等也開始應(yīng)用于CTCs 檢測領(lǐng)域,端粒酶活性[23]、體內(nèi)捕獲策略[24]等逐漸成為新型檢測平臺(tái)研發(fā)的切入點(diǎn),有望使CTCs 富集準(zhǔn)確性得到質(zhì)的飛躍。CTCs 鑒定及下游分析技術(shù)包括免疫細(xì)胞化學(xué)法、流式細(xì)胞術(shù)、熒光定量PCR、FISH技術(shù)、二代測序技術(shù)等,可結(jié)合細(xì)胞形態(tài)和腫瘤標(biāo)志物對CTCs 進(jìn)行鑒定、形態(tài)/功能亞群分析以及治療/耐藥靶點(diǎn)檢測。
4.1 輔助臨床診斷和分期傳統(tǒng)影像學(xué)檢查未能發(fā)現(xiàn)病灶時(shí),外周血中已存在ctDNA、EVs和CTCs,早期檢測這些標(biāo)志物有助于腫瘤的診斷。ctDNA 異常甲基化檢測已進(jìn)入結(jié)直腸癌、肺癌、胰腺癌等腫瘤篩查和診斷的臨床實(shí)踐。例如p16INK4A 啟動(dòng)子[25]、SHOX2和PTGER4等基因[26]異常甲基化均可輔助肺癌的診斷。關(guān)于EVs,研究發(fā)現(xiàn)肺癌患者的miR-21[27]、結(jié)直腸癌患者的CRNDE-h[28]表達(dá)水平顯著升高,提示EVs 可成為腫瘤的早期診斷標(biāo)志物。據(jù)報(bào)道,外泌體源性LINC00152和lncRNA-CRNDE-h 在胃癌和結(jié)直腸癌早期診斷中優(yōu)勢突出。此外,研究表明CTCs 與乳腺癌[29]、非小細(xì)胞肺癌[30]、結(jié)腸癌[31]等臨床分期的關(guān)系密切。除了數(shù)量的差異,CTCs的分子特征在腫瘤分期中也具有指示作用,CTCs 中g(shù)a733.2、muc-1,、mgb1、spdef 基因表達(dá)水平與乳腺癌分期顯著相關(guān)[32]。
4.2 輔助進(jìn)行療效評(píng)估以及耐藥性監(jiān)測液體活檢在耐藥性檢測及療效評(píng)估中的應(yīng)用引起了廣泛關(guān)注。通過檢測ctDNA的變化如乳腺癌患者HER2的異常擴(kuò)增[33],非小細(xì)胞肺癌患者T790M 突變[34]等可預(yù)測腫瘤耐藥。外泌體在腫瘤耐藥性的產(chǎn)生與傳遞中發(fā)揮重要的作用。胰腺癌患者外泌體分泌增多,可促進(jìn)吉西他濱耐藥性的產(chǎn)生[35]。耐藥患者與敏感患者的外泌體蛋白表達(dá)也存在差異,例如卵巢癌鉑類藥物耐藥患者的外泌體annexin A3 表達(dá)水平明顯高于敏感組[36]。因此,外泌體可作為指示耐藥和評(píng)估療效的標(biāo)志物,且抑制特異性外泌體的釋放可能可逆轉(zhuǎn)耐藥性的產(chǎn)生,亦可為突破腫瘤治療的耐藥性瓶頸提供新的方向。CTCs的數(shù)量及分子特征也可提示治療效果和耐藥。CTCs 根據(jù)其分子特征可分為不同的亞群,如腫瘤干細(xì)胞樣、EMT 樣和轉(zhuǎn)移起始樣CTCs等,其中根據(jù)EMT的程度又可分為上皮型、間質(zhì)型、混合型亞群。有研究發(fā)現(xiàn)CTCs的EMT 可作為乳腺癌耐藥標(biāo)志物[37],間質(zhì)型CTCs 比例減少提示治療有效,反之與疾病進(jìn)展相關(guān)。因此,CTCs亞群分析有助于制定個(gè)體化、有效化、靶向化的治療方案,進(jìn)一步推進(jìn)腫瘤精準(zhǔn)診治。此外,對分離出的CTCs 進(jìn)行體外培養(yǎng),有利于藥物敏感性機(jī)制的研究,開發(fā)相應(yīng)的靶向藥物。
4.3 實(shí)時(shí)監(jiān)測腫瘤的發(fā)展?fàn)顩r和預(yù)后判斷傳統(tǒng)的組織活檢重復(fù)取樣受限,難以實(shí)現(xiàn)動(dòng)態(tài)監(jiān)測,因此臨床上治療方案的調(diào)整與預(yù)后評(píng)估困難重重。液體活檢在規(guī)避上述局限性的同時(shí),還可綜合腫瘤異質(zhì)性因素對疾病進(jìn)展進(jìn)行監(jiān)測,并且為揭示腫瘤轉(zhuǎn)移機(jī)制提供依據(jù)。有研究[38]發(fā)現(xiàn)肝癌患者不同血管部位的CTCs 分布與生物學(xué)特征例如EMT 狀態(tài)存在明顯的空間異質(zhì)性,對肝癌多血管CTCs 檢測有助于揭示其轉(zhuǎn)移的新機(jī)制以及預(yù)測其轉(zhuǎn)移模式。ctDNA 特征分析可溯源腫瘤的發(fā)生部位[39],從而為腫瘤原發(fā)灶和轉(zhuǎn)移灶的判斷提供信息。此外,ctDNA的遺傳信息和腫瘤組織有良好的一致性,可作為腫瘤復(fù)發(fā)監(jiān)測和預(yù)后評(píng)估的標(biāo)志物。例如,ctDNA的BRAF 突變水平可作為黑色素瘤患者生存的一項(xiàng)預(yù)測因素[40]。另一方面,EVs 尤其是外泌體,在預(yù)后評(píng)估中也展現(xiàn)了極大的應(yīng)用價(jià)值。EVANS等[41]指出放化療中Annexin 陽性外泌體含量和膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的早期復(fù)發(fā)與總生存期相關(guān)。乳汁外泌體TGFβ2 水平分析有助于乳腺癌進(jìn)展的評(píng)估[42]。此外,大量研究表明,CTCs 是早期乳腺癌[43]、胃癌[44]、非小細(xì)胞肺癌[45]等患者的獨(dú)立預(yù)后因素。
4.4 腫瘤的靶向治療近年來,針對免疫檢查點(diǎn)抑制劑、血管形成和關(guān)鍵信號(hào)通路的腫瘤靶向療法逐漸成為熱點(diǎn)問題。ctDNA 腫瘤突變負(fù)荷、EVs 內(nèi)容物圖譜、以及CTCs數(shù)量與分子表征在靶向療法群體篩選和治療方案調(diào)整中均有指示作用。Lentz 提出全血經(jīng)膜濾過法[46]可減少外泌體,使部分患者的腫瘤縮小了50%以上。利用腫瘤抗原刺激自體樹突細(xì)胞,產(chǎn)生EVs,激活相應(yīng)抗腫瘤免疫活性,可使患者病情減緩[47]。EVs 內(nèi)容物也可作為有效的腫瘤靶向抑制劑,且EVs 是機(jī)體天然的內(nèi)源性物質(zhì),且有較好的膜穩(wěn)定性和靶向性,可作為良好的藥物傳遞載體。研究表明,針對耐藥性肺癌,外泌體包裹紫杉醇后藥效可提高至紫杉醇直接給藥的50 倍[48]。盡管尚有許多挑戰(zhàn)亟待解決,EVs 在靶向載藥和腫瘤免疫治療方面仍展現(xiàn)出巨大的發(fā)展?jié)摿Α?/p>
液體活檢作為一種非侵入性的新型檢測技術(shù),具有取樣方便、可動(dòng)態(tài)監(jiān)測等優(yōu)勢。針對液體活檢標(biāo)志物ctDNA、EVs和CTCs的檢測分析,在腫瘤的早期診斷、耐藥監(jiān)測、療效評(píng)估、預(yù)后判斷中具有重要的臨床應(yīng)用價(jià)值。但是,液體活檢技術(shù)也存在一些亟待解決的問題。一方面,ctDNA、EVs和CTCs的檢測技術(shù)缺乏規(guī)范化的流程和質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn),尚未有統(tǒng)一的臨床參考值。另一方面,如何在提高檢測特異性、靈敏性、經(jīng)濟(jì)性之間取得平衡仍值得考量。目前,大多數(shù)檢測都只聚焦于一種分析物,而綜合多種血液分析物的多參數(shù)檢測可能可以大幅度改善檢測的精確度和使用范圍?;跈z測技術(shù)、基礎(chǔ)生物學(xué)、分子生物學(xué)等多學(xué)科發(fā)展將是液體活檢未來的方向,需要我們深入了解液體分析物的產(chǎn)生機(jī)理和動(dòng)態(tài)變化,確認(rèn)液體標(biāo)志物的臨床有效性和實(shí)用性,進(jìn)而推動(dòng)液體活檢在腫瘤臨床診療中的廣泛應(yīng)用。