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宮頸癌組織中SALL3、DNMT3A、甲基化SALL3基因表達(dá)觀察

2019-03-13 13:53:22趙娟魏星楊婷趙敏伊楊筱鳳
山東醫(yī)藥 2019年36期
關(guān)鍵詞:甲基化宮頸癌宮頸

趙娟,魏星,楊婷,趙敏伊,楊筱鳳

(1 西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院,西安710061;2 西安交通大學(xué)第二附屬醫(yī)院)

宮頸癌是女性生殖系統(tǒng)常見的惡性腫瘤之一。研究[1]顯示,我國(guó)每年新發(fā)病例數(shù)達(dá)13.1萬(wàn),死亡例數(shù)達(dá)5.3萬(wàn),占所有女性惡性腫瘤的18%。近年來(lái),宮頸癌新的診斷和治療技術(shù)得到不斷發(fā)展,但患者的5年總體生存率僅在40%左右,因此明確宮頸癌發(fā)生發(fā)展的機(jī)制,尋找宮頸癌早期診斷指標(biāo)及治療方案具有重要的臨床意義[2]。研究[3]表明,表觀遺傳學(xué)調(diào)控如甲基化、乙?;⑻腔?,參與了宮頸癌的發(fā)生發(fā)展。DNA甲基化修飾在基因表達(dá)調(diào)控過(guò)程中發(fā)揮重要作用,DNA甲基化是在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNMT)催化下,以S-腺苷甲硫氨酸作為甲基供體,使CpG島中5′端胞嘧啶甲基化,而CpG島多位于基因啟動(dòng)子附近,因此DNA甲基化后將抑制基因轉(zhuǎn)錄。DNMT家族包括DNA甲基化維持酶(DNMT1)、DNA甲基轉(zhuǎn)移酶3A(DNMT3A)和DNA甲基轉(zhuǎn)移酶3B(DNMT3B)3個(gè)成員,在DNA甲基化的啟動(dòng)和維持中發(fā)揮重要作用。研究[4]顯示,DNMT3A在多種腫瘤中高表達(dá),可通過(guò)直接或協(xié)同作用導(dǎo)致抑癌基因異常甲基化而沉默其表達(dá)。spalt樣轉(zhuǎn)錄因子3(SALL3)是SAL基因家族的成員,位于染色體18q23,SALL3基因編碼產(chǎn)生含有4個(gè)鋅指結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)錄因子。研究[5]顯示,SALL3基因啟動(dòng)子在腫瘤發(fā)生時(shí)存在異常甲基化現(xiàn)象,導(dǎo)致SALL3基因表達(dá)水平降低。研究[6]發(fā)現(xiàn),SALL3能通過(guò)雙鋅指結(jié)構(gòu)域與DNMT3A的PWWP結(jié)構(gòu)域結(jié)合,抑制DNMT3A,而在腫瘤發(fā)生時(shí)SALL3表達(dá)降低,導(dǎo)致抑制DNMT3A能力下降,DNMT3A活性增強(qiáng)后進(jìn)而抑制抑癌基因的表達(dá),促進(jìn)腫瘤的發(fā)生發(fā)展。目前有關(guān)宮頸癌中SALL3及DNMT3A表達(dá)的研究較少。本研究觀察了宮頸癌組織中SALL3 mRNA、DNMT3A mRNA及甲基化SALL3基因表達(dá)情況,分析SALL3 mRNA、DNMT3A mRNA表達(dá)的相關(guān)性及其與宮頸癌患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系,現(xiàn)報(bào)告如下。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 選取2016年12月~2018年12月西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院診治的宮頸癌患者200例,患者年齡27~56歲,平均(42.9±7.1)歲,其中宮頸鱗癌161例、子宮腺癌39例,腫瘤高分化57例、中分化65例、低分化78例,腫瘤分期Ⅰ期112例、Ⅱ期88例[7],淺肌層浸潤(rùn)81例、深肌層浸潤(rùn)119例,淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移117例、無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移83例。納入標(biāo)準(zhǔn):①均經(jīng)宮頸活檢病理或術(shù)后病理檢查確診為宮頸癌;②均為初次診治,既往未接受其它抗腫瘤治療;③臨床病理資料完整,患者及家屬均知情同意并已簽署知情同意書。排除標(biāo)準(zhǔn):①合并其它器官系統(tǒng)的惡性腫瘤;②合并急性感染性疾病,如上呼吸道感染等;③合并嚴(yán)重的臟器功能不全,如心功能衰竭、肝功能衰竭等。選取同期接受手術(shù)治療的子宮肌瘤患者40例,患者年齡34~56歲,平均(42.1±6.8)歲。本研究中,200例宮頸癌患者與40例子宮肌瘤患者年齡間無(wú)顯著差異(P>0.05)?;颊呔邮苁中g(shù)切除治療,宮頸癌患者術(shù)中留取宮頸癌組織,子宮肌瘤患者術(shù)中留取正常宮頸組織,留取的組織標(biāo)本迅速置于凍存管內(nèi),液氮速凍后,置于-80℃冰箱保存。

1.2 宮頸癌組織及正常宮頸組織中SALL3 mRNA、DNMT3A mRNA檢測(cè)方法 采用qRT-PCR法。取約30 mg組織標(biāo)本,TRIzol法提取總RNA,溶于80 μL無(wú)RNA酶的ddH2O中,核酸蛋白測(cè)定儀上檢測(cè)RNA濃度。以2 μg總RNA為模板,逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA,總反應(yīng)體系為20 μL,實(shí)驗(yàn)步驟嚴(yán)格按照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行。以cDNA為模板,進(jìn)行熒光定量PCR反應(yīng)。引物序列如下:SALL3正向引物為5′-CCAATGTGTCGGTGTTCGAG-3′,反向引物為5′-CCGGGTAAGGGTTCATCTGG-3′;DNMT3A正向引物為5′-CCGATGCTGGGGACAAGAAT-3′,反向引物為5′-CCCGTCATCCACCAAGACAC-3′;內(nèi)參基因GAPDH正向引物為5′-GGAGCGAGATCCCTCCAAAAT-3′,反向引物為3′-GGCTGTTGTCATACTTCTCATGG-5′。熒光定量PCR反應(yīng)條件為:94 ℃ 4 min,94 ℃ 30 s,60 ℃ 1 min,72 ℃ 30 s,40個(gè)循環(huán)。所有反應(yīng)均在ABI實(shí)時(shí)定量PCR儀上完成,每個(gè)樣本重復(fù)3次。以2-ΔCt表示目的基因的相對(duì)表達(dá)量。

1.3 宮頸癌組織及正常宮頸組織中甲基化SALL3基因表達(dá)觀察 應(yīng)用酚-氯仿法提取、純化組織DNA,實(shí)驗(yàn)步驟按照TaKaRa Mini DNA 提取試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行,瓊脂糖凝膠電泳鑒定。應(yīng)用亞硫酸氫鈉修飾提取的500 ng基因組DNA,以將DNA中尚未甲基化的胞嘧啶(C)修飾為尿嘧啶(U),操作步驟按照EZ DNA Methylation-Gold Kit說(shuō)明書進(jìn)行,然后進(jìn)行甲基化特異PCR擴(kuò)增。引物序列如下:SALL3基因甲基化正向引物:5′-ATTTTAGAATGGAAGGGAGTTCGTC-3′,反向引物:5′-ATAACCTCCTAAAACTTCCCCGAA-3′;SALL3基因非甲基化正向引物:5′-ATTTTAGAATGGAAGGGAGTTTGTTG-3′,反向引物:5′-AAATAACCTCCTAAAACTTCCCCAAA-3′。PCR反應(yīng)體系根據(jù)PCR反應(yīng)試劑盒說(shuō)明進(jìn)行。PCR反應(yīng)條件為:95 ℃預(yù)變性10 min;然后進(jìn)行40個(gè)循環(huán)的擴(kuò)增反應(yīng),程序?yàn)?5 ℃變性30 s,51 ℃退火60 s,72 ℃延伸30 s;72 ℃延伸8 min,4 ℃保溫。PCR反應(yīng)結(jié)束后取10 μL反應(yīng)產(chǎn)物,應(yīng)用2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳,以去離子水為陰性對(duì)照,應(yīng)用成像分析系統(tǒng)照相,根據(jù)DNA條帶判斷結(jié)果。甲基化陽(yáng)性結(jié)果判斷方法:甲基化引物擴(kuò)增出目的條帶,而非甲基化引物未擴(kuò)增出目的條帶;甲基化陰性結(jié)果判斷方法:甲基化引物未擴(kuò)增出目的條帶,而非甲基化引物擴(kuò)增出目的條帶。用圖像分析系統(tǒng)計(jì)算受檢標(biāo)本的甲基化條帶密度值,即為標(biāo)本的相對(duì)甲基化程度。

2 結(jié)果

2.1 宮頸癌組織與正常宮頸組織中SALL3 mRNA、DNMT3A mRNA表達(dá)比較 宮頸癌組織中SALL3 mRNA、DNMT3A mRNA相對(duì)表達(dá)量分別為0.253±0.051、0.272±0.055,正常宮頸組織中SALL3 mRNA、DNMT3A mRNA相對(duì)表達(dá)量分別為1.050±0.062、0.093±0.016,兩者相比,P均<0.05。

2.2 宮頸癌組織中SALL3 mRNA、DNMT3A mRNA表達(dá)的相關(guān)性 宮頸癌組織中SALL3 mRNA、DNMT3A mRNA表達(dá)呈負(fù)相關(guān)(r=-0.679,P=0.000)。

2.3 SALL3 mRNA、DNMT3A mRNA表達(dá)與宮頸癌患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系 結(jié)果見表1。表1顯示,SALL3、DNMT3A mRNA表達(dá)與宮頸癌患者FIGO分期、分化程度有關(guān)(P均<0.05)。

2.4 宮頸癌組織及正常宮頸組織中甲基化SALL3基因比較 宮頸癌組織中SALL3基因甲基化率為60.5%(121/200),相對(duì)甲基化程度為1.72±0.61;正常宮頸組織中SALL3基因甲基化率為30.0%(12/40),相對(duì)甲基化程度為0.26±0.07;兩者相比,P均<0.05。

3 討論

DNA甲基化是表觀遺傳修飾的最常見形式,通過(guò)基因表達(dá)調(diào)控,參與各種分化發(fā)育、炎癥、自身免疫和腫瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程。研究[8]表明,啟動(dòng)子區(qū)域特別是CpG島異常的DNA甲基化與許多癌癥的發(fā)生密切相關(guān)。在結(jié)直腸癌研究[9]中發(fā)現(xiàn),β-環(huán)連蛋白抑制基因2(DACT2)為一種抑癌基因,其基因啟動(dòng)子區(qū)域存在高甲基化的現(xiàn)象,DACT2表達(dá)降低可能參與了結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展,而DNA高甲基化是DACT2的重要表達(dá)調(diào)控機(jī)制。此外,研究[10]發(fā)現(xiàn),谷胱甘S-轉(zhuǎn)移酶P1(GSTP1)保護(hù)細(xì)胞避免DNA損傷和癌細(xì)胞形成,GSTP1基因啟動(dòng)子甲基化可能造成GSTP1基因低表達(dá),GSTP1活性降低導(dǎo)致DNA損傷的敏感性增強(qiáng)和癌變發(fā)生的概率增加。因此,腫瘤相關(guān)基因的異常甲基化在致癌過(guò)程中起重要作用,研究宮頸癌中特異性基因甲基化具有重要意義。

表1 SALL3、DNMT3A mRNA表達(dá)與宮頸癌患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系

SALL3是SAL家族的成員,其參與人類多個(gè)系統(tǒng)的發(fā)育過(guò)程,該基因表達(dá)缺失患者表現(xiàn)為先天性心臟疾病、精神發(fā)育遲滯、生長(zhǎng)發(fā)育遲緩及肢體畸形等。近年來(lái)研究[11]表明,SALL3表達(dá)水平與腫瘤的發(fā)生發(fā)展之間關(guān)系密切,在肝細(xì)胞癌中,SALL3基因啟動(dòng)子被DNA甲基化修飾,SALL3高甲基化降低了肝細(xì)胞癌中SALL3的表達(dá)水平,SALL3的異常高甲基化有助于肝細(xì)胞癌的發(fā)生。本研究中,宮頸癌組織中SALL3基因表達(dá)在mRNA水平上明顯低于正常宮頸組織,表明宮頸癌組織中SALL基因表達(dá)降低。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),宮頸癌組織中SALL3 mRNA表達(dá)與FIGO分期、腫瘤分化程度有關(guān),F(xiàn)IGO分期越高、分化越低的癌組織中SALL3 mRNA相對(duì)表達(dá)量越低,表明SALL3 mRNA相對(duì)表達(dá)量能夠反映宮頸癌病情嚴(yán)重程度,有望成為新的腫瘤相關(guān)標(biāo)志物。我們認(rèn)為,其機(jī)制可能是隨著腫瘤進(jìn)展,腫瘤微環(huán)境中IL-7等細(xì)胞因子結(jié)合細(xì)胞表面的IL-7Rα,進(jìn)而抑制轉(zhuǎn)錄因子SALL3的表達(dá)[12]。此外,SALL基因啟動(dòng)子區(qū)域存在表觀遺傳學(xué)修飾的現(xiàn)象,也可降低SALL3基因表達(dá)。Yu等[13]在膀胱癌患者尿液中脫落的腫瘤細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)SALL3富含CG的啟動(dòng)子區(qū)域高度甲基化,認(rèn)為SALL3可能是檢測(cè)膀胱癌的新型DNA甲基化標(biāo)記物。本研究進(jìn)一步檢測(cè)SALL3基因甲基化表達(dá)情況,結(jié)果顯示宮頸癌組織中SALL3基因甲基化率及相對(duì)甲基化程度均顯著高于正常宮頸組織,表明SALL3基因的表觀遺傳學(xué)修飾可能參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展,特別是腫瘤的早期階段,因而檢測(cè)SALL3基因甲基化情況有可能成為宮頸癌的早期診斷方法。目前SALL3基因異常高甲基化的機(jī)制尚不清楚,可能與HPV感染有關(guān)。有研究[14]報(bào)道,在宮頸癌SiHa、HeLa兩種HPV陽(yáng)性細(xì)胞系中均存在SALL3基因啟動(dòng)子區(qū)域中高甲基化的現(xiàn)象,但在HPV陰性細(xì)胞系C33A中SALL3基因在啟動(dòng)子區(qū)域未出現(xiàn)甲基化現(xiàn)象,因而HPV的感染可能參與誘導(dǎo)SALL3基因甲基化,參與相關(guān)的致癌機(jī)制。

DNMT3A基因編碼DNA甲基轉(zhuǎn)移酶,是甲基化調(diào)節(jié)的關(guān)鍵酶,參與從頭甲基化過(guò)程,DNMT3A蛋白定位于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核。有研究[15]表明,DNMT3A與異染色質(zhì)的組分相互作用,包括HP1、HDAC和組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶,在染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的調(diào)節(jié)中起重要作用。研究[16]發(fā)現(xiàn),DNMT3A基因突變參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程,在25%的急性髓性白血病(AML)患者中常發(fā)生DNMT3A基因R882位點(diǎn)突變。本研究中,宮頸癌組織中DNMT3A在mRNA相對(duì)表達(dá)量上表達(dá)明顯高于正常宮頸組織,且宮頸癌組織中DNMT3A mRNA表達(dá)與FIGO分期、腫瘤分化程度有關(guān),F(xiàn)IGO分期越高、分化越低的癌組織中DNMT3A mRNA相對(duì)表達(dá)量越高,提示宮頸癌組織中DNMT3A mRNA表達(dá)升高可能參與宮頸癌的病情發(fā)展。DNMT3A表達(dá)升高的機(jī)制尚不清楚,可能與宮頸癌組織中SALL3基因高甲基化后SALL3表達(dá)降低,導(dǎo)致SALL3對(duì)DNMT3A的抑制作用減弱,DNMT3A的表達(dá)上調(diào)后促進(jìn)抑癌基因的從頭甲基化,促進(jìn)了宮頸癌的發(fā)生[13]。本研究中,SALL3與DNMT3A mRNA表達(dá)呈顯著負(fù)相關(guān),表明兩者可能存在相互作用,有待進(jìn)一步深入研究。

綜上所述,宮頸癌組織中SALL3 mRNA低表達(dá)、DNMT3A mRNA高表達(dá),兩者負(fù)相關(guān),SALL3、DNMT3A mRNA表達(dá)與宮頸癌FIGO分期、分化程度有關(guān),兩者共同參與宮頸癌的發(fā)生發(fā)展過(guò)程,有希望成為新的診斷、治療及預(yù)后評(píng)估的腫瘤標(biāo)志物。宮頸癌組織中SALL3基因甲基化率及相對(duì)甲基化程度升高,檢測(cè)甲基化SALL3基因情況有可能成為宮頸癌的早期診斷方法。

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