朱欽士 (美國南加州大學(xué)醫(yī)學(xué)院)
原核生物并不直接催化氫氣與硝酸鹽反應(yīng),因?yàn)檫@種直接反應(yīng)只能以熱的形式釋放能量,生物無法加以利用。 要利用該氧化還原反應(yīng)釋放的能量,原核生物采取的辦法是,先用氫酶(hydrogenase)將氫氣(H2)中的氫原子轉(zhuǎn)移到一種叫做“醌”(quinone)的分子上,使其變?yōu)椤皻漉?,再通過硝酸鹽還原酶(nitrate reductase)將氫醌分子上的氫原子轉(zhuǎn)移給硝酸鹽分子,將硝酸鹽(NO3-)變?yōu)閬喯跛猁}(NO2-),同時(shí)生成水。 硝酸鹽失去了1個(gè)氧原子,因此是被部分“還原”了。
之所以該反應(yīng)要經(jīng)過醌分子, 是因?yàn)轷肿佑幸环N能力,可利用氧化還原反應(yīng)釋放的能量,將氫離子(H+)從細(xì)胞膜的一側(cè)轉(zhuǎn)移至另一側(cè),使氫離子在膜一側(cè)的濃度極大超過另一側(cè)。 氫離子在膜兩側(cè)濃度不一樣的狀況稱為“跨膜氫離子梯度”。它就像水庫大壩兩側(cè)的水位不一樣高, 是儲(chǔ)存能量的一種方式。水庫里面的高水位具有勢(shì)能,在通過大壩時(shí)勢(shì)能被釋放, 驅(qū)動(dòng)水輪機(jī)進(jìn)而帶動(dòng)發(fā)電機(jī)發(fā)電。同樣,氫離子從濃度高的一側(cè)通過膜流至另一側(cè)時(shí), 也會(huì)帶著位于膜上的ATP 合成酶轉(zhuǎn)動(dòng),轉(zhuǎn)動(dòng)的力量可使酶的形狀改變,將ADP(二磷酸腺苷)和磷酸分子“捏合”到一起,形成ATP 分子。 ATP(adenosine triphosphate,即三磷酸腺苷)是腺苷分子上再連上3 個(gè)磷酸根而成。 由于磷酸根是帶負(fù)電的,彼此排斥,將3 個(gè)磷酸根強(qiáng)行“捏”在一起,就像是將彈簧壓縮,一旦有機(jī)會(huì)(即釋放出磷酸根時(shí))就會(huì)釋放能量。 因此ATP 是細(xì)胞中的“高能分子”,能為細(xì)胞中各種需要能量的生命過程提供能量。 原核生物利用氧化還原反應(yīng)釋放能量的方式, 就是先將這些能量以跨膜氫離子梯度的形式儲(chǔ)存起來, 再將跨膜氫離子梯度儲(chǔ)存的能量轉(zhuǎn)化為ATP 分子中的能量。
醌分子是如何將氧化還原反應(yīng)釋放的能量轉(zhuǎn)化為跨膜氫離子梯度的? 這與醌分子的化學(xué)結(jié)構(gòu)和性質(zhì)有關(guān)。醌分子的化學(xué)結(jié)構(gòu)較為簡(jiǎn)單,即一個(gè)能進(jìn)行氧化還原反應(yīng)的“頭部”連上一條長“尾巴”(圖1)。這條“尾巴”只含有碳原子和氫原子,是高度親脂的,它使醌分子能“溶解”在細(xì)胞膜的油性內(nèi)層中并在膜內(nèi)“游動(dòng)”,使其“頭部”可接近細(xì)胞膜的任何一側(cè)。
醌分子的“頭部”是一個(gè)環(huán)狀結(jié)構(gòu)(化學(xué)名稱叫“苯環(huán)”),上面連有2 個(gè)“羥基”(-OH,“羥”是化學(xué)家造的字,就是“氫加氧”組成的基團(tuán)的意思)而成。 這2 個(gè)羥基可以各失去1 個(gè)氫原子,變成2個(gè)“羰基”(C=O,“羰”也是化學(xué)家造的字,讀音“湯”,意思是“碳加氧”形成的基團(tuán),這里的C 表示環(huán)上的碳原子)。 羰基得到氫原子, 又可以變回羥基, 因此醌分子可反復(fù)得到和失去2 個(gè)氫原子,可作為氫原子的“轉(zhuǎn)運(yùn)站”。醌分子中的氧原子以羰基形式存在時(shí),是失去氫原子的,處于被“氧化”的狀態(tài),叫做醌(quinone,簡(jiǎn)稱為Q);醌分子中的氧原子以羥基的形式存在時(shí),是得到氫原子的,處于被“還原”的狀態(tài),叫做氫醌(quinol,簡(jiǎn)稱QH2)。
圖1 醌分子的結(jié)構(gòu)
要建立跨膜氫離子梯度, 首先需要一種氫離子無法直接通過的膜,就像水庫的壩。這應(yīng)該不是問題,因?yàn)樽畛醯纳褪且约?xì)胞的形式出現(xiàn)的,細(xì)胞膜將細(xì)胞的內(nèi)容物與環(huán)境分開, 以免組成生命的化學(xué)系統(tǒng)被水稀釋。 細(xì)胞膜是磷脂組成的雙層膜,中間有約2.5 nm 厚的“油”層,主要由磷脂分子上脂肪酸的碳?xì)滏湣拔舶汀苯M成。 這個(gè)油質(zhì)層對(duì)于各種帶電的離子,包括氫離子、鈉離子、氯離子,都是不通透的。這些離子要通過細(xì)胞膜必須通過膜上由蛋白質(zhì)組成的通道, 而通道的開關(guān)是受控制的,就像水壩的出水口是可以關(guān)閉的,所以細(xì)胞膜就可以起到“水壩”的作用。 有了不透氫離子的細(xì)胞膜,再有了“溶解”在膜中且能進(jìn)行氧化還原反應(yīng)的醌分子,轉(zhuǎn)化能量即可進(jìn)行。
如果氫醌分子是將其上的氫原子以原子的形式直接轉(zhuǎn)移給硝酸鹽, 則跨膜氫離子梯度無法建立。 但巧妙的是,氫醌被氧化時(shí),其上面的氫原子是分為電子和氫離子這2 個(gè)部分而“分開走”的。硝酸鹽還原酶先脫去醌分子中氫原子上的電子,將電子傳遞給硝酸鹽, 失去電子的氫原子以氫離子的形式被釋放至溶液中。 得到電子的硝酸鹽再從溶液中得到與電子數(shù)相同的氫離子, 讓電子變回氫原子,與硝酸鹽中的1 個(gè)氧原子結(jié)合成為水,硝酸鹽變?yōu)閬喯跛猁}, 總的結(jié)果就好像是氫原子被直接轉(zhuǎn)移一樣。 但實(shí)際上,原核生物就“鉆”了電子和氫離子分開走這個(gè)“空子”,將氫離子的釋放和結(jié)合安排在膜的兩側(cè), 就可實(shí)現(xiàn)能量轉(zhuǎn)化和氫離子的跨膜轉(zhuǎn)移(圖2 右)。
圖2 氫氣被硝酸鹽氧化時(shí)釋放的能量被用于建立跨膜氫離子梯度
氫醌在被硝酸鹽氧化時(shí), 硝酸鹽還原酶上氧化氫醌的地方接近細(xì)胞膜的外表面, 因而氫離子也被釋放至細(xì)胞膜外。 細(xì)胞膜外本來就有高濃度的氫離子,由于氫離子是帶正電的,細(xì)胞膜外的溶液也因此帶有正電, 所以在細(xì)胞膜外側(cè)釋放帶正電的氫離子在能量上是不利的, 因?yàn)閹д姷臍潆x子會(huì)被細(xì)胞膜外的正電所排斥。 但是電子從氫醌進(jìn)入硝酸鹽還原酶上的氧化還原中心, 能量是降低的。 這個(gè)釋放的能量就可“拉動(dòng)”氫醌在細(xì)胞膜的外側(cè)釋放氫離子,這就是能量轉(zhuǎn)化的過程。
硝酸鹽分子從硝酸鹽還原酶得到電子后,還需要同樣數(shù)量的氫離子才能將電子變回氫原子。由于該反應(yīng)是在酶伸到細(xì)胞質(zhì)內(nèi)進(jìn)行的, 氫離子也是從細(xì)胞質(zhì)內(nèi)取得。 該反應(yīng)在能量上也是不利的, 因?yàn)橐獜膸ж?fù)電的環(huán)境中再拿走帶正電的氫離子。 但硝酸鹽被還原時(shí)釋放的能量也足以驅(qū)動(dòng)該反應(yīng)。這樣,氫醌被氧化時(shí)在細(xì)胞膜外釋放2 個(gè)氫離子, 硝酸鹽被還原時(shí)在細(xì)胞膜內(nèi)拿走2 個(gè)氫離子, 總的效果就相當(dāng)于2 個(gè)氫離子被轉(zhuǎn)移到細(xì)胞膜外, 氫醌被氧化時(shí)釋放的能量就以跨膜氫離子梯度的形式被儲(chǔ)存。
利用醌分子的氧化還原反應(yīng)中電子和氫離子分開走的特點(diǎn),建立跨膜氫離子梯度,實(shí)現(xiàn)氧化還原反應(yīng)釋放的能量的轉(zhuǎn)化和儲(chǔ)存, 為細(xì)胞的生理活動(dòng)所用,這是原核生物的偉大發(fā)明。自從幾十億年前由原核生物發(fā)明以來,所有生物,包括人類,都仍然在使用這種方法建立跨膜氫離子梯度以儲(chǔ)存能量。 由于原核生物中的細(xì)菌(Bacteria)和古菌(Archaea)都含有醌,也都使用這種方式建立跨膜氫離子梯度, 醌分子的合成及在能量轉(zhuǎn)化和儲(chǔ)存中的使用, 一定出現(xiàn)在原核生物分化為細(xì)菌和古菌之前,也就是在原核生物的共同祖先中,那就是最早的細(xì)胞生命。
也許在醌分子出現(xiàn)之前, 原核生物就開始將跨膜氫離子梯度作為能量的一種來源。 一種生命起源的學(xué)說就認(rèn)為, 最初的生命是在海底熱泉處產(chǎn)生的。 熱泉噴出的帶堿性的水和帶酸性的海水之間如果有膜狀結(jié)構(gòu)相隔, 就會(huì)形成跨膜氫離子梯度,可以為最初的生命所利用。一旦這種儲(chǔ)存能量的方式被建立,就一直為細(xì)胞所使用,而醌分子的出現(xiàn)使得細(xì)胞能主動(dòng)將氧化還原反應(yīng)釋放的能量以跨膜氫離子梯度的形式儲(chǔ)存起來。
正是由于醌分子有轉(zhuǎn)化能量的能力, 所以氧化還原反應(yīng)中的電子傳遞鏈都是以醌分子為核心樞紐的: 醌分子從各種能提供氫原子的分子收集氫原子,變?yōu)闅漉?,氫醌再將氫原子“分配”給各種氧化物。從各種分子中脫下氫原子,并將氫原子交給醌分子的酶稱為“脫氫酶”(dehydrogenase);氧化氫醌,將氫原子交給氧化物的酶就稱為“氧化酶”(oxidase,如果最終氫原子受體是氧,例如氫醌氧化酶),或者某分子的“還原酶”(reductase,如果最終氫原子受體不是氧,例如硝酸鹽還原酶)。 原核生物要適應(yīng)環(huán)境,往往利用多種還原物,也利用多種氧化物,以增加自己生存的機(jī)會(huì)。例如大腸桿菌(Escherichia coli)的電子傳遞鏈就使用了15 種脫氫酶、10 種氧化酶或還原酶。 人也有類似的電子傳遞鏈,也以醌分子為電子傳遞鏈的核心樞紐。
不僅如此, 醌分子在能量轉(zhuǎn)化和儲(chǔ)存中的巧妙機(jī)制還被光合作用所利用, 成為光合作用中轉(zhuǎn)化太陽光能量的關(guān)鍵機(jī)制(見下文)。 因此,醌分子在轉(zhuǎn)化和利用氧化還原反應(yīng)釋放能量的過程中,以及轉(zhuǎn)化儲(chǔ)存太陽光能量的過程中,都起到關(guān)鍵作用,是所有細(xì)胞生物,包括細(xì)菌、古菌、真菌、動(dòng)物和植物都使用的重要分子。市面上賣的“輔酶Q”或者“Q10”,其實(shí)就是醌分子,使人們可通過口服的方式補(bǔ)充細(xì)胞中的醌分子。相反,降低血液中膽固醇水平的“他汀”(statin)類的藥物,在抑制膽固醇合成的同時(shí)也抑制醌分子的合成, 使細(xì)胞中能量轉(zhuǎn)化的過程受到影響,降低肌肉的功能,甚至造成肌肉疼痛,要靠服用Q10緩解。
醌分子在能量轉(zhuǎn)化和儲(chǔ)存上的作用也有局限性,即氫離子的釋放和接收必須在膜的兩側(cè)。如果釋放和接收氫離子的過程發(fā)生在膜的同一側(cè),這種機(jī)制就不起作用(見圖2 左)。 例如氫酶將氫分子中的氫原子轉(zhuǎn)移到醌分子上時(shí), 氫原子也是分為電子和氫離子分別走的。氫酶從氫氣分子(外來分子)獲得電子的位置在細(xì)胞膜外,因此氫離子也被釋放在細(xì)胞膜外。 雖然看上去會(huì)增加細(xì)胞膜外側(cè)氫離子的濃度, 但由于醌分子從氫酶得到電子的地方靠近細(xì)胞膜的外側(cè), 得到電子的醌分子也從細(xì)胞膜外的溶液中獲得氫離子變?yōu)闅漉?所以開始時(shí)釋放到細(xì)胞膜外的氫離子后來又被用掉了,沒有凈的氫離子跨膜運(yùn)輸。這是一種能量上的浪費(fèi), 因?yàn)闅湓拥难趸€原電位是-0.42 V,而醌的氧化還原電位在0V 左右, 氫分子上的氫原子轉(zhuǎn)移到醌分子上也是要釋放能量的, 但是在這里不能加以利用。 許多脫氫酶由于氧化還原性分子的位置在細(xì)胞膜外, 還原醌分子的位置也靠近細(xì)胞膜的外側(cè),所以也有同樣的問題。 為此,原核生物還發(fā)展出了另一種轉(zhuǎn)化和儲(chǔ)存這些能量的方法,即利用電子傳遞所引起的蛋白質(zhì)形狀的變化,直接將氫離子從膜的一側(cè)“泵”到另一側(cè),即用電子流動(dòng)驅(qū)動(dòng)氫離子。
用電子傳遞過程中蛋白分子形狀的變化,將氫離子從細(xì)胞膜的內(nèi)側(cè)“泵”到外側(cè),是原核生物的另一大發(fā)明。 例如大腸桿菌就有一種氫酶叫Hyd-2,它含有4 個(gè)蛋白亞基,其中O 亞基和C 亞基彼此結(jié)合位于膜外,與氫分子反應(yīng)。A 亞基連接OC 和位于膜內(nèi)的B 亞基(圖2 左)。A 亞基含有4個(gè)轉(zhuǎn)移電子的鐵硫中心, 負(fù)責(zé)將電子傳遞到醌分子上,而B 亞基不含有任何電子轉(zhuǎn)移中心。 實(shí)驗(yàn)表明,位于膜內(nèi)且不含電子轉(zhuǎn)移中心的B 亞基具有“泵”氫離子的功能。 電子通過A 亞基時(shí)引起的蛋白形狀變化帶動(dòng)B 亞基的形狀變化,該形狀變化改變了蛋白質(zhì)分子中不同氨基酸側(cè)鏈結(jié)合氫離子的強(qiáng)度, 使得B 亞基可將氫離子從膜的一側(cè)“泵”到另一側(cè)。 許多(不是所有)脫氫酶都有此功能, 使各種還原性分子在還原醌分子時(shí)釋放的能量也能被生物所利用。
同樣, 氫醌被外來氧氣氧化時(shí)放出的能量很多,也需要將其盡量儲(chǔ)存。 氧的氧化還原電位為+0.82 V, 比硝酸鹽的+0.42 V 高近一倍, 用同樣的醌機(jī)制轉(zhuǎn)移氫離子,會(huì)造成很大的能量浪費(fèi)。為避免這種浪費(fèi), 生物將氫醌氧化的過程分為兩大步,由膜上的2 個(gè)蛋白復(fù)合物分別催化。第1 步,用“細(xì)胞色素bc1復(fù)合物”(cytochrome bc1complex)氧化氫醌,將電子傳遞給“細(xì)胞色素c”。 這一步能量轉(zhuǎn)化的機(jī)制仍然是氫醌氧化時(shí)轉(zhuǎn)移氫離子。 第2步,用細(xì)胞色素c 還原氧分子,能量轉(zhuǎn)化過程就不是通過醌分子(這里也沒有醌分子的參與),而是通過蛋白復(fù)合物形狀的變化“泵”氫離子。 催化該反應(yīng)的蛋白復(fù)合物稱為“細(xì)胞色素c 氧化酶”(cytochrome c oxidase)。 這樣, 氫醌被外來氧氣氧化時(shí)所釋放的能量,由2 個(gè)蛋白復(fù)合物分段轉(zhuǎn)化,用不同的機(jī)制建立跨膜氫離子梯度, 效率比單一的酶提高很多。
更重要的是,細(xì)胞色素bc1復(fù)合物,還與醌分子一起,成為光合作用電子傳遞鏈中的重要組成部分。但至此,只介紹了醌分子的構(gòu)造和作用,還沒有介紹還原和氧化醌的蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu),在光合作用中,光驅(qū)動(dòng)電子還原醌分子的蛋白質(zhì)也有類似的結(jié)構(gòu)。 為了更好地了解光合作用的分子機(jī)制,有必要先介紹傳遞電子的蛋白復(fù)合物的結(jié)構(gòu)。
(待續(xù))