王輝, 耿茜, 邵聰文, 劉洋, 郝穎, 尹珊珊, 張瑚, 謝建生
深圳市婦幼保健院醫(yī)學(xué)遺傳中心(廣東深圳 518000)
環(huán)狀染色體是指長臂和(或)短臂末端閉合成環(huán),伴或不伴有遺傳物質(zhì)的丟失,是一類較為罕見的染色體結(jié)構(gòu)異常,人類的所有染色體都可見環(huán)狀染色體,環(huán)狀染色體的發(fā)生概率是1/25 000。18號環(huán)狀染色體綜合征臨床表現(xiàn)呈現(xiàn)高度異質(zhì)性,主要臨床特征有智力障礙、短頸、肌張力低下、聽力障礙、足部畸形等。我們通過G顯帶核型分析和微陣列比較基因組雜交為1例23月大的18號環(huán)狀染色體患兒明確遺傳學(xué)診斷,并對其生長發(fā)育進行追蹤隨訪,進一步探討18號環(huán)狀染色體微缺失與臨床表型的關(guān)系。
1.1 一般資料 患兒,女,23月大,第1胎第1產(chǎn),2017年5月16日就診。目前身高79 cm,體重9 kg。因“胎心監(jiān)測異?!庇谀赣H孕38+周時剖宮產(chǎn),出生體重2 900 g,羊水Ⅲ度污染,Apgar 評分1 min 10分,2 min 10分。雙耳聽力篩查通過。生后行頭顱超聲及MRI提示雙側(cè)側(cè)腦室中度擴大,雙側(cè)側(cè)腦室旁片狀輕度回聲增強,考慮輕度腦積水。新生兒住院期間診斷為新生兒胎糞吸入綜合征,新生兒腦損傷,代謝性酸中毒,產(chǎn)瘤。抬頭翻身獨坐等均慢于同齡人。外貌前額飽滿,發(fā)際線高,雙眼距略寬,鼻骨低,雙耳耳廓飽滿,耳位略低。現(xiàn)仍不能獨走,需扶走,會發(fā)“爸爸”“媽媽”等簡單兩音節(jié)字語。無癲癇抽搐歷史。
追溯患兒產(chǎn)前情況:患兒母親本次妊娠末次月經(jīng)2015年11月20日,孕1產(chǎn)0,孕26周至32周胎兒超聲提示胎兒偏小1+周,孕31+周起胎兒超聲提示雙側(cè)側(cè)腦室增寬1.2 cm,后多次復(fù)查側(cè)腦室均逐漸增寬,至38周胎兒雙側(cè)側(cè)腦室逐漸增寬至1.6 cm。孕26周起,均建議孕婦行產(chǎn)前診斷及住院治療,孕婦均拒絕。孕38周時因羊水指數(shù)66 mm,予以收住院,入院胎監(jiān)異常,緊急行剖宮產(chǎn)術(shù)。
患兒出生后身高體重均位于同齡兒第10百分位線下。6月大仍不會翻身,行小兒神經(jīng)心理發(fā)育測驗報告提示智力量表粗分57分,發(fā)育指數(shù)<50,為發(fā)育遲滯;運動量表粗分20分,發(fā)育指數(shù)57,為發(fā)育遲滯。體格檢查未見明顯異常,綜合評價發(fā)育遲緩。6月大骨齡發(fā)育未見延遲。10月大MR提示腦髓鞘化未達到足月10月水平,雙側(cè)側(cè)腦室后角旁小片狀長T1長T2信號影。11月大行兒童神經(jīng)心理發(fā)育檢查提示大運動發(fā)育商36分, 屬于低下區(qū);精細動作發(fā)育商54分,屬于低下區(qū);適應(yīng)能力發(fā)育商81分,屬于偏低區(qū);語言發(fā)育商63分,屬于低下區(qū);社交能力90分,屬于偏低區(qū)。12月大查骨密度正常。21月大查兒童神經(jīng)心理發(fā)育檢查提示智齡7.2月大,發(fā)育商65,智商水平屬于低下,GESELL量表提示大運動相當7.93月齡,量分38分,屬重度發(fā)育遲緩;精細動作相當于14.47月齡大,量表70分,屬輕度發(fā)育遲緩;適應(yīng)性相當于13.53月齡,量分65分,屬輕度發(fā)育遲緩;語言相當于14.47月齡大,量分69分,屬輕度發(fā)育遲緩;個人-社交相當于13.3月齡,量分74分,屬輕度發(fā)育遲緩。
1.2 方法
1.2.1 染色體核型分析 外周血標本行染色體G顯帶核型分析:標本接種于培養(yǎng)瓶中,進行外周血細胞培養(yǎng)、中期染色體核型制備,使用Meta Systems 色體自動掃描分析系統(tǒng)對制備好的核型進行掃描和核型分析。至少計數(shù)分析30個分裂相。
1.2.2 微陣列比較基因組雜交 外周血標本基因組DNA 采用Gentra Puregene Blood Kit(Qiagen公司)試劑盒,按照說明書操作流程提取DNA,使用Nanodrop2000 蛋白核酸分析儀檢測DNA 濃度及純度,選取DNA 總量大于50 ng/μL,A260/A280 在1.8~2.0 之間, A260/A230>2.0的標本進行后續(xù)實驗:酶切,DNA標記,純化并定量。使用2.7M Cytoscan陣列(Affymetrix,USA)進行基因組雜交,掃描后應(yīng)用Affymetrix CytoScan 750K芯片平臺進行CNV分析。數(shù)據(jù)分析參考以下公共數(shù)據(jù)庫:DGV (http://projects.tcag.ca/variation/), DECIPHER (http://decipher.sanger.ac.uk/), ISCA (https://www.isca consortium.org/), UCSC(http://genome.ucsc.edu/),OMIM (http://www.ncbi. nlm.nih.gov/omim),ClinGen Dosage Sensitivity Map(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/dbvar/clingen/index.shtml)。
外周血核型為46,XX,r(18),核型分析提示為18號環(huán)狀染色體。共計數(shù)30個分裂相。外周血微陣列比較基因組雜交結(jié)果:arr[GRCH37]18q22.1 q23(63244135 _78013728)x1;18p11.32 (136227 _495923) x1; 提示18號染色體 q22.1q23缺失,約14.770Mb,包括CDH7…PARD6G共67個基因,其中30個為OMIM基因,為致病性CNV。18號染色體p11.32缺失,約360 kb,包括USP14、THOC1、COLEC12共3個基因,均為OMIM基因,為臨床意義未明CNV。見圖1。缺失區(qū)域覆蓋Chromosome 18q deletion syndrome (OMIM: #601808)臨床表型相關(guān)關(guān)鍵區(qū)域,該綜合征臨床表現(xiàn)呈現(xiàn)高度異質(zhì)性,主要臨床特征有智力障礙、短頸、肌張力低下、聽力障礙、足部畸形等。通過對該綜合征基因型與表型相關(guān)性研究發(fā)現(xiàn)存在以下幾個18q關(guān)鍵區(qū)域與患者表型相關(guān)聯(lián),包括腦白質(zhì)異常及髓鞘形成延遲(18q22.3-q23);生長激素不足(18q22.3-q23);先天性外耳道閉鎖(18q22.3);輕度智力低下(18q21.33-qter)等。
1962年, Lindsten 等和Wang 等首次報道了18號環(huán)狀染色體,環(huán)狀染色體發(fā)生機制:(1)1條染色體長臂和或短臂末端發(fā)生斷裂(斷裂點可發(fā)生在長臂短臂的任何部位),具有著絲粒的兩個黏性末端閉合成環(huán),有遺傳物質(zhì)丟失;而無著絲粒節(jié)段的兩個斷端相接成環(huán)則形成無著絲粒環(huán),這種環(huán)通常在細胞分裂時丟失。第二:染色體兩條臂均無缺失,末端閉合成環(huán),即染色體末端兩端粒的融合,無遺傳物質(zhì)的丟失,這種患者表型正常[1-2]。
A: 外周血染色體核型46,XX,r(18);B: 18號環(huán)狀染色體;C:CMA 結(jié)果圖
2003年,Ballif 首次描述了環(huán)狀染色體的斷端存在染色體的片段重復(fù),隨后Rossi 等[3]對環(huán)狀染色體研究總結(jié)約21%的環(huán)狀染色體,其斷裂端伴有染色體片段的重復(fù),且重復(fù)片段可為多拷貝的重復(fù)。
由于環(huán)狀染色體本身的復(fù)雜性(是否伴有缺失以及缺失片段的位置和大小,斷點處是否存在重復(fù)片段以及重復(fù)片段大小,是否伴有嵌合的染色體核型,以及環(huán)狀染色體本身的不穩(wěn)定性),因而環(huán)狀染色體的臨床表現(xiàn)多樣。
Carter 等[4]曾對30例18號環(huán)狀染色體患者進行遺傳學(xué)檢測及分析,并對18號環(huán)狀染色體進行了總結(jié),常見的臨床表現(xiàn)為神經(jīng)肌肉異常(肌力減退,小頭畸形,白質(zhì)異常,癲癇等),內(nèi)分泌及代謝異常(生長激素分泌不足,甲低,新生兒黃疸等),聽力異常(聽力損失,慢性中耳炎,聽覺閉鎖等),骨骼畸形(脊柱側(cè)彎,扁平足等),喂養(yǎng)困難(食物反流,吞咽困難等),視力異常(遠視斜視,視神經(jīng)發(fā)育不全,散光,弱視等),心臟畸形(肺動脈狹窄,房間隔缺損等),腭裂,呼吸困難等。同時總結(jié)了14例18號環(huán)狀染色體行為:無法表達想法和有效溝通,無法安全地執(zhí)行基本生活任務(wù), 容易分心,無法集中,社交能力差,無法與他人合作。
本文病例通過G顯帶和微陣列比較雜交分析兩種檢測方法,明確患兒為18號環(huán)狀染色體且伴有長臂和短臂末端缺失,且斷端不伴有重復(fù)。通過G顯帶技術(shù)可以發(fā)現(xiàn)環(huán)狀染色體結(jié)構(gòu)異常,但尚不明確其末端是否缺失以及缺失片段的大小,以及斷裂端是否伴有染色體的重復(fù)。微陣列比較基因組雜交分析檢測提示18號染色體長臂和短臂分別存在360 Kb和14.77 Mb的雜合缺失,不含有染色體片段的重復(fù),長臂短臂斷裂末端閉成環(huán)。符合18號環(huán)狀染色體的形成機制一。
患兒18號染色體長臂缺失14.770 Mb,包括CDH7至PARD6G共67個基因,其中30個為OMIM基因,為致病性CNV。缺失區(qū)域覆蓋Chromosome 18q deletion syndrome (OMIM: #601808)臨床表型相關(guān)關(guān)鍵區(qū)域,包括腦白質(zhì)異常及髓鞘形成延遲(18q22.3-q23);生長激素不足(18q22.3-q23);先天性外耳道閉鎖(18q22.3);輕度智力低下(18q21.33-qter)等。其中16q22.3區(qū)域有5個重要的基因:RTTN 基因,CYB5A基因,CTDP1基因,TXNL4A基因和TSHZ1基因。RTTN 基因純合突變或復(fù)合雜合突變可引起小頭畸形,身長矮小,多小腦回伴或不伴癲癇發(fā)作;CYB5A基因純合突變可引起高鐵血紅蛋白血癥和兩性生殖器;TSHZ1基因雜合突變可與先天性聽覺閉鎖相關(guān);CTDP1基因純合突變可引起面部畸形和神經(jīng)病變的先天性白內(nèi)障;TXNL4A基因純合突變或復(fù)合雜合突變引起B(yǎng)urn-McKeown綜合征,臨床表現(xiàn)為:患者智力正常,典型的顱面畸形[狹窄的瞼裂,高鼻梁,短人中短,唇裂和(或)上顎裂,大而突出的耳朵],感覺神經(jīng)性耳聾,心臟缺陷。
值得注意的是位于18q21.2的TCF4基因,該基因點突變或缺失可導(dǎo)致皮特霍普金斯綜合征,臨床表現(xiàn)為中度至重度智力運動障礙,呼吸急促,抽搐癲癇以及獨特的面部特征,包括薄眉毛,凹陷的眼睛,突出的鼻梁,高鼻梁,上唇明顯的雙曲線(丘比特的弓),寬嘴唇,嘴唇豐滿,間距寬牙齒,厚杯狀耳朵。環(huán)狀染色體缺失不伴有TCF4基因缺失則臨床表現(xiàn)為輕度智力障礙[5]。本文病例中患兒無皮特霍普金斯綜合征的特征面容,且目前智力障礙程度并未達到重度,其18號染色體缺失片段并未覆蓋該基因,初步判斷患兒預(yù)后智力不會達到嚴重障礙程度。
綜上所述,我們聯(lián)合G顯帶核型分析和微陣列比較基因組雜交技術(shù)對18號環(huán)狀染色體患兒明確了遺傳學(xué)診斷,確定了缺失位點和缺失片段,并對患兒生長發(fā)育進行追蹤隨訪,探討了基因型-臨床表型的關(guān)系,并對患兒后期的預(yù)后進行初步判斷。同時對患兒進行產(chǎn)前回顧分析,發(fā)現(xiàn)患兒母親在孕期即已經(jīng)出現(xiàn)相應(yīng)超聲異常,結(jié)合患兒生后情況,明確了產(chǎn)前診斷的重要性和必要性。