楊帥 劉琴 萬傳星
(新疆生產(chǎn)建設兵團塔里木盆地生物資源保護利用重點實驗室/塔里木大學生命科學學院,新疆阿拉爾843300)
放線菌素D(Actinomycin D)是上世紀40年代Waksman首次從微小鏈霉菌Streptomyces parvullus中分離得到的多肽類抗生素[1],具有抗菌、抗腫瘤、抗癌和抗病毒作用[2]。目前文獻報道產(chǎn)放線菌素D的菌株有微小鏈霉菌S.parvulus,哥斯達黎加鏈霉菌S.costaricanus,公牛鏈霉菌S.tauricus,灰紅鏈霉菌S.griseoruber,抗生鏈霉菌S.rubiginosohelvolus,銹赤蠟黃鏈霉菌S.rubiginosohelvolus,黃灰鏈霉菌S.flavogriseusNJ-4等[3-8]。黃色鏈霉菌Streptomyces luteusTRM 45540是本課題組分離自新疆羅布泊土壤的放線菌,其主要次生代謝產(chǎn)物為放線菌素D[9],前期命名為易變鏈霉菌Streptomyces mutabilisTRM 45540,后經(jīng)全基因組測序和多相分類鑒定為S.luteus[10]。啟動子插入或替代是提高抗生素產(chǎn)量的常用方法之一,如尹守亮等在龜裂鏈霉菌M4018宿主內(nèi)利用強啟動子過表達OtcR蛋白,使土霉素的產(chǎn)量提高到原來產(chǎn)量的4倍[11];周威等用紅霉素啟動子(ermE*P1)替換波卓霉素生物合成簇抗性基因btmA和前體肽合成基因btmD啟動子實現(xiàn)了波卓霉素的產(chǎn)量提高[12];陶立彬等利用PermE*啟動子提高了淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌豐加霉素的產(chǎn)量[13]。本實驗擬通過接合轉移方法將強啟動子A4隨機插入整合在黃色鏈霉菌Streptomyces luteusTRM 45540基因組上,考察其對放線菌素D產(chǎn)量的影響。
2.1.1 菌株、質粒和培養(yǎng)基
黃色鏈霉菌 TRM 45540(Streptomyces luteus)菌株,由新疆生產(chǎn)建設兵團塔里木盆地生物資源保護利用重點實驗室提供。
質粒pSET152和大腸桿菌Escherichia coliS17-1,均由華中農(nóng)業(yè)大學劉琴博士提供。
LB培養(yǎng)基(1 L):胰蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,NaCl 10 g,pH 7.0;
ISP4培養(yǎng)基 (1 L):可溶性淀粉 10 g,K2HPO41 g,MgSO4·7 H2O 1.0 g,(NH4)2SO44.0 g,CaCO31.0 g,瓊脂粉 18 g,pH 7.0~ 7.5;
燕麥-豆粉培養(yǎng)基(1 L):燕麥片30.0 g,大豆粉15.0 g,NaCl 19.0 g,K2HPO41.5 g,MgSO4.7H2O 2.5 g;
Modified-ISP4(1 L):可溶性淀粉 10 g,K2HPO41.0 g,NaCl 1.0 g ,(NH4)2SO42.0 g,CaCO32.0 g,酵母提取物0.5 g,蛋白胨1 g,MgSO4.7H2O 1.0 g,無機鹽溶液 1 mL/L,瓊脂20 g;無機鹽溶液:FeSO41 g/L,MnCl21 g/L,ZnSO41 g/L,使用前溶化后添加MgCl2至終濃度為10 mM。
2.1.2 主要儀器和試劑
儀器:潔凈工作臺(Air Tech型,上海博訊實業(yè)有限公司);恒溫搖床(HYG-A型,太倉市實驗設備廠);高效液相色譜儀(LC-20AT型,日本島津公司),配有二元梯度泵和SPD-20A紫外檢測器。色譜柱:C18柱(Inertsil ODS-SP 4.6 mm×250 mm,5 μm)。
試劑:阿伯拉抗生素、萘啶酮酸購自北京索萊寶科技有限公司,PCR用相關試劑購自北京康為世紀生物科技有限公司,放線菌素D(純度大于99.0%)由本實驗室分離鑒定,其余試劑購自國藥集團。
2.2.1 大腸桿菌Escherichia coliS17-1感受態(tài)的制備及DNA轉化
感受態(tài)細胞的制備:(1)挑取平板上的E.coliS17-1單菌落于5 mL LB培養(yǎng)基內(nèi),37℃,220 r/min,16 h;(2)將過夜培養(yǎng)的菌液按1%的接種量轉入含50 mL LB三角瓶中,37℃,220 r/min,培養(yǎng)2.5 h左右,直至OD=0.6 ;(3)收集菌體,5 000 r/min,10 min;(4)加入25 mL TFBI重懸菌體,5 000 r/min,4 min,棄上清;(5)在菌體中加入2 mL TFBII重懸菌體,并分裝100 μL/離心管,放于-80 ℃儲存?zhèn)溆谩?/p>
DNA的轉化:從-80℃取一支100 μL感受態(tài)細胞在冰上放置5 min,加入5 μL酶連產(chǎn)物或2 μL質粒,繼續(xù)在冰上放置30 min。37℃熱激2 min或42℃熱激90 s,然后在冰上放置5 min。加入1 mL LB培養(yǎng)基,在37℃搖床中以200 r/min培養(yǎng)45 min。5 000 r/min離心3 min,倒掉大部分上清,用余下的上清將沉淀懸浮。涂布加有相應抗性的平板,37℃培養(yǎng)箱過夜培養(yǎng)。
2.2.2 轉化子的構建
以質粒pLQ 007+A4為模板擴增A4片段,擴增啟動子A4引物序列為:
引 物 pA4up:AAAAGGATCCGACACATCCTCCAGCTGAG
引物 pA4down:AAAATCTAGAGGACCACCAGTAAGAGCTGCGA
凝膠回收A4片段,用XbaI+BamHI酶切回收A4片段,提取pSET152的質粒DNA,用XbaI+BamHI酶切質粒DNA,脫磷處理后與A4片段進行連接;然后轉入E.coliS17-1感受態(tài)細胞中,形成轉化子pYS001(圖1).
圖1 pYS001質粒構建圖譜
2.2.3 接合子的構建
將pYS001接種在10 mL LB(Apr)培養(yǎng)基中,37℃,16 h;轉接培養(yǎng)了16 h的轉化子,以1%的接種量接種到新鮮的LB(Apr)培養(yǎng)基中,37℃,培養(yǎng)2.5-3 h,直至OD=0.6(600 nm);取新鮮的孢子懸液100 μL,用TSB清洗3次,5 000 r/min,4 min;完成后加入100 μL TSB懸浮,55 ℃,10 min,37 ℃,3 h;將重新轉接的轉化子懸液,收集2次,12 000 r/min,1 min,用 LB 清洗 3 次,5 000 r/min,4 min,加入100 μL LB,于 100 μL 的孢子懸浮液混勻,放置5 min,將共培養(yǎng)的產(chǎn)物涂布于Modified-ISP4平板中,30℃培養(yǎng)12~14 h;對平板進行抗生素覆蓋處理,覆蓋抗生素溶液配方為1 mL超純水、25 μL Nal、25 μL Apr。置于操作臺吹干后,30 ℃,培養(yǎng)5~7 d。一周后挑取單菌落進行純化培養(yǎng),提取接合子和TRM 45540菌株的總DNA,PCR驗證A4片段是否成功導入TRM 45540體內(nèi)。
2.2.4 轉化子質粒的雙酶切驗證
將提取的轉化子質粒DNA,使用HindIII和BamHI進行酶切驗證,體系如下:DNA 5 μL,10×fast Didest buffer 2 μL,HindIII 1 μL,BamHI 1 μL,ddH2O 11 μL。
2.2.5 轉化子和接合子PCR驗證
反應體系(20 μL):上游引物(10 μM)0.5 μL;下游引物(10 μM)0.5 μL;模版(約 30 ng/μL)0.5 μL;Buffer(10μL,含 Mg2+)2 μL;dNTPs(2.5 mM)2 μL;DNA 聚合酶(5 U/μL)0.5μL;ddH2O 14 μL。
PCR反應程序:預變性,95℃,10 min;變性94 ℃,30 s;復性,58 ℃,30 s;延伸,72 ℃,1 min。變性-復性-延伸,循環(huán)30次;終延伸72℃,10 min。
2.2.6 菌株培養(yǎng)發(fā)酵及前處理流程
采用ISP4培養(yǎng)基制備接合子菌株S.luteusTRM 45540::pYS001和野生菌株S.luteusTRM 45540種子液,裝液量150 mL/瓶、28℃、180 r/min搖床培養(yǎng)3天后,按4%接種量接種到燕麥-豆粉培養(yǎng)基中發(fā)酵,裝液量150 mL/瓶、28℃、180 r/min的搖床培養(yǎng)7天。每隔24 h取5 mL發(fā)酵液,50℃烘干后甲醇反復提取,定容到5 mL進行高效液相色譜(HPLC)檢測分析。
2.2.7 HPLC法檢測放線菌素D含量[14]
放線菌素D標準品配制成濃度為10.0 mg/mL的母液,倍性稀釋成系列濃度,HPLC流動相為0~40 min,10%~100%甲醇,流速為1 mL/min,進樣量為10 μL,柱溫35℃,檢測波長為443 nm,制作標準曲線如圖2。放線菌素D的標準曲線回歸方程為 y=(1.687 6×10-6)x+0.038 9,方程中x是峰面積,y是放線菌素D含量,R2值為0.999 6,放線菌素D的含量與峰面積呈良好線性關系,可用于放線菌素D的含量分析。
圖2 放線菌素D的HPLC標準曲線
提取轉化子pYS001質粒,利用XbaI+BamHI雙酶切,酶切產(chǎn)物葡聚糖凝膠電泳圖參見圖3。由圖3可知,轉化子pYS001質粒中含有A4片段。
圖3 轉化子pYS001質粒的雙酶切驗證
提取轉化子pYS001總DNA并以其為模板,利用啟動子A4(524bp)的一對引物pA4up與pA4down進行 PCR,所用 PCR條件為 94,10 min;94 ℃,30 s;58 ℃,30 s;72 ℃,1 min;30個循環(huán);72 ℃,10 min。將PCR產(chǎn)物進行葡聚糖凝膠電泳分析(參見圖4),結果顯示轉化子pYS001的PCR產(chǎn)物中含有A4片段,表明轉化成功。
圖4 轉化子pYS001 PCR產(chǎn)物驗證
對接合轉移獲得的接合轉移子進行阿伯拉抗生素(Apr)和萘啶酮酸(Nal)篩選,獲得穩(wěn)定遺傳的接合子S.luteusTRM 45540::pYS001,以接合子總DNA為模板,利用啟動子A4(524 bp)的一對引物pA4up與pA4down進行PCR擴增,PCR產(chǎn)物經(jīng)凝膠電泳分析(參見圖5),結果表明啟動子A4成功導入接合子中并能穩(wěn)定遺傳。
圖5 接合子S.luteusTRM 45540::pYS001中啟動子A4的PCR驗證
接合子S.luteusTRM 45540::pYS001和野生菌株TRM 45540經(jīng)燕麥-豆粉培養(yǎng)基發(fā)酵7 d后進行放線菌素D的HPLC分析和含量動態(tài)檢測(如圖6、圖7所示),接合子S.luteusTRM 45540::pYS001發(fā)酵7d后產(chǎn)放線菌素D的量為821.8 mg/L,明顯高于原始菌株TRM 45540放線菌素D的產(chǎn)量(647.6 mg/L),說明啟動子A4促進了黃色鏈霉菌TRM 45540產(chǎn)放線菌素D的產(chǎn)量。
圖6 S.luteusTRM 45540與S.luteusTRM 45540::pYS001發(fā)酵產(chǎn)物443nm波長下HPLC圖
圖7 S.luteusTRM 45540與S.luteusTRM 45540::pYS001產(chǎn)放線菌素D的曲線
放線菌素D(又稱更生霉素)是具有抗菌、抗病毒、抗腫瘤等多種活性的酯環(huán)肽類抗生素,其作用機理為嵌合于DNA雙鏈內(nèi),抑制DNA依賴的RNA聚合酶活性,干擾細胞的轉錄,從而抑制mRNA合成,盡管由于其毒性較高限制了放線菌素D的使用,但放線菌素D卻是治療霍奇金病、神經(jīng)母細胞瘤、絨毛膜上皮癌和橫紋肌肉瘤等惡性腫瘤的特效藥,還可提高腫瘤對放射治療的敏感性,臨床上有一定的需求,所以一直有放線菌素D高產(chǎn)菌株的報道,如灰紅鏈霉菌Streptomyces griseoruber放線菌素D的產(chǎn)量為210 mg/L[15],紅樹林鏈霉菌Stremptmeces costaricanus產(chǎn)量報道為 300 mg/L[16];兩株耐堿放線菌Streptomyces sindenensis放線菌素D的產(chǎn)量分別為120 mg/L和850 mg/L[17],黃灰鏈霉菌Streptomyces flavogriseusNJ-4放線菌素D的產(chǎn)量最高,為960 mg/L[18]。本實驗通過接合轉移的策略,導入強啟動子A4對TRM 45540進行分子改造,使黃色鏈霉菌S.luteusTRM 45540放線菌素D的產(chǎn)量提高到821.8 mg/L,在放線菌素D的制備上具有一定的應用潛能。