□ 劉彥泓 楊 滴 大連市檢驗檢測認證技術服務中心
能力驗證已經成為實驗室質量控制的常用方法之一,其在確定實驗室檢測或校準能力方面具有不可替代的作用。中國合格評定國家認可委員會(CNAS)要求已認可的實驗室和申請認可的實驗室必須參加能力驗證活動。轉基因抗草甘膦除草劑(Roundup Ready? )大豆(即轉基因大豆GTS-40-3-2)是目前種植面積和產量都很高的轉基因作物,實驗室開展此項目的檢測能力驗證,既可以提高實驗室的檢測技術能力與水平,也有利于提高實驗室對轉基因大豆進行監(jiān)管的能力。
轉基因大豆GTS40-3-2樣品:中檢院NIFDC-PT-136豆粉中大豆轉基因成分測定能力驗證陽性樣品。
DNA提取試劑盒(Magnetic DNA Purif ication System For Food),購自Promega公司;PCR反應試劑盒TaKaRa Ex Taq? DNA Polymerase、Premix Ex Taq ? (Probe qPCR),購自Takara Bio公司。
引物及探針購自Takara Bio公司,引物及探針序列見SN/T1195-2003[1]和GB/T19495.5-2018[2]。
采用Promega公司Magnetic DNA Purif ication System For Food試劑盒說明書進行提取。
Ex Taq 0.25 μL,10×Ex Taq Buf fer 5 μL,dNTP 4 μL,引物(10 μmol/L)各 1 μL,DNA(50 ng/μL)2 μL, 補水至50 μL。PCR擴增條件:94 ℃下5 min;94 ℃下 30 s,54 ℃下 40 s,72 ℃下60 s,40個循環(huán);最后一次循環(huán)中,72 ℃下7 min。擴增結束后,對產物進行電泳,并記錄結果。
反應緩沖液10 μL,引物(10 μmol/L)各 1 μL, 探 針(10 μmol/L)1 μL,DNA(50 ng/μL)1 μL, 補 水 至 20 μL。擴增條件95 ℃保持10 min;95℃保持1 min,60 ℃保持30 s(讀取熒光),40個循環(huán)。擴增結束后,對產物進行電泳,并記錄結果。
每個PCR反應均設置2個平行實驗,并設置空白對照、陽性對照和陰性對照。
ABI實時熒光PCR儀(型號為QuantStudio 7Flex),購自賽默飛世爾科技有限公司;ABI PCR儀(型號為VERITI),購自賽默飛世爾科技有限公司。
內源基因Lectin與外源基因CaMV35S、NOS、CP4 EPSPS的檢測結果均為陽性,其PCR產物大小與預期大小基本一致,空白對照、陽性對照和陰性對照均符合要求,判定此樣品為轉基因大豆GTS40-3-2陽性。電泳結果見圖1。
圖1 PCR檢測結果
內源基因Lectin和GTS40-3-2品系特異基因檢測結果均為陽性,空白對照、陽性對照和陰性對照均符合要求,判定此樣品為轉基因大豆GTS40-3-2陽性。擴增圖見圖2。
筆者所在實驗室作為中檢院NIFDC-PT-136豆粉中大豆轉基因成分測定項目的技術合作實驗室,在樣品制備、樣品轉基因成分定性檢驗、樣品均勻性及穩(wěn)定性檢驗等基礎性研究上做了大量的工作。對于轉基因大豆能力驗證樣品的檢驗,總結出幾點需要注意的地方。
圖2 實時熒光PCR檢測結果
能力驗證發(fā)放的樣品一般為陰性和陽性樣品均有。由于樣品是經過粉碎過篩的大豆粉,其粉塵容易飄散,取樣過程不規(guī)范可造成不同樣品之間的污染。目前轉基因成分檢測方法中,PCR檢測方法的應用最為廣泛[3]。PCR檢測的優(yōu)點是靈敏度高、操作簡便、快捷;缺點是操作不當容易造成污染,產生假陽性結果。PCR擴增時最主要的污染源是擴增產物,PCR擴增的終產物容易飛濺或形成氣溶膠,對實驗室環(huán)境、試劑、設備和衣物等造成污染[4]。因此檢測過程中避免污染非常重要。為保證結果準確,參加測試的實驗室應該在實驗室區(qū)域劃分、檢測過程質量控制等方面遵循規(guī)范性標準要求。核酸檢測實驗室應劃為5個區(qū):試劑配制和貯存區(qū)、樣品制備區(qū)、PCR反應配制區(qū)、擴增區(qū)和擴增產物分析區(qū)。做好清潔消毒工作:定期對實驗室進行消毒,用75%的酒精擦拭移液器等小型設備;經常擦洗臺面、地面,做好衛(wèi)生工作;加強實驗室空氣與大氣空氣的置換,從而凈化實驗室空氣;經常對實驗室進行長時間紫外燈照射,滅活空氣中的游離核酸片段。另外在實驗過程中應按標準要求設置陽性對照、陰性對照和空白對照,反映檢測過程是否存在污染。
模板的濃度和純度對目的基因的檢測來說是較為重要的[5]。通過紫外分光光度計可以測定模板DNA的濃度,并計算A260nm/A280nm的比值,在1.7~2.0比較好。通常情況下,建議PCR反應體系中模板的添加量為50~100 ng。
目前現行有效的涉及轉基因大豆檢測方法的標準有很多:GB/T 19495.4-2018、SN/T 1195-2003、SN/T 1204-2016、SN/T 2668-2010、SN/T 1202-2010、NY/T 675-2003 及SN/T 1201-2014等。建議實驗室選擇本實驗室常用的檢驗方法進行檢驗。同時建議選擇兩種以上的方法進行比較后,得出結論。