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光鑷捕獲單個(gè)上轉(zhuǎn)換發(fā)光微納復(fù)合物顆粒對(duì)鏈置換反應(yīng)引發(fā)解組裝過程的實(shí)時(shí)探測(cè)

2019-08-30 08:35:26宋重陽康亞峰李誠(chéng)予龐代文唐宏武
分析科學(xué)學(xué)報(bào) 2019年4期
關(guān)鍵詞:復(fù)合物孵育激光

宋重陽,康亞峰,李誠(chéng)予,龐代文,唐宏武

(生物醫(yī)學(xué)分析化學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,武漢大學(xué)化學(xué)與分子科學(xué)學(xué)院,湖北武漢430072)

自1986年Ashkin發(fā)明光鑷以來[1],這一操縱微粒的工具得到了廣泛的應(yīng)用。一些研究者應(yīng)用光鑷捕獲各種各樣的納米顆粒,例如金納米粒子(AuNPs)[2]、量子點(diǎn)(QDs)[3]、上轉(zhuǎn)換納米顆粒(UCNPs)[4-5]、DNA納米復(fù)合物[6]等,用來研究納米材料和結(jié)構(gòu)的光物理和光化學(xué)性質(zhì)等問題[3,5]。UCNPs具有近紅外激發(fā)、可見光發(fā)射的特點(diǎn),在生物分子檢測(cè)[7]、細(xì)胞標(biāo)記[8]、活體成像[9]等領(lǐng)域得到廣泛的應(yīng)用。Jaque等人基于光鑷捕獲UCNPs,研究了UCNPs的發(fā)光性質(zhì)[5],以及尺寸和表面電荷對(duì)光阱力的影響[10],并操縱單顆UCNPs考察了單細(xì)胞光熱效應(yīng)[11]。

鏈置換反應(yīng)(Strand Displacement Reaction)是動(dòng)態(tài)DNA納米技術(shù)(Dynamic DNA Nanotechnology)研究的核心。其中Toehold,即進(jìn)攻鏈(Invader strand)與之結(jié)合后引發(fā)分支遷移的單鏈DNA片段,可用于改變鏈置換反應(yīng)的速率,進(jìn)而構(gòu)建具有復(fù)雜動(dòng)力學(xué)行為的無酶DNA反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)[12-13]。一些研究者利用Toehold介導(dǎo)的鏈置換反應(yīng),結(jié)合生物功能化納米材料,構(gòu)建納米生物傳感器用于DNA/RNA的傳感和檢測(cè)。Sun等人[14]利用金納米棒、金納米十字架構(gòu)建熒光共振能量轉(zhuǎn)移-表面熒光增強(qiáng)類型的納米傳感器,實(shí)現(xiàn)miRNA-34a的靈敏檢測(cè)和細(xì)胞內(nèi)成像。Li等人[15]構(gòu)建衛(wèi)星式納米金復(fù)合物,探究Toehold介導(dǎo)的鏈置換反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)行為,并將其應(yīng)用于活細(xì)胞內(nèi)miRNA-21的實(shí)時(shí)檢測(cè)。

我們?cè)Y(jié)合光鑷技術(shù)和微球懸液分析方法,實(shí)現(xiàn)了腫瘤標(biāo)志物分子的體外檢測(cè)[7]。在此基礎(chǔ)上,本文結(jié)合核酸鏈置換反應(yīng)和發(fā)光穩(wěn)定的UCNPs,構(gòu)建可以對(duì)DNA進(jìn)行響應(yīng)的上轉(zhuǎn)換發(fā)光的微納復(fù)合物(Micro-Nano Composites,MNCs),并采用光鑷輔助的顯微成像平臺(tái)實(shí)時(shí)探測(cè)單顆MNCs的解組裝過程,希望未來本方法能夠應(yīng)用于生物體系中生物分子的實(shí)時(shí)檢測(cè)。

1 實(shí)驗(yàn)部分

1.1 儀器與試劑

IX70型倒置熒光顯微鏡(日本,Olympus Ltd);Evolve 512Delta型電子倍增電荷耦合器件(EMCCD)(加拿大,Photometrics Ltd);980nm連續(xù)激光器(上??颇颂丶す饪萍加邢薰荆?;ZS90型動(dòng)態(tài)光散射粒度儀(英國(guó),Malvern Instruments Ltd.);JEM-2010型透射電子顯微鏡鏡(日本,JEOL Ltd);SIGMA FESEM型掃描電子顯微鏡(德國(guó),Zeiss)。

稀土氯化物(LnCl3·6H2O)、Y(NO3)3·6H2O、NH4F、油酸(OA)、十八烯、2-(N-嗎啡啉)乙磺酸(Mes)、4-羥乙基哌嗪乙磺酸(Hepes),均購于上海阿拉丁公司;聚丙烯酸(PAA)、馬來酸酐十八碳烯共聚物(PMAO)、三羥甲基氨基甲烷(Tris),均購于Sigma-Aldrich(中國(guó)上海);雙(6-氨基己基)胺(BHMT)購于上海TCI;NaOH、NaF、NaCl、氯仿、乙醇、正己烷、甲醇、一縮二乙二醇等購于國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;碳二亞胺鹽酸鹽(EDC)購于上海共價(jià)化學(xué);羥基-PEG2000-氨基、生物素-PEG2000-氨基購于上海芃碩生物科技有限公司;色譜純鏈酶親和素(SA)和DNA購于上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司,見表1。實(shí)驗(yàn)用水為超純水。

表1 實(shí)驗(yàn)所用核酸序列Table 1 DNA Sequences used in this study

1.2 PMAO-UCNPs的制備

采用高溫?zé)崃呀夥ㄖ苽溆腿苄?UCNPs[16]。將1mmol稀土氯化物(Y/Yb/Er,78%/20%/2%)置于100mL三口燒瓶中,加入6mL OA和15mL十八烯,磁力攪拌和真空環(huán)境下升溫至120℃,保持120℃一段時(shí)間直至氯化物溶解。降溫至50℃以下,加入10mL NH4F(148mg)和NaOH(100mg)的甲醇溶液并攪拌30min,然后升溫至110℃將甲醇蒸出,隨后氬氣保護(hù)下升溫至320℃并保持此溫度反應(yīng)1h。反應(yīng)結(jié)束后,用水和乙醇的混合溶液(1∶1,V/V)、乙醇和正己烷(5∶11,V/V)的混合溶液分別洗滌3次,最后將得到的固體物質(zhì)分散于8mL氯仿中,即得OA包覆的上轉(zhuǎn)換納米顆粒(OA-UCNPs)。

OA-UCNPs的水溶性修飾采用兩親性聚合物PMAO包覆的方法[17]。稱取500mg的PMAO,置于100mL單口圓底燒瓶中,加入20mL氯仿攪拌溶解。加入1mL上述制備的OA-UCNPs,超聲5min,室溫下攪拌2h后,減壓旋蒸除去氯仿。再加入10mL氯仿溶解分散,磁力攪拌下逐滴加入1mL的BHMT(30mg)的氯仿溶液,水浴超聲30min后,減壓旋蒸除去氯仿。加入12mL Na3BO3溶液(50mmol/L,pH=9),于65℃水浴超聲將凝膠狀聚合物溶解。將所得的溶液于8 000r/min離心3min,棄去離心下來的團(tuán)聚物,上清液用0.45μm濾膜過濾后,于16 000r/min離心30min,將離心下來的固體用水洗滌3次,最后分散于1mL水中,即得水溶性上轉(zhuǎn)換納米顆粒PMAO-UCNPs。

1.3 PAA-MPs的制備

采用水熱法制備 NaYF4-MPs[18]。將0.0016mol Y(NO3)3·6H2O 置于50mL水熱反應(yīng)釜中后,用8mL水溶解,加入5mL檸檬酸鈉溶液(0.0016mol),磁力攪拌30min;加入18mL NaF溶液(0.0128mol)繼續(xù)攪拌1h后,將水熱釜加熱至220℃反應(yīng)12h,冷卻至室溫,依次用水、乙醇各洗滌3次后,分散于4mL乙醇中。MPs的表面修飾采用PAA配體交換的方法[19]。將200mg的PAA置于50mL三口燒瓶中,加入10mL一縮二乙二醇溶解,磁力攪拌下,逐滴加入1mL上述制備的MPs乙醇懸浮液,于水浴中超聲分散30min,磁力攪拌下升溫至120℃蒸出乙醇,在氬氣保護(hù)下升溫至240℃并持續(xù)攪拌4h。反應(yīng)結(jié)束后,依次用乙醇和水各洗滌3次,最后分散于1mL水中,即得PAA-MPs懸浮液。

1.4 Capture-MPs的制備

取20μL上述制備的 MPs懸浮溶液,加入30μL NH2-DNA(10μmol/L),混合均勻后加入10μL新配的EDC溶液(10mg/mL),混勻后置于旋轉(zhuǎn)混勻儀上反應(yīng)過夜,3 000r/min離心分離,并用Tris-HCl緩沖溶液(50mmol/L,pH=8.0,200mmol/L NaCl)洗滌3次,再分散于50μL的 Hepes緩沖溶液(10mmol/L,pH=7.4,200mmol/L NaCl)中,4℃下保存?zhèn)溆谩?/p>

1.5 SA-UCNPs的制備

取100μL制備的水溶性上轉(zhuǎn)換納米顆粒PMAO-UCNPs,依次加入100μL Mes緩沖溶液(10mmol/L,pH=6.1),10μL羥基-PEG2000-氨基(100mg/mL),10μL生物素-PEG2000-氨基(0.1mg/mL),混合均勻后加入10μL現(xiàn)配的EDC溶液(1mg/mL),室溫下反應(yīng)過夜。反應(yīng)結(jié)束后,16 000r/min離心30min,用 Hepes緩沖溶液(10mmol/L,pH=7.4,200mmol/L NaCl)洗滌3次,分散于200μL Hepes緩沖溶液中,加入2μg SA,于25℃孵育12h,用Hepes洗滌3次后,分散于200μL Hepes中,4℃下保存?zhèn)溆谩?/p>

1.6 MNCs的制備

取濃度均為10μmol/L的sDNA和cDNA各10μL,于25℃孵育2h,得到20μL的Duplex溶液(5μmol/L),置于4℃下保存?zhèn)溆?。將Capture-MPs和1nmol/L的Duplex孵育4h,Hepes(10mmol/L,pH=7.4,200mmol/L NaCl,1%BSA)洗滌3次后,加入SA-UCNPs孵育16h,Hepes洗滌3次,再分散于Hepes中,4℃下保存?zhèn)溆谩?/p>

1.7 鏈置換反應(yīng)引發(fā)MNCs解組裝

在上述制備的 MNCs懸浮液中加入不同濃度的Invader strand(10nmol/L、1nmol/L、0.1nmol/L、0nmol/L),混勻后于25℃旋轉(zhuǎn)振蕩反應(yīng)12h。取10μL樣品置于顯微成像樣品室中,以100×油鏡觀察,10mW激光形成光鑷捕獲單顆微納復(fù)合物,EMCCD采集顯微照片并記錄上轉(zhuǎn)換發(fā)光信號(hào)的強(qiáng)度(曝光時(shí)間50ms,增益2)。

1.8 實(shí)時(shí)探測(cè)光阱中MNCs的解組裝

將上述制備的MNCs懸浮液稀釋20倍,然后取10μL分別加入10μL不同濃度的Invader strand(2 000nmol/L、200nmol/L、20nmol/L、2nmol/L、0nmol/L),混勻后,立即加入顯微成像樣品室中,光鑷捕獲后觀察發(fā)光強(qiáng)度的變化,每一濃度測(cè)定5個(gè)MNCs。

2 結(jié)果與討論

2.1 實(shí)時(shí)探測(cè)MNCs解組裝的原理

如圖1所示,構(gòu)建的MNCs以鏈置換反應(yīng)的底物為連接單元和分子識(shí)別單元,NaYF4微米顆粒為載體,UCNPs為發(fā)光標(biāo)記材料。Invader strand存在時(shí),引發(fā)鏈置換反應(yīng),MNCs發(fā)生解組裝。單顆MNCs被捕獲時(shí)解組裝過程在光阱中進(jìn)行,通過顯微成像平臺(tái)實(shí)現(xiàn)對(duì)該過程的實(shí)時(shí)探測(cè)。

圖1 實(shí)時(shí)探測(cè)鏈置換引發(fā)MNCs解組裝的示意圖Fig.1 Schematic illustration of real-time detection of the disassembling process of MNCs induced by strand displacement

2.2 UCNPs的制備

圖2 A(a)為OA-UCNPs的透射電鏡(TEM)圖片,該納米顆粒粒徑均一(22.9±1.5nm)。制備得到的PMAO-UCNPs(圖2A(b))和OA-UCNPs相比,其形貌沒有明顯變化,但是其表面有一層聚合物包覆層,厚度約為2nm。動(dòng)態(tài)光散射測(cè)試結(jié)果(圖2B、2C)表明,偶聯(lián)PEG之后UCNPs的水合粒徑由27nm增加到30nm,Zeta電勢(shì)由-30mV變?yōu)椋?5mV,證明UCNPs表面偶聯(lián)上PEG分子。然后將SA和PEG末端的生物素結(jié)合,制備得到SA-UCNPs。

圖2 (A)OA-UCNPs(a)和PMAO-UCNPs(b)的透射電鏡(TEM)圖(標(biāo)尺100nm,插入圖中標(biāo)尺25nm);(B)PMAO-UCNPs和PEG-UCNPs的動(dòng)態(tài)光散射粒徑測(cè)試結(jié)果;(C)PMAO-UCNPs和PEG-UCNPs的動(dòng)態(tài)光散射Zeta電勢(shì)測(cè)試結(jié)果Fig.2 (A)TEM images of OA-UCNPs(a)and PAMO-UCNPs(b)(scale bar 100nm,insert scale bar 25nm);(B)DLS sizes of PMAO-UCNPs and PEG-UCNPs;(C)DLS zeta potentials of PMAO-UCNPs and PEG-UCNPs

2.3 PAA修飾的NaYF4微米顆粒(PAA-MPs)的制備

圖3 A為MPs的掃描電鏡(SEM)圖,由圖可見MPs為規(guī)則的正六邊型盤狀晶體,尺寸均一,平均直徑為1.17±0.07μm,平均厚度為0.67±0.05μm。我們用PAA對(duì)MPs的表面進(jìn)行修飾,在MPs表面引入羧酸官能團(tuán),Zeta電勢(shì)測(cè)試結(jié)果證明PAA成功修飾在MPs表面(圖3B)。

圖3 (A)MPs的掃描電鏡(SEM)圖(標(biāo)尺5μm);(B)MPs和PAA-MPs的動(dòng)態(tài)光散射(DLS)Zeta電勢(shì)Fig.3 (A)SEM image of MPs(scalebar 5μm);(B)DLS zeta potentials of MPs and PAA-MPs

2.4 MNCs的制備

UCNPs在MPs表面的組裝通過Duplex的連接實(shí)現(xiàn),詳細(xì)步驟如圖4A所示。首先PAA-MPs表面偶聯(lián)NH2-DNA,制備得到Capture-MPs,然后通過異相DNA雜交將Duplex固定到MPs表面,最后通過SA與biotin的結(jié)合,將SA-UCNPs組裝在MPs表面,從而得到MNCs。根據(jù)SEM圖(圖4B),UCNPs已成功組裝到MPs表面。

圖4 (A)MNCs的制備流程圖;(B)MNC的SEM圖Fig.4 (A)Schematic illustration of the preparation of MNCs;(B)SEM image of MNCs

2.5 單個(gè)MNCs的光學(xué)捕獲

我們通過對(duì)商品化的倒置熒光顯微鏡進(jìn)行改造來搭建光鑷平臺(tái),其光路如圖5A所示。圖5B為EMCCD拍攝的單顆MNCs進(jìn)入光阱被捕獲的過程。MNCs在極短時(shí)間內(nèi)即可被穩(wěn)定捕獲,MNCs處于光阱邊緣位置時(shí)發(fā)光微弱,穩(wěn)定捕獲后發(fā)光大大增強(qiáng)。這是因?yàn)楣廒鍍?nèi)的激光功率密度可以達(dá)到106W/cm2,雖然UCNPs量子產(chǎn)率較低,但仍然可以發(fā)出明亮的熒光。

圖5 (A)光鑷輔助的顯微成像平臺(tái);(B)單顆MNCs的捕獲過程Fig.5 (A)Optical tweezers-assisted imaging plateform;(B)Trapping process of single MNCs

水分子在980nm波長(zhǎng)處有較大吸收[4],如果產(chǎn)生的熱量過多,將會(huì)造成光阱(激光焦點(diǎn)處)內(nèi)溶液的溫度過高,會(huì)影響微納復(fù)合物中起連接作用的DNA Duplex的穩(wěn)定性,使其解鏈的可能性增加(圖6A)。如圖6B所示,激光功率為50mW時(shí)光阱中單顆MNCs的發(fā)光強(qiáng)度隨時(shí)間逐漸減弱,以10mW的激光功率捕獲MNCs的同時(shí)連續(xù)激發(fā)30min,MNCs的發(fā)光強(qiáng)度也沒有明顯變化,說明10mW激光不影響MNCs的穩(wěn)定性。為了避免過熱效應(yīng)對(duì)微納復(fù)合物穩(wěn)定性的不利影響,我們采用10mW的激光捕獲MNCs。

圖6 (A)過熱導(dǎo)致MNCs解組裝的示意圖;(B)不同功率激光對(duì)MNCs發(fā)光的影響Fig.6 (A)Scheme of the disassembly process of MNCs caused by overheating;(B)Influence of different powers on the luminescence of MNCs

2.6 鏈置換反應(yīng)引發(fā)微納復(fù)合物解組裝

Invader strand首先與sDNA的Toehold結(jié)合,然后經(jīng)過分支遷移,將cDNA置換下來,cDNA和sDNA分開,與sDNA連接的UCNPs脫離 MPs。如圖7所示,在MNCs懸液中加入不同濃度的Invader strand孵育12h,MNCs的發(fā)光強(qiáng)度有不同程度減弱,濃度越高信號(hào)變化越大。低至100pmol/L的濃度即可產(chǎn)生顯著的信號(hào)變化,因此MNCs可應(yīng)用于DNA的檢測(cè)。

2.7 微納復(fù)合物解組裝的實(shí)時(shí)探測(cè)

圖7 與不同濃度的invader strand孵育12h后單顆MNCs的發(fā)光強(qiáng)度Fig.7 Luminescence intensity of single MNCs after incubating with different concentrations of invader strand for 12h

在證明光阱中MNCs的穩(wěn)定性和解組裝的有效性之后,我們進(jìn)一步實(shí)時(shí)探測(cè)了光阱中MNCs的解組裝過程,如圖8A所示。加入100nmol/L Invader strand,MNCs的發(fā)光強(qiáng)度在數(shù)分鐘之內(nèi)快速減弱,如圖8B和8C所示。Invader strand的濃度越高,如圖8D所示,發(fā)光強(qiáng)度變化速度越快。Invader strand的濃度為1nmol/L時(shí),可以在10min內(nèi)產(chǎn)生顯著的信號(hào)變化,因此構(gòu)建的MNCs可作為微傳感器用于DNA的實(shí)時(shí)檢測(cè)。

圖8 (A)光阱中鏈置換引發(fā) MNCs解組裝;(B)100nmol/L invader strand產(chǎn)生的發(fā)光強(qiáng)度變化(平行測(cè)定5個(gè)MNCs);(C)圖B中5次結(jié)果的平均值;(D)不同濃度invader strand產(chǎn)生的發(fā)光強(qiáng)度變化(從上至下:0、1、10、100、1 000nmol/L)Fig.8 (A)Disassembling process of optical-trapped MNCs induced by strand displacement;(B)Luminescence variation caused by 100nmol/L invadet strand(measuring 5MNCs);(C)Average value of 5measurements in(B);(D)Luminescence variations caused by invader strand with different concentrations(from top to bottom:0,1,10,100,1 000nmol/L)

3 結(jié)論

本文以微米顆粒作為載體,納米顆粒為發(fā)光標(biāo)記材料,鏈置換反應(yīng)底物Duplex為連接單元構(gòu)建的微納復(fù)合物在Invader strand存在時(shí)順利發(fā)生解組裝。較低功率(10mW)的近紅外激光對(duì)微納復(fù)合物的穩(wěn)定性沒有明顯影響,利用光鑷輔助的顯微成像平臺(tái)可以實(shí)時(shí)探測(cè)鏈置換反應(yīng)引發(fā)的微納復(fù)合物的解組裝過程。光鑷捕獲的微納復(fù)合物可作為一種微傳感器來響應(yīng)DNA濃度的變化,結(jié)合光鑷可以主動(dòng)捕獲并操縱微粒的特點(diǎn),構(gòu)建的MNCs有望應(yīng)用于生物體系中DNA/RNA的實(shí)時(shí)探測(cè),為動(dòng)態(tài)DNA納米技術(shù)提供一種有效的研究手段。

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