黃壽輝 溫立香 彭靜茹 張芬
摘 要:為了明確廣西野生茶樹種質(zhì)資源的遺傳背景,該研究從廣西的寧明縣、金秀縣、蒼梧縣收集到14份地方野生茶樹種質(zhì)資源,以17個(gè)國(guó)家級(jí)茶樹良種作為參照,采用EST-SSR分子標(biāo)記技術(shù),探討了廣西這三個(gè)地方野生茶樹與國(guó)家級(jí)茶樹良種間的親緣關(guān)系以及廣西地方茶樹自身的遺傳多樣性。結(jié)果表明:15對(duì)EST-SSR引物共檢測(cè)到68個(gè)等位基因,平均每個(gè)引物可擴(kuò)增出4.53個(gè),其中多態(tài)性位點(diǎn)為60個(gè),多態(tài)性比率達(dá)88.2%。平均觀測(cè)雜合度、平均期望雜合度、平均Shannon信息指數(shù)分別為0.42、0.55和0.97。PIC值在0.23~0.74之間,平均為0.52,多態(tài)性較好。遺傳相似系數(shù)在0.53~0.9之間,平均值為0.71,31份供試材料在遺傳相似系數(shù)為0.71分為5組群,76%參照品種聚在A組群,而廣西本地的野生茶樹資源則主要分布在B、C、D、E組群。利用該研究中的4對(duì)核心引物即可將31份供試材料全部區(qū)分開,挑選其中10個(gè)多態(tài)性較好的等位位點(diǎn)進(jìn)行編碼,構(gòu)建31份供試種質(zhì)的DNA分子指紋圖譜。這表明廣西野生茶樹資源與國(guó)家級(jí)茶樹良種間遺傳差異較大、親緣關(guān)系較遠(yuǎn)、遺傳基礎(chǔ)寬、多樣性非常豐富,可作為茶樹育種的親本或開展茶樹功能基因研究的材料。
關(guān)鍵詞:野生茶樹, 種質(zhì)資源, EST-SSR, 遺傳多樣性, DNA分子指紋圖譜, 廣西
中圖分類號(hào):Q941, S571.1
文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A
文章編號(hào):1000-3142(2019)06-0821-10
Abstract:In order to clarify the genetic background of wild tea tree germplasm resources in Guangxi, fourteen local wild tea tree germplasm resources were collected from Ningming County, Jinxiu County and Cangwu County, Guangxi. Taking seventeen state-level tea cultivars as reference, and adopting EST-SSR molecular marker technology, the research focused on the genetic relationship between these wild tea trees and the state-level tea cultivars in three places of Guangxi and the genetic diversity of local tea trees in Guangxi. The experiment results showed that a total of 68 alleles were detected in fifteen pairs of SSR primers, and each primer could amplify 4.53 by average, of which polymorphic site were 60, and the polymorphic ratio was 88.2%. The average observed heterozygosity, average expected heterozygosity, and average Shannon information index were 0.42, 0.55, and 0.97 respectively. The PIC value was between 0.23-0.74 with an average of 0.52, and the polymorphism was good. The genetic similarity coefficient was between 0.53 and 0.9, with an average value of 0.71. The test materials were divided into five groups at genetic similarity coefficient of 0.71, among which 76% reference warietics were clustered in Group A, while the local wild tea tree resources in Guangxi were mainly distributed in B, C, D and E groups. By using the four pairs of core primers in this study, 31 test materials could be completely distinguished. Ten allelic sites with good polymorphisms were selected for coding, and 31 DNA fingerprints of the tested germplasm were constructed. The study indicates that there is a great genetic difference between the wild tea trees in Guangxi and the state-level tea cultivars. The wild tea tree resources in Guangxi has distant genetic relationship, wide genetic basis and rich diversity, and can be used as the parent for tea tree breeding or materials for studying tea tree functional genes.
Key words:wild tea tree, germplasm resources, EST-SSR, genetic diversity, DNA molecular fingerprint, Guangxi
茶樹種質(zhì)資源是開展茶樹種質(zhì)創(chuàng)新、新品種選育、功能基因挖掘等研究的的物質(zhì)基礎(chǔ)和基本條件,種質(zhì)資源豐富與否與新品種選育成功率有著緊密的聯(lián)系(周萌等,2013)。研究表明,茶樹起源于我國(guó)云南、四川、貴州交界地區(qū)(虞富蓮,1986),而廣西與貴州、云南、四川接壤,是茶樹次生起源地(覃秀菊等,2006),常年水熱資源豐富,自然條件優(yōu)越,孕育著豐富的野生、半野生茶樹種質(zhì)資源。經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期自然選擇和自身進(jìn)化,廣西各地野生茶樹資源在表型、農(nóng)藝性狀、內(nèi)含物含量上具有豐富的差異性(覃秀菊等,2006;彭靖茹等,2019)。但對(duì)于廣西野生茶樹種質(zhì)資源的研究多數(shù)僅限于調(diào)查、收集和簡(jiǎn)單分布地理位置和形態(tài)的描述,對(duì)于其遺傳特性的研究鮮見報(bào)道。
用于茶樹種質(zhì)資源遺傳分析與評(píng)價(jià)的方法主要有形態(tài)學(xué)標(biāo)記法、生化標(biāo)記法和DNA分子標(biāo)記法三種,由于形態(tài)學(xué)標(biāo)記法過(guò)多依賴鑒定者的經(jīng)驗(yàn),且鑒定結(jié)果易受生產(chǎn)方式和環(huán)境影響(劉本英,2009),故其鑒定的可靠程度不高。生化標(biāo)記法由于受限于蛋白質(zhì)種類偏少,因此其檢測(cè)位點(diǎn)較少,多態(tài)性不夠豐富,不能有效區(qū)分親緣關(guān)系非常密切的茶樹資源(喬婷婷,2010)。DNA分子標(biāo)記直接反映基因組DNA水平遺傳變異,多態(tài)性豐富、準(zhǔn)確性高、重復(fù)性好,且不隨發(fā)育時(shí)期而變化,不受環(huán)境影響,鑒于此,DNA分了標(biāo)記技術(shù)已被廣泛應(yīng)用在包括茶樹在內(nèi)的各類作物種質(zhì)資源遺傳分析和鑒定上(姚明哲,2009)。目前,應(yīng)用于茶樹遺傳分析的分子標(biāo)記主要有RAPD、AFLP、ISSR和EST-SSR標(biāo)記(王麗鴛等,2004;姚明哲和陳亮,2003;粱慧玲和梁月榮,2003),其中EST-SSR相對(duì)其他標(biāo)記具有等位點(diǎn)多、共顯性、重復(fù)性好、多態(tài)性高、數(shù)量豐富等優(yōu)勢(shì)(Powell et al., 1996),且可直接從EST數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選獲得SSR,開發(fā)成本相對(duì)較低(Varshney et al., 2005),另外EST-SSR序列為基因組的表達(dá)序列,其差異性直接反映出基因表達(dá)的差異(Saha et al., 2005; Gao et al., 2004)。EST-SSR應(yīng)用于茶樹遺傳分析屢見報(bào)道:如金基強(qiáng)等(2007)首次基于EST-SSR引物對(duì)浙江、福建等地的優(yōu)良茶樹品種資源進(jìn)行了分析,結(jié)果充分說(shuō)明EST-SSR標(biāo)記可有效分析茶樹種質(zhì)資源,能真實(shí)反映不同品種間的遺傳差異;劉振等(2008)利用EST-SSR標(biāo)記對(duì)60份中國(guó)西南茶區(qū)的茶樹資源進(jìn)行了遺傳多樣性和親緣關(guān)系分析,研究結(jié)果表明EST-SSR標(biāo)記非常適用于茶樹遺傳多樣性和親緣關(guān)系的研究,同時(shí)結(jié)果也顯示我國(guó)西南茶區(qū)的茶樹種質(zhì)資源多樣性非常豐富,值得深入開發(fā)研究。姚明哲等(2009)通過(guò)EST-SSR標(biāo)記對(duì)45份江北茶區(qū)的茶樹初級(jí)核心種質(zhì)的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)分析,提出可進(jìn)一步對(duì)初級(jí)核心種質(zhì)進(jìn)行篩選,選擇更有遺傳代表性的資源,構(gòu)建江北茶區(qū)的核心種質(zhì),從而提高江北茶區(qū)優(yōu)異資源發(fā)掘和利用的效率。陳熙等(2016)基于EST-SSR分子標(biāo)記對(duì)陜西茶樹資源遺傳多樣性進(jìn)行分析,指出陜西茶樹種質(zhì)資源遺傳多樣性處于較高水平,從群體種選育良種是可行的。
利用DNA分子標(biāo)記技術(shù)開展廣西野生茶樹資源的遺傳多樣性和親緣關(guān)系分析,可充分認(rèn)識(shí)廣西野生茶樹種質(zhì)資源的遺傳特性,對(duì)廣西茶樹資源的分子鑒定、品種遺傳改良、種質(zhì)保護(hù)、核心種質(zhì)的構(gòu)建、重要農(nóng)藝性狀基因定位以及分子標(biāo)記輔助育種都具有重要的參考價(jià)值和理論指導(dǎo)意義。該研究利用EST-SSR技術(shù)對(duì)廣西部分野生茶樹資源進(jìn)行遺傳特性研究,旨在揭示廣西野生茶樹種質(zhì)資源的遺傳基礎(chǔ),為今后核心種質(zhì)資源收集利用提供理論支撐。
1 材料與方法
1.1 材料
供試的31份茶樹種質(zhì)資源(表1),14份取自分布在廣西金秀、寧明、六堡鎮(zhèn)的野生茶,另外17份為國(guó)家級(jí)優(yōu)良品種。于2018年春季采摘一芽二葉新梢,液氮迅速冷凍,然后置于-70 ℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2 DNA提取
采用改進(jìn)的CTAB法(陳盛相,2009)提取茶葉DNA,使用分光光度計(jì)和1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA的質(zhì)量和濃度。然后稀釋DNA原液至50 ng·μL-1,于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3 EST-SSR標(biāo)記
參照姚明哲(2009)報(bào)道的EST-SSR標(biāo)記,經(jīng)過(guò)材料篩選,選出15對(duì)多態(tài)性高、帶型清晰的引物,引物信息如表2所示,委托華大基因科技有限公司合成。
1.4 PCR擴(kuò)增及產(chǎn)物檢測(cè)
按(表3)配制EST-SSR反應(yīng)體系,進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增各個(gè)循環(huán)參數(shù):先94 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃變性1 min,對(duì)應(yīng)溫度退火30 s(各引物退火溫度見表2),72 ℃延伸2 min,35個(gè)循環(huán);然后72 ℃延伸5 min,4 ℃保存。參照黃壽輝(2013)方法進(jìn)行PCR產(chǎn)物聚丙烯酰胺凝膠檢測(cè)、銀染顯色和拍照記錄。
1.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
每對(duì)SSR引物檢測(cè)一個(gè)位點(diǎn),每條多態(tài)性條帶視為一個(gè)等位變異,采用人工讀帶方法,將電泳圖上清晰的條帶記為“1”,同一位置無(wú)帶或不易分辨的弱帶計(jì)為“0”,建立“0-1”原始數(shù)據(jù)矩陣。使用軟件Popgene32(Yeh et al., 1999)統(tǒng)計(jì)每個(gè)引物在31份材料中擴(kuò)增的等位基因數(shù)(Na),觀測(cè)雜合度(Ho)、期望雜合度(He),Shannon信息指數(shù)(I)。根據(jù)公式PIC=1-∑(Pi)2計(jì)算每個(gè)引物的多態(tài)性信息量(PIC),其中Pi是帶有第i個(gè)等位基因群體的比例。根據(jù)公式DICE=2a/(2a+b+c)計(jì)算品種間的DICE遺傳相似性系數(shù),其中a為品種i與品種j共有帶型數(shù)目,b為品種i特有帶型數(shù)目,c為品種j特有帶型數(shù)目。用NTSYS-pc2.1(Rohlf,2000)軟件進(jìn)行品種間多態(tài)性和相似系數(shù)分析,通過(guò)非加權(quán)配對(duì)算術(shù)平均法(UPUMA)進(jìn)行聚類分析,建立親緣關(guān)系樹狀圖。結(jié)合供試材料的形態(tài)學(xué)特征,對(duì)聚類分析結(jié)果進(jìn)行分析討論。
2 結(jié)果與分析
2.1 EST-SSR擴(kuò)增結(jié)果及多態(tài)性分析
利用15對(duì)EST-SSR引物對(duì)31份實(shí)驗(yàn)材料進(jìn)行多態(tài)性檢測(cè),部分引物擴(kuò)增結(jié)果見圖1。如表4所示,共檢測(cè)到68個(gè)等位位點(diǎn)。擴(kuò)出等位位點(diǎn)數(shù)最多的引物為T395和T588,分別可以擴(kuò)出6個(gè)等位位點(diǎn),其次是T6、T8、T185、T685、T802、T1110,均可擴(kuò)出5個(gè),T12、T21、T228、T641、T687可擴(kuò)出4個(gè),T663、T113為3個(gè),T13擴(kuò)出的等位位點(diǎn)最少,為2個(gè),平均每個(gè)引物可擴(kuò)出的等位位點(diǎn)數(shù)為4.47個(gè)。在擴(kuò)增到的68個(gè)等位基因中有14個(gè)特異等位基因,主要分布在寧明2號(hào)、寧明4號(hào)、六堡1號(hào)和金秀5號(hào)中,表明這幾個(gè)種質(zhì)在某些位點(diǎn)與其他種質(zhì)有著很大差異,是研究等位基因功能差異的良好材料。對(duì)于整個(gè)群體而言,群體的觀測(cè)雜合度(Ho)變化范圍為0.18(T113)~0.63(T1110),
平均為0.42;期望雜合度(He)的變化范圍為0.23(T113)~0.74(T588),平均為0.55。Shannon信息指數(shù)(I)變幅在0.35~1.53之間,平均0.97。多態(tài)性信息含量(PIC值)是衡量引物擴(kuò)增位點(diǎn)多態(tài)性的重要指標(biāo)。當(dāng)PIC>0.5時(shí),表明擴(kuò)增位點(diǎn)具高度多態(tài)性,0.25<PIC<0.5時(shí),為中度多態(tài)性,PIC<0.25時(shí)為低度多態(tài)性(Botstein et al., 1980)。該研究選用的15個(gè)引物的PIC值在0.23~0.74之間,平均為0.52,標(biāo)記T13(PIC=0.23)為低度多態(tài)位點(diǎn),4個(gè)標(biāo)記T687(PIC=0.43)、T663(PIC=0.28)、T21(PIC=0.21)、T641(PIC=0.26)為中度多態(tài)位點(diǎn),其它10個(gè)為高度多態(tài)位點(diǎn),PIC值變化范圍為0.51~0.74,表明所選用EST-SSR引物在茶樹上具有較高水平的擴(kuò)增位點(diǎn)多態(tài)性,不同EST-SSR位點(diǎn)的多態(tài)性有明顯差異,同時(shí)也說(shuō)明廣西野生茶樹與國(guó)家級(jí)茶樹良種間遺傳差異大,具有較高的遺傳多樣性。
2.2 31份供試種質(zhì)的親緣關(guān)系
根據(jù)31份供試茶樹種質(zhì)資源擴(kuò)出的68個(gè)EST-SSR位點(diǎn)的譜帶數(shù)據(jù)組成原始矩陣,計(jì)算所有種質(zhì)之間的遺傳相似性系數(shù),繪制親緣關(guān)系聚類圖(圖2)。圖2結(jié)果表明,供試種質(zhì)間的遺傳相似系數(shù)為0.53~0.90,平均為0.71,當(dāng)遺傳相似系數(shù)等于0.82時(shí),70%種質(zhì)已經(jīng)完全分開,其中金秀1號(hào)和金秀3號(hào)的遺傳相似系數(shù)最高,達(dá)到0.90,寧明2號(hào)與湘波綠最低,僅為0.38, 表明廣西野生茶樹種質(zhì)資源間經(jīng)長(zhǎng)期的自然選擇后,與當(dāng)前推廣的國(guó)家級(jí)良種間存在較大的遺傳差異,而廣西野生資源之間既表現(xiàn)一定的遺傳相似性,也存在著豐富的遺傳差異。從系統(tǒng)樹發(fā)現(xiàn),31份供試材料分類比較零散,沒有很明顯的大群組,在相似系數(shù)為0.71左右分為5組群:A、B、C、D和E,其中A組群包含19份材料,占到所有供試的61%,分別是黃金芽、黃金葉、玉麒麟、六堡2號(hào)、梅占、金觀音、黃觀音、福鼎大毫、黃玫瑰、桂香18號(hào)、六堡3號(hào)、六堡4號(hào)、堯山秀麗、桂綠1號(hào)、云南大葉種、金秀1號(hào)、金秀3號(hào)、金秀5號(hào);B組群有金秀2號(hào)、金秀4號(hào)、碧香早、湘波綠;C組群也有6個(gè)材料,分別是白玉1號(hào)、紫鵑、六堡1號(hào)、六堡5號(hào)、寧明1號(hào)、寧明3號(hào);D和E組群分別都只有1份材料,分別是寧明4號(hào)和寧明2號(hào)。以相似系數(shù)0.78為閾值,A組群又可分為7個(gè)亞群,B組群細(xì)分為3個(gè)亞群,C組群則分為4個(gè)亞群。從整個(gè)親緣關(guān)系看,大部分資源按照相同地域來(lái)源聚在一起,如A3亞組群中來(lái)自浙江安吉的黃金葉和黃金芽,來(lái)自廣西桂林的A4亞組群桂綠1號(hào)和堯山秀麗,來(lái)自湖南長(zhǎng)沙的B3亞組群碧香早和湘波綠,還有A6亞組群金秀1號(hào)和金秀3號(hào),C3亞組群寧明1號(hào)和寧明3號(hào),兩份材料彼此間的遺傳相關(guān)系數(shù)相對(duì)較小,說(shuō)明較近的地理關(guān)系表現(xiàn)出較近的親緣關(guān)系;A1組群中,金牡丹、金觀音、黃觀音均由鐵觀音與黃金桂雜交而得,而黃玫瑰又是由黃金桂與黃觀音回交一個(gè)世代獲得,顯然他們之間的遺傳相似系數(shù)相對(duì)要高,聚到一起也是情理之中;另外C2亞組群中的紫鵑和六堡1號(hào),兩者雖然不是來(lái)自同一地區(qū),但兩份材料均為紫芽材料,也聚到了同一個(gè)分支上,較相近的形態(tài)學(xué)特征也表現(xiàn)出較近的親緣關(guān)系,說(shuō)明該研究所選用的引物可對(duì)供試材料的遺傳差異性進(jìn)行比較客觀科學(xué)的分析。
2.3 供試種質(zhì)的DNA指紋圖譜
使用15對(duì)EST-SSR引物,其中的T8、T21、T588、T1110共4對(duì)引物即可鑒定供試的31份種質(zhì),基于這4對(duì)引物對(duì)每份茶樹資源的等位基因帶型,挑選其中10個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行組合編碼,構(gòu)建了31份供試種質(zhì)的DNA分子指紋圖譜(圖3),并獲得10位數(shù)DNA分子身份證編碼(表5)。表5結(jié)果表明每份材料都對(duì)應(yīng)唯一的身份證編碼,這4對(duì)EST-SSR引物可作為鑒別茶樹品種參考引物。
3 討論與結(jié)論
3.1 EST-SSR標(biāo)記的多態(tài)性豐富,能對(duì)供試材料的遺傳多樣性進(jìn)行客觀分析隨著分子生物學(xué)、生物信息學(xué)、基因組學(xué)的快速發(fā)展,可供用于植物遺傳研究的分子標(biāo)記種類越來(lái)越豐富,除了傳統(tǒng)的RAPD、AFLP、ISSR、EST-SSR,近年來(lái)又出現(xiàn)了STS、SNP等分子標(biāo)記,但茶樹作為異花授粉的多倍體木本植物,基因組相對(duì)比較復(fù)雜,DNA分子標(biāo)記在茶樹遺傳研究起步較晚,目前多數(shù)標(biāo)記在茶樹上的研究基本處在初步階段。本研究用15對(duì)EST-SSR引物對(duì)14份廣西野生茶樹資源和17份國(guó)內(nèi)優(yōu)良茶樹品種進(jìn)行了遺傳多樣性和親緣關(guān)系的分析。15對(duì)EST-SSR引物各項(xiàng)數(shù)據(jù)均處于理想的范圍,說(shuō)明所篩選獲得的標(biāo)記多態(tài)性較好。聚類圖中,相同來(lái)源、相同親本、相同形態(tài)特性的材料均聚到了一起,說(shuō)明選用的引物能對(duì)材料的等位位點(diǎn)進(jìn)行有效擴(kuò)增,真實(shí)客觀反映出供試材料的遺傳多樣性。白玉1號(hào)、紫鵑和六堡1號(hào)表現(xiàn)出按葉色優(yōu)先聚類的趨勢(shì),說(shuō)明葉色的多樣性是分子標(biāo)記遺傳多樣性表現(xiàn)形式的一個(gè)方面,但這些EST-SSR標(biāo)記是否與茶樹葉色相關(guān)聯(lián)還需要進(jìn)一步研究。該研究中用四個(gè)引物即可將供試31種質(zhì)全部分開,經(jīng)過(guò)計(jì)算機(jī)處理,形成了每個(gè)種質(zhì)唯一的分子身份證編碼,說(shuō)明所用引物等位位點(diǎn)非常豐富,具有很強(qiáng)的茶樹品種鑒別能力,這套引物可用于構(gòu)建茶樹品種分子指紋圖譜或作為茶樹品種鑒定的參考引物。
3.2 廣西野生茶樹資源遺傳多樣性豐富本研究在聚類結(jié)果中,大部分資源能夠按照相同的地理來(lái)源或相似的形態(tài)學(xué)特性聚在同一類群,但也有部分材料例外,體現(xiàn)了茶樹復(fù)雜的親緣關(guān)系。在親緣關(guān)系圖中,供試的17份國(guó)家級(jí)良種中有13份都聚在A組群,占到總數(shù)的76%;而廣西本地的野生茶樹資源則分布在B、C、D、E組群,說(shuō)明廣西野生茶樹資源與國(guó)家級(jí)茶樹良種遺傳差異較大。另外,廣西本地的野生茶樹中,來(lái)自同一地區(qū)的材料間或者來(lái)自不同地區(qū)的材料間,除了金秀1號(hào)和金秀3號(hào)遺傳相似系數(shù)達(dá)到0.9外,其他兩兩之間的遺傳相似系數(shù)均小于0.81,寧明2號(hào)和寧明4號(hào)甚至在相似系數(shù)為0.53和0.64時(shí)便單獨(dú)聚成一類??梢姡瑥V西野生茶樹資源的遺傳多樣性非常豐富。這主要得益于廣西作為茶樹亞起源中心,自北向南分為中亞熱帶、南亞熱帶、北熱帶3個(gè)氣候帶,多樣的氣候環(huán)境也就孕育了多樣性十分豐富的野生茶樹資源,又由于廣西多山地,阻隔了各茶區(qū)之間的基因自然交流,這就使各個(gè)茶區(qū)形成了一個(gè)個(gè)相對(duì)獨(dú)立的資源庫(kù)。
3.3 廣西野生茶樹種質(zhì)資源遺傳多樣性的利用和保護(hù)廣西野生茶樹種質(zhì)資源豐富,以往限于人力和技術(shù),很多資源并未得到很好的挖掘,基于廣西本地茶樹資源選育出的茶樹良種少之又少,隨著人們對(duì)種質(zhì)資源認(rèn)識(shí)的不斷深入和研究分析手段的不斷豐富,廣西野生茶樹資源正逐步引起重視并被加以研究利用。利用分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)廣西野生茶樹資源進(jìn)行遺傳多樣性分析,揭示育種材料之間的親緣關(guān)系。在農(nóng)藝性狀優(yōu)良的前提下,將親緣關(guān)系遠(yuǎn)的材料進(jìn)行雜交,可望獲得遺傳基礎(chǔ)豐富、變異類型多甚至超親的雜交后代。從本研究結(jié)果來(lái)看,材料寧明2號(hào)和寧明4號(hào)在遺傳相似系數(shù)分別等于0.53和0.63時(shí)單獨(dú)聚類,說(shuō)明它們與其他供試材料間的遺傳差異較大,分別選擇寧明2號(hào)或者寧明4號(hào)與國(guó)家級(jí)良種進(jìn)行雜交育種,如:金牡丹(寧明2號(hào)與金牡丹遺傳相似系數(shù)為0.57)、湘波綠(寧明2號(hào)與湘波綠遺傳相似系數(shù)為0.58)、碧香早(寧明2號(hào)與碧香早遺傳相似系數(shù)為0.55),都有望獲得具有優(yōu)良性狀的雜交后代??梢姡z傳多樣性分析可以為親本配置提供依據(jù),使所做的育種工作更加有針對(duì)性,提高優(yōu)良品系選育的效率。遺傳多樣性分析在種質(zhì)保護(hù)中同樣具有重要價(jià)值,在開展收集種質(zhì)資源工作時(shí),人們往往通過(guò)肉眼觀察,根據(jù)形態(tài)學(xué)特性、農(nóng)藝性狀來(lái)篩選種質(zhì),但對(duì)于一些形態(tài)特性相似種質(zhì)會(huì)難以做出選擇,從而會(huì)錯(cuò)過(guò)一些攜帶優(yōu)異基因的種質(zhì)材料,另外僅從形態(tài)學(xué)往往會(huì)過(guò)高估計(jì)(Bushakra et al.,1999),收集到重復(fù)材料,在實(shí)際收集工作中造成人力、物力、財(cái)力的浪費(fèi)。收集前先對(duì)野生材料進(jìn)行系統(tǒng)的遺傳多樣性分析,然后根據(jù)分析結(jié)果篩選收集種質(zhì),從而以最少數(shù)量的遺傳資源最大限度地保存整個(gè)資源群體的遺傳多樣性,起到事半功倍的效果。
隨著茶樹基因組測(cè)序工作完成,茶樹分子標(biāo)記數(shù)量和種類將有大幅度增加,結(jié)合廣西野生茶樹資源豐富的優(yōu)勢(shì),今后重點(diǎn)對(duì)我區(qū)野生茶樹資源的遺傳特性進(jìn)行分析、鑒定,挖掘茶樹功能基因并進(jìn)行QTL定位,開展茶樹遺傳圖譜繪制等,在為我區(qū)乃全國(guó)茶樹育種工作不斷提供新的種質(zhì)材料的同時(shí),可極大促進(jìn)茶樹分子標(biāo)記輔助育種的進(jìn)一步發(fā)展。
參考文獻(xiàn):
BOTSTEIN D, WHITE RL, SKOLNICK M, et al., 1980. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms [J]. Am J Human Genet, 32:314-331.
BUSHAKRA JM, HODGES SA, COOPER JB, et al., 1999. The extent of clonality and genetic diversity in the Santa Cruz Island ironwood Lyonothamnus floribundus [J]. Mol Ecol, 8:471-475.
CHEN SX, 2009. A preliminary study on screening special tea plant germplasm resources with high caffeine and SSR markers related to high caffeine [D]. Chengdu:Sichuan Agriculture University:1-36.? [陳盛相, 2009. 高咖啡堿含量的茶樹特異種質(zhì)資源篩選及SSR標(biāo)記初步研究 [D]. 成都:四川農(nóng)業(yè)大學(xué):1-36.]
CHEN X, LI J, ZHANG Y, et al., 2016. Genetic diversity analysis of tea in Shaanxi Province based on EST-SSR [J]. J Sichuan Agric Univ, 34(3):322-327.? [陳熙, 李佼, 張羽, 等, 2016. 基于EST-SSR的陜西茶樹資源遺傳多樣性分析 [J]. 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào), 34(3):322-327.]
GAO LF, JING RL, HUO NX, et al., 2004. One hundred and one new microsatellite loci derived from EST-SSR in bread wheat [J]. Theor Appl Genet, 108:392-1400.
HUANG SH, 2013. Primary study on authenticity and purity detection of rapeseed hybrids using SSR markers [D]. Wuhan:Huazhong Agricultural University:1-48.? [黃壽輝, 2013. 油菜雜交種真實(shí)性和純度SSR標(biāo)記檢測(cè)初步研究 [D]. 武漢:華中農(nóng)業(yè)大學(xué):1-48.]
JIN JQ, CUI HR, GONG XC,et al., 2007. Studies on tea plants germplasms using EST-SSR marker [J]. Heletitas, 29(1):103-108.? [金基強(qiáng), 崔海瑞, 龔曉春, 等, 2007. 用EST-SSR標(biāo)記對(duì)茶樹種質(zhì)資源的研究 [J]. 遺傳, 29(1):103-108.]
LIANG HL, LIANG YR, 2003. The principle and application of plant molecular marker and the of in genetics and breeding of tea [J]. Tea, 29(4):191-194.? [粱慧玲, 梁月榮, 2003. 植物分子標(biāo)記技術(shù)原理及其在茶樹育種中的應(yīng)用 [J]. 茶葉, 29(4):191-194.]
LIU BY, 2009. Application studies of EST-SSR and ISSR markers in tea germplasms fromyunnan [D]. Beijing:Chinese Academy of Agricultural Sciences:1-97.? [劉本英, 2009. EST-SSR和ISSR分子標(biāo)記在云南茶樹資源中的應(yīng)用研究 [D]. 北京:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院:1-97.]
LIU BY, WANG LY, ZHOU J, et al., 2008. Fingerprinting construction and genetic diversity analysis of Yunnan Dayezhong tea germplasm resources by ISSR markers [J].? J Plant Gene Resour, (9):458-464.? [劉本英, 王麗鴛, 周健, 等, 2008. 云南大葉種茶樹種質(zhì)資源ISSR指紋圖譜構(gòu)建及遺傳多樣性分析 [J]. 植物遺傳資源學(xué)報(bào), (9):458-464.]
LIU Z, WANG XC, ZHAO LP, et al., 2008. Genetic diversity and relationship analysis of tea germplasms originated from southwestern China based on EST-SSR [J]. Mol Plant Breed, 6(1):100-110.? [劉振, 王新超, 趙麗萍, 等, 2008. 基于EST-SSR的西南茶區(qū)茶樹資源遺傳多樣性和親緣關(guān)系分析 [J]. 分子植物育種, 6(1):100-110.]
PENG JR, LI CC, TAN YW, et al., 2019. Clustering analysis for wild ancient tea germplasm resources in Debao County and Longlin County,Guangxi based on SSR molecular markers [J]. J Southern Agric, 50(1):1-7. [彭靖茹, 李朝昌, 檀業(yè)維, 等, 2019. 基于SSR分子標(biāo)記的廣西德??h和隆林縣野生古茶樹聚類分析 [J]. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào), 50(1):1-7.]
POWELL W, MACHRAY GC, PROVAN J, 1996. Polymorphism revealedby simple sequence repeats [J]. Trends Plant Sci, 1(7):215-222.
QIAO TT, 2010. Genetic diversity of tea and association analysis of phenotypic traits with EST SSR markers [D]. Beijing:Chinese Academy of Agricultural Sciences:1-57. [喬婷婷, 2010. 茶樹資源遺傳多樣性及其表型性狀關(guān)聯(lián)EST SSR位點(diǎn)的初步鑒定 [D]. 北京:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院:1-57.]
QIN XJ, CHEN XQ, CHEN CF, et al., 2006. A review of the germplasm resources of characteristic tea trees in Guangxi? [J]. Chin Countryside Well-Off Technol, (10):37-38.? [覃秀菊, 陳新強(qiáng), 陳春芬, 等, 2006. 廣西特性茶樹種質(zhì)資源綜述 [J]. 中國(guó)農(nóng)村小康科技, (10):37-38.]
ROHLF FJ, 2000. NTSYS-pc numerical taxonomy and multivariate analysis system version 2.1? [OL]. New York:pplied Biostatistics Inc. http://www.exetersoftware.com/cat/ntsyspc/ntsyspc.html.
SAHA MC, MIAN MA, EUJAYLL, et al., 2004. Tall fescue EST-SSR markers with transferability across several grass species [J]. Theor? Appl Genet, 109:783-791.
VARSHNEY RK, GRANER A, SORRELLS ME, 2005. Genic microsatellite markers in plants:Features and applications [J]. Trends Biotechnol, 23(1):48-55.
WANG LY, CHENG H, ZHOU J, 2004. Advances on DNA molecular markers and gene-engineering in tea plants [J]. J Tea Sci, 24(1):12-17.? [王麗鴛, 成浩, 周健, 2004. 茶樹DNA分子標(biāo)記及基因工程研究進(jìn)展 [J]. 茶葉科學(xué), 24(1):12-17.]
YAO MZ, CHEN L, 2003. The application of molecular marker in genetics and breeding of tea [J]. Biotechnol Bull, (5):27-30.? [姚明哲, 陳亮, 2003. 分子標(biāo)記在茶樹遺傳育種上的應(yīng)用 [J]. 生物技術(shù)通報(bào), (5):27-30.]
YAO MZ, 2009. Studies on genetic diversity and structure of tea ermnlasm in China based on ISSR and EST-SSR markers [D]. Hangzhou:Zhejiang University:1-90.? [姚明哲, 2009. 利用ISSR和EST-SSR標(biāo)記研究中國(guó)茶樹資源的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu) [D]. 杭州:浙江大學(xué):1-90.]
YEH FC, YANG RC, BOYLE T, 1999. POPGENE:Microsoft window-based freeware for population genetic analysis, version 1.31 [OL]. Edmonton, Canada:University of Alberta. http://sites.ualberta.ca/~fveh/popgene.html.
YU FL, 1986. An analysis on the origin and origin cener of tea trees [J]. J Tea Sci, 6(1):1-8.? [虞富蓮, 1986. 論茶樹原產(chǎn)地和起源中心 [J]. 茶葉科學(xué), 6(1):1-8.]
ZHOU M, LI YY, SUN XM, et al., 2013. Genetic diversity assessment of ancient tea plants in Yunnan Province of China revealed by EST-SSR markers? [J]. Acta Agric Boreal-Sin, (28):91-96.? [周萌, 李友勇, 孫雪梅, 等, 2013. 基于EST-SSR標(biāo)記的云南大茶樹遺傳多樣性分析 [J]. 華北農(nóng)學(xué)報(bào), (28):91-96.]