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不同品種桑樹(shù)根際土壤細(xì)菌多樣性的高通量測(cè)序分析

2019-09-10 07:22邱潔侯怡鈴徐麗麗錢葉丁祥
關(guān)鍵詞:高通量測(cè)序桑樹(shù)多樣性

邱潔 侯怡鈴 徐麗麗 錢葉 丁祥

摘要:【目的】探究不同品種桑樹(shù)根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及其分布規(guī)律,為促進(jìn)桑樹(shù)的生長(zhǎng)發(fā)育、提高其經(jīng)濟(jì)利用價(jià)值和培育更高品質(zhì)的桑樹(shù)品種提供參考?!痉椒ā繉?duì)3個(gè)品種桑樹(shù)(粵椹大10、嘉陵30號(hào)和紅果1號(hào))根際土壤細(xì)菌的16S rDNA序列V3~V5高變區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行高通量測(cè)序,分析土壤中細(xì)菌群落多樣性及分布規(guī)律?!窘Y(jié)果】3個(gè)土壤樣品中共檢測(cè)出細(xì)菌26門76綱88目149科370屬。不同品種桑樹(shù)根際土壤樣品中的細(xì)菌群落組成和結(jié)構(gòu)存在一定差異,豐富度方面表現(xiàn)為嘉陵30號(hào)>粵椹大10>紅果1號(hào);多樣性方面表現(xiàn)為紅果1號(hào)>嘉陵30號(hào)>粵椹大10。3個(gè)品種桑樹(shù)的根際土壤細(xì)菌在門綱目科屬水平上的優(yōu)勢(shì)菌群及所占比例分別為變形菌門(Proteobacteria,37.2%)、α-變形菌綱(Alphaproteobacteria,24.3%)、擬桿菌目(Bacteroidales,24.3%)、擬桿菌科(Bacteroidaceae,14.2%)、擬桿菌屬(Bacteroides,14.2%);隨著分類的細(xì)化,不同桑樹(shù)品種對(duì)土壤細(xì)菌群落組成和分布的影響越大?!窘Y(jié)論】變形菌門在3種桑樹(shù)根際土壤中均是最優(yōu)勢(shì)細(xì)菌類群,嘉陵30號(hào)桑樹(shù)品種根際土壤細(xì)菌種類最多,紅果1號(hào)桑樹(shù)品種土壤細(xì)菌分布最均勻。根際土壤細(xì)菌群落種類和均勻度可作為桑樹(shù)差異規(guī)?;N植的指標(biāo)。

關(guān)鍵詞: 桑樹(shù);根際土壤;細(xì)菌;多樣性;高通量測(cè)序

中圖分類號(hào): S888.5? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?   文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A 文章編號(hào):2095-1191(2019)03-0585-08

0 引言

【研究意義】土壤細(xì)菌是土壤生態(tài)系統(tǒng)的重要組成成分,參與養(yǎng)分元素循環(huán)、有機(jī)質(zhì)分解及能量轉(zhuǎn)換,在保持生態(tài)系統(tǒng)的功能、穩(wěn)定性及生產(chǎn)力等方面均發(fā)揮關(guān)鍵作用,是衡量土壤生產(chǎn)力和質(zhì)量的重要指標(biāo)(王衛(wèi)霞等,2013;馮丹妮等,2014;張文元等,2015;尹玉玲等,2017)。在土地覆被過(guò)程中,土壤特性、氣候因子和植被群落等均會(huì)影響土壤的細(xì)菌群落(Li et al.,2014;Tkacz and Poole,2015)。土壤有機(jī)質(zhì)含量與細(xì)菌群落組成和結(jié)構(gòu)間一般具有很好的線性關(guān)系(王傳杰等,2018)。土壤細(xì)菌不僅推動(dòng)了土壤的物質(zhì)循環(huán)和生化反應(yīng)(劉銀銀等,2013),土壤細(xì)菌群落的變化還會(huì)影響土壤養(yǎng)分的轉(zhuǎn)化和吸收,從而影響植物生長(zhǎng)代謝(孫波等,2017)。不同植物類型根系分泌物和凋落物的質(zhì)量又反作用于土壤細(xì)菌群落的生長(zhǎng)發(fā)育,造成某些細(xì)菌群落的出現(xiàn)或消亡(陳心想等,2014;潘彥碩等,2018;王美溪等,2018)。桑(Morus alba L.)為??粕僦参?,其葉是家蠶重要的飼料,是蠶絲產(chǎn)業(yè)發(fā)展的必須物質(zhì)基礎(chǔ)(Jia et al.,2014;向仲懷等,2017),因此,了解桑樹(shù)根標(biāo)土壤細(xì)菌組成多樣性對(duì)保障桑葉生產(chǎn)和促進(jìn)蠶絲產(chǎn)業(yè)發(fā)展均具有重要意義?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】Carvalhais等(2013)通過(guò)擬南芥在無(wú)菌土壤和非無(wú)菌土壤中生長(zhǎng)對(duì)比試驗(yàn),證明擬南芥在整個(gè)細(xì)菌群落存在條件下比細(xì)菌貧乏時(shí)表現(xiàn)出更強(qiáng)的生長(zhǎng)力。Muehe等(2015)通過(guò)對(duì)鼠耳芥根際細(xì)菌組成與植物對(duì)鎘和鋅的吸收研究,證明土壤細(xì)菌可直接或間接影響植物對(duì)金屬元素的吸收。崔佩佩等(2018)采用Biolog微平板法研究不同施肥條件下高粱根際土壤細(xì)菌功能多樣性的變化,結(jié)果證明施肥能改善土壤細(xì)菌的功能多樣性。蔣景龍等(2018)采用Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)西洋參根腐病病株和健株根際土壤細(xì)菌的組成及多樣性變化進(jìn)行研究,結(jié)果顯示鞘脂菌屬(Sphingobium)和紅游動(dòng)菌屬(Rhodoplanes)可能是引起西洋參根腐病的重要菌群。對(duì)于桑樹(shù)根際土壤細(xì)菌的研究,目前主要采用傳統(tǒng)方法探究不同施肥方案、作物間作等對(duì)根際土壤細(xì)菌種類變化、重金屬含量、酶活性差異的影響(楊統(tǒng)一等,2015;張萌萌等,2015)。鄧文等(2016)采用Biolog微生態(tài)技術(shù)研究偏施氮肥桑樹(shù)根際土壤細(xì)菌對(duì)碳源利用的能力變化,證明4年偏施氮肥桑樹(shù)根際土壤細(xì)菌多樣性及活性均高于其他方法處理的土壤。樊芳玲等(2016)利用磷脂脂肪酸(PLFA)法分析不同模式的坡耕地—桑樹(shù)系統(tǒng)對(duì)旱坡地紫色土壤中細(xì)菌群落的影響,證明種植桑樹(shù)能顯著提高土壤中PLFA含量,改善細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】高通量測(cè)序技術(shù)能產(chǎn)生測(cè)序覆蓋深度更高的基因數(shù)據(jù),在細(xì)菌群落組成研究中能真實(shí)地揭示環(huán)境中細(xì)菌群落的多樣性和復(fù)雜性。目前針對(duì)不同品種桑樹(shù)根際土壤細(xì)菌多樣性的高通量測(cè)序分析研究鮮見(jiàn)報(bào)道?!緮M解決的關(guān)鍵問(wèn)題】對(duì)不同品種桑樹(shù)根際土壤細(xì)菌的16S rDNA序列V3~V5高變區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行高通量測(cè)序,分析土壤中細(xì)菌群落多樣性及分布規(guī)律,了解不同品種桑樹(shù)根際土壤細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)、物種組成和差異,探究根際土壤細(xì)菌與桑樹(shù)的相互關(guān)系,為促進(jìn)桑樹(shù)的生長(zhǎng)發(fā)育、提高其經(jīng)濟(jì)利用價(jià)值及培育出更高品質(zhì)的桑樹(shù)品種提供參考。

1 材料與方法

1. 1 試驗(yàn)材料

土壤樣品采自四川省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蠶業(yè)研究所瀠溪桑園,分別以粵椹大10(廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蠶業(yè)與農(nóng)產(chǎn)品加工研究所選育)、嘉陵30號(hào)和紅果1號(hào)(四川省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蠶業(yè)研究所選育)3種果桑根際土壤作為采樣區(qū),隨機(jī)在每個(gè)采樣區(qū)設(shè)4個(gè)采樣點(diǎn),每個(gè)采樣點(diǎn)采集10份土壤樣品(0~10 cm),使用S形采樣法,剔除石塊和植物根系,混合均勻并過(guò)2 mm篩,以四分法篩取所得土樣為同一樣品,再裝入已滅菌的采樣袋,分別編號(hào)為L(zhǎng)CF20、LCF21和LCF22,于冰盒中保存。

1. 2 總DNA提取、16S rDNA序列擴(kuò)增及高通量測(cè)序

根據(jù)Fast DNA SPIN Kit for Soil(MP Biomedical,USA)的使用說(shuō)明,加入溶菌酶(上海源葉生物科技有限公司)60 mg/mL輔助提取土壤細(xì)菌的總DNA。用1%瓊脂糖凝膠對(duì)總DNA進(jìn)行電泳檢測(cè),電泳條件為120 V、45 min,總DNA條帶單一清晰,無(wú)嚴(yán)重拖尾現(xiàn)象,可用于后續(xù)體外擴(kuò)增。用引物515F/907R擴(kuò)增細(xì)菌16S rDNA序列的V3~V5區(qū)域。反應(yīng)體系25.0 μL:Dream Taq PCR Master Mix(2×)12.5 μL,DNA模板1.0 μL,515F/907R引物各0.5 μL,去離子水補(bǔ)足至25.0 μL。擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃ 30 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,進(jìn)行10個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)降低0.5 ℃;94 ℃ 30 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,進(jìn)行25個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min;4 ℃保存。擴(kuò)增產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測(cè),將單一清晰沒(méi)有拖尾現(xiàn)象條帶對(duì)應(yīng)的樣本送至北京金諾銳杰基因科技有限公司測(cè)序,并采用MiSeq測(cè)序儀完成測(cè)序工作(Lu et al.,2015;Navarrete et al.,2015;Lossius et al.,2016)。

1. 3 高通量測(cè)序數(shù)據(jù)處理

原始數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)低質(zhì)量過(guò)濾、去接頭等后得到高質(zhì)量的基因序列Reads,然后合并正反向Reads,獲得16S rDNA序列V3~V5區(qū)擴(kuò)增子。利用Flash 8.0合并正方向Reads,合并后序列輸出,并使用FastQC進(jìn)行質(zhì)控分析。采用Usearch61檢查嵌合體,De novo方式去除嵌合體序列,再對(duì)小片段文庫(kù)進(jìn)行組裝,獲得該物種的基因組序列圖譜。對(duì)所有分離的高質(zhì)量樣本序列進(jìn)行聚類分析,即一個(gè)OTU(同源性為97%),再劃分操作分類單元(OTUs),并構(gòu)建稀釋曲線及進(jìn)行聚類分析。

Chao1指數(shù)計(jì)算公式:Schao1=Sobs+n1(n1-1)/2(n2+1),其中,Schao1為估計(jì)的OUT數(shù),Sobs為觀測(cè)到的OTU數(shù),n1為只有一條序列的OUT數(shù)目,n2為只有兩條序列的OUT數(shù)目。

Shannon指數(shù)計(jì)算公式:H'=-∑(Pi)(lnPi),其中,Pi為此細(xì)菌個(gè)體數(shù)占總個(gè)體數(shù)比例。

相對(duì)豐度計(jì)算公式:D=(S-1)/lnN,其中,S為群落中的特定細(xì)菌總數(shù)目,N為群落中所有細(xì)菌的總數(shù)。

2 結(jié)果與分析

2. 1 不同品種桑樹(shù)根際土壤細(xì)菌多樣性分析結(jié)果

用Chao1指數(shù)表示細(xì)菌群落的豐富度,其值越高反映細(xì)菌群落物種豐富度越高,細(xì)菌種類越多。顯示3個(gè)樣品的細(xì)菌群落豐富度均隨測(cè)序深度的增加而增加,隨后逐漸趨于平緩,此時(shí)嘉陵30號(hào)的細(xì)菌群落豐富度最高,粵椹大10次之,紅果1號(hào)最低。用Shannon指數(shù)表示樣品的細(xì)菌多樣性程度,其值越高反映細(xì)菌群落的物種多樣性越高,分布也越均勻。當(dāng)3個(gè)樣品的Shannon指數(shù)曲線最終趨于平緩時(shí),紅果1號(hào)的細(xì)菌多樣性程度最高,粵椹大10最低。

2. 2 在門水平上的細(xì)菌群落豐度分析結(jié)果

從門水平來(lái)看,細(xì)菌種類最多的品種是嘉陵30號(hào)(26門),最少的是粵椹大10(24門)。變形菌門(Proteobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)和厚壁菌門(Firmicutes)的相對(duì)豐度較高,分別為37.2%、25.4%和14.1%,在3個(gè)土壤混合樣品中3種細(xì)菌門的相對(duì)豐度之和占土壤細(xì)菌總量的76.7%。將群落相對(duì)豐度水平位于前10的細(xì)菌(相對(duì)豐度>0.4%)按照樣品和分類進(jìn)行聚類后繪制熱圖,結(jié)果顯示,3個(gè)樣品中的細(xì)菌大致分為兩簇,梭桿菌門(Fusobacteria)、芽單胞菌門(Gemmatimona-detes)和厚壁菌門等親緣關(guān)系較近的聚為一簇,硝化螺旋菌門(Nitrospirae)、綠彎菌門(Chloroflexi)和酸桿菌門(Acidobacteria)等聚為另一簇。不同品種桑樹(shù)根際土壤中細(xì)菌的相對(duì)豐度有一定差異,其中,酸桿菌門在紅果1號(hào)和嘉陵30號(hào)中的相對(duì)豐度較高,在粵椹大10中的相對(duì)豐度較低;硝化螺旋菌門和綠彎菌門在紅果1號(hào)中的相對(duì)豐度較高,在嘉陵30號(hào)和粵椹大10中的相對(duì)豐度較低。

2. 3 在綱水平上的細(xì)菌群落豐度分析結(jié)果

3個(gè)土壤樣品中的細(xì)菌在綱水平上群落組成最多的是粵椹大10和嘉陵30號(hào)(76綱),最少的是紅果1號(hào)(74綱)。α-變形菌綱(Alphaproteobacteria)、β-變形菌綱(Betaproteobacteria)、γ-變形菌綱(Gammaproteobacteria)、擬桿菌綱(Bacteroidia)和梭狀芽胞桿菌綱(Clostridia)等5個(gè)細(xì)菌綱的相對(duì)豐度較高,分別為24.3%、16.0%、12.3%、11.2%和7.7%,在3個(gè)土壤混合樣品中5個(gè)細(xì)菌綱的相對(duì)豐度之和占土壤細(xì)菌總豐度的71.5%。將群落相對(duì)豐度水平位于前20的細(xì)菌(相對(duì)豐度>0.4%)按照樣品和分類進(jìn)行聚類后繪制熱圖,結(jié)果顯示,嘉陵30號(hào)與粵椹大10細(xì)菌種類的組成相比紅果1號(hào)而言更相似;3個(gè)樣品中的細(xì)菌大致分為兩簇,α-變形菌綱和擬桿菌綱等7個(gè)綱親緣關(guān)系較的近聚為一簇,γ-變形菌綱和β-變形菌綱等13個(gè)綱聚為另一簇。

2. 4 在目水平上的細(xì)菌群落豐度分析結(jié)果

3個(gè)土壤樣品中的細(xì)菌在目水平上的群落組成分別是紅果1號(hào)88目、嘉陵30號(hào)71目和粵椹大10 78目。擬桿菌目(Bacteroidales)、腸桿菌目(Enterobacteriales)、梭菌目(Clostridiales)、酸桿菌目(Acidobacteriales)和伯克氏菌目(Burkholderiales)等5個(gè)細(xì)菌目的相對(duì)豐度較高,分別為24.3%、12.3%、10.6%、4.1%和3.8%,在3個(gè)土壤混合樣品中5個(gè)細(xì)菌目的相對(duì)豐度之和占土壤細(xì)菌總豐度的55.1%。將相對(duì)豐度位于前30的細(xì)菌(相對(duì)豐度>0.4%)按照樣品和分類進(jìn)行聚類后繪制熱圖,3個(gè)樣品中的細(xì)菌大致分為兩簇,擬桿菌目和梭菌目等14個(gè)目親緣關(guān)系較近的聚為一簇,酸桿菌目和伯克氏菌目等16個(gè)目聚為另一簇。在目水平上,3個(gè)樣品中的細(xì)菌組成存在差異,如黃單胞桿菌目(Xanthomonadales)和紅螺菌目(Rhodospirales)在紅果1號(hào)中的相對(duì)豐度較高,在嘉陵30號(hào)和粵椹大10中的相對(duì)豐度較低。

2. 5 在科水平上的細(xì)菌群落豐度分析結(jié)果

3個(gè)土壤樣品中的細(xì)菌在科水平上的群落組成最多的是紅果1號(hào)(149科),嘉陵30號(hào)(116科)和粵椹大10(118科)相對(duì)較少。擬桿菌科(Bacteroidaceae,14.2%)、腸桿菌科(Enterobacteriaceae,10.6%)、普雷沃氏菌科(Prevotellaceae,8.3%)、瘤胃菌科(Ruminococcaceae,5.6%)、酸桿菌科(Acidobacteriaceae,3.2%)、毛螺菌科(Lachnospiraceae,2.6%)和韋榮氏菌科(Veillonellaceae,3.2%)等7個(gè)細(xì)菌的相對(duì)豐度較高,在3個(gè)土壤混合樣品中7個(gè)細(xì)菌科的相對(duì)豐度之和占土壤細(xì)菌總豐度的47.7%。將相對(duì)豐度位于前40的細(xì)菌(相對(duì)豐度>0.2%)按照樣品和分類進(jìn)行聚類后繪制熱圖,3個(gè)樣品中的細(xì)菌大致分為兩簇,梭桿菌科(Fusobacteriaceae)和黃單胞菌科(Xanthomonadaceae)等26個(gè)科聚為一簇,瘤胃菌科和韋榮氏菌科等14個(gè)科聚為另一簇。在科水平上,隨著分類的細(xì)化,桑樹(shù)品種對(duì)細(xì)菌群落組成的影響越大。如鞘酯菌科(Sphingomonadaceae)在嘉陵30號(hào)中的相對(duì)豐度較高,在粵椹大10和紅果1號(hào)中的相對(duì)豐度較低。

2. 6 在屬水平上的細(xì)菌群落豐度分析結(jié)果

3個(gè)土壤樣品中共有細(xì)菌屬370個(gè),其中單個(gè)樣品最多的是嘉陵30號(hào)(370屬),紅果1號(hào)(354屬)和粵椹大10(351屬)相對(duì)較少。擬桿菌屬(Bacteroides,14.2%)、普氏菌屬(Prevotella,8.3%)、棲糞桿菌屬(Faecalibacterium,3.1%)、奈瑟氏球菌屬(Neisseria,2.1%)、鏈球菌屬(Streptococcus,1.2%)、薩特氏菌屬(Sutterella,1.2%)、考拉桿菌屬(Phascolarctobacterium,1.1%)、不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter,1.1%)和巨單胞菌屬(Megamonas,1.0%)等9個(gè)細(xì)菌屬相對(duì)豐度較高,在3個(gè)土壤混合樣品中9個(gè)細(xì)菌屬的相對(duì)豐度之和占土壤細(xì)菌總豐度的33.3%。將相對(duì)豐度位于前50的細(xì)菌(相對(duì)豐度>0.1%)分別按照樣品和分類進(jìn)行聚類后繪制熱圖,3個(gè)樣品中的細(xì)菌大致分為兩簇,羅氏菌屬(Roseburla)和薩特氏菌屬等37個(gè)屬聚為一簇,硝化螺菌屬(Nitrospira)和黃桿菌屬(Flavobacterium)等13個(gè)屬聚為另一簇。各樣品屬級(jí)分類聚類分析結(jié)果顯示,在屬的水平上,莫拉氏菌(Kaistobacter)在嘉陵30號(hào)中的相對(duì)豐度較高,在粵椹大10和紅果1號(hào)中則相對(duì)較低;艾克曼菌屬(Akkermansia)在紅果1號(hào)中未檢測(cè)出;分枝桿菌屬(Ramlibacter)在粵椹大10中未檢測(cè)出。

3 討論

土壤作為細(xì)菌的天然培養(yǎng)基,含有大量且豐富的細(xì)菌種類。相比于傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù),使用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)土壤細(xì)菌多樣性的研究鮮見(jiàn)報(bào)道,且高通量測(cè)序產(chǎn)出的數(shù)據(jù)量是傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù)無(wú)法比擬(明磊等,2018)。本研究采用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)3個(gè)不同品種的桑樹(shù)根際土壤細(xì)菌組成和結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究,分析了3個(gè)不同品種桑樹(shù)根際土壤細(xì)菌在門、綱、目、科、屬不同分類水平上的優(yōu)勢(shì)類群,共檢測(cè)出包括擬桿菌門、厚壁菌門和變形菌門等優(yōu)勢(shì)菌門在內(nèi)的26門,其中變形菌門是最豐富的細(xì)菌類群,與Constancias等(2015)、Docherty等(2015)的研究結(jié)果一致。但Heiko等(2016)發(fā)現(xiàn)酸桿菌門是歐洲山毛櫸和挪威云杉根際土壤中含量最豐富的細(xì)菌類群;而Kristin等(2016)在溫帶草原和森林土壤中發(fā)現(xiàn)放線菌門(Actinobacteria)是占主導(dǎo)地位的細(xì)菌類群,說(shuō)明不同植物根際土壤中存在不同的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌類群。

本研究共測(cè)出包括α-變形菌綱和β-變形菌綱等優(yōu)勢(shì)菌綱在內(nèi)的76綱;擬桿菌目和腸桿菌目等優(yōu)勢(shì)菌目在內(nèi)的88目,擬桿菌科和腸桿菌科等優(yōu)勢(shì)菌科在內(nèi)的149科,擬桿菌屬和普氏菌屬等優(yōu)勢(shì)菌屬在內(nèi)的370屬。3種不同品種桑樹(shù)根際間土壤細(xì)菌在門綱目科屬水平上的優(yōu)勢(shì)菌群及所占總比例分別為變形菌門(37.2%)、α-變形菌綱(24.3%)、擬桿菌目(24.3%)、擬桿菌科(14.2%)、擬桿菌屬(14.2%)。但隨著分類的細(xì)化,不同的桑樹(shù)品種對(duì)細(xì)菌群落組成和分布的影響越大,在目科屬水平上差異更明顯。如黃單胞桿菌目和紅螺菌目在紅果1號(hào)中的相對(duì)豐度較高,鞘酯菌科在嘉陵30號(hào)中的相對(duì)豐度較高,而分枝桿菌屬在粵椹大10中未檢測(cè)出。土壤細(xì)菌群落多樣性不僅與植物種類有關(guān),還與土壤落葉層、腐殖質(zhì)及理化性質(zhì)有關(guān);同時(shí),桑樹(shù)根系的生理活動(dòng)能改善土壤理化性質(zhì),使之適應(yīng)土壤中細(xì)菌的生長(zhǎng)(Tkacz et al.,2015)。實(shí)際應(yīng)用中可根據(jù)桑樹(shù)品種的不同,選擇合適的栽培土壤,改善土壤理化性質(zhì)并施用高效細(xì)菌肥料,以促進(jìn)桑樹(shù)根際間土壤優(yōu)勢(shì)細(xì)菌群落的形成,從而促進(jìn)桑樹(shù)生長(zhǎng)。

4 結(jié)論

變形菌門在供試3種桑樹(shù)品種根際土壤中均是最優(yōu)勢(shì)細(xì)菌類群,嘉陵30號(hào)桑樹(shù)品種根際土壤細(xì)菌種類最多,紅果1號(hào)桑樹(shù)品種土壤細(xì)菌分布最均勻。根際土壤細(xì)菌群落種類和均勻度可作為桑樹(shù)差異規(guī)模化種植的指標(biāo)。

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(責(zé)任編輯 麻小燕)

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