康捷 章淑艷 韓韜 孫志梅
(1. 河北省微生物研究所,保定 071051;2. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué),保定 071000)
根際土壤是指處于植物根際周圍受根系生長(zhǎng)直接影響的土壤,根際微生物是受植物影響最大的土壤微生物群體,與植物的生長(zhǎng)發(fā)育關(guān)系密切[1]。根際微生物群落結(jié)構(gòu)的變化對(duì)土壤中物質(zhì)和能量的循環(huán)、有機(jī)質(zhì)的分解與合成等方面產(chǎn)生重要影響[2]。研究表明,影響根際微生物群落結(jié)構(gòu)變化因素有很多,不同植物間、同一植物的不同基因型,甚至同一植物的不同生長(zhǎng)期其根際微生物的數(shù)量、種類也有很大差別[3]。根際分泌物為根際微生物的生長(zhǎng)提供營(yíng)養(yǎng)和能源物質(zhì),其對(duì)微生物的數(shù)量、種類、分布及微生物的生長(zhǎng)都有一定的影響[4]。土壤微生物從各個(gè)方面影響著植物的生長(zhǎng)發(fā)育,土壤微生物區(qū)系的動(dòng)態(tài)平衡是保證土壤健康的重要標(biāo)準(zhǔn),只有健康、良性循環(huán)的土壤生態(tài)環(huán)境才能保證植物的健康生長(zhǎng)。有些根際微生物可以產(chǎn)生激素類物質(zhì)促進(jìn)土壤有機(jī)質(zhì)分解、誘導(dǎo)植株增加抗性等,或者通過爭(zhēng)奪營(yíng)養(yǎng)、占領(lǐng)生態(tài)位等方式抑制病原菌的生長(zhǎng)來間接促進(jìn)植物的生長(zhǎng)[5]。根際微生物群落結(jié)構(gòu)失調(diào),可能會(huì)導(dǎo)致病原菌數(shù)量的增加,從而使作物減產(chǎn)。因此研究不同作物土壤微生物的變化或同一作物不同生長(zhǎng)時(shí)期土壤微生物的情況具有重要意義。
一直以來由于大多數(shù)的微生物在營(yíng)養(yǎng)培養(yǎng)基中可培養(yǎng)性低或不能被培養(yǎng)的缺陷嚴(yán)重制約了微生物多樣性的研究。隨著分子生態(tài)學(xué)研究技術(shù)的發(fā)展,以 DNA 為基礎(chǔ)的分子分析技術(shù),如PCR-RFLP、DGGE/TGGE、SSCPP 等可以克服傳統(tǒng)培養(yǎng)技術(shù)的限制,從分子水平來直接分析微生物群落結(jié)構(gòu)的變化,然而這些技術(shù)存在檢測(cè)限低、工作量大等缺陷[6]。高通量測(cè)序等非傳統(tǒng)培養(yǎng)方法成為了研究土壤微生物多樣性和群落結(jié)構(gòu)特征的有力工具,其具有速度快,耗時(shí)少,成本低廉,準(zhǔn)確度高等優(yōu)點(diǎn),能更真實(shí)地反映環(huán)境中群落的特點(diǎn)。目前,高通量測(cè)序技術(shù)主要是 Illumina、Roche454 和 Life Technologies 等公司開發(fā)的測(cè)序平臺(tái)[7]。
張亮等[8]研究了不同品種百合在不同生育期根際土壤微生物種類、數(shù)量的變化規(guī)律,結(jié)果顯示在生育期內(nèi),細(xì)菌數(shù)量最多;其次為真菌,放線菌。孫建波等[9]通過對(duì)香蕉不同生長(zhǎng)期根際土壤細(xì)菌多樣性和數(shù)量的研究,結(jié)果顯示,細(xì)菌數(shù)量呈現(xiàn)先增加后減少的趨勢(shì),多樣性逐漸減少。仝利紅等[10]研究草莓不同生育期根區(qū)微生物多樣性及動(dòng)態(tài)變化,結(jié)果表明,根區(qū)可培養(yǎng)微生物總量從開始生長(zhǎng)期到盛果期逐漸增多,細(xì)菌群落多樣性指數(shù)和豐度在生長(zhǎng)末期達(dá)到最高,而真菌在現(xiàn)蕾期達(dá)到最高。常穎萃等[11]測(cè)定了竹蓀不同生育期內(nèi)土壤中細(xì)菌、真菌、放線菌3種微生物的數(shù)量,研究了土壤微生物動(dòng)態(tài)變化規(guī)律。胡延森等[12]對(duì)黃瓜根際主要微生物類群在不同生育期變化的研究,結(jié)果表明,根際微生物的數(shù)量一般是由栽種時(shí)開始升高,到花期或盛果期時(shí)達(dá)到最高峰,生長(zhǎng)后期有下降趨勢(shì),同時(shí)黃瓜生長(zhǎng)對(duì)某些種群數(shù)量分布有一定影響,也說明這些類群微生物可能是對(duì)黃瓜花期生長(zhǎng)起特殊作用。
目前尚未有報(bào)道對(duì)麻山藥不同生長(zhǎng)時(shí)期根際土壤微生物多樣性及群落結(jié)構(gòu)特性的研究,本研究以麻山藥為實(shí)驗(yàn)材料,采集麻山藥苗期、花期和收獲期的根際土樣。運(yùn)用 Illumina 測(cè)序平臺(tái)對(duì)土壤樣品細(xì)菌16S rDNA和真菌ITS rDNA 進(jìn)行了高通量測(cè)序,通過比較不同時(shí)期麻山藥根際土壤微生物多樣性、均勻度和優(yōu)勢(shì)種群集中度的變化及真菌、細(xì)菌量的變化,探究3個(gè)不同生長(zhǎng)期的麻山藥根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)多樣性及變化,從而揭示麻山藥不同生長(zhǎng)期微生物群落特點(diǎn)及變化規(guī)律,這對(duì)評(píng)價(jià)生長(zhǎng)期對(duì)土壤微生物多樣性的影響具有重要意義。
本研究所選地塊為河北省蠡縣小鐘麻山藥農(nóng)業(yè)合作社的麻山藥地,第2年種植。山藥品種,紫藥。播前土壤有機(jī)質(zhì)含量7.12 g/kg、堿解氮28.45 mg/kg、速效磷6.73 mg/kg、速效鉀63.37 mg/kg。測(cè)定方法參照文獻(xiàn)[13]。
在2016年5月1日,7月18日(苗期),8月24日(花期)和10月15日(收獲期)進(jìn)行樣品采集,在試驗(yàn)地內(nèi)選取5個(gè)取樣點(diǎn),撥開麻山藥根系周圍的表土層,在離麻山藥根基軸表面1-5 mm處,用抖落法獲取其上黏附的土壤作為根際土壤[14]。不同時(shí)期的5個(gè)土樣混合并除去較大根系等雜物后作為該時(shí)期土壤的一個(gè)樣品,每組做3個(gè)平行,裝于無菌牛皮紙袋中帶回實(shí)驗(yàn)室。新鮮的土壤置-20℃冰箱冷凍保存,用于后續(xù)微生物多樣性的測(cè)定。
1.2.1 土壤DNA提取與檢測(cè) 采用土壤基因組DNA提取試劑盒(離心柱型,天根生化科技有限公司)提取土壤總DNA,瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(普通離心柱型,天根生化科技有限公司)進(jìn)行純化,經(jīng)1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)及微量核酸蛋白檢測(cè)儀檢測(cè)濃度后置于-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 基因擴(kuò)增 PCR反應(yīng)體系:DNA模板1 μL,10×Buffer 5 μL,2.5 mmol/L dNTPS 4 μL,Taq DNA聚合酶0.5 μL,上下游引物各1.5 μL,無菌超純水補(bǔ)充至 50 μL。
以30-50 ng DNA為模板,使用金唯智設(shè)計(jì)的PCR引物擴(kuò)增原核生物16S rDNA上包括 V3、V4 及V5的3個(gè)高度可變區(qū)。采用包含CCTACGGRRBGCASCAGKVRVGAAT序列的上游引物和包含GGACTACNVGGGTWTCTAATCC序列的下游引物擴(kuò)增V3和V4區(qū),采用包含GTGYCAGCMGCCGCGGTAA序列的上游引物和包含CTTGTGCGGKCCCCCGYCAATTC 序列的下游引物擴(kuò)增V4和V5區(qū)。以5-50 ng DNA 為模板,PCR擴(kuò)增真菌ITS rDNA上的 ITS2可變區(qū)。
擴(kuò)增程序:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性50 s,50-60℃退火50 s,72℃延伸1.5 min,30個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。
1.2.3 高通量測(cè)序 高通量測(cè)序文庫(kù)的構(gòu)建和基于I11umina MiSeq平臺(tái)的測(cè)序由GENEWIZ公司(Suzhou,China)完成。雙端測(cè)序得到的正反向reads 首先進(jìn)行兩兩組裝連接,過濾拼接結(jié)果中含有N的序列,保留序列長(zhǎng)度大于200 bp的序列。經(jīng)過質(zhì)量過濾,去除嵌合體序列,最終得到的序列用于OTU分析,使用 VSEARCH(1.9.6)進(jìn)行序列聚類(序列相似性設(shè)為97%),比對(duì)的16S rRNA參考數(shù)據(jù)庫(kù)是Silva 119,ITS rRNA參考數(shù)據(jù)庫(kù)是UNITE ITS database(https://unite.ut.ee/)。 然 后 用 RDP classifier(Ribosomal databaseprogram)貝葉斯算法對(duì)OTU的代表性序列進(jìn)行物種分類學(xué)分析,并在不同物種分類水平下統(tǒng)計(jì)每個(gè)樣本的群落組成?;贠TU的分析結(jié)果,采用對(duì)樣本序列進(jìn)行隨機(jī)抽樣的方法,分別計(jì)算Shannon、Chao1等α多樣性指數(shù),并作出稀釋曲線。通過層次聚類(Hierarchical clustering)中的非加權(quán)組平均法構(gòu)建(Unweighted pair group method with arithmetic mean,UPGMA)進(jìn)化樹。
2.1.1 麻山藥不同生長(zhǎng)期土壤樣本細(xì)菌測(cè)序特性 由于高通量測(cè)序常常會(huì)出現(xiàn)一些突變等錯(cuò)誤,對(duì)測(cè)序結(jié)果的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行優(yōu)化處理,處理步驟及參數(shù):將2條序列進(jìn)行比對(duì),根據(jù)比對(duì)的末端重疊區(qū)進(jìn)行拼接,拼接時(shí)保證至少有20 bp的重疊區(qū),去除拼接結(jié)果中含有N的序列;去除引物和接頭序列,去除兩端質(zhì)量值低于20的堿基,去除長(zhǎng)度小200 bp的序列;將上面拼接過濾后的序列與數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),去除其中的嵌合體序列(Chimera sequence),得到最終的有效數(shù)據(jù)。
對(duì)于細(xì)菌群落來說,樣品在不用生長(zhǎng)時(shí)期統(tǒng)計(jì)結(jié)果如表1所示。
隨著樣品量的加大,可能出現(xiàn)測(cè)序檢測(cè)到的物種種類隨之增加的狀況,稀釋曲線(Rarefaction curve)是調(diào)查樣品的物種組成和預(yù)測(cè)樣品中物種豐度的有效工具,在生物多樣性和群落調(diào)查中,常用于判斷樣品量是否充分及估計(jì)物種的豐富度。從圖1和圖2可以看出,麻山藥不同生長(zhǎng)期樣品對(duì)應(yīng)的稀釋曲線均基本趨于平緩,說明取樣基本合理,細(xì)菌(或真菌)群落結(jié)構(gòu)的置信度較高,能比較真實(shí)地反映出樣品在不同生長(zhǎng)時(shí)期的細(xì)菌(或真菌)群落。
2.1.2 麻山藥不同生長(zhǎng)期土壤細(xì)菌多樣性指數(shù)分析 群落生態(tài)學(xué)中,α多樣性主要關(guān)注單樣本的多樣性分析,可以反映微生物群落中物種的數(shù)目,通過一系列統(tǒng)計(jì)學(xué)指數(shù)的分析來估計(jì)環(huán)境群落的物種豐度和多樣性。由表2可以看出,不同生長(zhǎng)期細(xì)菌的Good's Coverage指數(shù)都接近100%,說明樣本序列中沒有被測(cè)出的概率很低,在該水平上的測(cè)序結(jié)果能夠反映出所測(cè)樣本中細(xì)菌的真實(shí)情況。計(jì)算菌群豐度的指數(shù)有ACE和Chao,計(jì)算菌群多樣性指數(shù)有Shannon和Simpson,由表2可以看出,不同生長(zhǎng)期土壤中細(xì)菌豐度和多樣性之間沒有顯著性差異。
2.1.3 不同生長(zhǎng)期細(xì)菌種類分布 使用RDP classifier對(duì)97%相似水平的OTU代表序列進(jìn)行分類學(xué)分析,從而獲得每個(gè)樣品在各個(gè)水平對(duì)應(yīng)的群落組成。如表3所示,不同時(shí)期的土壤樣品中檢測(cè)到12個(gè)以上細(xì)菌門,其相對(duì)豐度均大于1%,說明這12個(gè)門的細(xì)菌在本實(shí)驗(yàn)中所取的土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成中占主要地位。
圖2 不同時(shí)期土壤樣品真菌稀釋曲線
表2 不同時(shí)期土壤細(xì)菌的α-多樣性指數(shù)
表3 主要細(xì)菌門的相對(duì)豐度
2.1.4 不同生長(zhǎng)期主要細(xì)菌物種分布 與Silva數(shù)據(jù)庫(kù)相對(duì)比,獲得各樣品細(xì)菌在門水平下Top30的物種分布圖。如圖3所示,結(jié)合上表分析得出,不同生長(zhǎng)期土壤中變形菌門均為最優(yōu)菌群,苗期、花期和收獲期所占的比例分別達(dá)到35.22%、29.44%和28.30%,隨著種植時(shí)間的延長(zhǎng),其所占的比例呈下降的趨勢(shì),即在麻山藥苗期所占的比例最高,較其他兩組都有顯著性差異(P<0.05),花期和收獲期兩組之間沒有顯著性差異;其次為酸桿菌門,兩者之和在不同生長(zhǎng)期所占的比例之和超過了50%,苗期、花期和收獲期酸桿菌門所占的比例分別為21.03%、24.85%和23.28%,在麻山藥花期土壤中酸桿菌門達(dá)到最高。此外,放線菌門、芽單胞菌門和擬桿菌門在麻山藥種植中不同生長(zhǎng)期內(nèi)均為優(yōu)勢(shì)菌群(所占比例超過5%),其中擬桿菌門同樣在麻山藥苗期達(dá)到最高,為9.15%,比花期和收獲期高3.69和3.75個(gè)百分點(diǎn),有顯著性差異(P<0.05)。其他菌群(所占比例超過1%,但低于5%)中,硝化螺細(xì)菌門所占比例在花期接近5%,顯著高于其他兩個(gè)時(shí)期,而綠彎菌門和浮霉菌門均在收獲期所占比例最高。
圖3 不同時(shí)期土壤樣品在門水平前30的細(xì)菌物種分布圖
2.1.5 不同生長(zhǎng)期細(xì)菌群落相似度聚類樹分析 樣品聚類分析利用各樣品序列間的進(jìn)化信息來比較在特定的進(jìn)化譜系中是否具有顯著的微生物群落差異,使用非加權(quán)組平均法(Unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)將樣品進(jìn)行聚類,結(jié)果(圖4)顯示,不同生長(zhǎng)時(shí)期土壤中細(xì)菌組成可以分為兩大類,圖4中苗期和花期土壤的細(xì)菌群落組成具有很高的相似性,苗期第1組和第3組具有很高的相似性,并與第2組的土壤樣品聚為一類,花期第3組和第2組具有很高的相似性,并與收獲期第一組的土壤樣品聚為一類,同時(shí)這6組土壤樣品的趨同性較高,而收獲期第3組和第2組樣品具有很高的相似性,并與花期第1組的土壤樣品聚為一類。由此可以得知,麻山藥不同生長(zhǎng)時(shí)期的土壤細(xì)菌群落多樣性之間雖然有不同程度的差異,但是苗期和花期兩組之間群落組成結(jié)構(gòu)相似性較高,與收獲期之間也存在趨同性。
2.2.1 麻山藥不同生長(zhǎng)期土壤樣本真菌測(cè)序特性 對(duì)真菌群落來說,樣品在不同生長(zhǎng)時(shí)期過濾后統(tǒng)計(jì)結(jié)果如表4所示。
圖4 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)UPGMA聚類圖
表4 不同時(shí)期真菌樣本統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)
2.2.2 麻山藥不同生長(zhǎng)期土壤真菌多樣性指數(shù)分析 由表5看出,不同生長(zhǎng)期真的Good’s Coverage指數(shù)都接近100%,說明樣本序列中未被測(cè)出的概率很低,在該水平上的測(cè)序結(jié)果能夠反映出所測(cè)樣本中真菌的真實(shí)情況。麻山藥不同生長(zhǎng)期土壤中真菌豐度之間同細(xì)菌一樣無顯著性差異,但表現(xiàn)為收獲期>花期>苗期。由表5中Shannon和Simpson指數(shù),同樣真菌多樣性也表現(xiàn)為收獲期>花期>苗期,且收獲期和花期的多樣性指數(shù)顯著高于苗期。由此可見,麻山藥種植過程中,不同生長(zhǎng)期內(nèi)真菌變化較大,隨著種植時(shí)間的延長(zhǎng),真菌豐度和多樣性明顯提高,說明真菌數(shù)量也有明顯提高。同時(shí),在不同生長(zhǎng)發(fā)育時(shí)期,麻山藥根系生理活動(dòng)代謝活動(dòng)的強(qiáng)弱也不同,生長(zhǎng)后期會(huì)出現(xiàn)特定菌屬所占比例顯著高于其他時(shí)期,這與作物生長(zhǎng)所需有關(guān)。
2.2.3 不同生長(zhǎng)期真菌種類分布 同樣使用RDP classifier對(duì)97%相似水平的OTU代表序列進(jìn)行分類學(xué)分析,獲得每個(gè)樣品在各個(gè)水平對(duì)應(yīng)的群落組成。如表6所示,不同時(shí)期的土壤樣品中檢測(cè)到13個(gè)以上真菌屬??梢?,這13個(gè)屬的真菌在本實(shí)驗(yàn)中所取的土壤真菌群落結(jié)構(gòu)組成中占主要地位。
2.2.4 不同生長(zhǎng)期主要真菌物種分布 對(duì)比Silva數(shù)據(jù)庫(kù),各樣品真菌在屬水平下Top30的物種分布圖如圖5所示。結(jié)合上表分析得出,與細(xì)菌不同的是不同生長(zhǎng)期土壤中最優(yōu)真菌菌屬不同,放射毛霉屬是麻山藥苗期最優(yōu)菌屬,所占比例為13.8%,而花期和收獲期的最優(yōu)菌屬為被孢霉屬,所占比例分別為6.97%和7.86%。根霉屬在麻山藥種植初期,即苗期所占的比例最高,達(dá)2.51%,比花期和收獲期高2.11和1.89個(gè)百分點(diǎn),差異顯著(P<0.05)。肉坐菌屬、毛殼菌屬和綠僵菌屬,在麻山藥的花期所占比例最高,分別為2.47%、1.16%和1.02%,而其他兩個(gè)時(shí)期的比例卻只有不到1.0%甚至更低,有顯著性差異(P<0.05),毛殼菌屬作為生防菌在防治植物病害方面最為突出,是腐生子囊菌中數(shù)量最多和意義較大的類群之一。被孢霉屬、接合菌屬、翅孢殼屬和球囊霉屬所占的比例在麻山藥種植期間呈上升趨勢(shì),即在收獲期最高,分別達(dá)到7.86%、1.25%、1.26%和1.12%,顯著高于其他兩個(gè)時(shí)期,花期和收獲期的比例均不到0.5%(被孢霉屬除外)。
表5 各處理組土壤真菌的α-多樣性指數(shù)
表6 主要真菌屬的相對(duì)豐度
2.2.5 不同生長(zhǎng)期真菌群落相似度聚類樹分析 不同生長(zhǎng)時(shí)期麻山藥土壤樣品真菌群落結(jié)構(gòu)聚類,結(jié)果(圖6)顯示,不同時(shí)期土壤中真菌組成分為兩大類,花期第3組土壤樣品與第2組之間具有很高的相似性,并與苗期第3組土壤樣品聚為一類;收獲期第2組土壤樣品和第3組之間有很高的相似性,并與第1組土壤樣品聚為一類,這6組樣品與苗期第2組樣品之間有較高的相似性,并與花期第一組樣品聚為一類;苗期第1組土壤樣品單獨(dú)聚為一類,與其余幾組之間真菌群落結(jié)構(gòu)存在相對(duì)較大的差異性。
圖5 不同時(shí)期土壤樣品在屬水平前30的真菌物種分布圖
土壤微生物區(qū)系是土壤質(zhì)量的變化的主要因素之一,同時(shí)也決定了土壤是否健康,土壤微生物區(qū)系與許多土傳病害之間都有著密切的聯(lián)系,研究表明,土壤健康的顯著特征是土壤微生物生物量大、多樣性高和土壤微生物區(qū)系組成的動(dòng)態(tài)平衡[15]。微生物培養(yǎng)計(jì)數(shù)作為傳統(tǒng)的分析方法在土壤微生物研究中具有重要作用,但是,傳統(tǒng)的分析方法不能反映其在土壤中的真實(shí)情況,需要采用新的方法進(jìn)行研究分析[16]。隨著人們對(duì)微生物在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中重要作用的認(rèn)識(shí)不斷加深,用土壤微生物學(xué)特性來評(píng)價(jià)土壤的健康程度和質(zhì)量日漸被認(rèn)可[17],用高通量手段測(cè)定的多樣性指標(biāo)可以作為評(píng)價(jià)土壤健康程度的一種指標(biāo),與傳統(tǒng)的培養(yǎng)測(cè)數(shù)法相比,都是一種手段。
圖6 真菌群落結(jié)構(gòu)UPGMA聚類圖
本研究運(yùn)用高通量測(cè)序技術(shù)探究3個(gè)不同生長(zhǎng)時(shí)期麻山藥根際土壤中細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)變化,計(jì)算菌群豐度的指數(shù)有ACE和Chao,由Chao于1984最早提出[18],在生態(tài)學(xué)中常用來估計(jì)物種總數(shù),計(jì)算菌群多樣性的指數(shù)有Shannon和Simpson,辛普森(Simpson)多樣性指數(shù),由Edward Hugh Simpson于1949提出,在生態(tài)學(xué)中常用來定量的描述一個(gè)區(qū)域的生物多樣性,其值越高,說明群落多樣性越高[19]。通過對(duì)麻山藥不同生長(zhǎng)期根際土壤分析可知,不同生長(zhǎng)期土壤中細(xì)菌豐度和多樣性之間沒有顯著性差異,變形菌門和酸桿菌門是麻山藥根際細(xì)菌群落的最優(yōu)菌群。而真菌在不同生長(zhǎng)時(shí)期變化趨勢(shì)明顯,從開始生長(zhǎng)期到收獲期逐漸增多,在收獲期時(shí)多樣性指數(shù)和豐度達(dá)到最高,放射毛霉屬和被孢霉屬始終是真菌群落的最優(yōu)菌群。結(jié)合其他優(yōu)勢(shì)菌群在不同生長(zhǎng)時(shí)期的明顯變化,可以看出,這些菌群跟麻山藥生長(zhǎng)發(fā)育密切相關(guān)。這表明麻山藥的生長(zhǎng)期對(duì)根際土壤細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)均有重要的影響。
有研究表明,真菌是參與土壤有機(jī)物質(zhì)分解過程中的主要成員之一,它們分解纖維素、半纖維素、木質(zhì)素、單寧等化合物的能力遠(yuǎn)大于細(xì)菌,從而有利于改良土壤結(jié)構(gòu),提高土壤肥力,促進(jìn)作物生長(zhǎng)[20]。研究顯示真菌數(shù)量在收獲期達(dá)到最高值,表明麻山藥種植后期根際生理代謝活動(dòng)加強(qiáng),其產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物僅有利于某些特定菌群的生長(zhǎng),從而顯著高于其他時(shí)期,而這些優(yōu)勢(shì)菌群對(duì)其他菌群具有競(jìng)爭(zhēng)優(yōu)勢(shì),結(jié)構(gòu)造成部分真菌成為優(yōu)勢(shì)菌群并大量繁殖,另外一些菌群則在競(jìng)爭(zhēng)中被抑制。早在1954年,Martin和Moorc[21]發(fā)現(xiàn),燕麥種子被球毛殼和螺卷毛殼侵染后,會(huì)使谷物、大麥等作物的幼苗免受鐮刀菌的再侵染[22],這點(diǎn)與測(cè)定結(jié)果相一致,被孢霉屬、接合菌屬、翅孢殼屬和球囊霉屬所占的比例在麻山藥種植期間呈上升趨勢(shì),在收獲期最高,說明這幾種真菌在麻山藥種植后期發(fā)揮作用。麻山藥種植不同時(shí)期內(nèi)真菌含量及所占的比例各不相同,說明不同類別的菌屬在不同時(shí)期所起的作用不同,這跟作物生長(zhǎng)所需有關(guān)。
研究同時(shí)發(fā)現(xiàn),麻山藥不同生長(zhǎng)時(shí)期所有樣品中共包含29個(gè)細(xì)菌門,其中變形菌門和酸桿菌門的相對(duì)豐度最高,兩者在不同時(shí)期所占比例均超過了50%;其次是放線菌門、芽單胞菌門和擬桿菌門,這3大門類分別所占的比例均超過了5%。袁紅朝等[23]分析稻田土壤細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)變形菌、酸桿菌和綠彎菌是優(yōu)勢(shì)細(xì)菌;其次是放線菌。牛世全等[24]分析河西走廊地區(qū)鹽堿土壤群落結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)變形菌門含量最高,占 28.56%;其次是放線菌門,占 17.2%。楊菁等[25]發(fā)現(xiàn)降香黃檀不同混交林土壤細(xì)菌多樣性主要菌群有變形菌門、酸桿菌門、放線菌門及綠彎菌門。結(jié)果均與本研究相一致。而真菌相對(duì)豐度在不同時(shí)期變化顯著,苗期、花期和收獲期分別包含有64、67和75個(gè)真菌屬,其中放射毛霉屬和被孢霉屬是真菌群落的最優(yōu)菌群,兩者在不同時(shí)期所占的比例約15%,結(jié)合其他優(yōu)勢(shì)菌群在不同生長(zhǎng)時(shí)期的明顯變化,可以看出,這些菌群在不同生長(zhǎng)時(shí)期所占的比例有所不同,可能與作物生長(zhǎng)發(fā)育有關(guān)。
本文研究了麻山藥在苗期、花期和收獲期根際土壤微生物群落結(jié)構(gòu)的變化,變形菌門和酸桿菌門是麻山藥根際細(xì)菌群落的最優(yōu)菌群,放射毛霉屬和被孢霉屬是真菌群落的最優(yōu)菌群,同時(shí)真菌數(shù)量在收獲期達(dá)到最高值,可以看出,這些菌群含量不同與麻山藥生長(zhǎng)發(fā)育密切相關(guān)。因此,為后續(xù)在研究麻山藥土傳病害的方面提供理論依據(jù),可通過研發(fā)土壤菌劑調(diào)節(jié)劑的手段,從而改變土壤微生物菌群的組成,使其通過細(xì)菌與細(xì)菌之間、真菌與真菌之間或細(xì)菌與真菌之間的相互作用,達(dá)到抑制病原微生物的生長(zhǎng),提高抗病性的目的。