邱志偉,陳有忠,于奧安,朱偉垚,楊俊林,陳招榮
(天津農(nóng)學(xué)院 園藝園林學(xué)院,天津 300384)
棗(Ziziphus jujubeMill)原產(chǎn)于我國,是我國特有的且重要的干果和特色經(jīng)濟(jì)樹種之一,是山區(qū)丘陵區(qū)發(fā)展農(nóng)村經(jīng)濟(jì)的支柱產(chǎn)業(yè),與杏、桃、李、栗并稱為“五果”,是我國第一大干果樹及第七大果樹,在經(jīng)濟(jì)果樹中占有重要地位[1-2]。天津地區(qū)的棗樹種植歷史可追溯至600多年前,被廣泛種植于海河下游地區(qū),其中以金絲小棗、冬棗等優(yōu)良品種為代表,具有耐旱、耐澇、耐鹽堿、經(jīng)濟(jì)效益高等特點(diǎn),成為天津地區(qū)經(jīng)濟(jì)作物中不可或缺的一部分。早在1984年天津靜海就獲得了“中國金絲小棗之鄉(xiāng)”的美譽(yù),在出口、加工制品等方面具有很大的發(fā)展?jié)摿3]。在種植中,棗樹病蟲害種類多、分布廣、危害嚴(yán)重是導(dǎo)致產(chǎn)量減少、品質(zhì)下降的主要原因。據(jù)調(diào)查,當(dāng)前天津地區(qū)對棗樹危害較重的病蟲害有十余種,其中病害以棗炭疽病、縮果病、棗瘋病、棗銹病等為代表[4]。目前,主要使用化學(xué)藥劑進(jìn)行防治,化學(xué)防治易導(dǎo)致病原菌產(chǎn)生抗藥性,隨之出現(xiàn)食品安全、環(huán)境污染等問題,所以無公害的生物防治已經(jīng)成為新趨勢,天津農(nóng)學(xué)院研究開發(fā)的TJ生防菌劑,田間試驗(yàn)表明對瓜類白粉病有著很好的防治效果[5]。
近年來,隨著研究的不斷深入,植物內(nèi)生菌作為潛在生防資源和外源基因載體及其所發(fā)揮的重要的生態(tài)和生理作用,在農(nóng)業(yè)及醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中展現(xiàn)出巨大的研究價值,如何利用內(nèi)生菌逐漸成為國內(nèi)外研究的熱點(diǎn)。研究表明,從植物各部位可分離出很多內(nèi)生菌,經(jīng)過篩選部分內(nèi)生菌對植物病害有很好的拮抗作用,為生物防治各種病害提供了基礎(chǔ)[6-10]。目前,在棗樹根部有益內(nèi)生菌篩選及其用于棗類病害生物防治這一領(lǐng)域研究不多,有著巨大的研究開發(fā)潛力。本研究擬從棗樹根部組織分離出內(nèi)生細(xì)菌,進(jìn)行形態(tài)和分子鑒定,并分別以棗黑點(diǎn)、棗鏈格、棗輪紋的病原菌為靶標(biāo),篩選出具有拮抗作用的內(nèi)生細(xì)菌,為進(jìn)一步利用內(nèi)生細(xì)菌進(jìn)行生物防治提供基礎(chǔ)。
試驗(yàn)所用棗樹根部組織均采自于天津農(nóng)學(xué)院東校區(qū)二教小花園。采集的新鮮材料帶回室內(nèi)4 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
抑菌測試菌株:棗黑點(diǎn)病病原菌仁果莖點(diǎn)霉(Phoma pomirumThum)和細(xì)交鏈格孢菌(Alternaria alternateKeissler)和棗輪紋病原菌葡萄座腔菌(Botryosphaeria dothidea)由天津農(nóng)學(xué)院植物病理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室提供。
培養(yǎng)基:馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA)、LB培養(yǎng)基[11]。
1.2.1 內(nèi)生細(xì)菌的分離純化
將采集到的棗樹根部組織用清水洗凈泥沙及表面附著物,稱取0.02 g放入超凈工作臺風(fēng)干水分,依次用75%乙醇溶液、3%次氯酸鈉進(jìn)行表面消毒,再用無菌水沖洗3~4次,取最后一次清洗的水涂布于LB平板檢測消毒是否徹底。消毒完全后的樣本在超凈工作臺風(fēng)干后,剪碎置于無菌研缽中,加入1 mL無菌水研磨成漿液。將研磨液轉(zhuǎn)移至無菌試管中,1 000 r/min離心1 min去除大部分根部組織,取上清液進(jìn)行梯度稀釋10-1~10-3,每個梯度取100 μL菌液涂布于LB平板中,28 ℃培養(yǎng)箱倒置培養(yǎng)。待內(nèi)生細(xì)菌長出之后,用平板劃線法反復(fù)純化,在平板表面得到單菌落,4 ℃下保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 革蘭氏染色
參考張嫻[12]的方法進(jìn)行革蘭氏染色。
1.2.3 內(nèi)生細(xì)菌的初步鑒定
挑取內(nèi)生細(xì)菌的單菌落放于裝有液體 LB的試管中,放置于 33 ℃的搖床(200 r/min)搖培10 h。然后用 EasyPure?Bacteria Genomic DNA Kit試劑盒提取DNA,方法步驟參考試劑盒說明書;提取出DNA后以此為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,引物為細(xì)菌通用的 27F(5'-AGAGTTTGATCCTGGC TCAG-3')/1 492 R(5'-TACGGTTACCTTGTTACG ACTT-3')。PCR 擴(kuò)增體系,體系:PCR Mix 25 μL,引物 27F 1 μL,引物 1 492R 1 μL,模板 DNA 2 μL,重蒸水21 μL,總體積50 μL。擴(kuò)增條件:預(yù)變性95 ℃ 5 min;變性 94 ℃ 45 s;退火 53 ℃ 40 s;延伸72 ℃ 45 s;變性、退火、延伸循環(huán)20次;終延伸72 ℃ 10 min;4 ℃保存。用凝膠電泳法檢測PCR反應(yīng)結(jié)果,取3 μL PCR產(chǎn)物與1 μL 6×DNA Loading Buffer 混合后加入1%瓊脂凝膠點(diǎn)樣孔中,在110 V的電壓下進(jìn)行電泳。待DNA跑至凝膠中央時結(jié)束,Goldview染色10 min,觀測。將擴(kuò)增后的DNA產(chǎn)物送至北京華大基因公司進(jìn)行測序。測序結(jié)果利用NCBI中的BLAST軟件對測序結(jié)果進(jìn)行序列同源性對比搜索。
1.2.4 拮抗活性內(nèi)生細(xì)菌的篩選
采用對峙培養(yǎng)法,將在PDA平板上活化培養(yǎng)5 d的病原菌,用直徑6 mm的無菌打孔器在菌絲生長外緣打取菌餅若干,放置于新的PDA平板中央,將從棗根部組織分離得到的內(nèi)生細(xì)菌點(diǎn)接在距離中央2.5 cm處的相對對角線上,每個平板點(diǎn)接4種內(nèi)生菌,每個處理重復(fù)2次,置于28 ℃培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng)5 d后,觀察是否存在抑菌帶。
分離操作中最后一次清洗的水涂布于 LB固體培養(yǎng)基上培養(yǎng)觀察,平板并未長出菌落,說明材料表面消毒完全。分離得到的內(nèi)生細(xì)菌根據(jù)形態(tài)差異進(jìn)行平板劃線純化,最終獲得18個差異菌株,對其命名為Z1~Z18。
將Z1~Z18進(jìn)行革蘭氏染色,對其進(jìn)行初步分類鑒定。革蘭氏染色顏色呈紫色為陽性菌,呈紅色為陰性菌,如圖1所示。
圖1 Z4號、Z12號菌革蘭氏染色鏡檢結(jié)果
18株內(nèi)生細(xì)菌革蘭氏染色結(jié)果如表1,其中12個菌株為革蘭氏陰性菌,占鑒定總數(shù)的2/3,而革蘭氏陽性菌為6個菌株,為1/3;可以看出棗內(nèi)生細(xì)菌大部分為革蘭氏陰性菌,內(nèi)生菌中革蘭氏陽性菌和陰性菌的比例與前人研究結(jié)果一致[13]。
表1 革蘭氏染色結(jié)果
將提取出來的內(nèi)生細(xì)菌總DNA作為模板,使用細(xì)菌通用引物27 F/1 492 R擴(kuò)增,經(jīng)1.0%的瓊脂糖凝膠上點(diǎn)樣電泳,均獲得了約1.5 kb的目的條帶(圖2~圖3),結(jié)果說明,成功擴(kuò)增了內(nèi)生細(xì)菌的16S rRNA基因的DNA片段。
將內(nèi)生細(xì)菌的16S rRNA基因片段的PCR產(chǎn)物或PCR產(chǎn)物連接載體的陽性克隆菌液送至華大基因公司測序,得到18個菌株的16S rRNA基因的DNA片段序列。
圖2 從左到右Z1~Z6號,Z7~Z10號菌PCR擴(kuò)增的電泳結(jié)果
圖3 Z11~Z18號菌PCR擴(kuò)增的電泳結(jié)果
利用NCBI中的BLAST軟件對測序結(jié)果進(jìn)行序列同源性比對搜索,結(jié)果18個菌株均找到與其相似度最高的菌株(見表2),分屬于6個屬,分別為金黃桿菌屬(Chryseobacterium)1株、假單胞菌屬(Pseudomonas)5株、芽孢桿菌屬(Bacillus Cohn)6株、志賀氏菌屬(Shigella Castellani)1株、埃希氏菌屬(Escherichia coli)3株、寡養(yǎng)單胞菌屬(Stenotrophomonas)2株。優(yōu)勢菌群是芽孢桿菌屬(Bacillus)。大部分棗樹的內(nèi)生細(xì)菌與NCBI存在序列的同源性超過97%。
表2 Z1~Z18內(nèi)生細(xì)菌鑒定結(jié)果
續(xù)表2
利用MEGA7.0對分離的內(nèi)生細(xì)菌的16S rRNA基因序列以及在 NCBI上比對同源性最高的序列進(jìn)行序列比對,刪去前后未被匹配上的堿基,以鄰近相接法(Neighbor-joining法)對18株分離得到的內(nèi)生細(xì)菌以及與 NCBI中比對得到的同源性最高的序列進(jìn)行聚類,采用1 000同源性最高的序列進(jìn)行聚類,采用1 000個重復(fù)做Bootstrap檢驗(yàn),構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果見圖4。
圖4 Z1~Z18與NCBI中同源性最高序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹
對峙培養(yǎng)5 d后,棗黑點(diǎn)、棗輪紋、棗鏈格病原菌菌絲不斷擴(kuò)展,Z1~Z17內(nèi)生細(xì)菌逐漸被包圍、覆蓋,即說明這些內(nèi)生細(xì)菌對上述3種病原菌無拮抗作用,如圖5。而Z18號菌對上述3種病原菌對峙培養(yǎng)顯示有著不同程度的拮抗作用,抑菌帶一直存在,且越來越明顯。其中,Z18號菌對棗輪紋病原菌的抑制作用最明顯,抑菌圈的直徑最大,而對棗黑點(diǎn)、棗鏈格病原菌的抑制作用相對較小,兩菌落逐漸靠近,但無覆蓋,見圖6。
圖5 某些內(nèi)生細(xì)菌對棗主要病原菌無拮抗作用
圖6 Z18號菌對三種病原菌的拮抗作用
通過對棗樹根部內(nèi)生細(xì)菌的分離與篩選,得到一株對棗黑點(diǎn)、棗輪紋、棗鏈格病原菌有拮抗作用的菌株Z18。利用傳統(tǒng)分類方法和 16S rRNA序列測定對菌株進(jìn)行了鑒定,菌株Z18初步鑒定為芽孢桿菌,革蘭氏染色呈陽性。
芽孢桿菌抗逆性較強(qiáng),是植物病害的生物防治中應(yīng)用最廣泛的細(xì)菌。目前,芽孢桿菌用于林木抗病促生在國內(nèi)已有一定研究,如蔡麗等從鳳凰單叢茶分離篩選出具有抑菌活性的甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌,對梨果黑斑病菌、核桃葉枯病菌、紅棗黑斑病菌、立枯絲核菌的菌絲具有較強(qiáng)的抑制作用[14]。芽孢桿菌產(chǎn)生的抗菌活性物質(zhì)主要包括脂肽類、聚酮類及抗菌蛋白等,芽孢桿菌易于在田間定值,也便于分離、培養(yǎng)以及保存;已有研究顯示芽孢桿菌已經(jīng)成功的在生產(chǎn)實(shí)踐中應(yīng)用于生物防治[15]。劉偉成等[16]利用芽孢桿菌B08的菌懸液及滅菌后的發(fā)酵液經(jīng)過田間小區(qū)防治試驗(yàn)顯示均具有較好的防病作用,對小麥赤霉病抑制效果明顯而持久。由此可見,篩選棗內(nèi)有益內(nèi)生菌并利用其開發(fā)對環(huán)境友好、高效、專一的生物農(nóng)藥,對克服化學(xué)防治的負(fù)面影響,保證棗高質(zhì)增產(chǎn)具有重要的意義。
本試驗(yàn)表明了在棗根部存在可利用的內(nèi)生細(xì)菌,給生物防治棗類真菌性病害以及植原體病害的生物防治提供材料。由于拮抗菌株Z18是從棗根部組織分離得到,且所有的試驗(yàn)均在實(shí)驗(yàn)室完成,Z18號菌株在植物活體條件下對本試驗(yàn) 3種病原菌的拮抗作用是否呈正相關(guān),Z18的各種理化性質(zhì)以及拮抗機(jī)理尚不明確,本研究后續(xù)將進(jìn)行拮抗菌回接活體植株的試驗(yàn),對生物防治棗黑點(diǎn)、棗輪紋、棗鏈格病原菌引起的棗類病害提供科學(xué)依據(jù)。