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結(jié)核分枝桿菌對乙硫異煙胺/丙硫異煙胺耐藥的機制及其增敏劑研究進展

2020-01-08 02:31宋艷華高孟秋李琦
中國防癆雜志 2020年2期
關(guān)鍵詞:抗結(jié)核基因突變結(jié)核病

宋艷華 高孟秋 李琦

耐藥結(jié)核病(MDR-TB)是全球結(jié)核病控制的重大挑戰(zhàn)。2019全球結(jié)核病播報數(shù)據(jù)顯示,全球估計約有48.4萬例為新發(fā)的耐利福平結(jié)核病(rifampicin-resistant tuberculosis,RR-TB),其中有78%為MDR-TB。 中國是MDR-TB高負擔國家之一,和印度、俄羅斯3個國家占了全球1/2的MDR/RR-TB患者[1]。對一線核心抗結(jié)核殺菌藥品異煙肼(isoniazid,INH)、利福平(rifampicin,RFP)耐藥的MDR-TB,需要二線抗結(jié)核藥物治療,WHO指南推薦4~5種抗結(jié)核藥品組成MDR-TB治療方案[2]。二線抗結(jié)核藥物因為不良反應(yīng)多、用藥不便、療效欠佳等局限性,往往導致不規(guī)律治療,增加產(chǎn)生廣泛耐藥結(jié)核病(XDR-TB)的風險。研發(fā)新型有效的抗結(jié)核藥物是治愈MDR-TB的關(guān)鍵,目前只有貝達喹啉和德拉馬尼兩種藥品用于臨床。乙硫異煙胺(ethionamide,ETH)/丙硫異煙胺(prothionamide,PTH)是在1950年發(fā)現(xiàn)的抗結(jié)核藥物,但是因為這兩種藥品的有效濃度和藥物不良反應(yīng)(消化道反應(yīng)、肝損傷等)相關(guān),限制了應(yīng)用,一直為二線抗結(jié)核藥品;ETH/PTH對一線藥物耐藥的MTB仍可敏感,所以隨著對INH、RFP耐藥的MDR-TB的增多, ETH/PTH主要用于MDR-TB的治療,目前仍是WHO相關(guān)指南推薦為RR-TB/MDR-TB治療的藥品之一[2]。近年來, ETH/PTH增敏劑的研究也取得了明顯進展。筆者就兩種藥品的應(yīng)用史、流行病學、作用機制、耐藥及與INH交叉耐藥機制、增敏劑研究等方面進行綜述。

一、ETH/PTH簡介

ETH和ETH是在20世紀50年代后期合成,都是異煙酸的衍生物。兩種藥品在體外和體內(nèi)都表現(xiàn)出了抗MTB活性,作用機制和INH相似,都是抑制分枝菌酸的合成,但抗菌活性較INH活性低,ETH對MTB野生株的最低抑菌濃度(MIC)為 0.5~2 mg/L; PTH對MTB的 MIC值在0.125~1.0 mg/L[3]。PTH在小鼠體內(nèi)表現(xiàn)出和ETH相似的抗菌活性,并且患者使用中不良反應(yīng)較ETH少[4]。ETH與PTH結(jié)構(gòu)和作用機制相似,可以視為同一種藥物,在應(yīng)用中兩藥可以相互代替[5-6],我國僅生產(chǎn)PTH,屬于二線抗結(jié)核藥品,因為口服方便性及可獲得性,PTH目前在我國的MDR-TB方案中常作為一個基本的組成部分[6-7]。

二、流行病學

PTH作為二線抗結(jié)核藥品,在我國抗結(jié)核藥物治療中的應(yīng)用遠不如一線抗結(jié)核藥物普遍,但是由于和INH存在部分交叉耐藥性,并且隨著在MDR-TB患者中的應(yīng)用時間延長,PTH耐藥株在我國的流行情況及耐藥特征需要了解。2010年我國結(jié)核病流行病學調(diào)查顯示,INH耐藥率為 30.8%,PTH總耐藥率為12.9%(95%CI:9.2%~17.4%)[8];來自部分結(jié)核病防治機構(gòu)的數(shù)據(jù)顯示,MDR-TB(包括XDR-TB)中PTH耐藥率為4.5%和6.0%[9-10];來自一些結(jié)核病??漆t(yī)院的數(shù)據(jù)顯示 MDR-TB(包括XDR-TB)的PTH的耐藥率為20.0%~24.8%[11-13],其中筆者的研究(數(shù)據(jù)來自北京胸科醫(yī)院)顯示PTH的耐藥率隨著MDR-TB到XDR-TB耐藥譜的增寬,PTH耐藥率逐漸增高,在MDR-TB中為11.2%,pre-XDR-TB中為30.1%,XDR-TB中為70.6%[14]。而非洲的MDR-TB患者中對ETH的耐藥率較高, MDR-TB 臨床分離菌株中 78.6%(11/14)對ETH耐藥,在泰國的MDR-TB患者中這一耐藥率為15.0%[15]。對ETH耐藥的菌株基本上都對INH耐藥[16-17]。由此可見,在不同地區(qū)對INH耐藥的菌株(尤其是MDR-TB)同時對ETH/PTH耐藥的耐藥率具有差異性, ETH/PTH的應(yīng)用需要結(jié)合所在地區(qū)的耐藥菌株流行情況制訂合理的治療方案。

三、ETH/PTH的抗結(jié)核作用機制

ETH/PTH的抗結(jié)核作用機制主要是抑制敏感細菌分枝菌酸的合成而使細胞壁破裂[6]。INH、ETH/PTH和吡嗪酰胺(pyrazinamide,PZA)相似,需要在細菌體內(nèi)激活而發(fā)揮作用。ETH/PTH由黃素腺嘌呤二核苷酸單加氧酶(EthA,又稱EtaA,由Rv3854c編碼)激活,形成ETH-NAD或者PTH-NAD復合物,之后和INH作用機制相似,作用于enoyl-ACP還原酶(InhA,Rv1484編碼)[18],進而降低單不飽和?;鵄CP(acyl-ACP)到酰基ACP的合成,干擾脂肪酸合酶Ⅱ(FASⅡ)形成,導致分枝菌酸的生物合成的受阻,導致MTB死亡[18-19]。但是因為和INH存在部分相同作用通路,導致INH和ETH/PTH存在著部分交叉耐藥。

四、對ETH/PTH耐藥的機制

對ETH/PTH耐藥的機制,主要包括ETH/PTH前藥激活酶 EthA和EthA的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子EthR、藥物的作用靶點enoyl-ACP還原酶InhA編碼基因突變,及其他調(diào)節(jié)藥物激活或者作用的酶類基因的改變,如ndh基因、mshA基因、nudC基因等[18]。下面對3個主要的耐藥機制進行說明。

(一) ETH/PTH的作用靶點InhA的改變(inhA基因突變)

ETH/PTH的作用靶點enoyl-ACP還原酶InhA基因突變,是ETH/PTH耐藥機制,也是INH和ETH/PTH交叉耐藥的主要機制。

1960年有研究者從用過INH但是沒有用過ETH的結(jié)核病患者的臨床分離株中發(fā)現(xiàn)了對INH和ETH共耐藥的菌株[20]; 1990年隨著分枝桿菌質(zhì)粒轉(zhuǎn)化系統(tǒng)技術(shù)的發(fā)展,證實MTB的InhA改變是對INH和ETH共耐藥性的共同機制。Banerjee 等[21]在1994年通過構(gòu)建恥垢分枝桿菌(M.smegmatis),牛分枝桿菌(M.biovs)耐藥株及敏感株的基因組DNA文庫,并通過質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到野生型M.smegmatis、M.biovs、MTB的方法,發(fā)現(xiàn)inhA基因的開放閱讀框(Open reading frames,ORF)突變或者inhA過度表達足以引起M.smegmatis、M.biovs、MTB對INH和ETH 共耐藥,同時通過基因測序分析等方法證實inhAORF的S94A突變是引起INH和ETH共耐藥的原因。把對INH和ETH耐藥的M.smegmatis中的inhAS94A突變體轉(zhuǎn)染到野生型MTB中,獲得的菌株對INH和ETH耐藥性較野生型MTB高5倍[22]。分子化學研究顯示,inhAS94A突變導致InhA共作用因子NADH的米氏常數(shù)(Km值)增加,同時減少了INH-NAD和InhA(S94A)的結(jié)合,顯著減弱INH-NAD對InhA(S94A)的抑制作用[23]。另外,inhA調(diào)控序列的c-15t突變,使inhA基因的mRNA水平增加20倍,導致inhA過度表達,INH和ETH的對MTB的MIC增加了8倍[23]。

在對ETH/PTH耐藥的臨床分離株中,inhA基因突變是比較常見的分子機制,包括調(diào)控序列和ORF突變。在對INH和ETH/PTH耐藥的菌株中分別有8%~43%和47%~65%菌株存在inhA基因突變[24],以調(diào)控序列突變?yōu)橹鳌W畛R姷耐蛔兪莄-15t[11,16],對INH和ETH/PTH共耐藥的菌株中約70%有此突變,其次是g-17t[16]。單inhAc-15t 突變的MTB臨床株多為對INH低度耐藥(MIC<2 mg/L)[22],少部分菌株的MIC略高(MIC在2~4 mg/L)[16];而對ETH耐藥的程度變化較大(MIC從<2.5 mg/L 到≥200 mg/L)[16]。而據(jù)報道在c-15t突變的對INH耐藥的菌株中有1/2以上合并KatG和ethA、inhA編碼區(qū)突變[16,22]。 對INH和ETH/PTH耐藥菌株的臨床檢測結(jié)果中,inhA的ORF突變發(fā)生率較調(diào)控序列低,主要突變類型為S94A,其次是I21T、 I95P[22],這些突變菌株多對INH呈低度耐藥[22,25],對ETH呈高度耐藥[16]。我國Tan等[26]的研究顯示,在46株對PTH耐藥的菌株中,26.1%菌株存在c-15t突變,13%菌株存在S94A突變。而據(jù)報道在inhA的c-15t突變的對INH耐藥的菌株中有1/2以上合并katG和ethA、inhA編碼區(qū)突變[22,27]。這可能是由于對INH和ETH/PTH共耐藥的菌株多為MDR-TB菌株,隨著耐藥種類及程度的累積增加,突變基因及位點也積累增多,對INH及ETH的表型耐藥也可能是不同機制的多個基因位點聯(lián)合突變的結(jié)果;而且對于沒有檢測出inhA基因突變的臨床株,選擇ETH/PTH組成方案時,也要考慮其他耐藥基因突變存在可能,注意觀察療效及進行表型藥敏試驗隨訪。

另外,和臨床株的耐藥分子機制不同,體外含INH和ETH培養(yǎng)基上獲得的耐藥株缺乏inhA基因突變[27]。既往臨床株研究多數(shù)關(guān)注的是對INH或者ETH/PTH耐藥的菌株(以MDR-TB為主)中inhA的突變情況,對敏感株中inhA突變情況研究較少。最近幾年來數(shù)個臨床研究報道,inhAc-15t(合并或不合并其他inhAORF基因突變)突變的臨床菌株中仍有一定比例(13.5%~69%)的菌株對ETH/PTH敏感[11,28-31]。所以筆者認為,inhA基因突變與 ETH/PTH表型藥敏試驗結(jié)果為耐藥的相關(guān)性可能具有地域性,inhA突變株可能存在其他機制發(fā)揮對ETH作用,inhA突變的臨床意義需要進一步研究。

(二) ETH/PTH激活酶EthA的改變(ethA 突變)

ETH/PTH需要經(jīng)過細菌的EthA酶激活才能發(fā)揮生物效應(yīng)。在實驗室由ETH藥培養(yǎng)基篩選出耐藥株,有19.4%(7/46)菌株存在ethA基因錯義或缺失突變[29]。在臨床株研究中,ethA基因突變也是對ETH耐藥的一種重要分子機制。據(jù)報道,在對ETH耐藥的MDR-TB臨床株中有54.2%~100.0%菌株存在ethA突變[15,17,32],部分菌株合并inhA基因突變。基因ethA的突變中大約2/3的核苷酸變化是錯義突變,而其余則是插入、缺失或無意義突變;這些突變位點分布在ethA的整個編碼區(qū)域,沒有優(yōu)勢突變位點[18]。我國Tan等[26]的研究中,46株對PTH臨床耐藥的菌株中,19株(51.4%) 有ethA突變,16 株(43.2%)有inhA調(diào)控序列突變,6 株(16.2%) 為inhAORF突變。法國一項研究顯示,對ETH耐藥的菌株中,62%菌株具有inhA的突變(ORF和/或調(diào)控序列),47%的ethA存在突變[32]。不同地區(qū)菌株ethA的突變率有差異,結(jié)合體外研究數(shù)據(jù),考慮ethA基因突變和ETH藥物應(yīng)用,是造成對ETH耐藥的重要機制,對于ETH應(yīng)用較廣泛或者耐藥率較高的地區(qū),在考慮選擇ETH組成方案時,有必要進行ethA基因的分子耐藥檢測。

(三) EthA調(diào)控因子EthR的改變(ethR基因)

EthR(Rv3855)是一種轉(zhuǎn)錄抑制因子,負向調(diào)控ethA的轉(zhuǎn)錄。ethR失活的菌株對ETH高度敏感,ethR過度表達導致MTB對ETH的耐藥性增加[33]。對ETH高耐藥的臨床株中,4%的菌株有此突變,突變類型為A95T和F110L[32];但是部分對ETH耐藥的菌株含有ethA或inhA突變。基因ethR可能在臨床菌株對ETH耐藥只中扮演次要的角色。但是,以ethR為靶點抑制劑的研究是新藥研究的一個方向,目的是減少EthR對EthA的負向調(diào)控作用, 促進常規(guī)劑量下ETH/PTH的殺菌作用。

五、 ETH增敏劑的研究進展

細胞壁的完整性、通透性、致病性對于分枝桿菌的生存至關(guān)重要,是一個重要的藥物靶點。抗結(jié)核藥品ETH/PTH、INH作用于MTB的細胞壁的脂類的合成過程,對這些已經(jīng)存在抗結(jié)核藥物作用機制的深入了解,進一步促進了未來藥物靶點的發(fā)現(xiàn)及新型藥物的研發(fā)。近年來基于EthA轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子EthR的抑制劑(ETH增敏劑)研究取得了新的進展。

ETH作為一種前藥,需要細菌的單加氧酶 EthA激活才能具有殺菌活性。EthR是轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子TetR家族的一員,基因ethR與ethA排列在一個共同的基因間啟動子區(qū)域的不同操作子中,負向調(diào)控ethA的轉(zhuǎn)錄。通過抑制EthR的功能,增強ethA的表達,促進ETH/PTH 的殺菌活性,是新藥研發(fā)的一個方向。

近年來,采用基于結(jié)構(gòu)或者片段的藥物設(shè)計方法,通過虛擬篩選新型分子結(jié)構(gòu)物,在尋找EthR 抑制劑方面進行了大量的新型分子研究,發(fā)現(xiàn)一些化合物(如BDM31343、BDM41906)能具有抑制EthR的作用。體外及動物體內(nèi)研究顯示,這些抑制物和ETH同時應(yīng)用,可增強ETH對MTB敏感菌株的殺菌活性[34];同時提高了對INH和RFP耐藥的MDR-TB菌株殺菌作用,但是對ethA突變耐藥菌株殺菌作用不確定。在對EthR 抑制劑進一步結(jié)構(gòu)改造中發(fā)現(xiàn)的一種新型化合物SMARt-420,這種化合物失去了與EthR結(jié)合的能力,但是它仍然能增強ETH抗結(jié)核作用[35-36]。用SMART-420處理的牛分枝桿菌BCG轉(zhuǎn)錄組的分析,揭示了編碼轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子和氧化還原酶(分別命名為EthR2和EthA2)的兩個隱性基因的強烈誘導, SMART-420的靶點是EthR2,而不是EthR[37]。SMARt-420與EthR2結(jié)合并改變其構(gòu)象,從而阻斷后者在EthA2啟動子上游的結(jié)合?;騟thA2和ethR2是一對ethA和ethR同源基因,EthR2抑制EthA2的轉(zhuǎn)錄表達,而不是EthA。 EthR2和EthR分子結(jié)構(gòu)相似, SMARt-420 通過抑制EthA2作用,增加對ETH有激活作用的EthR2的表達,同時繞過ethA、ethR基因突變靶點,所以SMARt-420 和ETH聯(lián)合可以增加敏感株對ETH敏感性,同時提高ethA基因突變的耐藥菌株對ETH的敏感性,其發(fā)揮作用的靶點仍是InhA[36]。SMARt-420作為ETH的增敏劑的出現(xiàn)將在絕大多數(shù)MDR-TB中提高ETH的殺菌活性,即使對ETH耐藥的ethA突變菌株,也能發(fā)揮殺菌活性。但是其人體安全性及有效性數(shù)據(jù)需要進一步驗證。

另外,以InhA為靶點的新型藥物研究也有發(fā)現(xiàn)。烯酰-ACP還原酶InhA是參脂肪酸合成的酶,是抗結(jié)核藥物開發(fā)的有效靶點之一。大多數(shù)對INH耐藥的是katG突變,導致INH-NAD復合物形成障礙,使得INH不能被激活; ETH/PTH發(fā)揮殺菌作用也是同樣需要激活,ethA等突變導致其激活受阻,進而不能和InhA結(jié)合發(fā)揮生物活性。但是設(shè)計直接抑制InhA的化合物就可以繞過katG基因和inhA基因,直接發(fā)生效應(yīng)[38]。研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一些化合物對MTB的InhA有明顯的抑制作用。如二苯醚衍生物具有和InhA具有高親和力等特點,但一些二苯醚化合物只在體外具有顯著的療效,沒有體內(nèi)活性。在InhA抑制劑中,4-羥基-2-吡啶酮(4-hydroxy-2-pyridones)是種具有體外及體內(nèi)顯著抑制InhA活性和較好藥代動力學參數(shù)的新化學物[38],具有一定的研究和應(yīng)用前景。

六、總結(jié)

ETH/PTH目前仍是WHO耐多藥治療指南和我國專家共識推薦的治療MDR-TB的藥品,了解耐藥特征及分子機制,將指導我們選擇藥物組成合適方案,同時基于ETH、PTH作用機制的新藥的研發(fā),為耐藥結(jié)核病治療及終結(jié)結(jié)核病的目標帶來新的希望。

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