楊沔 沈迎春 賀海斌 錢(qián)海龍 俞仲輝 江州華 裘豐
生物節(jié)律的破壞是導(dǎo)致人類結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC)發(fā)生、發(fā)展的內(nèi)源性因素之一[1-3]。盡管哺乳類動(dòng)物的晝夜節(jié)律已被廣泛研究,但多數(shù)研究只是基于轉(zhuǎn)錄水平的負(fù)性調(diào)控及轉(zhuǎn)錄后水平的修飾[4]。近年來(lái),有學(xué)者致力于微小RNA(microRNA,miRNA)的研究。miRNA幾乎可以調(diào)控整個(gè)細(xì)胞代謝進(jìn)程,如細(xì)胞增殖、凋亡等[5-7]。miR-124作為腫瘤抑癌基因,通過(guò)一些特殊靶點(diǎn)(如STAT3、SMC4、iASPP等)發(fā)揮CRC抑制作用也常被報(bào)道[8-11]。但是,miR-124與生物鐘基因hClock之間是否存在調(diào)控作用尚未清楚。本研究就miR-124通過(guò)hClock調(diào)控人CRC進(jìn)展的機(jī)制作一探討,現(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下。
1.1 對(duì)象 選取2015年12月至2016年12月在寧波市醫(yī)療中心李惠利醫(yī)院東部院區(qū)行CRC根治術(shù)的50例患者為研究對(duì)象,所有患者術(shù)后病理檢查證實(shí)為CRC,術(shù)前均未行放化療。其中男28例,女22例;年齡35~82(56.3±13.8)歲。術(shù)中將患者的癌組織標(biāo)本立即投入液氮中暫存,術(shù)后放入-80℃冰箱保存待檢。
1.2 hClock蛋白表達(dá)檢測(cè) 采用免疫組化染色法。取癌組織標(biāo)本,甲醛固定、石蠟包埋、切片(4 μm 厚);脫蠟、切片、水化、枸櫞酸緩沖液(0.01 M,pH 6.0)10 min微波抗原修復(fù);單克隆抗體 hClock(cat#5157,1:100 dilution,美國(guó)Cell signaling Technology公司)4℃孵育過(guò)夜。PBS簡(jiǎn)單清洗后,加二抗(#A31460,1:500 dilution,美國(guó)Thermo Fisher公司)37°C孵育60 min。PBS再次清洗,DAB顯色試劑盒染色5~10 min,常規(guī)蘇木素復(fù)染細(xì)胞核1 min,在光學(xué)顯微鏡(×400)下觀察細(xì)胞染色情況。由2位病理科醫(yī)生獨(dú)立評(píng)估染色強(qiáng)度(無(wú)著色為0分,弱著色為1分,中度著色為2分,強(qiáng)著色為3分)及染色細(xì)胞百分比,計(jì)算免疫組化評(píng)分。免疫組化評(píng)分=染色強(qiáng)度評(píng)分×染色細(xì)胞百分比,≥1.5分為hClock蛋白高表達(dá),<1.5分為hClock蛋白低表達(dá)。
1.3 miR-124表達(dá)檢測(cè) 采用qPCR法。(1)RNA抽提及逆轉(zhuǎn)錄:用Trizol試劑提取CRC組織樣本中的總RNA,分光光度計(jì)檢測(cè)總RNA含量。總RNA通過(guò)特異的miRNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒及miR-124莖環(huán)結(jié)構(gòu)逆轉(zhuǎn)錄引物進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。引物序列:5'-GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACGGCATTC-3'。(2)PCR反應(yīng):加入SYBR-green的成熟miR-124的PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系,在PCR儀(Corbett,美國(guó)Bio-Rad公司)上進(jìn)行反應(yīng),反應(yīng)體系包括 cDNA 4 μl、10 mmol/L引物4 μl(上、下游引物各2 μl)、PCR Master Mix 10 μl、水2μl,最終配成20 μl反應(yīng)體系。反應(yīng)參數(shù):95℃5 min;95℃5 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 5 s,40個(gè)循環(huán)。qPCR 引物序列:正義為 5'-GCTAAGGCACGCGGTG-3',反義為 5'-CAGTGCAGGGTCCGAGGT-3'。根據(jù)每例患者癌組織與癌旁正常組織miR-124相對(duì)表達(dá)量的比值不同分為兩組,即miR-124低表達(dá)組(比值<2)和miR-124高表達(dá)組(比值≥2)[12-13]。
1.4 miR-124生物信息學(xué)靶點(diǎn)預(yù)測(cè) 采用雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)。使用3種靶點(diǎn)預(yù)測(cè)軟件TargetScan(http://www.targetscan.org)、PicTar(http://pictar.mdc-berlin.de/cgibin/new_vertebrare.org)、miRNA.org(http://www.microrna.org)對(duì)miRNA在hClock 3'-非翻譯區(qū)上的靶點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè)。將野生型或突變型的hClock 3'-非翻譯區(qū)基因克隆到雙熒光素酶報(bào)告基因中,進(jìn)一步驗(yàn)證hClock是否為miR-124的直接調(diào)控靶點(diǎn)。
1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 18.0統(tǒng)計(jì)軟件。計(jì)量資料用±s表示,組間比較采用兩獨(dú)立樣本t檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料用率表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)。CRC患者癌組織miR-124表達(dá)與hClock蛋白表達(dá)的相關(guān)性分析采用Pearson相關(guān)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 不同臨床特征CRC患者癌組織hClock蛋白高表達(dá)率比較 CRC患者癌組織hClock蛋白高表達(dá)率為52.0%(26/50)。不同TNM分期及有無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者癌組織hClock蛋白高表達(dá)率比較,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05);不同性別、年齡及腫瘤位置、組織學(xué)分級(jí)、浸潤(rùn)深度的患者癌組織hClock蛋白高表達(dá)率比較,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05),見(jiàn)表1。
2.2 不同臨床特征CRC患者癌組織miR-124低表達(dá)率比較 CRC患者癌組織miR-124低表達(dá)率為68.0%(34/50)。有無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者癌組織miR-124低表達(dá)率比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);不同性別、年齡及腫瘤位置、組織學(xué)分級(jí)、浸潤(rùn)深度、TNM分期的患者癌組織miR-124低表達(dá)率比較,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05),見(jiàn)表 2。
2.3 CRC患者癌組織miR-124表達(dá)與hClock蛋白表達(dá)的關(guān)系 CRC患者癌組織miR-124低表達(dá)34例,高表達(dá)16例。miR-124高表達(dá)組hClock蛋白表達(dá)的免疫組化評(píng)分為(1.13±0.61)分,明顯低于miR-124低表達(dá)組的(1.71±0.54)分,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=2.67,P<0.05),免疫組化染色結(jié)果見(jiàn)圖1。CRC患者癌組織miR-124相對(duì)表達(dá)量與hClock蛋白表達(dá)的免疫組化評(píng)分呈負(fù)相關(guān)(r=-0.798,P<0.01)。
表1 不同臨床特征CRC患者癌組織hClock蛋白高表達(dá)率比較[例(%)]
圖1 miR-124高、低表達(dá)組結(jié)直腸癌(CRC)患者癌組織中hClock蛋白表達(dá)情況(a:miR-124高表達(dá)組;b:miR-124低表達(dá)組;免疫組化染色,×400)
2.4 miR-124生物信息學(xué)靶點(diǎn)預(yù)測(cè) 3種常用的靶點(diǎn)預(yù)測(cè)信息軟件(TargetScan、PicTar、miRNA.org)都預(yù)測(cè)到miR-124-3p可能與hClock 3'-非翻譯區(qū)相結(jié)合;經(jīng)雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,推測(cè)hClock可能是miR-124的直接調(diào)控靶點(diǎn),見(jiàn)圖2。
當(dāng)前,雖然CRC的治療策略有了較大的進(jìn)步,但是患者預(yù)后仍較差。對(duì)CRC發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)制進(jìn)行深入研究,可能對(duì)進(jìn)一步完善治療策略具有重要價(jià)值[14-15]。生物鐘基因調(diào)控的晝夜節(jié)律紊亂可能是CRC發(fā)生、發(fā)展的內(nèi)源性因素之一。但是作為核心生物鐘基因的hClock在CRC發(fā)生、發(fā)展中的具體調(diào)節(jié)機(jī)制尚未完全清楚。
表2 不同臨床特征CRC患者癌組織miR-124低表達(dá)率比較[例(%)]
本研究通過(guò)生物信息學(xué)對(duì)調(diào)節(jié)hClock的miRNA進(jìn)行預(yù)測(cè),發(fā)現(xiàn)miR-124直接與hClock 3'-非翻譯區(qū)相結(jié)合。相關(guān)研究表明,miR-124在CRC中表達(dá)下調(diào),然后通過(guò)結(jié)合一些特異基因發(fā)揮抑癌基因作用;而miR-124表達(dá)下調(diào)可能與上游啟動(dòng)子甲基化有關(guān)[14]。筆者推測(cè)在CRC中,miR-124啟動(dòng)子甲基化可能是決定其表達(dá)下調(diào)而hClock表達(dá)上調(diào)的原因之一。為搞清楚這個(gè)問(wèn)題,本研究對(duì)人CRC組織中miR-124及hClock表達(dá)進(jìn)行了檢測(cè),結(jié)果顯示不同TNM分期及有無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者癌組織中hClock蛋白高表達(dá)率比較,以及有無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者癌組織中miR-124低表達(dá)率比較,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;miR-124高表達(dá)組hClock蛋白表達(dá)的免疫組化評(píng)分明顯低于miR-124低表達(dá)組,CRC患者癌組織中miR-124相對(duì)表達(dá)量與hClock蛋白表達(dá)的免疫組化評(píng)分呈負(fù)相關(guān)。然后使用3種常用的靶點(diǎn)預(yù)測(cè)信息軟件,發(fā)現(xiàn)都能預(yù)測(cè)到hClock是miR-124的直接調(diào)控靶點(diǎn)。因此,筆者認(rèn)為hClock是miR-124的直接調(diào)控靶點(diǎn),miR-124通過(guò)與hClock 3'-非翻譯區(qū)結(jié)合,在轉(zhuǎn)錄后水平對(duì)hClock表達(dá)進(jìn)行調(diào)節(jié)。
圖2 miR-124生物信息學(xué)靶點(diǎn)預(yù)測(cè)(a:在不同物種間,miR-124與hClock的3'-非翻譯區(qū)結(jié)合的靶序列是段保守序列;b:雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn))
綜上所述,miR-124通過(guò)調(diào)控hClock促進(jìn)人CRC的進(jìn)展;miR-124表達(dá)下調(diào)可能是促進(jìn)人CRC進(jìn)展的原因之一。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果為hClock的促癌作用及miR-124的抑癌作用提供了一定的證據(jù),而在CRC細(xì)胞中hClock是否為miR-124的直接調(diào)控靶點(diǎn),有待進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)證實(shí)。