宋華麗 孫效迎 孔祥會 李莉 裴超
(河南師范大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院,新鄉(xiāng) 453007)
RNA干擾(RNA interference,RNAi)是指由內(nèi)源或外源性的雙鏈RNA引發(fā)的同源靶基因的mRNA特異性降解,而導(dǎo)致基因沉默的現(xiàn)象,屬于轉(zhuǎn)錄后基因沉默,具有清除體內(nèi)異?;虻谋磉_(dá)、抵抗病毒等外源異物侵害的功能。在植物、真菌(Fungus)、線 蟲(Caenorhabditis elegans)、 果 蠅(Drosophila melanogaster)、斑馬魚(Barchydaniorerio)和小鼠(Musmusculus)等多種生物中均存在RNA干擾現(xiàn)象[1-6]。近年來,由于雙鏈RNA合成技術(shù)的改進(jìn),RNA干擾這一技術(shù)迅速被應(yīng)用在各個領(lǐng)域,從而加速了基因功能、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、基因治療、新藥開發(fā)等方面的研究。
近年來隨著水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的迅速發(fā)展,水產(chǎn)品已成為世界上一個主要的經(jīng)濟(jì)和糧食來源[7]。與此同時,由于養(yǎng)殖規(guī)模的擴(kuò)大和養(yǎng)殖密度的增加,由病毒、細(xì)菌和寄生蟲引起的水產(chǎn)動物疾病也頻繁爆發(fā),給水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)帶來極大的危害,因此如何有效防控水產(chǎn)動物疾病是我們急需解決的問題。RNA干擾可以特異性的沉默目的基因,不僅可以用來研究基因的功能,還可以用來識別藥物靶點和候選疫苗,并且通過干擾宿主體內(nèi)病原體的傳播、發(fā)育和增殖來控制疾病。因此,本文對RNA干擾在水產(chǎn)動物抗病毒和抗寄生蟲治療等方面的應(yīng)用進(jìn)行了綜述,以期為有效地進(jìn)行水產(chǎn)動物的病害防治提供參考。
1990年,Napoli等[1]將一個能產(chǎn)生色素的基因?qū)氚珷颗#≒hellodeneron hybrida vilm)中,試圖加深花瓣的紫顏色,結(jié)果多數(shù)花并不是紫色而是花斑色,甚至是白色,他們將這種現(xiàn)象命名為共抑制(Cosuppression)。1995 年,Guo 和 Kempheus[8]嘗試用反義RNA技術(shù)阻斷線蟲par-1基因的表達(dá)以研究該基因的功能,結(jié)果注射的反義RNA阻斷了基因的表達(dá),奇怪的是,注射正義RNA也出現(xiàn)了同樣的結(jié)果。1998年,F(xiàn)ire等[3]首次將雙鏈RNA——正義鏈和反義鏈的混合物注入線蟲體內(nèi),結(jié)果誘發(fā)了比單獨注射正義鏈或反義鏈都要強(qiáng)得多的基因沉默,他們將這種現(xiàn)象稱為RNA干擾。2000年,Zamore等[9]使用體外培養(yǎng)的果蠅細(xì)胞進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn),外源性dsRNA通過耗能過程降解成21-23 nt的小干擾RNA(siRNA)引發(fā)干擾。2017年,在人類體細(xì)胞及動物體細(xì)胞內(nèi)發(fā)現(xiàn)人腸道病毒71型(EV71)感染可以使細(xì)胞產(chǎn)生具有抗病毒功能的vsiRNA,確證了 RNAi在哺乳動物中是一種先天性抗病毒免疫的方式[10]。
RNA干擾的作用機(jī)制見圖1。在RNA干擾過程中,內(nèi)源或外源性的雙鏈RNA被宿主Dicer蛋白識別并在協(xié)助蛋白 TRBP(TAR-RNA binding protein)和PACT(Protein activator of PKR)的作用下,被切割成21-23 nt、5' 端含有一個磷酸基團(tuán)、3'端含有一個羥基并且突出2 nt的siRNA。siRNA隨后在Dicer 的幫助下與含AGO2蛋白的核酶復(fù)合物結(jié)合,構(gòu)成 RNA 誘導(dǎo)沉默復(fù)合體(RNA-induced silencing complex,RISC)。RISC中的siRNA經(jīng)AGO2作用分解成兩條單鏈,正義鏈被釋放出去,反義鏈則留在RISC中。僅含反義鏈的RISC被激活,在反義鏈的引導(dǎo)下通過堿基互補(bǔ)配對原則與靶基因結(jié)合,在距離反義鏈3' 端12個堿基的位置將mRNA切斷,斷裂的mRNA隨后被核酸酶降解,從而誘導(dǎo)靶基因的沉默[11]。siRNA 還可以作為引物與mRNA結(jié)合,在RNA依賴性RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)的作用下擴(kuò)增產(chǎn)生新的雙鏈RNA,雙鏈RNA又被切割成siRNA進(jìn)入RNA干擾循環(huán),從而使得RNA干擾的效果級聯(lián)放大[12]。外源性shRNA重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染進(jìn)入細(xì)胞后,在RNA 聚合酶 III 的作用下轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生初始的短發(fā)夾RNA前體,這些初始結(jié)構(gòu)又被Drosha加工形成pre-shRNA。preshRNA隨后在轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白 Exportin-5的作用下轉(zhuǎn)運(yùn)出核,在細(xì)胞質(zhì)中被Dicer和協(xié)助蛋白TRBP、PACT識別并剪切,去除發(fā)夾結(jié)構(gòu),產(chǎn)生雙鏈siRNA[13-14]。
病毒是水環(huán)境中數(shù)量最多的生物,可引發(fā)22.6%的水產(chǎn)養(yǎng)殖相關(guān)疾病,一旦爆發(fā)會給水產(chǎn)養(yǎng)殖戶帶來巨大的經(jīng)濟(jì)損失,因此如何抗病毒感染成為急需解決的問題[15-16]。目前,利用RNA干擾技術(shù)在水產(chǎn)動物抗病毒中的研究主要集中在魚蝦中,包括蝦病毒中的對蝦白斑綜合癥病毒(White spot syndrome virus,WSSV)、 黃 頭 病 毒(Yellow head virus,YHV)、桃拉綜合癥病毒(Taura syndrome virus,TSV);魚病毒中的草魚呼腸孤病毒(Grass carp reovirus,GCRV)、出血性敗血癥病毒(Viral hemorrhagic septicemia virus,VHSV)、神經(jīng)壞死病毒(Nervous necrosis virus,NNV)、真鯛虹彩病毒(Red sea bream iridovirus,RSIV)等。
病毒感染宿主,首先吸附到宿主細(xì)胞表面,通過細(xì)胞介導(dǎo)的內(nèi)吞作用進(jìn)人細(xì)胞后,利用宿主細(xì)胞提供低分子物質(zhì)合成大量的病毒核酸和蛋白組分,并裝配成完整的病毒顆粒釋放到胞外[17]。參與病毒復(fù)制的基因至關(guān)重要,利用RNA干擾沉默病毒基因或與病毒復(fù)制有關(guān)的宿主基因,可以抑制病毒的復(fù)制。利用RNA干擾技術(shù)在水產(chǎn)動物抗病毒感染中的研究應(yīng)用在表1和表2中列出。
圖1 RNA干擾機(jī)制圖
根據(jù)病毒基因編碼的蛋白是否參與構(gòu)成病毒粒子,可以分為兩大類:結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白。結(jié)構(gòu)蛋白是組裝成完整的病毒顆粒所必需的蛋白成分;非結(jié)構(gòu)蛋白是病毒在感染細(xì)胞過程中表達(dá)的蛋白。研究人員通過抑制病毒的結(jié)構(gòu)蛋白或非結(jié)構(gòu)蛋白來抑制病毒的復(fù)制。在蝦病毒中,針對白斑綜合癥病毒的非結(jié)構(gòu)基因orf89、wsv191和結(jié)構(gòu)基因vp28、vp26設(shè)計的dsRNA注射凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei),蝦感染病毒后的累積死亡率分別為10%、83%、10% 和21%,而對照組全部死亡,結(jié)果表明干擾orf89、vp28和vp26對抑制病毒復(fù)制非常有效。同時也發(fā)現(xiàn)非結(jié)構(gòu)性的WSSV基因,如orf89,可以作為新的靶標(biāo)來設(shè)計RNA干擾分子以對抗 WSSV 感染[18]。Yodmuang等[19]將靶向黃頭病毒蛋白酶的dsRNA注射到斑節(jié)對蝦(Penaeus monodon)體內(nèi),人工感染YHV 10 d后,注射dsRNA組對蝦未發(fā)生死亡,而對照組死亡率達(dá)90%,表明該dsRNA抑制了對蝦體內(nèi)病毒的復(fù)制。在魚病毒中,陳蕓[20]以草魚呼腸孤病毒的外衣殼蛋白VP7為靶位點設(shè)計siRNA注射稀有鮈鯽(Gobiocypris rarus),實驗組死亡率僅30%,且病程延長至20 d,而對照組死亡率達(dá)100%,病程為12 d,說明siRNA 通過降解稀有鮈鯽體內(nèi)病毒的mRNA,從而抑制病毒粒子的形成。馬杰等[21]針對GCRVJX0901(GCRV I型)和HGDRV(GCRV II型)設(shè)計了兩個siRNA多表達(dá)載體,一個表達(dá)載體靶向兩種病毒的VP2基因、另一個靶向GCRV-JX0901的VP7基因和HGDRV的VP6基因,每個siRNA多表達(dá)載體均可以同時抑制細(xì)胞內(nèi)GCRV-JX0901和HGDRV的復(fù)制,表明該多重siRNA表達(dá)系統(tǒng)具有治療由多種基因型GCRV引起的草魚出血性疾病的可能性。神經(jīng)壞死病毒非結(jié)構(gòu)蛋白B2被干擾后,促凋亡基因Bax表達(dá)下調(diào),NNV感染的細(xì)胞獲救[22]。在蛙病毒中,通過轉(zhuǎn)染針對病毒53R基因的siRNA,可以抑制蛙虹彩病毒(Rana grylio virus,RGV)的復(fù)制[23]。通過化學(xué)合成大鯢蛙病毒(Chinese giant salamander Ranavirus,CGSRV)主要衣殼蛋白基因(MCP)、甲基轉(zhuǎn)移酶基因(MTase)、DNA多聚酶基因(DNA polymerase)特異的siRNA,轉(zhuǎn)染鯉魚上皮瘤細(xì)胞(EPC)后感染大鯢蛙病毒,這些特異性siRNA推遲了細(xì)胞病變效應(yīng)(CPE)出現(xiàn)的時間并降低了病毒毒力[24]。這些研究均證實利用RNA干擾抑制病毒的結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白的表達(dá)可以有效抑制病毒的復(fù)制,并且可能為水產(chǎn)動物疫苗研制提供有效的靶點。
研究表明不僅病毒自身的基因參與病毒對宿主的感染,而且宿主基因在病毒感染過程中也起到重要作用。在病毒侵染宿主的過程中,病毒通過與宿主表面的受體結(jié)合進(jìn)入細(xì)胞,然后開始復(fù)制,細(xì)胞中有些宿主基因的表達(dá)有利于病毒復(fù)制,而有些宿主基因則能夠抑制病毒復(fù)制。利用RNA干擾技術(shù)抑制宿主受體基因、宿主與病毒復(fù)制相關(guān)基因和宿主抗病毒相關(guān)基因的表達(dá),可以研究各個基因在病毒感染過程中的功能,為進(jìn)一步了解病毒侵染機(jī)制和抗病毒研究提供理論參考。
2.2.1 RNA干擾宿主受體基因 病毒只有與細(xì)胞表面的病毒受體結(jié)合后,才能入侵細(xì)胞,因此細(xì)胞表面的受體對病毒的感染至關(guān)重要,我們可以通過抑制受體的表達(dá)來減少病毒進(jìn)入細(xì)胞的機(jī)會,以此抑制病毒的感染。YRP65(Yellow head virus receptor protein) 是 YHV 受 體,Assavalapsakul等[54]利用dsRNA沉默斑節(jié)對蝦的YRP65基因,結(jié)果抑制了YHV復(fù)制,并且蝦全部存活。層黏連蛋白受體是一種細(xì)胞表面受體,是指導(dǎo)細(xì)胞間、細(xì)胞與細(xì)胞外基質(zhì)相互作用的重要蛋白,紅螯螯蝦(Cherax quadricarinatus)體內(nèi)層黏連蛋白受體樣基因(Laminin receptor-like gene,LR樣基因)的表達(dá)被抑制后,造血組織細(xì)胞中WSSV的進(jìn)入和復(fù)制明顯減少,并且通過研究發(fā)現(xiàn)病毒包膜蛋白VP28通過與之結(jié)合而吸附并侵入細(xì)胞[55]。Wang等[56]同樣針對草魚(Ctenopharyngodon idella)層黏連蛋白受體基因設(shè)計的siRNA,將其轉(zhuǎn)染CIK細(xì)胞,被轉(zhuǎn)染細(xì)胞抵抗草魚呼腸孤病毒感染的能力得到提高。利用RNA干擾技術(shù)阻斷宿主受體基因的表達(dá),使病毒不能與受體結(jié)合,從而不能入侵細(xì)胞,是一種很好的抗病毒方法。
2.2.2 RNA干擾宿主抗病毒相關(guān)基因 病毒入侵后,機(jī)體可調(diào)節(jié)自身的一系列基因抵抗病毒的感染,通過增加抗病毒相關(guān)基因的表達(dá),可減少水產(chǎn)動物感染病毒的機(jī)會,提高機(jī)體的抵抗力、抑制病毒的復(fù)制,從而減少水產(chǎn)動物的死亡率?,F(xiàn)今水產(chǎn)動物抗病毒相關(guān)基因的功能還未完全了解,而RNA干擾技術(shù)是研究基因功能的有力工具,因此可以利用RNA干擾技術(shù)研究水產(chǎn)動物抗病毒相關(guān)基因的功能。在斑節(jié)對蝦中,Sinthujaroen等[57]干擾翻譯控制腫瘤蛋白(The translationally controlled tumor protein,TCTP/fortilin)的表達(dá)后,實驗組蝦感染病毒后7 d內(nèi)表現(xiàn)出100%的死亡率,而fortilin基因未被干擾的對照組在感染后12 d蝦的死亡率僅為37.50%,此后作者給另一重要的商業(yè)品種凡納濱對蝦飼喂含有1%和5% fortilin重組蛋白飼料后,用WSSV攻毒,最終蝦的存活率分別為 66.7%和91.7%,證明fortilin在水產(chǎn)養(yǎng)殖的實際應(yīng)用中也能發(fā)揮抗病毒作用,是一種有應(yīng)用前景的飼料添加劑。Mx蛋白是一種由干擾素誘導(dǎo)的蛋白,對多種病毒具有抗病毒活性[58]。尖吻鱸(Lates calcarifer)的Mx基因被siRNA沉默后,病毒的RNA、蛋白質(zhì)和子代病毒滴度的表達(dá)水平遠(yuǎn)高于對照組,表明Mx基因抑制NNV的表達(dá)[59]。在哺乳動物中,神經(jīng)肽參與調(diào)節(jié)一系列免疫過程,如抗體合成、細(xì)胞因子的產(chǎn)生和釋放、炎癥和抗炎癥、免疫記憶、免疫耐受和自身免疫反應(yīng)等[60-61]。凡納濱對蝦體內(nèi)的的神經(jīng)肽蛻皮抑制激素(Moltinginhibiting hormones,MIHs)被干擾后,由WSSV感染的蝦的死亡率及病毒在組織中的拷貝數(shù)明顯增加,說明了MIHs可以在蝦的抗病毒免疫反應(yīng)中發(fā)揮積極作用[62]。白喉酰胺生物合成蛋白7(Diphthamide biosynthesis protein 7,Dph7)是古生菌和真核生物合成白喉酰胺的重要蛋白,Wang等[63]用雙鏈RNA敲除日本對蝦(Marsupenaeus japonicus)的白喉酰胺生物合成蛋白7基因,研究結(jié)果表明Dph7通過調(diào)節(jié)細(xì)胞凋亡、血細(xì)胞數(shù)量、酚氧化酶(Phenoloxidase,PO)活性和超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase,SOD)活性來應(yīng)對WSSV病毒感染。通過研究免疫相關(guān)基因的功能,能夠為更深入的了解水產(chǎn)動物抗病毒免疫機(jī)制和防治病毒性疾病提供參考。
表1 RNA干擾病毒基因
2.2.3 RNA干擾宿主與病毒復(fù)制相關(guān)基因 此外,宿主基因也可以參與病毒入侵過程,Rab是一種GTP結(jié)合蛋白,與病毒的細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)有關(guān),Chalermporn等[64-66]針對 Rab5、Rab7和 Rab11設(shè)計dsRNA注射蝦,然后感染白斑綜合癥病毒(WSSV)或黃頭病毒(YHV),病毒的表達(dá)均被抑制。磷酸丙糖異構(gòu)酶(Triosephosphate isomerase,TPI)是糖酵解途徑中的重要酶,其可催化甘油醛-3-磷酸(GAP)和磷酸二羥丙酮(DHAP)的相互轉(zhuǎn)化,其中DHAP參與脂質(zhì)代謝和磷脂合成。TPI基因的干擾導(dǎo)致WSSV感染的脊背白蝦(Exopalaemon carinicauda)體內(nèi)的病毒拷貝數(shù)顯著降低,表明WSSV感染可能通過調(diào)節(jié)糖酵解途徑,使其產(chǎn)生更多磷脂,來促進(jìn)病毒的復(fù)制[67]。這些研究結(jié)果表明通過干擾宿主體內(nèi)與病毒入侵、復(fù)制相關(guān)基因的表達(dá),可有效抑制病毒的復(fù)制。
表2 RNA干擾宿主基因、非特異性雙鏈RNA
研究人員已經(jīng)證明針對病毒設(shè)計的特異性雙鏈RNA可以抑制病毒復(fù)制,非特異性雙鏈RNA有些情況下也表現(xiàn)出抑制作用。Robalino等[68]在感染白斑綜合癥病毒和桃拉病毒的凡納濱對蝦中分別注射綠頭鴨(Anas platyrhynchos)、鯰(Ictalurus punctatus)和野豬(Sus scrofa)的免疫球蛋白基因dsRNA,結(jié)果顯示,注射異源物種dsRNA組的死亡率遠(yuǎn)低于對照組,由于凡納濱對蝦體內(nèi)不存在上述脊椎動物的免疫球蛋白基因,所以這些dsRNA分子不可能參與到凡納濱對蝦的抗病毒干擾體系中去,引起染病對蝦死亡率降低的原因可能是異源物種dsRNA激活了對蝦的先天免疫反應(yīng)。此后的一系列實驗均證實了這一點,Clarke等[69]靶向VHSV糖蛋白(G)或聚合酶(L)基因設(shè)計shRNA,其中五種特異性shRNA可以顯著減少斑馬魚(Brachydanio rerio)細(xì)胞中VHSV的復(fù)制,而一種錯誤折疊的shRNA,通過誘導(dǎo)干擾素和Mx基因產(chǎn)生非特異性的抗病毒應(yīng)答降低病毒的感染。針對RSIV的主要衣殼蛋白(MCP)基因,以及靶向牙鲆彈狀病毒(Hirame rhabdovirus,HIRRV)設(shè)計的干擾RNA都抑制了病毒的復(fù)制,而靶向β-半乳糖苷酶基因(β-LacZ)的對照組細(xì)胞中也觀察到對病毒復(fù)制的抑制作用,針對病毒的干擾不僅能觸發(fā)microRNA相關(guān)的途徑,而且還能激活干擾素途徑,以增加細(xì)胞對病毒的抵抗力[70]。在長牡蠣(Crassostrea gigas)中,抑制NF-κB抑制蛋白(IκB2)的表達(dá)后,感染牡蠣皰疹病毒1(Ostreid herpesvirus 1,OsHV-1)的長牡蠣全部存活,而對照組注射綠色熒光蛋白的雙鏈RNA,存活率也為100%,并且對照組中免疫相關(guān)基因的表達(dá)均增加[71]。以上結(jié)果均表明不僅只有特異性的雙鏈RNA可以抑制病毒復(fù)制,而非特異性的雙鏈RNA也具有干擾病毒復(fù)制的作用。
隨著水產(chǎn)動物養(yǎng)殖業(yè)的擴(kuò)大,寄生蟲病的出現(xiàn)也日益增多。被寄生蟲侵犯的魚體呈現(xiàn)不安狀態(tài),嚴(yán)重影響食欲,日漸消瘦,并且還容易引發(fā)白皮病、赤皮病等各種病癥[79]。寄生蟲感染的問題亟待解決,應(yīng)用RNA干擾技術(shù)抑制寄生蟲的生殖、生長發(fā)育、運(yùn)動、宿主識別等相關(guān)基因的表達(dá),觀察寄生蟲的表征變化,從而進(jìn)一步了解寄生蟲侵襲宿主的機(jī)制,為抗寄生蟲感染提供參考。RNA干擾技術(shù)在水產(chǎn)動物抗寄生蟲研究中的應(yīng)用在表3中列出。
Ohashi等[80]第一次成功地在魚寄生蟲體內(nèi)用dsRNA介導(dǎo)了基因沉默,通過浸泡引入新貝尼登蟲(Neobenedenia girellae)血管相關(guān)基因vlg1或vlg2的dsRNA,可以使生殖細(xì)胞部分或完全喪失,孵化率降低,說明RNA干擾技術(shù)可以成功干擾新貝尼登蟲基因,并且可以研究該寄生蟲基因的功能。
此后RNA干擾技術(shù)的抗寄生蟲研究主要集中在魚虱(Lepeophtheirus salmonis)的基因功能研究上。大西洋鮭是世界著名經(jīng)濟(jì)魚類,而魚虱是危害大西洋鮭魚(Salmo salar)的主要寄生蟲之一,因而受到廣泛研究[81-82]。魚虱的控制很大程度上依賴抗魚虱藥物,但是經(jīng)常使用會導(dǎo)致魚虱的抗藥性[83-84]。近年來應(yīng)用RNA干擾技術(shù)在研究魚虱生殖、生長、運(yùn)動等具體機(jī)制以及參與調(diào)控的基因等方面也取得了大量進(jìn)展,從而為尋找新的藥物靶點及控制魚虱感染提供理論參考。Dalvin等[85]首次嘗試用RNA干擾技術(shù)研究魚虱卵黃相關(guān)蛋白基因(Yolk-associated protein,YAP)的功能,被干擾后的未成熟雌性通常會在體外產(chǎn)卵,但大多數(shù)胚胎要么無法孵化,要么產(chǎn)生了嚴(yán)重畸形的幼蟲,這表明YAP在魚虱的胚胎發(fā)育中起著至關(guān)重要的作用。在寄生的生命階段,魚虱會攝取大量的宿主血液,其中含有大量的鐵,鐵雖是一種必須的微量營養(yǎng)元素,但在高劑量時是有毒性的,而鐵調(diào)節(jié)蛋白(Iron regulatory protein 1B,IRP1B)在調(diào)節(jié)體內(nèi)鐵含量過程中發(fā)揮重要作用。干擾IRP1B的雙鏈RNA注射魚虱后,鐵蛋白(Ferritin)表達(dá)增加,卵串變短,后代數(shù)量減少,可用來控制寄生蟲后代數(shù)量[86]。維甲酸X受體(Retinoid X receptor,RXR),屬于核受體超家族,參與控制個體的遺傳發(fā)育以及包括生殖和代謝途徑在內(nèi)的多個過程。雌虱的維甲酸X受體被干擾后,產(chǎn)生卵子的數(shù)量大幅減少或不產(chǎn)生,而幼蟲幾乎全部死亡[87]。雷帕霉素靶蛋白(Target of rapamycin,TOR)信號通路存在于所有后生動物中,是根據(jù)營養(yǎng)多寡調(diào)節(jié)細(xì)胞活動的主要調(diào)控因子。RNA干擾魚虱的TOR通路,抑制了卵子的發(fā)育和成熟,后代存活數(shù)量減少,證實TOR通路在魚虱卵黃蛋白產(chǎn)生和卵發(fā)育中存在極其重要的作用[88]。黏液樣精子包膜蛋白1 &2(Mucin-like spermatophore wall protein 1 & 2,MLSWP1& 2)基因被干擾后,雌體攜帶的精子包囊減少,可以通過干擾該基因以減少受精率[89]。
甲殼動物由于獨特的身體構(gòu)造,在個體發(fā)育過程中存在蛻皮現(xiàn)象。蛻皮素在介導(dǎo)蛻皮過程中發(fā)揮重要作用。蛻皮素受體(Ecdysone receptor,EcR)單獨被干擾導(dǎo)致魚虱營養(yǎng)不良、發(fā)育遲緩、死亡率增加,而蛻皮素受體和維甲酸X受體同時被干擾,幼蟲蛻皮停滯,說明EcR對魚虱的蛻皮和發(fā)育具有重要的作用[90]。Eichner等[91]干擾幾丁質(zhì)酶2(Chitinases2,Chi2)基因,引起魚虱的背部肌肉變短,整體形態(tài)發(fā)生改變,運(yùn)動能力降低,并且不能感染宿主,表明Chi2可能與魚虱的生長發(fā)育有關(guān)。Carpio等[92]用雙鏈RNA介導(dǎo)的干擾來研究魚虱my32基因的功能,結(jié)果表明,與對照組相比,用my32-dsRNA浸泡的魚虱的my32轉(zhuǎn)錄本下調(diào)了70%,魚虱后代發(fā)育遲緩,數(shù)量減少,這表明my32蛋白有希望作為疫苗的開發(fā)目標(biāo),以對抗魚虱的侵?jǐn)_。
寄生蟲具有高度的宿主特異性,魚虱的離子型受體(Ionotropic receptors,IRs)被特異性dsRNA干擾后,改變了對宿主識別的特異性,一部分魚虱寄生到非宿主體表,停留一段時間后離開,表明IRs的缺乏降低了魚虱對寄生宿主的特異性,使其感染非宿主魚,這一新的發(fā)現(xiàn)為將來利用宿主識別系統(tǒng)控制寄生蟲開辟了道路[93]。
魚虱識別宿主后,通過運(yùn)動吸附于宿主體表,開始寄生生活。幾丁質(zhì)酶2(Chitinases 2,Chi2)基因和血紅素過氧化物酶(Heme peroxidase 1,HPX1)基因的干擾均引起魚虱幼蟲活動減少、游泳速度減慢[94]。表明這些基因參與調(diào)節(jié)魚虱的運(yùn)動功能。
寄生蟲感染可引起水產(chǎn)動物死亡,降低水產(chǎn)養(yǎng)殖的經(jīng)濟(jì)效益。通過研究寄生蟲的生長發(fā)育、生殖、運(yùn)動、宿主識別相關(guān)基因的功能,深入了解寄生蟲的寄生機(jī)制,可以為尋找更加有效的控制寄生蟲感染的藥物奠定理論基礎(chǔ)。
表3 RNAi技術(shù)在水產(chǎn)動物抗寄生蟲研究中的應(yīng)用
隨著水產(chǎn)養(yǎng)殖品種的增多和養(yǎng)殖規(guī)模的增大,各種傳染性疾病的暴發(fā)和流行已經(jīng)嚴(yán)重威脅了水產(chǎn)養(yǎng)殖的健康持續(xù)發(fā)展。目前水產(chǎn)動物病毒性疾病的防治可供利用的有效藥物和疫苗非常有限,而RNA干擾技術(shù)是目前研究基因沉默的熱門技術(shù),已廣泛應(yīng)用于植物、動物和人類基因的功能研究及疾病治療方面的探索,利用RNAi技術(shù)關(guān)閉目標(biāo)基因,結(jié)合轉(zhuǎn)基因技術(shù),將有望成為探索水產(chǎn)動物疾病防治方法的新途徑。
現(xiàn)階段,人們主要通過注射、浸泡及轉(zhuǎn)染等手段將dsRNA/siRNA分子傳遞到水產(chǎn)動物或細(xì)胞內(nèi)以用于水產(chǎn)動物抗病毒和抗寄生蟲感染研究,但RNA干擾技術(shù)在應(yīng)用研究中仍存在許多問題,如沉默效率低、脫靶、穩(wěn)定性差、引起免疫反應(yīng)、安全性。對于脫靶效應(yīng)可以通過針對同一個基因選擇多個靶位點,靶位點選擇在不易突變的區(qū)域,用軟件預(yù)測是否含有脫靶效應(yīng),選擇合適的siRNA濃度,利用化學(xué)修飾或用特殊物質(zhì)封裝siRNA 分子等方法來解決,但如何更大程度甚至完全消除毒副作用,還有待于進(jìn)一步研究。
隨著對分子生物學(xué)研究的不斷深入,RNAi 技術(shù)作為一種新的基因阻斷技術(shù),必將從實驗階段走向?qū)嶋H應(yīng)用,廣泛應(yīng)用于水產(chǎn)動物基因功能分析、免疫機(jī)制研究、病原抑制與疾病控制等方面。RNAi技術(shù)在充滿挑戰(zhàn)的后基因組時代將有廣闊的應(yīng)用前景,它將會在水產(chǎn)動物醫(yī)學(xué)中帶來一次新的技術(shù)革命。