潘 永,楊 陽(yáng),楊 琦,3*
1.貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院,貴州貴陽(yáng) 550025;2.貴州大學(xué)動(dòng)物疫病研究所,貴州貴陽(yáng) 550025;3.貴州省動(dòng)物疫病與獸醫(yī)公共衛(wèi)生重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,貴州貴陽(yáng) 550025
長(zhǎng)順綠殼蛋雞作為貴州省優(yōu)勢(shì)蛋雞品種,具有耐粗飼、抗病力強(qiáng)、覓食能力強(qiáng)等特點(diǎn),為了解該品種雞腸道優(yōu)勢(shì)益生菌群的特點(diǎn)以及篩選防治禽類(lèi)疾病的候選菌種,本研究將針對(duì)其糞便,通過(guò)嚴(yán)格厭氧培養(yǎng)、形態(tài)學(xué)觀察、分子生物學(xué)鑒定幾個(gè)方面對(duì)其優(yōu)勢(shì)型益生菌進(jìn)行初步的分離和鑒定[1]。
貴州省長(zhǎng)順縣光輝綠殼蛋雞產(chǎn)業(yè)集團(tuán)采集的健康成年蛋雞糞便20 份,置于無(wú)菌封口袋中,-20 ℃保存。
MRS 培養(yǎng)基、PBS、厭氧培養(yǎng)包(1 000 mL)、革蘭氏染液。
稱取糞便1 g 放入無(wú)菌10 mLPBS 緩沖液中攪拌均勻,用無(wú)菌紗布過(guò)濾雜質(zhì)。以濾液為原液,每次稀釋10 倍,分別用PBS 緩沖液稀釋3 次,保留包含原液的4 個(gè)稀釋梯度的樣品。分別取各樣品100 μL 用無(wú)菌三角玻璃棒涂布于MRS 培養(yǎng)基,放入?yún)捬跖囵B(yǎng)包,密封后于37 ℃培養(yǎng)箱過(guò)夜培養(yǎng)。
宏觀:選取20 份糞便樣品稀釋培養(yǎng)后MRS 培養(yǎng)基,記錄菌落數(shù)在30 ~100 的平板,挑選并標(biāo)記優(yōu)勢(shì)菌,優(yōu)勢(shì)菌應(yīng)同時(shí)具備以下特點(diǎn):菌落總數(shù)最多,菌落形態(tài)較大。觀察優(yōu)勢(shì)菌透明度、形狀、邊緣、顏色、濕潤(rùn)與否、光滑或粗糙。微觀:酒精燈旁,釣菌環(huán)蘸取一滴無(wú)菌蒸餾水于無(wú)菌玻片中央,釣菌環(huán)挑取少量單個(gè)優(yōu)勢(shì)菌落與蒸餾水混合并以同心圓的形式擴(kuò)散涂布,玻片于酒精燈火焰上方來(lái)回烘干,吸取一滴結(jié)晶紫染料于玻片中央并晃動(dòng)使之覆蓋附著于玻片的細(xì)菌,30 ~60 s 后用無(wú)菌蒸餾水輕輕沖洗,吸取一滴碘液于同樣的位置并使其鋪開(kāi),30 ~60 s 后無(wú)菌蒸餾水輕輕沖洗,吸取一滴95%乙醇脫色液于同樣位置并鋪開(kāi),20 ~30 s 后無(wú)菌蒸餾水輕輕沖洗,吸取一滴沙皇復(fù)染色液于同樣位置并鋪開(kāi),30 ~60 s 后蒸餾水輕輕沖洗,吸水紙從邊緣將玻片上多余的水吸干,酒精燈火焰上方將玻片烘干,吸取一滴松節(jié)油到玻片中央,于光學(xué)顯微鏡1 000 倍觀察細(xì)菌形態(tài)。
通過(guò)登陸NCBI 網(wǎng)站,下載并分析現(xiàn)有益生菌16S rDNA 基因序列,以同源性最高的上游序列:5’-AGAGTTTGATCCTGGCTNAG -3’為正向通用引物,同源性最高的下游序列:5’-GGTTACCTTGTTACGACT T-3’為反向通用引物,通過(guò)Touchdown PCR 技術(shù)擴(kuò)增20 份糞便樣品優(yōu)勢(shì)益生菌16S rDNA 基因序列。擴(kuò)增產(chǎn)物取10 μL 經(jīng)1.2%瓊脂糖凝膠檢測(cè)后,膠回收送往上海勤邦生物有限公司測(cè)序。將測(cè)序結(jié)果導(dǎo)入NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行BLAST 檢測(cè),比對(duì)分析其在細(xì)菌中的分類(lèi)地位。
對(duì)20 份樣品中優(yōu)勢(shì)益生菌的判斷發(fā)現(xiàn),A1 菌株在8 份糞便樣品中被判定為優(yōu)勢(shì)菌,A2 在另外的6 份糞便樣品中被判定為優(yōu)勢(shì)菌,A3 則在剩下的6 份糞便樣品中被判定為優(yōu)勢(shì)菌。通過(guò)3 株優(yōu)勢(shì)益生菌進(jìn)行宏觀和微觀形態(tài)學(xué)對(duì)比,結(jié)果顯示,有3 株菌株表現(xiàn)為不同的微觀形態(tài),其中A1 為革蘭氏陽(yáng)性菌,屬短桿菌,兩端鈍圓,成對(duì),無(wú)芽孢。A2 為革蘭氏陽(yáng)性菌,屬長(zhǎng)桿菌,棒狀,成對(duì),無(wú)芽孢。A3 為革蘭氏陽(yáng)性菌,屬中短型桿菌,兩端鈍圓,成對(duì)或鏈狀排列,無(wú)芽孢。
通過(guò)通用引物對(duì)上述三株細(xì)菌16S rDNA 基因進(jìn)行PCR 擴(kuò)增并對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序鑒定,結(jié)果顯示,除空白對(duì)照組外,均出現(xiàn)單一目的條帶,經(jīng)測(cè)序表明,A1 菌株16S rDNA 基因序列堿基數(shù)為1 469 bp,A2菌株16S rDNA 基因序列堿基數(shù)為1 450 bp,A3 菌株16S rDNA 基因序列堿基數(shù)為1 486 bp。
通過(guò)登錄NCBI 網(wǎng)站進(jìn)入BLAST 單元,導(dǎo)入上述3 種菌株16S rDNA 基因測(cè)序反饋序列,比對(duì)分析結(jié)果顯示,A1 菌株與羅伊乳桿菌具有最高的相似度,A2 菌株與黏膜乳桿菌具有最高的相似度,A3 菌株則與植物乳桿菌具有最高的相似度。以上結(jié)果表明,本研究成功從雞糞便中分離到3 株不同的益生菌菌株。
細(xì)菌耐藥性一直以來(lái)均被視為世界衛(wèi)生體系中較為重要的問(wèn)題,同時(shí)對(duì)動(dòng)物養(yǎng)殖業(yè)產(chǎn)生了較為嚴(yán)重后果[2]。本研究中對(duì)20 份糞便樣品的分離鑒定結(jié)果發(fā)現(xiàn),三株益生菌分別為不同實(shí)驗(yàn)組別中的優(yōu)勢(shì)菌群。該結(jié)果提示,益生菌菌群的構(gòu)成較為復(fù)雜,正常腸道環(huán)境中并非僅有一種益生菌發(fā)揮作用,可能是多種,而益生菌群之間存在聯(lián)系與否,還需深入研究。