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低氮條件下響應(yīng)接種根瘤菌的大豆產(chǎn)量相關(guān)性狀遺傳位點(diǎn)及基因挖掘

2020-04-23 08:23霍曉波李喜煥孔佑賓李文龍張彩英
關(guān)鍵詞:節(jié)數(shù)主莖單株

霍曉波,李喜煥,杜 匯,孔佑賓,李文龍,張彩英

(河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 教育部華北作物種質(zhì)資源研究與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河北 保定 071001)

大豆是人類食用油與植物蛋白重要來源,在國民經(jīng)濟(jì)中占有不可替代的地位。同時由于大豆可通過與根瘤菌互作進(jìn)行共生固氮,因而又是養(yǎng)地作物,在農(nóng)作物輪作倒茬中具有重要作用[1]。據(jù)統(tǒng)計(jì),大豆籽粒中的生物固氮量在肥沃與貧瘠土壤條件下可分別達(dá)到25%~50%和80%~90%。因此,根瘤固氮成為提高大豆產(chǎn)量、減少化肥使用、維持農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展重要途徑[2-4]。然而,大豆根瘤固氮屬于多基因控制數(shù)量性狀[5],其對大豆產(chǎn)量的作用機(jī)制亦同樣復(fù)雜。

全基因組關(guān)聯(lián)分析和連鎖分析是進(jìn)行基因定位的重要方法。Prabhu等以自然群體為研究材料,定位到與固氮量、氮含量以及C/N顯著關(guān)聯(lián)SNP 60個[6];Kamfwa等通過259份菜豆自然群體的葉綠素含量、根瘤個數(shù)、地上部生物重、地上部氮百分含量等固氮相關(guān)性狀,結(jié)合基因型數(shù)據(jù)(5 398個SNP),關(guān)聯(lián)到40個顯著關(guān)聯(lián)SNP,分布于9條染色體[7];Zhou等以302份重測序大豆野生品種、地方品種和育成品種為材料,關(guān)聯(lián)到控制含油量、株高、茸毛等13個農(nóng)藝性狀的230個QTL[8];Sonah等以139個大豆品種為材料,發(fā)掘了與花色、種臍顏色、株高、籽粒油分和蛋白等8個性狀顯著關(guān)聯(lián)的25個遺傳位點(diǎn)[9];Fang等鑒定了809份大豆品種的84個農(nóng)藝性狀,檢測到245個顯著關(guān)聯(lián)SNP位點(diǎn),其中95個遺傳位點(diǎn)之間存在互作[10];Zhang等鑒定了314份大豆的鐮刀菌抗性,發(fā)掘了12個遺傳位點(diǎn),分布于8條染色體[11];Lee等測定了621份大豆籽粒蛋白、脂肪、以及主要氨基酸含量,結(jié)合基因型數(shù)據(jù)(34 014個SNP),發(fā)掘了17個顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn)[12];Tanya等[13]利用大豆RIL群體定位到5個與根瘤個數(shù)相關(guān)QTL,7個與根瘤鮮重、干重相關(guān)QTL, 2個與固氮酶活性相關(guān)QTL;Nicola′s等[14]以 F2:3群體為材料,定位到多個大豆固氮相關(guān)QTL;Santos等[15]定位到2個地上部干重相關(guān)QTL、3個根瘤個數(shù)相關(guān)QTL、1個單個根瘤干重相關(guān)QTL;Hwang等[16]定位到與植株地上部酰脲及全氮含量相關(guān)QTL;Ray等[17]利用大豆自然群體關(guān)聯(lián)到53個與地上部酰脲含量相關(guān)位點(diǎn)。由此可見,針對大豆發(fā)育早期固氮相關(guān)性狀已有較多研究,而關(guān)于低氮條件下接種根瘤菌后的大豆成熟期產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL與候選基因研究較少。

鑒于此,本研究以前期構(gòu)建的大豆自然群體和RIL分離群體為材料,采用關(guān)聯(lián)分析與連鎖分析2種方法,在低氮條件下接種根瘤菌對大豆成熟期的株高、主莖節(jié)數(shù)、分枝數(shù)、單株莢數(shù)、單株粒數(shù)、單株粒重和百粒重等產(chǎn)量相關(guān)性狀進(jìn)行QTL定位,尋找控制產(chǎn)量相關(guān)性狀遺傳位點(diǎn)及候選基因,為接種根瘤菌大豆產(chǎn)量相關(guān)性狀遺傳基礎(chǔ)解析、大豆品種固氮能力改良的分子育種提供選擇標(biāo)記和候選基因。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)材料

1.1.1 供試品種 以前期構(gòu)建的大豆自然群體和RIL群體為研究材料,自然群體包含155份大豆種質(zhì)資源,包括育成品種(68份)、品系(56份)和地方品種(31份);RIL群體以高固氮品種‘鄭92116’和低固氮品種‘遼豆14’為雜交親本,包含154個F6:10家系。

1.1.2 供試根瘤菌菌株 采用優(yōu)勢快生型費(fèi)氏中 華 根 瘤 菌[Sinorhizobium(Ensifer) fredii]CCBAU45436為供試菌株,由中國農(nóng)業(yè)大學(xué)根瘤菌研究中心提供[18-19]。

1.2 試驗(yàn)方法

1.2.1 大豆RIL和自然群體種植與管理 2018年6月將大豆自然群體與RIL群體及其親本播種于河北農(nóng)業(yè)大學(xué)育種中心低氮池。低氮池底部和四周用水泥加固,池內(nèi)土壤肥力為有機(jī)質(zhì)9.10 g/kg,堿解氮22.18 mg/kg,速效磷5.72 mg/kg,速效鉀133.54 mg/kg。隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),2次重復(fù)。首先將氯氣消毒后的15粒種子均勻播種在1.5 m行長的犁溝中,隨后將50 mL制備好的CCBAU45436菌液均勻噴灑在種子上,覆土[20]。待大豆出苗后定苗,每周澆1次無氮B&D營養(yǎng)液[21]。

1.2.2 大豆RIL群體與自然群體產(chǎn)量相關(guān)性狀鑒定 待大豆成熟后,每行選取具有代表性的連續(xù)5株進(jìn)行產(chǎn)量相關(guān)性狀測定,包括株高(PH)、底莢高(LPH)、主莖節(jié)數(shù)(NN)、分枝數(shù)(BN)、單株莢數(shù)(PN)、單株粒數(shù)(SN)、單株粒重(SW)和百粒重(HSW)等。其鑒定方法參考國家大豆區(qū)域試驗(yàn)考種標(biāo)準(zhǔn)。

1.2.3 大豆群體產(chǎn)量相關(guān)性狀數(shù)據(jù)分析 利用SPSS statistics V19.0分析大豆產(chǎn)量相關(guān)性狀均值、標(biāo)準(zhǔn)差、最大值、最小值、變異系數(shù)、偏度和峰度等,同時計(jì)算各性狀間的相關(guān)系數(shù)。

1.2.4 大豆群體產(chǎn)量相關(guān)性狀關(guān)聯(lián)與連鎖分析 大豆自然群體的群體結(jié)構(gòu)分析見已發(fā)表論文[22]。利用上述大豆自然群體各產(chǎn)量相關(guān)性狀表型值,結(jié)合群體基因型,利用GAPIT V2軟件包中的MLM模型進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析[23-24];同時利用Icimapping V4.1中的BIP功能,對大豆RIL群體產(chǎn)量相關(guān)性狀進(jìn)行加性和上位性QTL檢測,其中加性QTL步長為0.1 cM,LOD值2.5,上位性QTL步長5 cM,LOD值4.5。

1.2.5 大豆產(chǎn)量相關(guān)性狀候選基因預(yù)測 基于Soybase參考基因組Glyma.Wm82.a1版本(https://www.soybase.org),篩選顯著關(guān)聯(lián)SNP衰減距離內(nèi)的候選基因,并結(jié)合Soynet(https://www.inetbio.org/soynet/)分析候選基因間的互作網(wǎng)絡(luò)[25]。

2 結(jié)果與分析

2.1 大豆產(chǎn)量相關(guān)性狀遺傳變異分析

2.1.1 大豆自然群體產(chǎn)量相關(guān)性狀遺傳變異 分析供試大豆自然群體在低氮條件下接種根瘤菌的產(chǎn)量相關(guān)性狀,結(jié)果發(fā)現(xiàn)(表1),株高、主莖節(jié)數(shù)、分枝數(shù)、單株莢數(shù)、單株粒數(shù)等8個產(chǎn)量相關(guān)性狀在品種間的差異均達(dá)到極顯著,變異系數(shù)分布在15.32%~49.03%,最大的為分枝數(shù)(49.03%),其次是單株莢數(shù)(40.10%),最小的為主莖節(jié)數(shù)(15.32%),說明供試大豆群體產(chǎn)量相關(guān)性狀存在廣泛遺傳變異。同時,各產(chǎn)量相關(guān)性狀表型呈連續(xù)的正態(tài)分布,屬于多基因控制數(shù)量性狀。

表1 大豆自然群體產(chǎn)量相關(guān)性狀遺傳變異Table 1 Genetic variation of yield-related traits in soybean natural population

2.1.2 大豆RIL群體及其親本產(chǎn)量相關(guān)性狀遺傳變異 分析供試大豆RIL群體及其親本在低氮條件下接種根瘤菌的產(chǎn)量相關(guān)性狀,結(jié)果發(fā)現(xiàn)(表2),RIL親本間存在較大遺傳差異,‘鄭92116’的株高、主莖節(jié)數(shù)、分枝數(shù)、單株莢數(shù)、單株粒數(shù)等各產(chǎn)量相關(guān)性狀均高于遼豆14。進(jìn)一步分析RIL群體產(chǎn)量相關(guān)性狀發(fā)現(xiàn),株系間的差異達(dá)到極顯著,變異系數(shù)在10.87%~34.02%之間,其中以分枝數(shù)和單株莢數(shù)的變異系數(shù)最高,說明供試RIL群體各產(chǎn)量相關(guān)性狀存在較大遺傳變異。同時,各相關(guān)性狀表型也呈連續(xù)的正態(tài)分布。另外還發(fā)現(xiàn),RIL群體部分株系表現(xiàn)正向或負(fù)向超親優(yōu)勢。

表2 大豆RIL群體產(chǎn)量相關(guān)性狀遺傳變異Table 2 Genetic variation of yield related traits in soybean RIL population

2.2 大豆產(chǎn)量相關(guān)性狀相關(guān)性分析

分別分析自然群體和RIL群體8個產(chǎn)量相關(guān)性狀間的相關(guān)系數(shù),結(jié)果發(fā)現(xiàn)(表3),多個產(chǎn)量相關(guān)性狀間存在顯著(極顯著)相關(guān),其中RIL群體的單株莢數(shù)、單株粒數(shù)、單株粒重間的相關(guān)系數(shù)高達(dá)0.85~0.93,株高與主莖節(jié)數(shù)間的相關(guān)系數(shù)也高達(dá)0.85;供試自然群體中以株高與主莖節(jié)數(shù)間的相關(guān)系數(shù)最高(r=0.78),其次單株莢數(shù)與單株粒重(r=0.73)、單株粒數(shù)(r=0.68)相關(guān)系數(shù)較高。這些顯著或極顯著的相關(guān)系數(shù)一方面說明各產(chǎn)量性狀間的緊密聯(lián)系,另一方面也為關(guān)聯(lián)/連鎖位點(diǎn)的一因多效解釋提供了依據(jù)。

表3 供試大豆群體各產(chǎn)量相關(guān)性狀間的相關(guān)性分析Table 3 Correlation analysis of yield related traits in two soybean populations

2.3 大豆自然群體產(chǎn)量相關(guān)性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析

利用自然群體產(chǎn)量相關(guān)性狀表型值,結(jié)合群體基因型進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)(圖1),有59個SNP與產(chǎn)量相關(guān)性狀顯著關(guān)聯(lián),分布于10條染色體上,其中與株高關(guān)聯(lián)的SNP最多,共18個;其次為主莖節(jié)數(shù)(17個SNP)、分枝數(shù)(11個SNP),與單株莢數(shù)顯著關(guān)聯(lián)的SNP 4個、與單株粒重顯著關(guān)聯(lián)的SNP 2個、與百粒重顯著關(guān)聯(lián)的SNP 1個。同時發(fā)現(xiàn),株高與主莖節(jié)數(shù)有17個共關(guān)聯(lián)的SNP,分別為2號染色體ss715581250、6號染色體ss715593820和ss715593829、7號染色體ss715598582和8號染色體ss715602540等。

進(jìn)一步分析上述關(guān)聯(lián)位點(diǎn)發(fā)現(xiàn),19號染色體與株高和主莖節(jié)數(shù)顯著關(guān)聯(lián)的ss715635425與已報(bào)道Dt1基因(Glyma19g37890)相距僅19 kb,而Dt1已被證實(shí)可同時控制大豆開花期、株高、產(chǎn)量等多個重要產(chǎn)量相關(guān)性狀;同時6號染色體與株高和主莖節(jié)數(shù)顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)ss715593820和ss715593829恰好位于已報(bào)道的開花期基因QNE1(Glyma06g22240)和E1(Glyma06g23040)之間[26]。另外還發(fā)現(xiàn)2個一因多效SNP:15號染色體ss715622869同時與分枝數(shù)、單株莢數(shù)和單株粒重關(guān)聯(lián),19號染色體ss715635361同時與株高、主莖節(jié)數(shù)和底莢高關(guān)聯(lián)。

圖1 大豆自然群體產(chǎn)量相關(guān)性狀關(guān)聯(lián)分析(閾值以紅線標(biāo)出)Fig.1 Association analysis results of yield related traits in soybean natural population(The threshold was indicated with red line)

2.4 大豆RIL群體產(chǎn)量相關(guān)性狀連鎖分析

2.4.1 產(chǎn)量相關(guān)性狀加性QTL分析 對供試RIL群體產(chǎn)量相關(guān)性狀進(jìn)行QTL分析發(fā)現(xiàn)(表4),有23個加性QTL與產(chǎn)量性狀顯著相關(guān),分布于8條染色體,在23個QTL中,6號和19號染色體QTL最多(7個、5個),其次為10號染色體(4個);這些QTL的表型貢獻(xiàn)率為5.90%~32.87%,其中有11個QTL的表型貢獻(xiàn)率超過10%。控制單株莢數(shù)的qPN-C2位于Gm06的91.7 cM、qPN-O位于Gm10的36.7 cM;控制單株粒數(shù)的qSN-C2位于Gm06的91.7 cM、qSN-O位于Gm10的36.7 cM、qSN-L位于Gm19的45.5 cM;控制單株粒重qSW-C2位于Gm06的91.7 cM、qSW-O位于Gm10的39.8 cM、qSW-L位于Gm19的45.5 cM;控制百粒重的qHSW-N位于Gm03的141.0 cM、qHSW-O位于Gm10的37.0 cM。對表型貢獻(xiàn)率分別為9.18%~17.42%、6.31%~20.35%、5.95%~24.60%和7.27%~9.45%。發(fā)掘到控制底莢高QTL 4個,株高、主莖節(jié)數(shù)、分枝數(shù)各3個。

進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),在6號染色體上定位到1個同時控制株高、主莖節(jié)數(shù)、單株莢數(shù)、單株粒重和單株粒數(shù)的QTL,位于ss715594069-ss715593914之間,表型貢獻(xiàn)率17.42%~24.60%,增效基因來自‘鄭92116’;在19號染色體上定位到1個同時控制株高與主莖節(jié)數(shù)的QTL,位于ss715635545-ss715635383之間,貢獻(xiàn)率為25.90%~32.87%,以及1個同時控制單株粒數(shù)和單株粒重的QTL,位于ss715635619-ss715635545之間,貢獻(xiàn)率為6.31%~7.67%,2個QTL相鄰,上述兩個QTL的增效基因均來自‘遼豆14’;在10號染色體上定位到1個同時控制單株莢數(shù)和單株粒數(shù)的QTL(qPN-O、qSN-O),位于ss715607504-ss715607483之間,且與控制百粒重的QTLqHSW-Oss715607483-ss715607458相 鄰,解釋表型變異7.27%~11.76%。另外,在13號染色體上還定位到1個同時控制株高和底莢高QTL,位于ss715616007-ss715616040之間,表型貢獻(xiàn)率8.88%~11.27%。

表4 大豆RIL群體產(chǎn)量相關(guān)性狀加性QTL分析Table 4 The additive QTLs of yield related traits in soybean RIL population

2.4.2 產(chǎn)量相關(guān)性上位性QTL分析 分析RIL群體產(chǎn)量相關(guān)性狀上位性QTL發(fā)現(xiàn)(表5),共定位到13對影響單株粒數(shù)、單株莢數(shù)、百粒重等性狀上位性QTL,分布于13條染色體上,其中3對單株粒數(shù)上位性QTL中有2對效應(yīng)值為負(fù),表現(xiàn)出重組型大于親本型,1對效應(yīng)值為正,表現(xiàn)出親本型大于重組型;2對單株莢數(shù)上位性QTL效應(yīng)值為負(fù),表現(xiàn)出重組型大于親本型。進(jìn)一步分析還發(fā)現(xiàn),7號染色體ss715596707-ss715597345和12號染色體ss715611920-ss715611545上位性QTL同時影響單株粒數(shù)和單株莢數(shù),屬于一因多效上位性QTL。

表5 大豆RIL群體產(chǎn)量相關(guān)性狀上位性QTL分析Table 5 The epistatic QTL of yield related traits in soybean RIL population

2.5 大豆產(chǎn)量相關(guān)性狀候選基因發(fā)掘

綜合分析自然群體和RIL群體定位結(jié)果,發(fā)現(xiàn)6號和19號染色體存在產(chǎn)量相關(guān)性狀一致性QTL,在其附近尋找候選基因,6號染色體有7個,包含磷酸丙酮酸激酶、轉(zhuǎn)移酶、PCF轉(zhuǎn)錄因子和發(fā)育調(diào)節(jié)因子基因等;19號染色體有16個,包含Dt1(Glyma19g37890)、氧化還原酶、亮氨酸重復(fù)受體激酶、結(jié)瘤素、鐵硫蛋白基因等(表6)。

為進(jìn)一步明確上述候選基因間的內(nèi)在聯(lián)系,利用Soynet在線工具分析上述基因發(fā)現(xiàn)(圖2),21個基因參與互作網(wǎng)絡(luò),說明其相互之間存在直接或間接聯(lián)系(除Glyma19g39370、Glyma19g37430外)。在21個參與網(wǎng)絡(luò)的候選基因中,存在直接互作關(guān)系且處于網(wǎng)絡(luò)核心位置的有2對,其中之一是位于19號染色體的Glyma19g38520(氧化還原酶基因)和Glyma19g37500(氧化還原酶基因),另一對為該染色體的Glyma19g38450(氨基酸連接酶基因)和Glyma19g37930(鐵硫蛋白基因)。

表6 大豆6號與19號染色體產(chǎn)量相關(guān)性狀候選基因Table 6 Candidate genes associated with yield related traits on Gm06 and Gm19

續(xù)表:

圖2 大豆6號與19號染色體候選基因的互作網(wǎng)絡(luò)(節(jié)點(diǎn)中心以紅色箭頭標(biāo)出)Fig.2 The network of candidate genes on Gm06 and Gm19(The node center was pointed with red arrow)

3 結(jié)論與討論

本研究采用關(guān)聯(lián)與連鎖分析方法對低氮條件下接種根瘤菌的大豆株高、主莖節(jié)數(shù)、分枝數(shù)、單株莢數(shù)、單株粒數(shù)、單株粒重和百粒重等產(chǎn)量相關(guān)性狀進(jìn)行QTL研究。通過關(guān)聯(lián)分析發(fā)掘到響應(yīng)根瘤菌接種的產(chǎn)量相關(guān)性狀SNP 59個,利用連鎖分析獲得23個加性QTL和13對上位性QTL,其中控制株高、主莖節(jié)數(shù)等產(chǎn)量相關(guān)性狀的一致性QTL主要位于6號和19號染色體上,在自然群體和分離群體均被定位,并在其附近篩選到23個候選基因。

利用RIL群體與自然群體進(jìn)行連鎖和關(guān)聯(lián)分析是目前尋找植物目標(biāo)性狀QTL重要研究手段,已有學(xué)者綜合運(yùn)用2種方法尋找控制植物性狀QTL與基因,且效果較好[27]。本研究分別利用這2種方法獲得了多個與大豆產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL。為進(jìn)一步尋找2種方法共定位的一致性QTL,本研究對比了連鎖定位與關(guān)聯(lián)分析SNP,結(jié)果發(fā)現(xiàn),在6號與19號染色體存在較好的一致性位點(diǎn),其中6號染色體的22.27 mb~28.32 mb(參考基因組WM82.a1v1)區(qū)間存在1個可同時控制株高、主莖節(jié)數(shù)、單株莢數(shù)、單株粒數(shù)和單株粒重QTL,其兩側(cè)連鎖標(biāo)記為ss715593914和ss715594069,同時在該染色體19.54 mb位置關(guān)聯(lián)到1個與株高和主莖節(jié)數(shù)顯著相關(guān)標(biāo)記ss715593829,二者物理距離相距較近(2.73 mb)。在19號染色體定位到1個同時控制株高、主莖節(jié)數(shù)QTL,該QTL兩側(cè)標(biāo)記為ss715635383和ss715635545,位于參考基因組(WM82.a1v1)44.64 mb和45.81 mb位置,其間包含Dt1位點(diǎn),并且包含自然群體關(guān)聯(lián)分析中的4個同時影響株高和主莖節(jié)數(shù)SNP(ss715635477、ss715635494、ss715635506和ss715635548)。另外,RIL群體中還定位到1個與上述QTL相鄰,控制單株粒重和粒數(shù)的一因多效QTL(ss715635545-ss715635619),物理位置為45.81 mb~46.76 mb,該區(qū)間也包含自然群體中2個同時與株高和主莖節(jié)數(shù)關(guān)聯(lián)的一因多效SNP(ss715635548和ss715635553)。

結(jié)合前期我們利用相同自然群體在溫室和大田兩種環(huán)境下對苗期結(jié)瘤固氮相關(guān)性狀遺傳位點(diǎn)及基因的研究結(jié)果[22],發(fā)現(xiàn)成熟期產(chǎn)量相關(guān)性狀與苗期結(jié)瘤固氮相關(guān)性狀部分遺傳位點(diǎn)存在一致性,如在6號染色體上關(guān)聯(lián)到的控制底莢高QTL(qLPH-C2),該位點(diǎn)距離本研究前期檢測到的控制苗期根系鮮重、干重的Locus14僅108 kb;同時在該染色體定位到的成熟期控制分枝數(shù)QTL(qBN-C2)距離上述Locus14僅694 kb,并與控制苗期地上部總氮含量的Locus19相距331 kb。另外,13號染色體定位到的成株期控制株高、底莢高QTL(qPH-F、qLPH-F)距離苗期控制地上部干重QTL(qSDW-F-2)僅625 kb[22]。上述一致性位點(diǎn)的發(fā)現(xiàn),不僅說明了本研究結(jié)果的可靠性,也為解析大豆苗期結(jié)瘤固氮與成熟期產(chǎn)量性狀相關(guān)性提供了理論依據(jù)。

關(guān)于大豆產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL報(bào)道目前已有很多,但多是基于自然土壤條件下研究結(jié)果,本研究在低氮條件下接種根瘤菌研究大豆產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL,結(jié)果發(fā)現(xiàn)部分QTL與前人報(bào)道及Soybase公布QTL存在較好一致性,如本研究在19號染色體關(guān)聯(lián)到的多個與株高、主莖節(jié)數(shù)顯著相關(guān)SNP,其中ss715635425標(biāo)記與已報(bào)道的株高位點(diǎn)Plantheight 1-g25和Plant height 3-g5定位在同一位點(diǎn),ss715635454、ss715635477、ss715635494和ss715635506位點(diǎn)則分別與已報(bào)道的株高位點(diǎn)Plant height 3-g2,Plant height 3-g6,Plant height 3-g7和Plant height 3-g3共定位,該QTL區(qū)間包含大豆開花期和株高Dt1基因[28-29],并且Hwang等利用大豆RIL群體在低氮條件下接種根瘤菌也定位到Dt1,故推測Dt1對低氮接菌條件下的大豆產(chǎn)量相關(guān)性狀也同樣具有重要作用[30]。同時,本研究定位到的6號染色體控制株高QTLqPH-C2與Soybase公布QTL的株高位點(diǎn)Plant height 10-1和Plant height 23-2一致[31-32];13號染色體的株高 QTLqPH-F與已報(bào)道的株高位點(diǎn)mqPlant height-006和Plant height 39-1一致[33-34];6號染色體控制單株莢數(shù)QTLqPN-C2與已有單株莢數(shù)位點(diǎn)Pod number 2-g4一致[35];10號染色體的單株莢數(shù)QTL qPN-O與已報(bào)道的單株莢數(shù)位點(diǎn)Pod number 8-3一致[36];19號染色體的單株粒數(shù)QTLqSN-L與已有單株粒數(shù)位點(diǎn)Seed number 5-1一致[36];6號染色體控制單株粒數(shù)QTL qSN-C2區(qū)間含有已報(bào)道的單株粒數(shù)候選基因Glyma06g28570[37],這些結(jié)果充分說明了本研究結(jié)果的可靠性。更重要的是,除上述與前人報(bào)道一致性的QTL外,本研究還定位/關(guān)聯(lián)到多個前人未報(bào)道的新QTL,這些QTL可能是大豆在低氮條件下接種根瘤菌特有的產(chǎn)量相關(guān)性狀位點(diǎn),目前課題組正在針對這些位點(diǎn)展開后續(xù)研究,以期為大豆根瘤固氮相關(guān)基因克隆及生物固氮效率改良奠定物質(zhì)基礎(chǔ)。

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