安全性及抗藥性等問題是新農(nóng)藥開發(fā)和應(yīng)用過程中需要重點(diǎn)解決的問題。近日,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)殺菌劑生物學(xué)團(tuán)隊(duì)揭示了殺菌劑作用靶標(biāo)——肌球蛋白的三維結(jié)構(gòu)。未來,在該成果基礎(chǔ)上開展新型殺菌劑的設(shè)計和生產(chǎn),有望實(shí)現(xiàn)“一把鑰匙開一把鎖”的精準(zhǔn)靶向殺菌。國際微生物學(xué)期刊美國《公共科學(xué)圖書館—病理學(xué)》(PLOS Pathogens)在線發(fā)表了這一成果。
在近140年的現(xiàn)代殺菌劑發(fā)展史上,人類先后研發(fā)了400多種殺菌劑用于植物病害的化學(xué)防控。這些殺菌劑有的對其他生物產(chǎn)生毒副作用,有的作用位點(diǎn)單一使得有害病原物容易產(chǎn)生抗藥性。
受制于研究手段的不足,目前探明的殺菌劑作用的分子靶標(biāo)或受體蛋白只有20多種,其中具有重要研發(fā)利用價值的殺菌劑分子靶標(biāo)更是屈指可數(shù)。此前,科學(xué)家一直沒有在結(jié)構(gòu)層面上闡明任何一個靶標(biāo)蛋白與藥劑是如何相互作用的,以致新型殺菌劑創(chuàng)制的盲目性大,周期越來越長,成本越來越高,而且難以解決“殺敵一千,自損八百”的問題。
如何解決這個問題,研制出能精確識別“敵友”的智能殺菌手段?論文通訊作者、團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人周明國認(rèn)為,科研工作“要模擬到生物體內(nèi)的真實(shí)情況”。該團(tuán)隊(duì)經(jīng)過近20年的不斷探索,發(fā)現(xiàn)了一種重要的新靶標(biāo)——肌球蛋白-5。這種靶標(biāo)具有“馬達(dá)”般的超強(qiáng)活力,在細(xì)胞營養(yǎng)運(yùn)輸中具有提供能量的關(guān)鍵作用,是病菌生命活動的馬達(dá)蛋白。
論文共同通訊作者、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)教授張峰介紹,利用結(jié)構(gòu)生物學(xué)方法,他們首次獲得小麥赤霉病菌肌球蛋白分辨率為2.65?的晶體結(jié)構(gòu),揭示了植物病原絲狀真菌肌球蛋白與其抑制劑的互作特征,同時揭示了氰烯菌酯抑制肌球蛋白ATP酶活性的分子機(jī)制。
基于三維結(jié)構(gòu),研究還發(fā)現(xiàn)了新的與氰烯菌酯結(jié)合的氨基酸位點(diǎn),并證明其中重要的氨基酸位點(diǎn)M375在不同真菌中的遺傳分化決定了肌球蛋白對氰烯菌酯的敏感性。研究提出了針對肌球蛋白K375設(shè)計對稻瘟病菌等具有高活性的新型廣譜肌球蛋白抑制劑的可能性。
周明國告訴《中國科學(xué)報》,這就相當(dāng)于給靶標(biāo)肌球蛋白繪制了一幅3D效果的立體解剖圖,揭示了肌球蛋白的功能位點(diǎn)以及可以與化合物互作的關(guān)鍵氨基酸,這將有助于避免農(nóng)藥創(chuàng)制的盲目性,大幅度提高新型殺菌劑的抗菌活性和安全性。
周明國解釋道,每一種生物的肌球蛋白就像是每個房間的鎖芯,只要探明了需要打開房間的鎖芯結(jié)構(gòu),就可以有針對性地配上專門的“鑰匙”,這樣既能滿足“解鎖”的需求,又能保證其他門鎖的安全。不僅如此,由于精準(zhǔn)掌握了病原菌的這種蛋白與藥劑結(jié)合的關(guān)鍵氨基酸,就能發(fā)現(xiàn)他們的變化規(guī)律,提前“預(yù)知”產(chǎn)生抗藥性的機(jī)制和速度,從而采取預(yù)防手段,確保精確武器的長期有效性?,F(xiàn)實(shí)生產(chǎn)中,一種新型農(nóng)藥的研發(fā)需要合成10多萬個化合物,花費(fèi)10年的時間,而抗藥性的產(chǎn)生往往三五年就夠了。
該研究成果揭示了殺菌劑作用靶標(biāo)蛋白與小分子化合物親和互作的精細(xì)結(jié)構(gòu)特征,為快速發(fā)展顛覆性靶向殺菌劑,有效解決新農(nóng)藥創(chuàng)制跟不上抗藥性發(fā)展速度的問題提供了新方法。同時,對于推動農(nóng)業(yè)有害生物的農(nóng)藥受體結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究和靶向農(nóng)藥發(fā)展具有引領(lǐng)性作用。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1008323