朱福周,董解榮,陳 寧,張成林,2*
(1.天津科技大學(xué) 生物工程學(xué)院,天津 300457;2.菱花集團(tuán)有限公司,山東 濟(jì)寧 272073)
α-酮戊二酸(α-ketoglutarate,α-KG)是三羧酸循環(huán)的重要中間產(chǎn)物之一,參與生物體內(nèi)氨基酸、維生素和有機(jī)酸的合成及能量代謝[1-2]。α-酮戊二酸經(jīng)轉(zhuǎn)氨基作用形成L-谷氨酸進(jìn)入氮代謝中,是連接細(xì)胞內(nèi)碳代謝和氮代謝的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)[1]。常見(jiàn)的α-酮戊二酸衍生物包括γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)、5-氨基乙酰丙酸(5-aminolevulinic acid,5-ALA)以及由α-酮戊二酸依賴(lài)的羥化酶催化生成的羥化物如4-羥基異亮氨酸(4-hydroxyisoleucine,4-HIL)等。迄今為止,α-酮戊二酸及其衍生物已被廣泛應(yīng)用于化工、食品、醫(yī)藥、日化等諸多領(lǐng)域[3-6],具有非常廣泛的應(yīng)用前景。
工業(yè)化生產(chǎn)α-酮戊二酸、γ-氨基丁酸及5-氨基乙酰丙酸主要采用化學(xué)合成法,4-羥基異亮氨酸主要采用是提取法。然而,上述工藝多存在生產(chǎn)工藝復(fù)雜、分離困難收率低、易引起環(huán)境污染等不足,限制其大規(guī)模生產(chǎn)和應(yīng)用[2,7-9]。相比而言,生物合成法具備成本低、效率高、環(huán)境友好等優(yōu)勢(shì)。但總體而言,生物法合成α-酮戊二酸及其衍生物尚處于起步階段。基于此,本文從α-酮戊二酸及其衍生物的應(yīng)用、生物合成途徑及其代謝調(diào)控、生物法合成策略等方面進(jìn)行了綜述,以期為其生產(chǎn)菌株的代謝工程構(gòu)建和工藝開(kāi)發(fā)提供借鑒。
α-酮戊二酸作為合成多種藥物的重要前體物質(zhì)被廣泛應(yīng)用于醫(yī)藥領(lǐng)域。α-酮戊二酸可與5-羥甲基糠醛合成抗氧化劑,具有提高抗氧壓的功能[10];能與丙三醇、1,2,4-丁三醇或1,2,6-己三醇通過(guò)聚合反應(yīng)生成三醇-α-酮戊二酸聚合物,從而增強(qiáng)其機(jī)械性能和化學(xué)特性,廣泛應(yīng)用于組織工程學(xué)和藥物傳遞等領(lǐng)域[11]。此外,α-酮戊二酸還具有緩解尿毒癥、有效促進(jìn)術(shù)后傷口愈合、治療營(yíng)養(yǎng)不良以及控制血脂水平等功能[6,12]。
α-酮戊二酸作為運(yùn)動(dòng)類(lèi)飲料的營(yíng)養(yǎng)成分可用于提供能量,其被吸收后與運(yùn)動(dòng)員體內(nèi)過(guò)多的氨結(jié)合以防止氨中毒,同時(shí)還用作飲料中的抗菌劑。α-酮戊二酸還可與精氨酸結(jié)合形成精酮合劑,具有補(bǔ)充能量、抗疲勞、提高其訓(xùn)練時(shí)表現(xiàn)的功能[13]。此外,α-酮戊二酸鹽還具有增強(qiáng)奶酪和臘腸等發(fā)酵食品風(fēng)味的功能,被廣泛應(yīng)用于食品工業(yè)中[5]。
α-酮戊二酸具有促進(jìn)牲畜生長(zhǎng)、增加骨骼密度、增強(qiáng)免疫功能、提高抗應(yīng)激能力以及提高繁殖率等功能,因此作為營(yíng)養(yǎng)強(qiáng)化劑應(yīng)用于動(dòng)物飼料中[14]。α-酮戊二酸是植物氨同化必需的碳架及信號(hào)分子,廣泛參與碳和氮代謝及其調(diào)節(jié)。在農(nóng)業(yè)中,α-酮戊二酸常用于增強(qiáng)農(nóng)作物抗干旱性能[15]。
除用于上述領(lǐng)域外,α-酮戊二酸還可用作化妝品的主要成分,具有清除自由基、緩解褐斑等功效。
目前α-酮戊二酸的合成方法主要包括化學(xué)合成法、酶法和微生物發(fā)酵法。但工業(yè)上主要采用化學(xué)合成法,該方法是以琥珀丁二酸二乙酯、草酸二乙酯等為原料,經(jīng)縮合、水解、蒸餾濃縮、結(jié)晶等工藝合成α-酮戊二酸,收率最高為75%[16-17]。該技術(shù)在多步復(fù)雜的合成反應(yīng)過(guò)程中會(huì)產(chǎn)生大量副產(chǎn)物,其中包括氰化物等劇毒品、重金屬污染物以及易爆物等,不僅加大了分離難度、降低了生產(chǎn)率,同時(shí)也增加了生產(chǎn)的危險(xiǎn)性[16-17]。
早期酶催化法生產(chǎn)α-酮戊二酸是利用谷氨酸脫氫酶(glutamate dehydrogenase,GDH)以谷氨酸為底物合成,但由于谷氨酸脫氫酶對(duì)α-酮戊二酸的親和力高于谷氨酸且該反應(yīng)需要輔酶煙酰胺腺嘌呤二核苷磷酸(nicotinamide adenine dinucleotide phosphate,NADP+),因此未被工業(yè)化應(yīng)用[18]。近年來(lái),有研究者利用L-谷氨酸氧化酶(L-glutamate oxidase,GLOD)以谷氨酸為底物合成α-酮戊二酸[19],但該方法在反應(yīng)過(guò)程中產(chǎn)生的過(guò)氧化氫嚴(yán)重抑制酶活性[20]。盡管添加過(guò)氧化氫酶(catalase,CAT)可消除過(guò)氧化氫,但因生產(chǎn)工藝復(fù)雜化并增加生產(chǎn)成本未被工業(yè)化應(yīng)用[20]。
與化學(xué)合成法、酶催化法相比,微生物發(fā)酵法具有成本低、收率高、污染輕及副產(chǎn)物少等優(yōu)點(diǎn),具有很大的工業(yè)化生產(chǎn)的潛力[21]。目前已發(fā)現(xiàn)熒光假單胞菌(Pseudomonas fluorescens)、銅綠假單胞菌(P.aeruginosa)、粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescenss)、石蠟節(jié)桿菌(Arthrobacter paraffineus)、谷氨酸棒桿菌(Corynebacterium glutamicum)、解脂亞洛酵母(Yarrowia lipoytica)及光滑球擬酵母(Torulopsis glabrata)等多種微生物能夠過(guò)量合成α-酮戊二酸,其中谷氨酸棒桿菌、解脂亞洛酵母及光滑球擬酵母生產(chǎn)性能最好。解脂亞洛酵母發(fā)酵生產(chǎn)α-酮戊二酸具有發(fā)酵周期長(zhǎng)、產(chǎn)酸速率低、副產(chǎn)物過(guò)高等不足,限制了其工業(yè)化應(yīng)用[17]。谷氨酸棒桿菌因具有安全穩(wěn)定及遺傳背景清晰的特性被廣泛用于氨基酸、有機(jī)酸及核苷的發(fā)酵生產(chǎn)。谷氨酸棒桿菌因三羧酸循環(huán)(tricarboxylic acid cycle,TCA)中檸檬酸至α-酮戊二酸代謝流較強(qiáng)的性能[2]。盡管利用該菌株合成α-酮戊二酸的發(fā)酵周期大幅度縮短,但其生產(chǎn)效率還需進(jìn)一步提高。
α-酮戊二酸是微生物三羧酸循環(huán)中的中間代謝產(chǎn)物,葡萄糖進(jìn)入細(xì)胞后經(jīng)糖酵解途徑生成丙酮酸,其在丙酮酸脫氫酶復(fù)合體(pyruvate dehydrogenase complex,PDHC)的作用下形成乙酰輔酶A。后者與草酰乙酸依次在檸檬酸合酶(citrate synthase,CS)、順烏頭酸酶(cis-aconitase,ACO)、異檸檬酸脫氫酶(isocitrate dehydrogenase,IDH)的作用下生成α-酮戊二酸。α-酮戊二酸可在α-酮戊二酸脫氫酶復(fù)合體(α-ketoglutarate dehydrogenase complex,OGDC)的作用下生成琥珀酰輔酶A以完成三羧酸循環(huán)[22];亦可在谷氨酸脫氫酶的作用下生成谷氨酸[23];此外還可與谷氨酰胺經(jīng)谷氨酸合酶(glutamate synthase,GOGAT)催化生成谷氨酸(見(jiàn)圖1)。
圖1 α-酮戊二酸的生物合成途徑Fig.1 Biosynthetic pathway of α-ketoglutarate
α-酮戊二酸的生物合成途徑中有3個(gè)重要代謝節(jié)點(diǎn),分別為磷酸烯醇式丙酮酸-丙酮酸-草酰乙酸節(jié)點(diǎn)、檸檬酸節(jié)點(diǎn)和α-酮戊二酸節(jié)點(diǎn)[23]。草酰乙酸是合成α-酮戊二酸的重要前體物質(zhì),除來(lái)源于三羧酸循環(huán)外,還可通過(guò)回補(bǔ)途徑(replenishment pathway,RP)獲得,分別由丙酮酸經(jīng)丙酮酸羧化酶(pyruvate carboxylase,PC)和磷酸烯醇式丙酮酸經(jīng)磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase,PEPC)催化生成。其中前者以生物素為輔酶,后者通常受天冬氨酸和α-酮戊二酸的反饋抑制。不同微生物含有上述1種或2種羧化酶,如大腸桿菌僅含磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶、枯草芽孢桿菌及解脂亞洛酵母僅含丙酮酸羧化酶、谷氨酸棒桿菌同時(shí)含有磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶和丙酮酸羧化酶。
檸檬酸節(jié)點(diǎn)是控制三羧酸循環(huán)代謝流量的重要代謝節(jié)點(diǎn),檸檬酸合酶是該節(jié)點(diǎn)的關(guān)鍵酶,其活性往往受檸檬酸、腺嘌呤核苷三磷酸(adenosine triphosphate,ATP)及NADP的反饋抑制[24]。α-酮戊二酸節(jié)點(diǎn)決定其代謝去向,α-酮戊二酸分別在α-酮戊二酸脫氫酶和谷氨酸脫氫酶的催化下合成琥珀酰輔酶A和谷氨酸。α-酮戊二酸脫氫酶以硫胺素為輔酶。因此,當(dāng)培養(yǎng)基中硫銨素不足時(shí),α-酮戊二酸會(huì)因三羧酸循環(huán)代謝流減弱而流向谷氨酸。在谷氨酸棒桿菌中,α-酮戊二酸脫氫酶的活性除受硫銨素調(diào)節(jié)外,還受抑制蛋白(oxoglutarate dehydrogenase inhibitor,OdhI)的抑制作用。OdhI與α-酮戊二酸脫氫酶結(jié)合后使其喪失活性,但OdhI第14位蘇氨酸被絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶PknG磷酸化后不能與α-酮戊二酸脫氫酶結(jié)合,從而該抑制作用被解除。但當(dāng)培養(yǎng)基中生物素充足時(shí),OdhI不能被PknG磷酸化從而恢復(fù)其抑制作用[24]。
目前共發(fā)現(xiàn)3種谷氨酸脫氫酶,分別以NADH(EC 1.4.1.2)、NADPH(EC 1.4.1.4)以及NADPH或NADH(EC 1.4.1.3)為輔酶。不同微生物含谷氨酸脫氫酶種類(lèi)不同,如大腸桿菌含EC 1.4.1.4、枯草芽孢桿菌含EC 1.4.1.2、谷氨酸棒桿菌含EC 1.4.1.3和EC 1.4.1.4、解脂亞洛酵母含EC 1.4.1.2和EC 1.4.1.4。研究發(fā)現(xiàn),谷氨酸棒桿菌中EC 1.4.1.4起主要作用,但其對(duì)α-酮戊二酸的米氏常數(shù)(Km值)(5.7 mmol/L)高于α-酮戊二酸脫氫酶(0.02~0.13 mmol/L)[25]。前期研究發(fā)現(xiàn),在谷氨酸棒桿菌培養(yǎng)過(guò)程中減少生物素或NH4+后,α-酮戊二酸脫氫酶和谷氨酸脫氫酶活性被抑制,α-酮戊二酸大量積累[26]。
發(fā)酵法生產(chǎn)α-酮戊二酸最早始于LOCKWOOD L B等[27]利用熒光假單胞菌生物合成α-酮戊二酸的研究,隨后多種微生物均被發(fā)現(xiàn)可以過(guò)量合成α-酮戊二酸[4,28]。谷氨酸棒桿菌及解脂亞洛酵母和光滑球擬酵母等酵母菌因具有生理和遺傳特性清晰、生長(zhǎng)快速、底物譜寬等特性被認(rèn)為是發(fā)酵法生產(chǎn)α-酮戊二酸的理想菌株。因此,α-酮戊二酸生產(chǎn)菌種的選育研究主要集中在上述3種微生物,其主要策略包括增強(qiáng)α-酮戊二酸前體物的供應(yīng)以及弱化競(jìng)爭(zhēng)代謝支路。
4.1.1 增強(qiáng)α-酮戊二酸前體物的供應(yīng)
陳堅(jiān)等[29]于解脂亞洛酵母(Y.lipoytica)WSH-Z06過(guò)表達(dá)丙酮酸脫氫酶E1編碼基因PDA1以提高其活性。結(jié)果表明PDA1過(guò)表達(dá)菌株胞內(nèi)丙酮酸含量顯著降低,經(jīng)發(fā)酵144 h,其α-酮戊二酸產(chǎn)量由37.6 g/L提高至43.3 g/L。VENELINA Y等[30]于解脂亞洛酵母(Y.lipolytica)H355過(guò)量表達(dá)了NADP+依賴(lài)型的異檸檬酸脫氫酶編碼基因IDP,以增強(qiáng)α-酮戊二酸前體物異檸檬酸的供應(yīng)。經(jīng)發(fā)酵117 h,重組菌株Y.lipolyticaH355Aα-酮戊二酸產(chǎn)量達(dá)到167.6 g/L,較出發(fā)菌株提高6.8%,副產(chǎn)物丙酮酸的積累量顯著下降。孫蘭超等[31]于谷氨酸棒桿菌(C.glutamicum)GDK-10過(guò)表達(dá)磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶編碼基因ppc以增加其草酰乙酸供應(yīng),重組菌株GDK-12的單位菌體產(chǎn)量出發(fā)菌株提高38.59%。
4.1.2 弱化競(jìng)爭(zhēng)代謝支路
JO J H等[32]以谷氨酸棒桿菌(C.glutamicum)HH109為出發(fā)菌株,敲除其異檸檬酸裂解酶編碼基因aceA、谷氨酸脫氫酶編碼基因gdh和谷氨酸合酶編碼基因gltB,以阻斷異檸檬酸的消耗及α-酮戊二酸向谷氨酸的代謝,獲得的重組菌株谷氨酸棒桿菌(C.glutamicum)JH107α-酮戊二酸產(chǎn)量達(dá)到51.1 g/L,較出發(fā)菌株提高68%。趙巖等[33]以谷氨酸棒桿菌(C.glutamicum)GDK-10為出發(fā)菌株,通過(guò)敲除乳酸脫氫酶編碼基因ldh、乙酸激酶編碼基因ackA、丙酮酸醌氧化還原酶編碼基因pqo,以減少副產(chǎn)物乳酸、乙酸和丙酮酸積累量。結(jié)果表明,ldh和pqo基因敲除菌株C.glutamicumGDK-14和C.glutamicumGDK-15的α-酮戊二酸產(chǎn)量分別為40.18 g/L和31.94 g/L,較出發(fā)菌株降低8.54%和27.9%;ackA基因敲除菌株(C.glutamicum)GDK-16的α-酮戊二酸產(chǎn)量為47.88g/L,較出發(fā)菌株提高8.99%。LIY等[26]以谷氨酸棒桿菌C.glutamicumGKG-047為出發(fā)菌株,敲除其谷氨酸脫氫酶編碼基因gdh1和gdh2,獲得的重組菌(C.glutamicum)GKGDα-酮戊二酸產(chǎn)量達(dá)到45.6 g/L。薛寧等[34]以谷氨酸棒桿菌C.glutamicumGKGD為出發(fā)菌株,分別敲除異檸檬酸裂解酶編碼基因aceA和谷氨酸合酶編碼基因gltB,以減少異檸檬酸向乙醛酸循環(huán)的代謝流量及α-酮戊二酸的消耗。獲得的重組菌株GKGD-1和GKGD-2搖瓶條件下α-酮戊二酸產(chǎn)量分別為12.86 g/L和13.81 g/L,較出發(fā)菌株提高14.72%和7.39%,轉(zhuǎn)化率分別提高9.76%和5.43%。
4.2.1 培養(yǎng)基優(yōu)化
韓洪軍等[35]向培養(yǎng)基中添加玉米漿和表面活性劑吐溫60以增加生長(zhǎng)因子供應(yīng)并增強(qiáng)細(xì)胞膜通透性,并考察其對(duì)谷氨酸棒桿菌GKGD發(fā)酵生產(chǎn)α-酮戊二酸的影響。結(jié)果表明,在初始發(fā)酵培養(yǎng)基中添加6 mL/L的玉米漿、在發(fā)酵10 h添加1 mL/L的吐溫60,α-酮戊二酸的產(chǎn)量達(dá)到17.9 g/L,較未優(yōu)化前提高了198%。
ZENG W等[36]研究了不同初始濃度甘油對(duì)解脂亞洛酵母(Y.lipolytica)WSH-Z06細(xì)胞生長(zhǎng)和α-酮戊二酸合成的影響。發(fā)現(xiàn)當(dāng)培養(yǎng)基中初始甘油質(zhì)量濃度為50 g/L時(shí),α-酮戊二酸的產(chǎn)量為67.4 g/L,丙酮酸產(chǎn)量達(dá)到39.1 g/L,較優(yōu)化前分別提高了9.6%和176.8%,實(shí)現(xiàn)了α-酮戊二酸和丙酮酸聯(lián)產(chǎn)。彭小雨等[37]考察了氮源濃度以及硫銨素濃度對(duì)解脂亞洛酵母(Y.lipolytica)WSH-Z06 C3聯(lián)產(chǎn)酮酸的影響。結(jié)果表明,大豆蛋白粉和硫銨素質(zhì)量濃度分別為4 g/L和0.2 μg/L時(shí),α-酮戊二酸和丙酮酸的總產(chǎn)量最高(78.2 g/L),較優(yōu)化前提高了57.9%。
4.2.2 發(fā)酵條件優(yōu)化和過(guò)程控制
CHERNYAVSKAYA O G等[38]以乙醇為碳源,考察了溶氧對(duì)解脂亞洛酵母(Y.lipolytica)N1發(fā)酵生產(chǎn)α-酮戊二酸的影響。發(fā)現(xiàn)低溶氧(5%)時(shí)菌株對(duì)NH4+的利用速率比高溶氧(50%)時(shí)快,低溶氧條件下的產(chǎn)量為49 g/L,較高溶氧條件下提高了22.5%。進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)溶氧水平極大的影響Y.lipolyticaN1對(duì)NH4+的利用速率,進(jìn)而影響α-酮戊二酸的積累。
YU Z等[39]考察了pH對(duì)解脂亞洛酵母(Y.lipolytica)WSH-Z06合成α-酮戊二酸的影響。發(fā)現(xiàn)低pH有利于α-酮戊二酸的合成,當(dāng)pH維持在3.0時(shí),α-酮戊二酸的產(chǎn)量達(dá)到53.4 g/L,較優(yōu)化前提高了142%。王炫等[40]對(duì)α-酮戊二酸生產(chǎn)菌谷氨酸棒桿菌(C.glutamicum)KGA-3的發(fā)酵條件進(jìn)行系統(tǒng)優(yōu)化,分別研究了pH控制方式、初始糖質(zhì)量濃度、發(fā)酵溫度、搖瓶裝液量等因素對(duì)α-酮戊二酸產(chǎn)量的影響,最終確定培養(yǎng)基初始pH為7.0,初始糖質(zhì)量濃度為90 g/L,發(fā)酵溫度為32 ℃,搖瓶裝液量為25 mL/500 mL,優(yōu)化后α-酮戊二酸的產(chǎn)量和轉(zhuǎn)化率分別為25.8 g/L和35.1%,較優(yōu)化前分別提高了45.5%和11.5%。張海林等[41]通過(guò)動(dòng)力學(xué)分析確定了通過(guò)調(diào)控pH控制菌體濃度促進(jìn)α-酮戊二酸積累的策略,發(fā)酵初期控制pH值為6.0,菌體質(zhì)量濃度達(dá)到10 g/L后pH自然降至3.0并保持至發(fā)酵結(jié)束,α-酮戊二酸產(chǎn)量為54 g/L,產(chǎn)量和生產(chǎn)強(qiáng)度分別較未優(yōu)化前提高19.3%和17.8%。
γ-氨基丁酸是天然非蛋白質(zhì)氨基酸,廣泛存在于動(dòng)物、植物以及微生物中。γ-氨基丁酸可以抑制大腦中神經(jīng)遞質(zhì)的傳遞,進(jìn)而影響到對(duì)壓力的應(yīng)激反應(yīng)[42]。此外,γ-氨基丁酸還可以提高生長(zhǎng)激素水平,參與大腦中蛋白質(zhì)的合成,具有降血壓、利尿、治療糖尿病等功能[43]。
目前已報(bào)道的生物法合成γ-氨基丁酸的菌株主要包括乳酸菌、大腸桿菌和谷氨酸棒桿菌。α-酮戊二酸在谷氨酸脫氫酶和谷氨酸脫羧酶的催化下生成γ-氨基丁酸。其生產(chǎn)菌株的代謝工程改造策略包括過(guò)表達(dá)磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶或丙酮酸羧化酶編碼基因及敲除蘋(píng)果酸脫氫酶編碼基因以增強(qiáng)草酰乙酸供應(yīng)[7]、過(guò)表達(dá)谷氨酸脫羧酶編碼基因以促進(jìn)γ-氨基丁酸的合成[44-45]、敲除γ-氨基丁酸轉(zhuǎn)氨酶編碼基因以阻止其降解以及過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)氨酶透過(guò)酶編碼基因以增強(qiáng)其輸出[46]。
5-氨基乙酰丙酸亦屬于天然非蛋白質(zhì)氨基酸,是亞鐵血紅素、葉綠素、微生素B12合成的重要前體。5-氨基乙酰丙酸被廣泛應(yīng)用于癌癥的光動(dòng)力學(xué)診斷和治療,還可用作殺蟲(chóng)劑和植物生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑[8,47]。
5-氨基乙酰丙酸的生物合成包括C4途徑和C5途徑。其中C5途徑以α-酮戊二酸為前體物質(zhì)依次在谷氨酸脫氫酶(glutamte dehydrogenase,GDH)、谷氨酰-轉(zhuǎn)移核糖核酸合成酶(glutamyl-transfer ribonucleic acid synthetase,GluRS)、谷氨酰-轉(zhuǎn)移核糖核酸還原酶(glutamyl-tRNA reductase,GluRR)以及谷氨酸-1-半醛氨基轉(zhuǎn)移酶(glutamate-1-semialdehyde aminotransferase,GluSA)催化作用下生成5-氨基乙酰丙酸。目前已報(bào)道的利用C5途徑合成5-氨基乙酰丙酸的菌株主要包括大腸桿菌和谷氨酸棒桿菌。其生產(chǎn)菌株的代謝工程改造策略包括過(guò)表達(dá)檸檬酸合酶編碼基因以增強(qiáng)檸檬酸供應(yīng)[48]、弱化α-酮戊二酸脫氫酶編碼基因以減少α-酮戊二酸消耗[48]、過(guò)表達(dá)谷氨酰-tRNA還原酶和谷氨酸-1-半醛氨基轉(zhuǎn)移酶編碼基因以強(qiáng)化5-氨基乙酰丙酸的合成[49-51]、弱化5-氨基乙酰丙酸脫水酶編碼基因以減少5-氨基乙酰丙酸降解[52]、過(guò)表達(dá)輸出蛋白編碼基因以增強(qiáng)其輸出[50]、敲除乳酸脫氫酶和乙酸激酶編碼基因以減少副產(chǎn)物乳酸和乙酸的積累等[53]。
羥基氨基酸是重要的氨基酸衍生物,可由α-酮戊二酸和Fe2+依賴(lài)的氨基酸羥化酶催化氨基酸和α-酮戊二酸生成。4-羥基異亮氨酸是常見(jiàn)的羥基氨基酸,由異亮氨酸和α-酮戊二酸經(jīng)異亮氨酸羥化酶催化生成[54]。4-羥基異亮氨酸具有血糖濃度依賴(lài)的促進(jìn)胰島素分泌的活性以及增加葡萄糖耐受性、促進(jìn)脂肪代謝和保護(hù)肝臟等功能[55]。
目前已報(bào)道的生物法合成4-羥基異亮氨酸的菌株主要包括大腸桿菌和谷氨酸棒桿菌。其生產(chǎn)菌株的代謝工程改造策略包括過(guò)表達(dá)異亮氨酸羥化酶以構(gòu)建4-羥基異亮氨酸合成途徑[56]、過(guò)表達(dá)磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶或丙酮酸羧化酶編碼基因以增強(qiáng)草酰乙酸供應(yīng)[54]、過(guò)表達(dá)檸檬酸合酶和異檸檬酸脫氫酶編碼基因以增強(qiáng)α-酮戊二酸供應(yīng)[57]、敲除異檸檬酸裂解酶編碼基因以減少異檸檬酸的消耗[57]、敲除(或弱化)α-酮戊二酸脫氫酶編碼基因以減少α-酮戊二酸消耗[58]、過(guò)表達(dá)NAD激酶和6-磷酸葡萄糖脫氫酶編碼基因?yàn)楫惲涟彼岷铣商峁㎞ADPH[9]等。
近年來(lái),隨著生物技術(shù)尤其是生物信息學(xué)、合成生物學(xué)及酶工程技術(shù)的不斷進(jìn)步,α-酮戊二酸及其衍生物的生物合成水平逐漸提高,工業(yè)化進(jìn)程也在加快,其應(yīng)用范圍和領(lǐng)域逐漸擴(kuò)大。如前所述,α-酮戊二酸脫氫酶和谷氨酸脫氫酶競(jìng)爭(zhēng)α-酮戊二酸,其產(chǎn)物琥珀酰-輔酶A(coenzyme A,CoA)和谷氨酸參與多種生物反應(yīng),因此動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)其活性以平衡其合成代謝將是實(shí)現(xiàn)α-酮戊二酸高效合成的關(guān)鍵。隨著成簇的規(guī)律間隔的短回文重復(fù)序列干擾(clustered regularly interspaced short palindromic repeats interference,CRISPRi)技術(shù)的應(yīng)用以及生物感應(yīng)器(biosensor)的開(kāi)發(fā)和應(yīng)用,將為解決該關(guān)鍵問(wèn)題提供重要支撐。